TREX2 Color FASTA
The longest form of insertion/deletion sites is shown in the FASTA sequence and contain a '-' as the alternate allele in the variation tag.
*Display courtesy of GeneSNPs

GTATATACCC AGTAATGGGA TGGCTGGGTC AAATGGTATT TCTAGTTCTA 50 | REPEAT | var(32):[C:0.01]
GATCCCTGAG GAATCGCCAC ACTGACTTCC ACAATGGTGG AACTAGTTTA 100
CACTCCCACC ATCCTTTTGG TTTCTTTTCT TTCCTCTGCA GCTACCAAGA 150 | var(103):[A:0.04]
TGAATGAACT AATGGAGAAA TAGAAAGTCT TCAGTGATGG CCTACGCCAA 200
AGCACAGGAT GGGGCGGGCA GGAAGCCCTC TCCCAAGATC GAGTTGGCCG 250
AGGATGGATG ATTGTGGCAG CAGAAGCCGT TGCAGCCCCA CGTTGTGCTC 300
TAGGCAGGGA CCTTTGGCCC CTTTGGGGAG GGAGAGACAG ACGGGCGGTT 350
TGACTTGGAC ACAAAGAAAG CCTTGGTTTC TAAGCAGTTG CCTCCAGCCT 400
GCTTTCTGCT TCCTCAGCTC TATGTCTCTC TCCTTCCCCT TGTCCTGAGC 450
TGCTCAGGTG GCCCAGGTCT GGGCAGGCTG GCGGCGGCCC TCCTGTCATC 500
TTGGCGGGCC TGGGCTGCGT CCTCTTCCTG TGGCTCCACT CCTCCCTGCT 550
GCTGCCAGCC ACTTGAAAGC AGAGAACCCA CTGTCGCCTC CCCCGGCTGG 600 | var(574):[T:0.01]
CCTTAGGGTC CTGTGCGAGA CGCACCCCTC AGCCGCCCTC CTTGAGTGCC 650
CCTGGATCCC CCGCGGGGTA CCAGTTTCCT GCTCCTCCCT GGCTGGGCGC 700 | var(682):[G:0.02] | var(698):[T:0.02]
TCAGCTCTGG GCTGGGGAAT TCAGCCTGAC TGGTTGTCCA GGAAGATGCT 750
GTCTGGGCTT CCCAGGGTGA CCCAGTATCT CCCTGAGCAG TGTGCCTGTC 800
ACAGCTGCCT CCCTCCCTGT GAGTACCGGA ACAGGCGTGA CTGGTAGGGC 850
CTCTGCCTCC TTGGGGCCAT TGTACCTGCT GCTGCCCGCC CCACCCTGCT 900 | var(888):[C:0.01]
CCCTCCTGGC ACCATCTCCT TTGCTTCCCC AAGGTCCCTG TGGGCACACA 950
AGGCAAGGAG GCCAGGAGGA GCCAGGTGCC AGACCCCCCT CCATCCCAGT 1000 | var(951):[C:0.09] | var(989):[:0.10] | var(995):[T:0.01]
CGCCTGAGGC ATCCCCCAGC CACCACTGTG AGAGGTGGGA GGCCGGGCAG 1050 | var(1049):[C:0.14]
GCCTGTGGTC ACCATGGTGC AGGTGCACCA CCTGATTTAT AGGCCAAGGG 1100
ACTCCTCTTG GTCACCTCTC TGTGCCCCCA GCATGGGGCT GGCCCTGCAG 1150
TGCACCCACC ATCAAGGGCT GTTGTCTCTT GCTCCAGAAT GAGGTCTTCA 1200
GGGCGCCACT GCTCGCAGGA CCGGGAAGGA CCTGGTGCCC TTTGCCTGGA 1250 | var(1204):[T:0.04]
GCGGGATAGA CAGGGCAGGT CCCTGAGCCT GGGGTCCGAG GGGCTGGGCT 1300
TCACTCCTCC TGTAGTCCCG GCGCTCCTGG CCCACCCCCT AACGTTGCTT 1350
ATCTGTGGTG GAGGAAGCAT TAGCTCAGCT GCGGCCTGCA CAGCTCCCGG 1400
GCCAGGCCCA CCTCCCTTCC TTCCCCAGCA GCCACTGTTA GGTGCACGGT 1450
AGACATGATG AAGCGACGTC CTTAAAGCAG ATAGCATCTC CCGAGGCTGC 1500
CCCATCCCTA GGTTTTGGGG GAGCACCCCT TCCCCTTTGG AGGCTGAGCA 1550
CGGCATGTGT GGGCACCTTG GTCACACTCC AGAGCTCGCT TCATCCCCAC 1600 | Exon 1 | UTR
GAGCGGCACC TGATCTCCAG TGACGGGGAG ACTGAGGCCT GGCAAAGAGG 1650
ACCTGTTGCC TTTGTGTAAC TGGCCCCAGC ATGGGGGAGG CATTGGCCCC 1700
AGCATGGGGG AGGCATTGAC CCCAGGCCTG CCAGGCCTGG CAGCCACAGC 1750
CTGGCTAGGT GGAGGTTACT GCCTTCCGCA CCACTCTGGC TTCCTCCCCG 1800
TGCCTGTGAA GAGCTCGGGG CCTGCTTCCT AATTTGTAAA CACGGGGCGT 1850
GTGTCTCAGT GGCTGTGAGC TAGCGAGGGG GTGGCGAGCG AGCCGGCTGC 1900
GCAGGTCCTG AGGCCCCAGG CCTCATTGTT GGCCAACAGG CAGCTGGGGG 1950
CGGGCTGCGG CCGCTGATTA AAGGCCGCCT AGAGCAGCCT GTGTGGCGAC 2000 | var(1959):[A:0.04]
AGGTGCCCAG AAGCCCAGGA AGCCGGTCAG TGCCCGCCCC AG
GTAAGCTG 2050
GTGTGGTGGG GTTGGCAAGG ACAGTCTCCC CGGGAGCCTG GGGGCAAGCA 2100
GGCAGAGGCC AGCTCGGGAC CAGCACCTGT GTGCCAGGGA CAAGGGTGGG 2150
GAGGTCGAGC CCAGCGGGAG CTGGGTGCAC TGCATGGGCT CTTTCGGGTG 2200
GCTGCTTGCC TGCTTCCCGG CAGCTGGTTC CAGGGCTGGA GACCCAGTGT 2250
GCTATGCCCC AGGTTCCCAG CCAAGGCATT CCGGTGAAGG GGCTGGACCC 2300 | var(2289):[T:0.01]
CGCCAAGGTG CGGTCCCTGA GCTGCCTCTG CCTCTCCCAA TCCCTGCTGG 2350
GGACTGTGGC TGGAGGCAGG CAGTAGAGCG CTCTGAGGCC TGCCTTTTCT 2400
GTTCAGTAGG TGACAGGAGT GGGGCTGACG CTCCCAGAGC CAAAGGTCAC 2450
AGGTGCTGTG GTCGGGGGTG GCAGGAAGTG AGCCCCAGAA GGGTCAGAGC 2500
TTTGGCTAGG GGGAGGATGG TACACAGCAG GGCCCGGGCG AACCCCTCTC 2550 | var(2535):[T:0.01]
TCCAGTCCTC AGGGTTTGTG CCTCTCGCTC GGACAGTTTG AGGACTTGCT 2600 | Exon 2 | UTR
ATCCCCGTGG GAACATCACC A
TGTCCGAGG CACCCCGGGC CGAGACCTTT 2650
                       M  S  E   A  P  R  A   E  T  F  10
GTCTTCCTGG ACCTGGAAGC CACTGGGCTC CCCAGTGTGG AGCCCGAGAT 2700
 V  F  L   D  L  E  A   T  G  L   P  S  V   E  P  E  I 27
TGCCGAGCTG TCCCTCTTTG CTGTCCACCG CTCCTCCCTG GAGAACCCGG 2750
  A  E  L   S  L  F   A  V  H  R   S  S  L   E  N  P   43
AGCACGACGA GTCTGGTGCC CTAGTATTGC CCCGGGTCCT GGACAAGCTC 2800
E  H  D  E   S  G  A   L  V  L   P  R  V  L   D  K  L  60
ACGCTGTGCA TGTGCCCGGA GCGCCCCTTC ACTGCCAAGG CCAGCGAGAT 2850
 T  L  C   M  C  P  E   R  P  F   T  A  K   A  S  E  I 77
CACCGGCCTG AGCAGTGAGG GCCTGGCGCG ATGCCGGAAG GCTGGCTTTG 2900
  T  G  L   S  S  E   G  L  A  R   C  R  K   A  G  F   93
ATGGCGCCGT GGTGCGGACG CTGCAGGCCT TCCTGAGCCG CCAGGCAGGG 2950
D  G  A  V   V  R  T   L  Q  A   F  L  S  R   Q  A  G  110
CCCATCTGCC TTGTGGCCCA CAATGGCTTT GATTATGATT TCCCCCTGCT 3000
 P  I  C   L  V  A  H   N  G  F   D  Y  D   F  P  L  L 127
GTGTGCCGAG CTGCGGCGCC TGGGTGCCCG CCTGCCCCGG GACACTGTCT 3050 | var(3029):[T:0.01]
  C  A  E   L  R  R   L  G  A  R   L  P  R   D  T  V   143
GCCTGGACAC GCTGCCGGCC CTGCGGGGCC TGGACCGCGC CCACAGCCAC 3100
C  L  D  T   L  P  A   L  R  G   L  D  R  A   H  S  H  160
GGCACCCGGG CCCGGGGCCG CCAGGGTTAC AGCCTCGGCA GCCTCTTCCA 3150 | var(3121):[T:0.04]
 G  T  R   A  R  G  R   Q  G  Y   S  L  G   S  L  F  H 177
CCGCTACTTC CGGGCAGAGC CAAGCGCAGC CCACTCAGCC GAGGGCGACG 3200
  R  Y  F   R  A  E   P  S  A  A   H  S  A   E  G  D   193
TGCACACCCT GCTCCTGATC TTCCTGCACC GCGCCGCAGA GCTGCTCGCC 3250 | var(3244):[T:0.04]
V  H  T  L   L  L  I   F  L  H   R  A  A  E   L  L  A  210
TGGGCCGATG AGCAGGCCCG TGGGTGGGCC CACATCGAGC CCATGTACTT 3300 | var(3271):[C:0.11]
 W  A  D   E  Q  A  R   G  W  A   H  I  E   P  M  Y  L 227
GCCGCCTGAT GACCCCAGCC TGGAGGCCTG AGCACCAGGG CCACCTCCTG 3350
  P  P  D   D  P  S   L  E  A                          236
TGCCATGGAC AGTGCCAGCC TCCACCGTTC AGCTGGCCTC TACCACCCCC 3400
GGCTCCTCCT ATCTGGGCAG CCTCAGGTCC GTGCACCTGC CAGGCCTTCC 3450
CTGGCTGCCT GACCAGCCAT ACGGCCCTGG ATTCCTCTCC AGGCCCCGCT 3500
TCCAGGGCCG TGCTCTCCCG GCTGGCCTGG GTGCCCAGCA GAGTTTGCTG 3550
TTTCCCAATA AACATTGCCA ACTACTCACC CTCCGACTAG CTGGCCAGAT 3600
ACTAGGGGCT GGACTCCCTC GACCCCCTGC TGAGCAGGGC CAGGCGGTGA 3650
GCCATGCCAG GGGCCAGCAC AAGACCTCCA GGGCCGCCCC CCTATGGCCT 3700
CTCCTCGCGG TGAGGACCGT GGGTGGCTGG GTAGGGAGAC GTCAAGCTCT 3750
TGGGTTGGTC TGAGGGCTGA TGGGTTGTGG CTGTGGGCTG ATTGCCGCCC 3800
ATCTGCATTG TCACCCCAGA GGCCCAAAGA AGCCATGAGT AGGGCCTTAA 3850
GCCCACAGAG CCGGCCGCCT GCCTGGGCAC AAAGCTCAGC TGCAGCGCTT 3900 | NOT SCANNED
GCCCGCCGTG GGACCTGGAG TCTCTGTCCC TGCTCTGTGA AGTGGTAACA 3950
GGGTGAAATG TTAAGAAACG GGGTGCTGGG GAAAAGGGAG GTGCCCCCAC 4000
ATGTGGGCAT GCACATGTAC ATGTACATGC TAAGGGCCCT GACGGTGCAC 4050
GGAGCAGAGG TGGGGTGGCT GGTGCTGTGA GGGTGACCCT GGAAGGGAGC 4100
CTATCCTGCA GCCCGTGTCC CCGTAGGGCC AGGAGGCCGC TCGGTGGGAG 4150
GGCAGCTTCT GGCCACCGCA CTGTGCTTTG GGTTCCCTGC TAACCTGCCT 4200
CAGGGGCCCC ACCCTGAGGC ACTTCCAGTC TTGGGAGGCC TCATGGGTGG 4250
GGAGAGACCT GTCACCAACG CTGGGTCAGG TAAGAAGGGA TGGGGTGGCC 4300 | REPEAT
ACGCCTGAGA GTGACTCACA TGAGCAAAGC CTGAGCCTCC AGCCAGCTGG 4350 | var(4329):[A:0.01]
ACAATCTGGG AAGCCCTAAG TAGGTCAGAA TGACTGGAGC CACTGCAGCG 4400
TGCACGGTGG TAGGATGGTG AGGCCAGAGC ACAGGCAGTG ACCACCTCAG 4450
ACCTTCCTTG TGGCCCGGGC CAGGCCTGAC CCTGATGGCA GCGGGGAGCC 4500 | var(4451):[T:0.01] | var(4493):[A:0.04]
GCGGAGGGTC ATGAGCAGGA GAGGGGAAAA GTCTGGTGTA GGCTTCTGCC 4550
ATATGCTGCT TGGGCTGCGT GCCGAGCTGT TCTCGAGTTG CTGTGAAGAA 4600 | var(4573):[T:0.01] | REPEAT
ATACTTGAGG CTGGGTCATT TACAAAGACA GCGGGTTTAT TTTGGCTCAG 4650
CAGTGCTGGC ATCTGTTAAC TGGTGGGGCC TCAGGAAGCT TCCACTTATG 4700
GCAGAAGGCA AAGGGGGAGC AAGAGAGAGG CGGGGAGGTG AACTCACAGC 4750 | var(4709):[G:0.01]
GAGAATTCAA CTCCTTGCGG AGGTGAGGAC GGCACCAAGC CATTCATGAG 4800 | var(4769):[A:0.01]
GGATCCAACC CCATGACCCA AACGCCTCCC ACCAAGGCCC CACCTCCAAC 4850 | var(4801):[A:0.15]
ATTGGGGGTT ACATCTCAAA CTGAGATTTG GAGGGGACGA ACGTCCAAAC 4900
CACATCAGGC TGCTGCATGG AGAATGGGCT GGAGAGGACA GCGACGGCAA 4950
GGCGGGCAGA AGCAGAGCAT GGAGGGCTTT GGTGGAGGGA GGGAGAGCTA 5000
TGGGCCTGGC CAAGGACAGT GGCAGCAGGG GAGGGGAGGG GGCACGGTCT 5050
GGGGAAGCCC CACAGGACCT AGTTTGGGAA TGTGGTTAGT AACCAGAAGA 5100
TCTTGTCACA GCCAAGCTTC CCGAGGAGAG CATCACCTGG GAGAGTGTCA 5150
CAAGCCCTGG GCTGGCCCTA CAGAAGCTGG AGTAGGGGAC ACTGAGCCCC 5200 | var(5197):[T:0.09]
CAGATCCCCT GGTGCCCAGA CAGGGCCTGC TTCTGTTTAT CTTACTGGCC 5250
AGGC