TREX1 Color FASTA
The longest form of insertion/deletion sites is shown in the FASTA sequence and contain a '-' as the alternate allele in the variation tag.
*Display courtesy of GeneSNPs

GTGACACATG AGTGCTTGTC CTGGGTCTTC CCTGGGAAGG TCCCACACCA 50
CTTCTTGGAC CCATTTGTGC AGACAAACAG TTGCTGAAGC AAGTGAACTC 100
TTATAGAAGC TTAAGAAAAC CCTCGCAGGG ACTGGTCTCC TTCTGCCCAG 150 | var(121):[T:0.01]
GATGGAACCA CTCTGTTCTT GTTCTAGGTG GTGTGGCTCC TGGCTAAGCT 200 | var(161):[A:0.32]
TGGTGTGCAG AGCCCCTTGC CCCCAGTCAC TGGCTCCAAC TGCCAGTGTA 250
ATGTGGAGGT GAGTGGGTAG GGGCCAACAG CTGGCAGCTC TGGTGGTAAG 300
GGGGCCCCGT GCAAGGACTG TAGGCCCCAC TGCAAACCCC CTCACGTGAG 350
GTGGCTAGGC TGAGCGGATT GTTAGGGTGC AGGCCATGGT GGCACCAGGC 400
CTCAGTCTGC ACCCCCCCTC TCTCAGGTGG TCAGAGCGCT CACGGTGATG 450 | var(415):[A:0.01] | var(419):[C:0.01]
TTGCACAGAC AGTGGCTGAC AGTGCGGAGG GCAGGGGGAC CCCCAAGGAC 500
CGACCAGCAG AGGCGGACAG TGCGCTGTCT GCGGGACACG GTGCTGCTGC 550 | var(501):[T:0.01]
TGCACGGCCT ATCGCAGAAG GACAAGCTCT TCATGATGCA CTGCGTGGAG 600
GTCCTGCATC AGTTTGACCA GGTGATGCCG GGGGTCAGCA TGCTCATCCG 650
AGGGCTTCCT GATGTGACGG ACTGTGAAGG TAAGCCTGCC AGAGGCCATC 700
CTGCCCAGCC CCCATGGCTT CTTCCAGAGG TTCCCCAACA AGTCAGATTC 750
CTGGGTGTCC CCTCAGCAGG CCCCCGCCCA CTGCAGCCTG TTCCAGCACT 800
GGGGCCATTT TCTTTTATCT TCCTGCCTCA GTTCTTCTCC AAGCATATTG 850
GGATGCCTTT TGCATCTATC TGTTGAGTGT GCCTGGCAGA GCCACGGTTT 900
TTCCAGAAAT AGCCGTGTCT GAATTGCCTT TGTATCACTT TGTTTGCAGT 950
AGCTGAGGGA GCAGGGCCTG GGTGTGGAAG GGACTGGTTA GTTCCTGCGG 1000
ACGTTGGGGG AGGAGAGGTG GGACCTGCCC TAGGCCCTGG CACCTTTGGG 1050
CCCTCACCAG GAACCTCTCC TTTTTGTCTC AGAGGCAGCC CTGGATGACC 1100
TCTGTGCCGC GGAAACCGAT GTGGAAGACC CCGAGGTGGA GTGTGGCTGA 1150
GGCCCTGAGT GTCCAGCCAC ATGGTGGCAC CAGCACCACT CCTTTCCTTA 1200
CCACATCAAC TGATTAAAGC AGTGACCAGC AGGAACTGCC CAGAGAACTG 1250
GCTGGCCTTG TTTCCTGAGT CTGATCTGTT TGGCGGAGTG GGAGGGGTGG 1300
AGCAGGACCC GGACCCTGAG TGGCTGGGAT CCTTCTTCCT GTCCCTGGCT 1350
GTTGCTGAGC CCGTCCCCAT GGTAACTGAT CTGCCTTGAG GAAGGAGCCC 1400
TGCCCTGCCT GTGGAATTGT CCTGAGTCAT TGCTTTGGGC TGGGGCCATG 1450 | var(1421):[-:0.01]
GGAAGAAACC ATTGTGTGGC AGGGAAGGAG GTGGCTCTTG GCCCAGGCCT 1500
AAACCAGGAA AGCCTGGGAA ACTGGGACCC ACAGGTGGGC ATGAAAGGGC 1550 | Exon 1 | UTR
CGCAGCAGGG GCTCCCAGCA GTGTGTAAGA CCGGGAGCTG GTCTGGCACC 1600
ACTGCCCTGG TCCTTCCAGC TGCCTGTCAC TGGTATGATG GCCCCGGTGC 1650
ATTGTGCCAC CAGCAGGCCA CAGCTGTGGA TCTTGGAAGG CCTCTGGGGT 1700
CCCCCGGGAG CAGGGGAGTG GGTGTGGGGG GGAACGGATG GTGGTGAGAG 1750
GGACAGACCA G
GCAGGCTGA CGAGCAGGGC GGGCCTGGCT CACGTGGGCC 1800 | var(1772):[A:0.01]
TGTAGGCGGG CCCACGCCAA GTTTCACTTC CCGCCACTGC TGCCAGCGAG 1850
AGCCGCGGGA GAGTGTGCAG CCGAGTCACT ACTGCCTGCC TGCCTGCCTG 1900 | var(1864):[C:0.11] | var(1872):[T:0.01]
CTACGGTGAG TGTGGCCCCC ACAATGGGAT GGCGCAGGGC AGGAGGGCCA 1950
TGGGTTCCCC CACCCCAGAC TAAGGGGGCA CTAGGGGAGG GGCCGAGTCA 2000
TGTGAAGAGG GAGACCCTCT CAGACAGTCG AATGTGCTGG TCCCACTAAG 2050 | var(2019):[G:0.01]
GAAACCACCT CACCCTCTCC AACTTCCTGC CTGAAAATGG GCCCTGGAGC 2100
TCGCAGACAG GGCAGGATTG TGCAGGGAAG GCCTGAGATG TGCTTCTGCC 2150
CACCCCCTAC CCCACTCCCT CCCCTTCGGA TCTTAACACT GGGCACTCAC 2200
ACACCCACCC CATGCTCCTC TCCAGGCTCA GCAGCAGGTA CGTACCCAAC 2250
CATGGGCTCG CAGGCCCTGC CCCCGGGGCC CATGCAGACC CTCATCTTTT 2300 | Exon 2 | UTR
                                   M  Q  T   L  I  F   6
TCGACATGGA GGCCACTGGC TTGCCCTTCT CCCAGCCCAA GGTCACGGAG 2350
F  D  M  E   A  T  G   L  P  F   S  Q  P  K   V  T  E  23
CTGTGCCTGC TGGCTGTCCA CAGATGTGCC CTGGAGAGCC CCCCCACCTC 2400
 L  C  L   L  A  V  H   R  C  A   L  E  S   P  P  T  S 40
TCAGGGGCCA CCTCCCACAG TTCCTCCACC ACCGCGTGTG GTAGACAAGC 2450 | var(2449):[A:0.01]
  Q  G  P   P  P  T   V  P  P  P   P  R  V   V  D  K   56
TCTCCCTGTG TGTGGCTCCG GGGAAGGCCT GCAGCCCTGC AGCCAGCGAG 2500
L  S  L  C   V  A  P   G  K  A   C  S  P  A   A  S  E  73
ATCACAGGTC TGAGCACAGC TGTGCTGGCA GCGCATGGGC GTCAATGTTT 2550
 I  T  G   L  S  T  A   V  L  A   A  H  G   R  Q  C  F 90
TGATGACAAC CTGGCCAACC TGCTCCTAGC CTTCCTGCGG CGCCAGCCAC 2600
  D  D  N   L  A  N   L  L  L  A   F  L  R   R  Q  P   106
AGCCCTGGTG CCTGGTGGCA CACAATGGTG ACCGCTACGA CTTCCCCCTG 2650
Q  P  W  C   L  V  A   H  N  G   D  R  Y  D   F  P  L  123
CTCCAAGCAG AGCTGGCTAT GCTGGGCCTC ACCAGTGCTC TGGATGGTGC 2700
 L  Q  A   E  L  A  M   L  G  L   T  S  A   L  D  G  A 140
CTTCTGTGTG GATAGCATCA CTGCGCTGAA GGCCCTGGAG CGAGCAAGCA 2750 | var(2713):[C:0.01]
  F  C  V   D  S  I   T  A  L  K   A  L  E   R  A  S   156
GCCCCTCAGA ACACGGCCCA AGGAAGAGCT ACAGCCTAGG CAGCATCTAC 2800 | var(2782):[T:0.29]
S  P  S  E   H  G  P   R  K  S   Y  S  L  G   S  I  Y  173
ACTCGCCTGT ATGGGCAGTC CCCTCCAGAC TCGCACACGG CTGAGGGTGA 2850
 T  R  L   Y  G  Q  S   P  P  D   S  H  T   A  E  G  D 190
TGTCCTGGCC CTGCTCAGCA TCTGTCAGTG GAGACCACAG GCCCTGCTGC 2900
  V  L  A   L  L  S   I  C  Q  W   R  P  Q   A  L  L   206
GGTGGGTGGA TGCTCACGCC AGGCCTTTCG GCACCATCAG GCCCATGTAT 2950
R  W  V  D   A  H  A   R  P  F   G  T  I  R   P  M  Y  223
GGGGTCACAG CCTCTGCTAG GACCAAGCCA AGACCATCTG CTGTCACAAC 3000
 G  V  T   A  S  A  R   T  K  P   R  P  S   A  V  T  T 240
CACTGCACAC CTGGCCACAA CCAGGAACAC TAGTCCCAGC CTTGGAGAGA 3050
  T  A  H   L  A  T   T  R  N  T   S  P  S   L  G  E   256
GCAGGGGTAC CAAGGATCTT CCTCCAGTGA AGGACCCTGG AGCCCTATCC 3100
S  R  G  T   K  D  L   P  P  V   K  D  P  G   A  L  S  273
AGGGAGGGGC TGCTGGCCCC ACTGGGTCTG CTGGCCATCC TGACCTTGGC 3150
 R  E  G   L  L  A  P   L  G  L   L  A  I   L  T  L  A 290
AGTAGCCACA CTGTATGGAC TATCCCTGGC CACACCTGGG GAGTAGGCCA 3200 | var(3163):[A:0.03] | UTR
  V  A  T   L  Y  G   L  S  L  A   T  P  G   E         304
AGAAGGAAAA TCTGACGAAT AAAGACCCCC GCTGCCCCAT
AGCACTGAGT 3250 | var(3233):[C:0.01]
GGTCAATTGG CTCCTACCCT TCTTGGCAGC ACAGACCTCT GCCCACACCC 3300
AGGGACCTGG GGAGGAGGGC ACAGTGTTTG TCCCTCACTT TCCCTAGCAG 3350 | var(3325):[C:0.01]
GATGGTCAAC TATCTGAGCC CAGTAAAAGT AGGGAAGACA CAACACAGAG 3400 | var(3387):[-:0.98]
AAGCCCAAAT GGATGGAAAG AGTACAGCCT GATTCCAATT CCAGCAGCCG 3450 | var(3412):[A:0.01]
AGGCCAGGAA GAAAGGGGGC AGCAGCTCCA AACGATTGCA TTTATTATAA 3500
ACAAGTGTAC AGACCCTAGA CTCAGAAACA CAACAGATTT GAGCTAAGAC 3550
AGCTCTGGTG AAACAGTAAT AGAGGGAGGA GGAACACGAG GTATTCATGT 3600
CTGGGCCAGA GCTGCCATCC AGGGCCCCAC ACCCCACCTT TGGTCCAGAT 3650
GGCCCATTGG CCCAGGTGTC CCTGCTGCCA GAACACCGTG GACTGGGGTA 3700
CAGGAGTTGT TGCATATTCC ATGAGGCTGG TGTCGGGAAG CAGGGACTCA 3750 | var(3713):[G:0.01]
CAGTTGCCAG GTTGTCCATC TCTGAGCCAA TTTCCCTCCA CAACCCAGGG 3800
GTTTCAGTCT CATATCAACT ATCATGTTTG AAACAGAAAA CAGGCAAAAT 3850
GTTTGGCTAA AATAAAATGA AAACACTGCA GGGAAGAGAA CTGAGTGTGC 3900
TGGTGGACAG GAGCCCTGCT CACCTGTGGG AAGGGCAGGG CCAGCAAGGG 3950
CAGCAGAGCT CCCTGGGGGC AGCTAGGCTG TGTGTGCATG TGGCCCTCCA 4000
GCTGGTCCCA GGGGAGATGC GGGGACAGGG GACAGTCCAG GCAGACAGGT 4050
ACAGCTGAGT AGGGCTCTGC CTGAGGTGTT CTGGCATCAG GAGGCTGCCT 4100
GATCCCCAAC AGGCATGACA GGCTCCAGGG AGCAATGGGA CATCTGCCCA 4150
AAGGATCAAA GTCCAACTTG GCCAGATCCC AAGCTTCGCC TGCATCATGT 4200
CCCTGGCTCT GCAACGGGTA CCCCCAACTC CGGGGACGAG CCATGGCCTC 4250
AAGCAGCAGC TGGCTACGCT GCCGAAACCA GGACACATCT GCATCACACA 4300
GAAAGCTGCG CCACCCTGGT GTGACAGGCC CTACTTGGTC ACCCTAGGGT 4350
AAGCTGGAGA AGAACTCCAG ATGTGCCCTG GAGAGGCCCC CACCTCTCAG 4400 | var(4391):[T:0.01]
GGGCCACCTC ACAGGGTGCC CCCCACCACC CCATTCTTTG AGTTTGGCTT 4450 | var(4412):[T:0.02]
GAGATTTTAG GAAGCATAAT TTCAGGTGAG GAAGAGAACA AAGTCTGGTC 4500
CCAGCCCACT CTGGCAAGGA TTGTTCCCCA CCTTGTCAGC ATCAGAGGAA 4550 | var(4532):[T:0.01]
GCCACATATA CAGGCAGGAC ACACACAGCA CACATGGGGC GTAAGGAACC 4600
GTGCCTGGAC ACACACAGCA CACATGGGGC GTAAGGAACC GCGCCTGCAC 4650 | var(4602):[C:0.01] | var(4643):[A:0.01]
ACCACTCACG CACACACACA ACATAACCAA GTGGCAGCCA GAGAGGCCAG 4700
GGAATGCTCA GAGGGCCGCC TTCGGGGCAT CCATGTAGGC CGGGTTGTAA 4750
GGAGGCTGGC TGGCGGGGTA GGGCGCGGCT GCTCCTCCTG AAAGCAGAGA 4800
GGACCCTGGT TGGCTGTGAG CATGGTGGGC TGCCGTGTGA GTGGCAGGCA 4850
AGCAGAAAGG GGCAGAGGCC TGTTGAGTGA TGTAGTTTGG GATGGGTGCC 4900
CGAGGGATGC TGGCAGAGAC TCGGGAAGTC GGGCAGGGCT AGAGTTGGCA 4950
GGGGCACTCA CCAGCCAGGG TCTCGTGGTA GGCCGGTGGG CCCATGGGCT 5000
GGGCTGGGTA AGGTGGTGGG TACTGCATTG GGTAGGGTGC TGCTGGCATC 5050
CCTGGCTGAG GCGGCATGGT GTGGTAGCCC TGGTAGCTTG GTCCAGGGTA 5100
GCTGGGCGGC ACACTTGGAG GCTGAGGATA AGGGGCATGC ACCACAGTGG 5150
TGGATGTGGT GGTGGTGACA ACCGCTGCAA AGAGAATTCC AGTCAGGACC 5200
CTCCTCCATC TCCCCAGGTC TTGAGAGCCA GGCTTGCCAC CCATCCCTCC 5250
AGCTTAGCCA AAGCAGGGCC TGGTCAGCTT CCCTTACCAC CCCAGGGGGT 5300 | var(5280):[C:0.01]
CACAGTGGGG CAGGGTGGGC ACGCTTACGA CGTGGTCGGC GGCACGTCTT 5350
GTAAAGGCAG CAGCAGGAGC AGGTGAAGCA GATGATGATA GTGACGACAG 5400
ACAGCACAAA GATGGTCAGG CCAACGGCCA AGGTCGCTCC GAACCTGCCA 5450
AAGAGCTAGA CGTGACCCGG GGCACCTCGC CCCTCCCCAG ACCAGCATCC 5500
ACACCTTCCC AAGGCATGCC CCTCTTGCCA GAAGGGGTCT GGGCAATACA 5550
GTTATAGCTA CTTCCTTGTC GGGTGGCCTG CACCTGTTTC AATCTGTTTC 5600
CTCTTGTGTA AACTGGGGTA TATGTGAGTC CCTGTAACTG TCTCTCCCTG 5650
GGTCTCCCCC GCTTGTCCCA CCCTCAGAGG CATGGGAGGA AGCTCTTCAA 5700
GTCCCATGCC ACACACATAC ATCTATCTTG TCCACCTCAC AACCAACTGA 5750 | var(5735):[T:0.01]
TCAGCAGATG GGTATAGGGC ACATGCCACA AGCCAGGCAC TGTGATTTGA 5800 | REPEAT
GTCAAAAAAC TTAACAGTGG GCAAGACAGC CAGCCCTGGC CTCTGGGAGC 5850
CCACAGTCCA GTGTAGGAGG CAGACAGTGA A