Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop hz 000181 T 0.01 A 0.99 0.01 000760 G 0.01 C 0.99 0.01 000879 T 0.01 C 0.99 0.02 001191 T 0.06 C 0.94 0.12 001506 A 0.23 C 0.77 0.35 001539 A 0.01 G 0.99 0.01 001652 T 0.14 G 0.86 0.24 002453 T 0.01 C 0.99 0.01 002466 A 0.01 C 0.99 0.01 002969 T 0.05 G 0.95 0.10 002980 A 0.03 G 0.97 0.07 003031 A 0.02 T 0.98 0.03 003348 C 0.06 T 0.94 0.12 003352 A 0.06 G 0.94 0.12 003373 A 0.01 G 0.99 0.01 003818 A 0.01 G 0.99 0.01 003903 + 0.02 - 0.98 0.03 003975 A 0.06 G 0.94 0.11 004086 T 0.06 C 0.94 0.12 004188 T 0.11 G 0.89 0.20 005146 T 0.02 C 0.98 0.05 005232 T 0.01 C 0.99 0.01 005462 A 0.01 G 0.99 0.01 005634 C 0.02 T 0.98 0.03 005704 A 0.01 C 0.99 0.01 005741 T 0.01 C 0.99 0.01 006412 T 0.01 C 0.99 0.01 006491 A 0.31 G 0.69 0.43 006608 T 0.01 C 0.99 0.01 006732 A 0.01 G 0.99 0.01 007378 C 0.01 G 0.99 0.01 007541 A 0.01 G 0.99 0.01 007587 A 0.01 G 0.99 0.01 007721 C 0.48 T 0.52 0.50 007818 G 0.03 A 0.97 0.06 007820 T 0.06 G 0.94 0.12 008198 A 0.02 G 0.98 0.03 008417 A 0.01 G 0.99 0.01 008516 T 0.01 C 0.99 0.01 009034 T 0.07 C 0.93 0.13 009083 T 0.01 C 0.99 0.01 009128 C 0.01 T 0.99 0.01 009145 A 0.42 G 0.58 0.49 009220 T 0.42 C 0.58 0.49 009262 G 0.01 C 0.99 0.01 009316 C 0.42 A 0.58 0.49 009461 A 0.42 G 0.58 0.49 009743 A 0.40 G 0.60 0.48 010162 G 0.49 A 0.51 0.50 010213 T 0.06 C 0.94 0.12 010361 A 0.01 G 0.99 0.02 010367 - 0.01 + 0.99 0.01 010464 - 0.42 + 0.58 0.49 010475 T 0.31 C 0.69 0.43 010757 A 0.01 G 0.99 0.01 010869 A 0.04 G 0.96 0.08 011247 - 0.01 + 0.99 0.02 011267 C 0.01 T 0.99 0.01 011309 C 0.01 G 0.99 0.01 011469 T 0.35 C 0.65 0.45 011540 A 0.46 G 0.54 0.50 011802 G 0.45 C 0.55 0.49 011982 A 0.01 G 0.99 0.02 012047 T 0.40 G 0.60 0.48 012610 A 0.01 C 0.99 0.01 013548 G 0.13 T 0.87 0.23 013761 G 0.07 T 0.93 0.13 013769 A 0.13 G 0.87 0.23 014064 T 0.01 C 0.99 0.01 014223 T 0.12 C 0.88 0.21 014401 G 0.49 C 0.51 0.50 014497 G 0.02 A 0.98 0.03 014543 + 0.48 - 0.52 0.50 014682 T 0.01 C 0.99 0.01 014741 A 0.11 G 0.89 0.20 014829 T 0.01 C 0.99 0.01 015344 A 0.03 G 0.97 0.06 016008 A 0.01 G 0.99 0.01 016220 T 0.01 C 0.99 0.01 016401 A 0.11 G 0.89 0.20 016915 A 0.01 C 0.99 0.01 016984 T 0.01 C 0.99 0.02 017630 A 0.01 G 0.99 0.01 017859 G 0.01 C 0.99 0.01 017965 G 0.02 C 0.98 0.04 018135 A 0.01 G 0.99 0.01 018141 A 0.40 C 0.60 0.48 018246 A 0.04 C 0.96 0.08 018591 A 0.01 C 0.99 0.02 018812 T 0.01 C 0.99 0.01 018879 A 0.04 G 0.96 0.08 018941 A 0.36 G 0.64 0.46 019457 C 0.14 T 0.86 0.24 019742 C 0.48 T 0.52 0.50 020004 A 0.06 C 0.94 0.12 020451 C 0.01 T 0.99 0.01 021042 A 0.01 G 0.99 0.01 021413 A 0.07 C 0.93 0.13 021456 T 0.02 C 0.98 0.03 021536 - 0.06 + 0.94 0.12 021564 C 0.01 G 0.99 0.01 021951 C 0.12 G 0.88 0.21 022356 A 0.01 C 0.99 0.01 022684 G 0.10 A 0.90 0.18 022746 A 0.06 G 0.94 0.11 022815 A 0.05 C 0.95 0.10 023147 C 0.39 T 0.61 0.48 023281 T 0.01 C 0.99 0.02 023554 A 0.01 T 0.99 0.01 023555 A 0.01 T 0.99 0.01 023717 T 0.49 C 0.51 0.50 023793 C 0.02 T 0.98 0.03 Note: pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 003903: ATGGGG 010367: GT 010464: AAG 011247: C 014543: ATTT 021536: CAGGAGG