CYP27B1 Color FASTA
The longest form of insertion/deletion sites is shown in the FASTA sequence and contain a '-' as the alternate allele in the variation tag.
*Display courtesy of GeneSNPs

ATGTCCTATA TAGGTACATC CGGCATAGCT GACCTCACCC AATGGATATA 50 | NOT SCANNED
TGGTTAGAAT TGGTAAGTAG AAGGAGACTC ACCTCACGGG CAGGGTGGGG 100
GGGCGTATTC CTATCCTGAC CTAGGAGAAA GGTTTGAAGC TGGGAGGCAG 150
ATGTTGCAGC GAGCCAAGAT CCTGTGGCCC AAACTTTAAA TTTAATTTTT 200
TTTAGAGACA GGCCCTCTCT CTGTTGCCTA GGCTGGAGTG CAGTGGTACA 250
ATCATAACTC ACTGCAGCCT TGACCTCCCG GGCTCATGTA ATCCACCTCA 300
GCCTCTCAAG GCACTACAGG CATACGCCAC CATGCCTGGC TAATTTTTGT 350 | var(305):[G:0.01]
ATTTTTTGTA GAGACAGTTC CACTATGTTG CCCAGGCTGG TCTCAGACTC 400 | var(358):[A:0.01] | var(371):[G:0.38]
CTGAGCTCAA GCAGTCTGCC CACCTTAGCC TCCCAAAGTG TTGGGATTAC 450
AGTCATGAGC TGCCGTGCCC AGCCTAATTT TTAAACTTCT TCTGTAGAGA 500
CAGTCTTGCT ATGTTGCTCA AGCTTGTCTC AACCTCCTGG CCTCATGCCA 550
TCCTCCTGCC TCAGCCTCCC AAAGTGCTGG GATTATAGGC ATGAGCCACC 600
ACAGGATTCT GAGGCTAAAA GTAGAAAGGA GCTGCTAACC AGAAAGCCCC 650
CCAGAGGAGA CCGAGTCAGC TGGGGAATTA GAACATCCAC ATCCATTTAG 700
CTCCTCTAAC ACCCCACAGA CAATCTCTGA ACTTAACTAA TGTACAAAAA 750
GTTTCATTTC TGCTTCTCAA GCCCCAAATT CCCATGTCTG GAAGGAGGGG 800
GCTTGTATAC CCAAGAGACC CCCTTATCCT CAAGAAAGAA AGATGGAGGT 850
TCTAGGAGCC ATTTTAGCCC ATTAACCCAC CTGCCATCTG CCCAGTATAT 900
GTTAGGTACA GGAGGAGGGG GAGGTGTGGC TAGTGCAGGA AAATAATGCA 950
GAGAAGATAC AACCCACTAA GCCAAGAATG TGGGGACAGT TACAGCTGTG 1000
CCTCCCCTGC TTCCCTTCCT GGAGGAGCTG AAAGATGGGG AATTCCTGAG 1050
GATGGGCCTA AAGGGGCTGG GCTCACTGGT AGAAGTGGGA ATATCAGAGA 1100
CTGACTAGTG TAGCTTGGTC ACCTAGTCCC TACTAAAAAG CCTTATAGCC 1150
TTTCCTAGGA TGAGACTTTG AGGCTCCTAG ACAAAGGCAC TCTCCCAGGA 1200
GGAAAATCTT AGGCCCTCCC TCCCATGAGG GTCATTGCAA CATGAGACCC 1250
AAGGGAGTTG TGAAGTCAGC CCCAGCCCCG CCTACTGTTC CTGGGTGCTA 1300
ATCCCCAGCA CAGACCACTC AGGAGGAGGG ATTGGCTGAG GAGCTTGGAG 1350
AGGGGGCGTC ATCACCTCAC CCAAAGGTTA AATAGGGGTT GAGATATGAT 1400 | Exon 1 | UTR
GCTCAGGAGA AGCGCTTTCT TTCGCGAGCA CCCTGAACCA GACCA
TGACC 1450
                                                 M  T  2
CAGACCCTCA AGTACGCCTC CAGAGTGTTC CATCGCGTCC GCTGGGCGCC 1500
 Q  T  L   K  Y  A  S   R  V  F   H  R  V   R  W  A  P 19
CGAGTTGGGC GCCTCCCTAG GCTACCGAGA GTACCACTCA GCACGCCGGA 1550
  E  L  G   A  S  L   G  Y  R  E   Y  H  S   A  R  R   35
GCTTGGCAGA CATCCCAGGC CCCTCTACGC CCAGCTTTCT GGCCGAACTT 1600
S  L  A  D   I  P  G   P  S  T   P  S  F  L   A  E  L  52
TTCTGCAAGG GGGGGCTGTC GAGGCTACAC GAGCTGCAGG TAGGAAGGGA 1650
 F  C  K   G  G  L  S   R  L  H   E  L  Q              65
CGCCTTTCCC GAGACAGAGT GCTGGGGAAA CTGGTTTTGA CAGCGTCAGA 1700
AAGGACTGAC TAGTGCAGAG CAAATGTGGG ACAGCCAGAG AGAACGGATG 1750
CCCATGAAAT AAGGAAAAGG CGAGTTGAGG CTGGGGGCGG TGTGGCTACA 1800
CTCGGGCAGA GCCCGTCCCG ACTCTTAGCA GAGGGCGCTG CGAAAGCGCC 1850
TTCTCGCTGT CCTGAGGTGT GGAGATCCTG CAGATAAAGT ACAAGTGCGC 1900 | var(1896):[C:0.03]
GGGAGGGGGA GGCCGGAGTG GGCAGTACCC TCCGCCTGCT TGCGGCTTAA 1950 | var(1914):[G:0.01]
AGCTACATGG GTTCCTTTTC ATTCACTGAG GACTCGTCCT GAGATGGACA 2000
GTCCAGACAT GGAACTTTTA GAGATTTCTC CTCGACCGAG ATGATCAGAG 2050
AGGTCCTGAA TGTCTGCCTT GCACAAAGTT CCGGTTTTGC CCATCACACT 2100
CAAACTTTCT AGGGATGGGA AATGAGAGAG GAGGAGTTTG CAGTATCAAA 2150
GGCATACACT AGTTGGGCAC CCGAGAAAGA GCAGAAGCTC CCTATTCCCA 2200
AGCCCAGTCA ACGCCCTTGG CGTGGGCACA GGTCAAGCTG AAAGTCCCCG 2250
CCCAGGTATC CAAGTGTCCG CTGTGTCCGC TCCCCCAGGT GCAGGGCGCC 2300 | Exon 2
                                          V   Q  G  A  69
GCGCACTTCG GGCCGGTGTG GCTAGCCAGC TTTGGGACAG TGCGCACCGT 2350
 A  H  F   G  P  V  W   L  A  S   F  G  T   V  R  T  V 86
GTACGTGGCT GCCCCTGCAC TCGTCGAGGA GCTGCTGCGA CAGGAGGGAC 2400
  Y  V  A   A  P  A   L  V  E  E   L  L  R   Q  E  G   102
CCCGGCCCGA GCGCTGCAGC TTCTCGCCCT GGACGGAGCA CCGCCGCTGC 2450
P  R  P  E   R  C  S   F  S  P   W  T  E  H   R  R  C  119
CGCCAGCGGG CTTGCGGACT GCTCACTGCG TGAGTCTTCT CTGCCCCCAG 2500
 R  Q  R   A  C  G  L   L  T  A                        129
AAGCCCAGAC GCCCTGCAGC GGCCCTCTCC TGCTGCGGGT CCCGAAACTA 2550
TCAATCTGGG GGCATGGTGG GAGGTCGGCT GTCCCACTCT ACCATTGGGC 2600
ATCTTGGGGT TCCCATCCCA GTCTGCTTCA CCCACACTCA GGTTGAGCCC 2650
CAACCTCACT CCCCGCCTAC CTCCTTATCC TTTGAGGCCC GAATCCTGGG 2700
AACTGGGGGA ACCGGAGGAA TTGGGCTAGG GTACAAGGAT CTGGATGGAA 2750
TGAATGTAAG GTTCTGTGAC TCAAGTTACC CGGGAACCCC GGCCCCTGAG 2800
GGCAGGAAAT GAGTAAAGAG GAAGGGGGCT GGAAGACAGG CGCAGGCCGG 2850
TGCAGGTTTC CGTACCCCAA GGGGGCAGAC GCAATCCCTC TCCTGGCCAC 2900
CGCAGCCGAA CGCGCTCCTT CACTGCAGCC AGTCCCGTCG AGCCGTCCCC 2950
ACCTTCCCGA TGCGCACTCT CTCCTCAACC CTGCAGGGAA GGCGAAGAAT 3000 | Exon 3
                                         E   G  E  E   133
GGCAAAGGCT CCGCAGTCTC CTGGCCCCGC TCCTCCTCCG GCCTCAAGCG 3050
W  Q  R  L   R  S  L   L  A  P   L  L  L  R   P  Q  A  150
GCCGCCCGCT ACGCCGGAAC CCTGAACAAC GTAGTCTGCG ACCTTGTGCG 3100 | var(3096):[C:0.02]
 A  A  R   Y  A  G  T   L  N  N   V  V  C   D  L  V  R 167
GCGTCTGAGG CGCCAGCGGG GACGTGGCAC GGGGCCGCCC GCCCTGGTTC 3150
  R  L  R   R  Q  R   G  R  G  T   G  P  P   A  L  V   183
GGGACGTGGC GGGGGAATTT TACAAGTTCG GACTGGAAGG TGAGTCCCAG 3200
R  D  V  A   G  E  F   Y  K  F   G  L  E               196
GACAGAGCTG GGCAGGCGTC GGGGGCGCCC TACCAGAGCC TCCCGGAACC 3250
CTGACGGCGC CCCCTCCCGA CAAGGCATCG CCGCGGTTCT GCTCGGCTCG 3300 | Exon 4
                          G  I   A  A  V  L   L  G  S  205
CGCTTGGGCT GCCTGGAGGC TCAAGTGCCA CCCGACACGG AGACCTTCAT 3350
 R  L  G   C  L  E  A   Q  V  P   P  D  T   E  T  F  I 222
CCGCGCTGTG GGCTCGGTGT TTGTGTCCAC GCTGTTGACC ATGGCGATGC 3400
  R  A  V   G  S  V   F  V  S  T   L  L  T   M  A  M   238
CCCACTGGCT GCGCCACCTT GTGCCTGGGC CCTGGGGCCG CCTCTGCCGA 3450
P  H  W  L   R  H  L   V  P  G   P  W  G  R   L  C  R  255
GACTGGGACC AGATGTTTGC ATTTGGTAAG GCACAGGTCG AGGTGGAAAT 3500
 D  W  D   Q  M  F  A   F                              263
GGGGGAATGT AAAGCTGTCC AGGGGTAGCG AGGTATTCAC GTGCCTTCTA 3550
CCCACGCAGC TCAGAGGCAC GTGGAGCGGC GAGAGGCAGA GGCAGCCATG 3600 | Exon 5
         A   Q  R  H   V  E  R   R  E  A  E   A  A  M  277
AGGAACGGAG GACAGCCCGA GAAGGACCTG GAGTCTGGGG CGCACCTGAC 3650
 R  N  G   G  Q  P  E   K  D  L   E  S  G   A  H  L  T 294
CCACTTCCTG TTCCGGGAAG AGTTGCCTGC CCAGTCCATC CTGGGAAATG 3700
  H  F  L   F  R  E   E  L  P  A   Q  S  I   L  G  N   310
TGACAGAGTT GCTATTGGCG GGAGTGGACA CGGTGAGGTT CTCCCTCCGT 3750 | var(3711):[A:0.01]
V  T  E  L   L  L  A   G  V  D   T                     321
GCTGTGAGCC GGTTCCAGGG CTTAGCCTCC GCAGACTCCG GCTCCATTTT 3800
TCTGTTGCAG GGGATCCATT ATGGCCACGT AGACCAGCTT GGCTTAGCAC 3850
CCTGTAGCCC CAGACTCTTC CATAATCTGC ACCCTCTGCT GGGTTCTCAC 3900
ACCCAACACC TCTCTTGCTT TCACATGTTT TTCAGGTGTC CAACACGCTC 3950 | Exon 6
                                       V  S   N  T  L  326
TCTTGGGCTC TGTATGAGCT CTCCCGGCAC CCCGAAGTCC AGACAGCACT 4000
 S  W  A   L  Y  E  L   S  R  H   P  E  V   Q  T  A  L 343
CCACTCAGAG ATCACAGCTG CCCTGAGCCC TGGCTCCAGT GCCTACCCCT 4050
  H  S  E   I  T  A   A  L  S  P   G  S  S   A  Y  P   359
CAGCCACTGT TCTGTCCCAG CTGCCCCTGC TGAAGGCGGT GGTCAAGGAA 4100
S  A  T  V   L  S  Q   L  P  L   L  K  A  V   V  K  E  376
GTGCTAAGGT GAGGGGGAAG GAGAGGAGGA ACAAGAGGAA ATGCCAAGGA 4150
 V  L  R                                               379
AGGGCTGGGG AAGCAACTAG TGGATGGAAG CAGGGAGATA GCAGAGAAAA 4200 | var(4165):[G:0.02]
ATGGCCCTCT ACTCCTGGCC AAAAAGGGTT TGGAAGTTGG AAACAATGAG 4250
AAGGGGGCTG CAGCCCCTAG CCTCATCTTG TTGTCTCCAT TTTGTGCTTT 4300 | var(4281):[C:0.45]
GCAACCTAGA CTGTACCCTG TGGTACCTGG AAATTCTCGT GTCCCAGACA 4350 | Exon 7
            L  Y  P   V  V  P  G   N  S  R   V  P  D   392
AAGACATTCA TGTGGGTGAC TATATTATCC CCAAAAATGT GAGTAAAGCC 4400
K  D  I  H   V  G  D   Y  I  I   P  K  N               405
TATGCACCCT TTCTACTGAG CCATTCCTCA CTATCTTGGG CCCCAACCCT 4450
GTTCTCAAAC ACTCTCCTAA AAGCCCTTCA AACACTCCCC TTGACCCCTC 4500
TCTAGGATAT GCCTTTCTAG GATGTAATGG AACAGTGGGG AGATCCTTCC 4550
AAAAGTAGCC CCAGAAAACT TCCCCATCAC CCACCAGGAC CTGCCTTTGT 4600
CCCTGTCTGA ATATCCTCTT CTTCATGCCT GCCCTATTCT GAGCCCAAAC 4650
TGACAAGTTT GTTTTCCTTT GCACCAGACG CTGGTCACTC TGTGTCACTA 4700 | Exon 8
                              T   L  V  T   L  C  H  Y 413
TGCCACTTCA AGGGACCCTG CCCAGTTCCC AGAGCCAAAT TCTTTTCGTC 4750
  A  T  S   R  D  P   A  Q  F  P   E  P  N   S  F  R   429
CAGCTCGCTG GCTGGGGGAG GGTCCCACCC CCCACCCATT TGCATCTCTT 4800
P  A  R  W   L  G  E   G  P  T   P  H  P  F   A  S  L  446
CCCTTTGGCT TTGGCAAGCG CAGCTGTATG GGGAGACGCC TGGCAGAGCT 4850
 P  F  G   F  G  K  R   S  C  M   G  R  R   L  A  E  L 463
TGAATTGCAA ATGGCTTTGG CCCAGGTGAG TGCTCTAGAT TTTATACCTT 4900
  E  L  Q   M  A  L   A  Q                             471
CCCCAGACTG GAGAGACCCT AACCCTCTAA AGTTGTGAGC TCTTTCCCCT 4950
GACAAGCATA GGAAATCATA TAAGACCTGG TAGAATGAAT CTTCTGAAAT 5000 | var(4966):[C:0.02] | var(4988):[C:0.05]
ATGATAAGCC CATTATAGGC CTGGAGTGTA AGTGAGGGTA TTCAAACTAT 5050
TTTTTCCCTA CCATAATCCC TCACCCTTAT TAACCAAGAA GTCCCCTACT 5100
GGCCACAGGT GCCACCCAAT CATTGACCAT TCTAACACTA ATAATGCATG 5150 | var(5136):[T:0.03]
CCCTTTACCA ATTGGATTAC CAATGAATCC CCCCATTATA GATATCTTTC 5200
ATAGTAATGC TCACCTTCTT CCCTTTCCAG ATCCTAACAC ATTTTGAGGT 5250 | Exon 9
                                  I  L  T   H  F  E  V 478
GCAGCCTGAG CCAGGTGCGG CCCCAGTTAG ACCCAAGACC CGGACTGTCC 5300 | var(5269):[A:0.01]
  Q  P  E   P  G  A   A  P  V  R   P  K  T   R  T  V   494
TGGTACCTGA AAGGAGCATC AACCTACAGT TTTTGGACAG ATAGTCCCAT 5350 | UTR
L  V  P  E   R  S  I   N  L  Q   F  L  D  R            508
GGAAAGAGAC TGTCATCATC ACCCTTTCAT TCATCATAGG GATAAGATTT 5400
TTTGTAGGCA CAAGACCAAG GTATACATCT TCCCCTAATG CCTATCTGAC 5450 | var(5421):[A:0.02]
CAAACTGGAT AGAACCACCA TAGTGAAGTG TGAGGCGGCC CTGACCAATG 5500
TGTGAAGTAT GCACTTGGCC TGACTCAGGA AGCCAGGTGA GAAAACCATG 5550
GTCTCTCTGC TTGCTTGGCC CTTCTGATCA TGTATGCATC CCCCAAGGAT 5600
GAAATCAGAT TTTAACTAAT AATGCTGGAT GGCCTGAGGA AAGATTCAAC 5650
TGCCTCTCTT TTTGGGCTTT CATAGTGTTC ATTGATGCTG CTGGCTAAGC 5700
ATTTATCAAA GCATAAGCTC AGTAACTGTG CATCTGGTCT GTACCTGGTT 5750
GGTCCTTCGT CTTTGCATGT AAGCTCTTTG AGAGGAAGGG TGAAGCCTTA 5800 | var(5759):[A:0.01]
TTTGTTTTTT ATGTCCCCTG CCAGGGCCTG TCTCTGACTA GGTGTCACCA 5850
TACACATTCT TAGATTGAAT CTGAACCATG TGGCAGAAGG GATAAGCAGC 5900
TTACTTAGTA GGCTCTGTCT ACCCCCTTCC TTCTTTGTCT TGCCCCTAGG 5950
AAGGTGAATC TGCCCTAGCC TGGTTTACGG TTTCTTATAA CTCTCCTTTG 6000
CTCTCTGGCC ACTATTAAGT GGGTTTGCCC CATCACTTAG TTCTCAGGCA 6050
GAGACATCTT TGGGCCTGTC CCTGCCCAGG CCTCTGGCTT TTTATATTGA 6100
AAATTTTTAA ATATTCACAA ATTTTAGAAT AAATCAAATA TTCCATTCTT 6150
GATTTTGACT TATTTCTCTC ATATTCCCAC TTCCTACAAG ACCTGGAGGC 6200
AAGACTCTAA CCCTCCCATC TCCCACCTTG GTTTCTCAGG TCCTGGGGGT 6250
GACCCCCATA ACAATGGGAG GTCTGGACGC CTGGAAGAGT AGTTTGTAAC 6300 | var(6284):[A:0.01]
ACAAACCCAG ACATGTTTCT GTCTGTAGTG GGAACATCCA AGTCTAGTCT 6350
GGCTTCCTGT AAGAGATTAA GGGGGTGGGG GGTGAAAAGT AACGGCAGGG 6400
GCTAAGCTGT AAAATGGGCC CGGAGCTAGG GATTTGCAGA CATGGGCAGA 6450
GGTTGCTGAC TCTGGTAAGG AAAGTGCTTT TGGACTGCCA GGATTGAAGG 6500
AAGTCCTAGA TTGGTCACTT TGCCCTCTCT GGAAAAGTTG TTCCAAGATA 6550
ATTTCCTTCA GAGGAAGGGA TACAAGCAGA GAAGTGGAAT CAGACAGACA 6600
GAATGAAAGC TGAGTGTGGG GGTGGCCAGA AGCCCTGGGG CACTGAGGCA 6650
GGATAAGGGC GGTGGGCAGA GGGAGACTGT TTCCCTAAGT CAGCATTCTC 6700
TGGCCCCCCA GAGGCTGGGC ACAGCTCTCC TCTTGTGATG TATACAGATT 6750
AACTCATCTT CCATCCAAAT AAATCTCTCA GCACACTGCA CAGTTCCTTC 6800
TGCATCCCAG ATTACCCTTC CCATGTCAGG ACTTGCCCCC CTTCCCCTAC 6850
CGCTCACCCT ATTCCAATTA GCTGGGTGTA GATGGAGATT TCACTTCACA 6900
CTTCTTCCTC CTCCACACCT TGGCCTCCTG GCCTAGACAT GGCTCCCTGA 6950
CCGCAGAAAC TCCAGTAGCC ACCAGGCCTT TTGCAGGGGC ATCTAATTAT 7000
GCAAGATCTA CAGAGGGGCA GGGCAGACCC AAAGCCTCGT ACAAAGATCA 7050 | var(7047):[T:0.02]
AGGTTTCTGT GCATTTTCTG CCCTTCTCAA CTCCTTCCCT ACTGTATACT 7100
CAGTCTCCAC CCCTATTCCT CTATCACTGA ACTCAATTTG AACCTAAATG 7150
ACCAAATTTT CAGCAGATTT GATCTTTGAG GGAGAATAAA GCCCAGCTTG 7200
TCAGACCCTT TACCCTGGAA TCAGTGATGA GAATTCTGCC CATCCGTACT 7250 | var(7246):[A:0.01]
CCCTATTTTC CACTGGGCAA GTAGGAATGC CCACTTGAAG AGGGCAGCAG 7300
TTCCCATGAC CCTTTCCTGG ACAATGATCT TTTTAAGTTG GAAAAAGGAA 7350
GAAGAGGAGA CCATACTGAT TGCTGGCCCC AACTCCCATA CCAAGACTTC 7400
CATTAGTGCT GAAGGAGAGG GGAAAGTGTC CCACTTGGCC TCATTTTAGG 7450
ACCCAGAGTG TAAATGGATA CAGTGTGTTT GTGTGTGAGT ATGTCTATTT 7500
TCTTTGGTAT GTCTAACCTT CCCTGCAGAG CCATCACAGA GGACAGCTCA 7550
GGCTTGGCAC AGGAAGCTCC ACATGTGTCC TATCTAC