Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000331 A 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 000645 C 0.34 0.00 0.05 0.00 0.09 T 0.66 1.00 0.95 1.00 0.91 0.45 0.00 0.09 0.00 0.17 000965 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.94 1.00 1.00 1.00 0.99 0.10 0.00 0.00 0.00 0.02 001325 A 0.09 0.02 0.00 0.00 0.03 G 0.91 0.98 1.00 1.00 0.97 0.17 0.04 0.00 0.00 0.06 001349 C 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 T 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 001475 A 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 001531 - 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 001630 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001741 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 001901 G 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 002059 C 0.20 0.00 0.05 0.00 0.07 T 0.80 1.00 0.95 1.00 0.93 0.32 0.00 0.09 0.00 0.13 002213 T 0.39 0.02 0.05 0.00 0.13 C 0.61 0.98 0.95 1.00 0.87 0.48 0.04 0.09 0.00 0.22 002503 T 0.35 0.52 0.36 0.21 0.36 C 0.65 0.48 0.64 0.79 0.64 0.46 0.50 0.46 0.33 0.46 002536 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 002599 T 0.09 0.02 0.00 0.00 0.03 C 0.91 0.98 1.00 1.00 0.97 0.17 0.04 0.00 0.00 0.06 002835 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.03 002947 A 0.25 0.00 0.03 0.00 0.08 G 0.75 1.00 0.97 1.00 0.92 0.38 0.00 0.05 0.00 0.15 003234 - 0.35 0.00 0.05 0.00 0.12 + 0.65 1.00 0.95 1.00 0.88 0.46 0.00 0.10 0.00 0.21 004022 C 0.06 0.02 0.00 0.00 0.02 T 0.94 0.98 1.00 1.00 0.98 0.10 0.04 0.00 0.00 0.04 004524 A 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 0.00 0.03 004533 A 0.10 0.02 0.00 0.00 0.03 G 0.90 0.98 1.00 1.00 0.97 0.18 0.05 0.00 0.00 0.06 004733 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 005057 G 0.57 0.57 0.38 0.21 0.44 A 0.43 0.43 0.62 0.79 0.56 0.49 0.49 0.47 0.33 0.49 005236 T 0.21 0.00 0.05 0.00 0.07 G 0.79 1.00 0.95 1.00 0.93 0.33 0.00 0.09 0.00 0.13 005880 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 006161 A 0.00 0.07 0.00 0.00 0.02 G 1.00 0.93 1.00 1.00 0.98 0.00 0.13 0.00 0.00 0.03 006329 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 006542 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 006670 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 006685 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 006766 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 006997 G 0.40 0.02 0.05 0.00 0.13 A 0.60 0.98 0.95 1.00 0.87 0.48 0.04 0.09 0.00 0.23 007099 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 007123 C 0.23 0.00 0.05 0.00 0.08 A 0.77 1.00 0.95 1.00 0.92 0.36 0.00 0.09 0.00 0.14 007124 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 007134 T 0.15 0.02 0.00 0.00 0.05 C 0.85 0.98 1.00 1.00 0.95 0.26 0.04 0.00 0.00 0.09 008699 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 008893 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 009054 A 0.07 0.02 0.00 0.00 0.03 G 0.93 0.98 1.00 1.00 0.97 0.14 0.05 0.00 0.00 0.05 009064 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 009328 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 009692 T 0.04 0.19 0.12 0.29 0.16 C 0.96 0.81 0.88 0.71 0.84 0.07 0.31 0.21 0.41 0.26 010060 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 010234 A 0.19 0.00 0.05 0.00 0.06 G 0.81 1.00 0.95 1.00 0.94 0.30 0.00 0.10 0.00 0.12 010463 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 010509 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 012346 C 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 012485 G 0.03 0.00 0.02 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.05 0.00 0.02 012838 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 013240 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 013292 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 013383 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 014647 - 0.24 0.42 0.53 0.79 0.47 + 0.76 0.57 0.47 0.21 0.53 0.37 0.49 0.50 0.33 0.50 014658 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 014783 - 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.05 0.00 0.02 015140 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 015202 T 0.04 0.32 0.34 0.15 0.20 C 0.96 0.68 0.66 0.85 0.80 0.07 0.43 0.45 0.25 0.32 015432 G 0.37 0.02 0.05 0.00 0.12 C 0.63 0.98 0.95 1.00 0.88 0.46 0.04 0.09 0.00 0.21 016052 C 0.17 0.02 0.00 0.00 0.05 T 0.83 0.98 1.00 1.00 0.95 0.28 0.04 0.00 0.00 0.10 016771 T 0.02 0.00 0.05 0.00 0.02 C 0.98 1.00 0.95 1.00 0.98 0.04 0.00 0.09 0.00 0.03 016975 T 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 017732 A 0.17 0.03 0.00 0.00 0.04 G 0.83 0.97 1.00 1.00 0.96 0.28 0.05 0.00 0.00 0.08 017940 T 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.06 0.00 0.00 0.00 0.01 017943 T 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.06 0.00 0.00 0.00 0.01 018032 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018161 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 018201 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 019118 T 0.00 0.07 0.00 0.00 0.02 G 1.00 0.93 1.00 1.00 0.98 0.00 0.14 0.00 0.00 0.03 019148 T 0.08 0.03 0.00 0.00 0.03 C 0.92 0.97 1.00 1.00 0.97 0.14 0.05 0.00 0.00 0.05 019381 T 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 C 1.00 1.00 1.00 0.92 0.98 0.00 0.00 0.00 0.15 0.04 019682 T 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 019700 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 019714 G 0.23 0.00 0.05 0.00 0.08 A 0.77 1.00 0.95 1.00 0.92 0.36 0.00 0.09 0.00 0.14 020043 G 0.36 0.02 0.03 0.00 0.11 A 0.64 0.98 0.97 1.00 0.89 0.46 0.04 0.05 0.00 0.19 020212 T 0.19 0.00 0.03 0.00 0.06 G 0.81 1.00 0.97 1.00 0.94 0.31 0.00 0.05 0.00 0.11 020230 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 020323 A 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 020506 A 0.05 0.17 0.14 0.31 0.17 G 0.95 0.82 0.86 0.69 0.83 0.10 0.29 0.24 0.43 0.28 020597 + 0.06 0.02 0.00 0.00 0.02 - 0.94 0.98 1.00 1.00 0.98 0.10 0.05 0.00 0.00 0.04 020685 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 020691 A 0.37 0.02 0.05 0.00 0.12 G 0.63 0.98 0.95 1.00 0.88 0.47 0.04 0.09 0.00 0.21 020920 T 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 021052 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 021113 A 0.02 0.00 0.00 0.02 0.01 G 0.98 1.00 1.00 0.98 0.99 0.04 0.00 0.00 0.04 0.02 021178 T 0.00 0.00 0.00 0.07 0.02 C 1.00 1.00 1.00 0.93 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 021542 T 0.22 0.00 0.05 0.00 0.07 C 0.78 1.00 0.95 1.00 0.93 0.35 0.00 0.09 0.00 0.14 021969 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 022097 G 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 022476 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 022537 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 022548 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 022677 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 022780 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 022817 T 0.06 0.02 0.00 0.00 0.02 C 0.94 0.98 1.00 1.00 0.98 0.12 0.04 0.00 0.00 0.04 022867 T 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 022947 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 022956 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 023139 - 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 023239 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 023459 - 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 + 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 023479 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 023686 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 024973 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 025102 T 0.00 0.00 0.24 0.21 0.11 C 1.00 1.00 0.76 0.79 0.89 0.00 0.00 0.36 0.34 0.19 025119 A 0.23 0.43 0.55 0.81 0.50 T 0.77 0.57 0.45 0.19 0.50 0.35 0.49 0.49 0.31 0.50 025148 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 025691 A 0.19 0.00 0.05 0.00 0.06 C 0.81 1.00 0.95 1.00 0.94 0.31 0.00 0.09 0.00 0.12 025718 C 0.12 0.00 0.02 0.00 0.04 T 0.88 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.04 0.00 0.07 025949 C 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 026065 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 026119 - 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 026476 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 026512 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 026583 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 026692 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 026736 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 026958 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 026961 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 027357 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 027533 T 0.24 0.00 0.03 0.00 0.07 C 0.76 1.00 0.97 1.00 0.93 0.36 0.00 0.05 0.00 0.14 027616 G 0.06 0.02 0.00 0.00 0.02 A 0.94 0.98 1.00 1.00 0.98 0.11 0.05 0.00 0.00 0.04 027860 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 027953 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 028174 T 0.19 0.00 0.05 0.00 0.06 C 0.81 1.00 0.95 1.00 0.94 0.30 0.00 0.09 0.00 0.11 028482 A 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 028550 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 028584 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 028591 G 0.00 0.07 0.00 0.00 0.02 A 1.00 0.93 1.00 1.00 0.98 0.00 0.13 0.00 0.00 0.03 028820 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 028912 G 0.26 0.55 0.36 0.21 0.34 A 0.74 0.45 0.64 0.79 0.66 0.38 0.50 0.46 0.33 0.45 029072 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 029255 T 0.13 0.02 0.00 0.00 0.04 C 0.87 0.98 1.00 1.00 0.96 0.23 0.04 0.00 0.00 0.08 029289 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 029604 A 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 029812 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 029876 G 0.06 0.02 0.00 0.00 0.02 A 0.94 0.98 1.00 1.00 0.98 0.10 0.04 0.00 0.00 0.04 030030 A 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 030136 C 0.35 0.52 0.35 0.21 0.35 T 0.65 0.48 0.65 0.79 0.65 0.45 0.50 0.45 0.33 0.46 030250 C 0.00 0.07 0.00 0.00 0.02 G 1.00 0.93 1.00 1.00 0.98 0.00 0.13 0.00 0.00 0.03 030301 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 030332 T 0.06 0.02 0.00 0.00 0.02 C 0.94 0.98 1.00 1.00 0.98 0.10 0.04 0.00 0.00 0.04 030365 G 0.20 0.00 0.05 0.00 0.07 C 0.80 1.00 0.95 1.00 0.93 0.32 0.00 0.09 0.00 0.13 030549 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 030571 T 0.12 0.02 0.00 0.00 0.04 A 0.88 0.98 1.00 1.00 0.96 0.20 0.04 0.00 0.00 0.07 030734 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 030832 C 0.41 0.03 0.05 0.00 0.13 T 0.59 0.97 0.95 1.00 0.87 0.48 0.05 0.09 0.00 0.23 031383 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 031601 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 031997 G 0.26 0.55 0.36 0.21 0.34 A 0.74 0.45 0.64 0.79 0.66 0.38 0.50 0.46 0.33 0.45 032226 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 032297 C 0.37 0.02 0.05 0.00 0.12 T 0.63 0.98 0.95 1.00 0.88 0.47 0.04 0.09 0.00 0.21 032341 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 032368 C 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 033239 C 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 033382 G 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.05 033576 A 0.00 0.00 0.09 0.03 0.03 G 1.00 1.00 0.91 0.97 0.97 0.00 0.00 0.17 0.05 0.05 033630 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 033658 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 033917 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 034694 A 0.12 0.11 0.15 0.17 0.13 C 0.88 0.89 0.85 0.83 0.87 0.20 0.19 0.25 0.28 0.23 034705 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 034878 C 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 035831 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 036471 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 036843 A 0.35 0.55 0.36 0.21 0.36 T 0.65 0.45 0.64 0.79 0.64 0.46 0.50 0.46 0.33 0.46 037125 A 0.31 0.02 0.05 0.00 0.11 G 0.69 0.98 0.95 1.00 0.89 0.43 0.04 0.09 0.00 0.19 037133 A 0.31 0.02 0.05 0.00 0.11 G 0.69 0.98 0.95 1.00 0.89 0.43 0.04 0.09 0.00 0.19 037215 C 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 037582 - 0.00 0.05 0.02 0.00 0.02 + 1.00 0.95 0.98 1.00 0.98 0.00 0.10 0.04 0.00 0.03 037663 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 037694 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 038178 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 038368 T 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 038390 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 038536 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 038768 C 0.22 0.00 0.05 0.00 0.07 G 0.78 1.00 0.95 1.00 0.93 0.35 0.00 0.09 0.00 0.14 039029 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 039137 C 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.10 0.00 0.00 0.02 039436 - 0.44 0.57 0.40 0.21 0.40 + 0.56 0.43 0.60 0.79 0.60 0.49 0.49 0.48 0.33 0.48 039450 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 039466 A 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 039537 G 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 039585 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 039605 G 0.20 0.00 0.03 0.00 0.07 A 0.80 1.00 0.97 1.00 0.93 0.32 0.00 0.05 0.00 0.12 039608 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 039919 A 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 G 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 039985 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 040361 G 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.95 1.00 1.00 1.00 0.99 0.09 0.00 0.00 0.00 0.02 040640 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 040714 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 040784 G 0.35 0.02 0.02 0.00 0.11 T 0.65 0.98 0.98 1.00 0.89 0.46 0.04 0.05 0.00 0.20 040961 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 040992 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 041049 A 0.00 0.07 0.00 0.00 0.02 G 1.00 0.93 1.00 1.00 0.98 0.00 0.13 0.00 0.00 0.03 041051 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 041088 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 041585 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 041647 T 0.00 0.05 0.07 0.00 0.03 C 1.00 0.95 0.93 1.00 0.97 0.00 0.09 0.13 0.00 0.05 041653 G 0.17 0.02 0.02 0.00 0.06 A 0.83 0.98 0.98 1.00 0.94 0.29 0.04 0.04 0.00 0.11 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001531: CTTTTT 003234: c 014647: aa 014783: t 018201: cata 020597: ac 023139: c 023459: t 026119: t 037582: t 039436: g