Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop hz 000238 T 0.01 G 0.99 0.01 000247 A 0.01 T 0.99 0.02 000542 T 0.02 C 0.98 0.04 000707 C 0.24 T 0.76 0.36 000876 A 0.15 C 0.85 0.26 000877 + 0.01 - 0.99 0.01 000882 T 0.11 C 0.89 0.20 000933 T 0.01 C 0.99 0.02 000980 A 0.01 C 0.99 0.01 001093 A 0.01 G 0.99 0.01 001167 C 0.01 A 0.99 0.01 001169 A 0.01 C 0.99 0.01 001228 G 0.01 C 0.99 0.01 001363 A 0.02 G 0.98 0.04 001431 A 0.09 G 0.91 0.16 001495 A 0.02 G 0.98 0.03 001501 A 0.08 G 0.92 0.14 001748 T 0.01 C 0.99 0.01 001812 + 0.01 - 0.99 0.01 002006 T 0.01 G 0.99 0.02 002226 T 0.01 A 0.99 0.01 002228 A 0.12 G 0.88 0.21 002369 + 0.01 - 0.99 0.02 002432 - 0.01 + 0.99 0.01 002475 + 0.02 - 0.98 0.03 002969 T 0.01 C 0.99 0.01 003049 G 0.08 A 0.92 0.14 003059 A 0.01 G 0.99 0.01 003955 T 0.01 C 0.99 0.01 004174 T 0.01 G 0.99 0.01 004902 C 0.06 G 0.94 0.12 005169 A 0.01 G 0.99 0.02 005196 C 0.04 T 0.96 0.08 005257 A 0.04 G 0.96 0.08 005387 A 0.03 G 0.97 0.06 005522 A 0.04 G 0.96 0.08 005827 T 0.01 C 0.99 0.01 005867 A 0.02 G 0.98 0.05 005881 A 0.03 G 0.97 0.06 006018 T 0.01 C 0.99 0.02 006673 C 0.01 G 0.99 0.01 006775 C 0.01 T 0.99 0.01 006858 G 0.01 A 0.99 0.01 006935 A 0.01 G 0.99 0.01 Note: pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000877: C 001812: C 002369: TGAA 002432: G 002475: AG