Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000192 T 0.13 0.00 0.00 0.00 0.04 G 0.87 1.00 1.00 1.00 0.96 0.23 0.00 0.00 0.00 0.07 000269 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 000505 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 000603 T 0.44 0.00 0.05 0.00 0.13 C 0.56 1.00 0.95 1.00 0.87 0.49 0.00 0.09 0.00 0.23 000713 G 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 A 0.81 1.00 1.00 1.00 0.95 0.31 0.00 0.00 0.00 0.10 000813 A 0.10 0.41 0.07 0.23 0.20 G 0.90 0.59 0.93 0.77 0.80 0.17 0.48 0.14 0.35 0.32 000860 - 0.00 0.00 0.10 0.04 0.03 + 1.00 1.00 0.90 0.96 0.97 0.00 0.00 0.17 0.08 0.06 000872 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 001202 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001269 A 0.25 0.29 0.07 0.27 0.22 C 0.75 0.71 0.93 0.73 0.78 0.38 0.42 0.13 0.39 0.34 001938 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 002015 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 002280 T 0.03 0.00 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.05 0.00 0.03 002369 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 017106 A 0.02 0.10 0.09 0.00 0.05 G 0.98 0.90 0.91 1.00 0.95 0.04 0.17 0.17 0.00 0.09 017188 G 0.13 0.00 0.00 0.00 0.04 A 0.87 1.00 1.00 1.00 0.96 0.23 0.00 0.00 0.00 0.07 017238 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 017332 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 017409 C 0.00 0.10 0.05 0.00 0.03 T 1.00 0.90 0.95 1.00 0.97 0.00 0.17 0.09 0.00 0.06 017468 C 0.63 0.43 0.14 0.27 0.38 G 0.37 0.57 0.86 0.73 0.62 0.47 0.49 0.24 0.39 0.47 017898 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 017953 T 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 018628 G 0.63 0.40 0.14 0.26 0.37 A 0.37 0.60 0.86 0.74 0.63 0.47 0.48 0.24 0.39 0.47 018711 T 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 018833 T 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 018868 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 019101 C 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 T 0.86 1.00 1.00 1.00 0.96 0.24 0.00 0.00 0.00 0.08 019181 T 0.79 0.40 0.12 0.32 0.43 C 0.21 0.60 0.88 0.68 0.57 0.33 0.48 0.22 0.43 0.49 019352 G 0.78 0.43 0.14 0.29 0.42 C 0.22 0.57 0.86 0.71 0.58 0.34 0.49 0.24 0.41 0.49 019354 A 0.48 0.43 0.14 0.29 0.34 G 0.52 0.57 0.86 0.71 0.66 0.50 0.49 0.24 0.41 0.45 019374 T 0.78 0.43 0.14 0.29 0.42 C 0.22 0.57 0.86 0.71 0.58 0.34 0.49 0.24 0.41 0.49 019383 C 0.80 0.43 0.14 0.29 0.42 T 0.20 0.57 0.86 0.71 0.58 0.31 0.49 0.24 0.41 0.49 019413 T 0.77 0.43 0.18 0.29 0.43 C 0.23 0.57 0.82 0.71 0.57 0.36 0.49 0.30 0.41 0.49 019425 A 0.78 0.43 0.18 0.29 0.43 G 0.22 0.57 0.82 0.71 0.57 0.34 0.49 0.30 0.41 0.49 019489 + 0.76 0.48 0.14 0.31 0.44 - 0.24 0.52 0.86 0.69 0.56 0.37 0.50 0.24 0.43 0.49 019601 C 0.24 0.00 0.00 0.00 0.07 T 0.76 1.00 1.00 1.00 0.93 0.36 0.00 0.00 0.00 0.13 019630 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 019851 G 0.78 0.42 0.12 0.31 0.42 A 0.22 0.58 0.88 0.69 0.58 0.34 0.49 0.21 0.43 0.49 020092 T 0.85 0.46 0.05 0.12 0.45 C 0.15 0.54 0.95 0.88 0.55 0.26 0.50 0.10 0.20 0.49 020374 G 0.16 0.00 0.00 0.00 0.04 A 0.84 1.00 1.00 1.00 0.96 0.27 0.00 0.00 0.00 0.08 020908 + 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 - 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 020956 A 0.77 0.43 0.14 0.27 0.41 G 0.23 0.57 0.86 0.73 0.59 0.36 0.49 0.24 0.39 0.49 020971 G 0.77 0.43 0.14 0.27 0.41 A 0.23 0.57 0.86 0.73 0.59 0.36 0.49 0.24 0.39 0.49 021000 G 0.13 0.00 0.00 0.00 0.04 C 0.87 1.00 1.00 1.00 0.96 0.23 0.00 0.00 0.00 0.07 022473 A 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 G 0.86 1.00 1.00 1.00 0.96 0.24 0.00 0.00 0.00 0.07 022522 C 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 G 0.85 1.00 1.00 1.00 0.96 0.26 0.00 0.00 0.00 0.08 022785 A 0.69 0.37 0.12 0.25 0.35 T 0.31 0.63 0.88 0.75 0.65 0.42 0.46 0.21 0.38 0.46 022977 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 023092 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 023165 T 0.77 0.43 0.14 0.27 0.41 C 0.23 0.57 0.86 0.73 0.59 0.35 0.49 0.24 0.39 0.48 026122 T 0.00 0.00 0.16 0.00 0.04 G 1.00 1.00 0.84 1.00 0.96 0.00 0.00 0.27 0.00 0.07 026180 - 0.62 0.43 0.14 0.25 0.37 + 0.38 0.57 0.86 0.75 0.63 0.47 0.49 0.24 0.38 0.46 026182 C 0.14 0.02 0.00 0.00 0.04 G 0.86 0.98 1.00 1.00 0.96 0.24 0.05 0.00 0.00 0.08 026242 A 0.00 0.07 0.23 0.08 0.09 G 1.00 0.93 0.77 0.92 0.91 0.00 0.13 0.35 0.15 0.17 026755 A 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 027871 C 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 T 0.81 1.00 1.00 1.00 0.95 0.30 0.00 0.00 0.00 0.10 028186 A 0.06 0.07 0.23 0.08 0.11 G 0.94 0.93 0.77 0.92 0.89 0.10 0.13 0.35 0.15 0.19 028350 T 0.07 0.07 0.21 0.04 0.10 G 0.93 0.93 0.79 0.96 0.90 0.12 0.13 0.34 0.08 0.17 029242 G 0.76 0.40 0.15 0.27 0.41 A 0.24 0.60 0.85 0.73 0.59 0.36 0.48 0.26 0.40 0.49 029347 C 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 029447 G 0.16 0.00 0.00 0.00 0.05 A 0.84 1.00 1.00 1.00 0.95 0.27 0.00 0.00 0.00 0.09 029512 A 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 G 0.81 1.00 1.00 1.00 0.95 0.30 0.00 0.00 0.00 0.10 029531 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 029742 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 029883 G 0.17 0.43 0.19 0.33 0.27 A 0.83 0.57 0.81 0.67 0.73 0.28 0.49 0.31 0.44 0.40 029926 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 029931 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 030141 T 0.02 0.02 0.03 0.00 0.02 C 0.98 0.98 0.97 1.00 0.98 0.04 0.04 0.05 0.00 0.03 030155 T 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 030174 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 030508 C 0.00 0.07 0.07 0.00 0.03 T 1.00 0.93 0.93 1.00 0.97 0.00 0.14 0.13 0.00 0.06 030511 T 0.35 0.40 0.20 0.30 0.31 C 0.65 0.60 0.80 0.70 0.69 0.45 0.48 0.33 0.42 0.43 030594 A 0.60 0.42 0.23 0.31 0.40 C 0.40 0.57 0.77 0.69 0.60 0.48 0.49 0.35 0.43 0.48 030601 T 0.02 0.12 0.02 0.00 0.04 C 0.98 0.88 0.98 1.00 0.96 0.04 0.22 0.04 0.00 0.07 030688 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 030843 T 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 030908 - 0.26 0.27 0.48 0.69 0.42 + 0.74 0.73 0.52 0.31 0.58 0.38 0.40 0.50 0.43 0.49 032896 T 0.20 0.07 0.24 0.08 0.15 A 0.80 0.93 0.76 0.92 0.85 0.32 0.13 0.36 0.15 0.25 032939 A 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 033280 C 0.00 0.03 0.02 0.00 0.01 T 1.00 0.97 0.98 1.00 0.99 0.00 0.05 0.05 0.00 0.02 033339 A 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 034171 T 0.23 0.00 0.00 0.00 0.05 C 0.77 1.00 1.00 1.00 0.95 0.36 0.00 0.00 0.00 0.09 034272 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 034416 T 0.00 0.10 0.18 0.10 0.10 C 1.00 0.90 0.82 0.90 0.90 0.00 0.18 0.29 0.17 0.18 034723 T 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.95 1.00 1.00 1.00 0.99 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000860: TT 019489: A 020908: a 026180: A 030908: ATC