Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Total-hz 000069 T 0.43 C 0.57 0.49 000124 T 0.01 C 0.99 0.01 000125 A 0.03 G 0.97 0.06 000161 G 0.24 T 0.76 0.36 000355 A 0.03 G 0.97 0.06 000426 C 0.19 G 0.81 0.31 000458 C 0.44 T 0.56 0.49 001061 T 0.08 G 0.92 0.14 001191 C 0.07 T 0.93 0.13 001368 A 0.17 G 0.83 0.29 001511 G 0.41 A 0.59 0.49 001550 A 0.01 T 0.99 0.01 001677 G 0.03 A 0.97 0.06 001685 G 0.02 A 0.98 0.05 001789 C 0.04 T 0.96 0.09 001866 T 0.01 A 0.99 0.01 002012 T 0.01 C 0.99 0.01 002151 G 0.01 C 0.99 0.01 002274 C 0.20 G 0.80 0.32 002441 G 0.22 A 0.78 0.34 002812 - 0.46 + 0.54 0.50 004064 A 0.01 G 0.99 0.01 004196 A 0.01 G 0.99 0.01 004429 G 0.01 C 0.99 0.01 004513 T 0.02 C 0.98 0.05 004672 A 0.01 G 0.99 0.01 004780 G 0.01 A 0.99 0.01 004859 T 0.11 C 0.89 0.20 004994 C 0.01 T 0.99 0.02 005027 G 0.12 T 0.88 0.21 005557 - 0.17 + 0.83 0.28 005893 A 0.14 G 0.86 0.24 006175 G 0.03 A 0.97 0.06 006261 C 0.08 T 0.92 0.14 006681 G 0.01 A 0.99 0.02 006739 + 0.07 - 0.93 0.14 006771 - 0.42 + 0.58 0.49 006808 C 0.01 T 0.99 0.02 007376 A 0.43 T 0.57 0.49 007381 T 0.01 C 0.99 0.01 008147 C 0.01 T 0.99 0.01 008330 A 0.01 G 0.99 0.02 008343 G 0.02 A 0.98 0.03 008529 G 0.01 C 0.99 0.01 008622 T 0.01 C 0.99 0.01 009272 G 0.01 A 0.99 0.01 009341 T 0.01 C 0.99 0.03 014444 C 0.01 T 0.99 0.01 014758 G 0.01 A 0.99 0.02 015152 A 0.02 C 0.98 0.03 015184 G 0.01 A 0.99 0.01 015480 A 0.01 G 0.99 0.01 015715 + 0.07 - 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0.01 + 0.99 0.01 027344 C 0.01 T 0.99 0.02 027373 G 0.01 T 0.99 0.02 027483 T 0.01 C 0.99 0.01 027516 G 0.09 A 0.91 0.16 027567 - 0.01 + 0.99 0.01 027610 C 0.01 G 0.99 0.03 027648 T 0.31 C 0.69 0.43 027783 G 0.03 A 0.97 0.05 027899 G 0.01 A 0.99 0.03 028213 T 0.01 C 0.99 0.02 028235 A 0.01 G 0.99 0.01 028310 C 0.01 A 0.99 0.02 028479 A 0.01 G 0.99 0.01 028489 T 0.07 A 0.93 0.13 028808 G 0.01 C 0.99 0.01 028938 G 0.40 A 0.60 0.48 029038 T 0.16 C 0.84 0.27 029106 G 0.01 A 0.99 0.01 029128 T 0.01 A 0.99 0.01 029229 T 0.01 G 0.99 0.02 029450 A 0.09 G 0.91 0.16 029497 A 0.02 G 0.98 0.04 029735 C 0.03 T 0.97 0.07 030090 A 0.04 G 0.96 0.07 030169 G 0.32 T 0.68 0.44 030325 T 0.01 C 0.99 0.02 030369 G 0.28 A 0.72 0.40 030717 T 0.01 G 0.99 0.02 030836 C 0.37 T 0.63 0.47 031108 C 0.01 T 0.99 0.01 031222 A 0.01 G 0.99 0.01 031255 T 0.01 C 0.99 0.01 034034 + 0.03 - 0.97 0.06 034274 G 0.01 A 0.99 0.01 034601 A 0.04 G 0.96 0.09 034733 T 0.02 C 0.98 0.04 034799 G 0.05 T 0.95 0.09 034845 G 0.02 C 0.98 0.04 034945 C 0.24 G 0.76 0.36 035121 A 0.01 G 0.99 0.02 035151 - 0.41 + 0.59 0.48 035204 A 0.01 G 0.99 0.01 035212 G 0.45 C 0.55 0.50 035226 A 0.02 G 0.98 0.04 035256 T 0.01 C 0.99 0.01 035266 A 0.01 G 0.99 0.02 035285 T 0.01 C 0.99 0.01 035402 T 0.01 C 0.99 0.01 035479 T 0.01 C 0.99 0.01 036192 G 0.03 A 0.97 0.06 037107 C 0.18 T 0.82 0.29 037492 T 0.07 C 0.93 0.13 037724 C 0.01 T 0.99 0.01 038011 T 0.02 G 0.98 0.04 038327 C 0.05 G 0.95 0.09 038497 A 0.04 C 0.96 0.09 038654 A 0.01 G 0.99 0.02 038822 G 0.01 A 0.99 0.01 038824 A 0.01 C 0.99 0.01 038924 C 0.01 T 0.99 0.01 039058 C 0.15 T 0.85 0.25 039173 G 0.01 T 0.99 0.01 039178 T 0.16 C 0.84 0.26 039513 A 0.01 G 0.99 0.01 039908 T 0.01 C 0.99 0.01 040147 C 0.01 T 0.99 0.01 040228 C 0.06 G 0.94 0.11 040239 - 0.01 + 0.99 0.02 040503 A 0.01 G 0.99 0.01 040961 A 0.15 G 0.85 0.26 041473 T 0.08 C 0.92 0.14 041478 T 0.03 G 0.97 0.05 041765 A 0.17 G 0.83 0.29 041781 T 0.01 C 0.99 0.01 041900 T 0.01 C 0.99 0.02 041939 C 0.02 T 0.98 0.04 042000 + 0.02 - 0.98 0.04 042170 G 0.01 A 0.99 0.01 042172 T 0.01 C 0.99 0.01 042278 A 0.01 G 0.99 0.01 042423 T 0.33 C 0.67 0.44 042570 T 0.01 A 0.99 0.01 042587 A 0.03 G 0.97 0.07 042733 A 0.13 G 0.87 0.23 042839 T 0.02 C 0.98 0.03 043490 G 0.01 A 0.99 0.03 043849 T 0.01 C 0.99 0.01 044160 T 0.01 C 0.99 0.01 044166 A 0.38 G 0.62 0.47 044203 A 0.01 G 0.99 0.01 044247 A 0.15 G 0.85 0.25 044266 C 0.22 A 0.78 0.34 044894 G 0.01 A 0.99 0.01 044925 A 0.01 G 0.99 0.02 045019 A 0.17 G 0.83 0.29 045169 A 0.01 G 0.99 0.01 045341 A 0.47 C 0.53 0.50 046043 T 0.01 C 0.99 0.01 046169 C 0.01 T 0.99 0.01 046450 G 0.01 A 0.99 0.01 046907 G 0.04 A 0.96 0.08 047228 A 0.01 G 0.99 0.01 047397 C 0.18 A 0.82 0.29 047701 C 0.03 G 0.97 0.06 047867 T 0.01 C 0.99 0.01 048100 C 0.01 T 0.99 0.01 048243 A 0.01 C 0.99 0.01 048275 G 0.17 A 0.83 0.28 048445 G 0.31 A 0.69 0.43 Note: Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002812: c 005557: ag 006739: T 006771: att 015715: caGAGG 015772: TG 017395: taata 027298: C 027567: c 034034: T 035151: G 040239: GAA 042000: c