Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop 000069 T 71 C 95 000124 T 1 C 173 000125 A 5 G 169 000161 G 41 T 133 000355 A 5 G 171 000426 C 34 G 142 000458 C 77 T 97 001061 T 11 G 129 001191 C 12 T 160 001368 A 30 G 144 001511 G 73 A 103 001550 A 1 T 175 001677 G 5 A 165 001685 G 4 A 166 001789 C 7 T 149 001866 T 1 A 159 002012 T 1 C 159 002151 G 1 C 161 002274 C 30 G 122 002441 G 32 A 114 002812 - 81 + 97 004064 A 1 G 173 004196 A 1 G 175 004429 G 1 C 171 004513 T 4 C 168 004672 A 1 G 169 004780 G 1 A 169 004859 T 19 C 147 004994 C 2 T 164 005027 G 20 T 144 005557 - 25 + 125 005893 A 23 G 143 006175 G 5 A 165 006261 C 13 T 155 006681 G 2 A 176 006739 + 13 - 163 006771 - 47 + 65 006808 C 1 T 87 007376 A 77 T 103 007381 T 1 C 179 008147 C 1 T 171 008330 A 2 G 174 008343 G 3 A 173 008529 G 1 C 171 008622 T 1 C 143 009272 G 1 A 177 009341 T 2 C 140 014444 C 1 T 173 014758 G 2 A 174 015152 A 3 C 171 015184 G 1 A 161 015480 A 1 G 165 015715 + 11 - 145 015761 A 12 G 146 015772 - 2 + 158 015902 T 1 C 179 015978 G 20 T 150 015992 G 2 A 176 016161 T 8 C 162 016351 C 2 T 166 016949 A 1 T 169 017295 G 4 A 124 017376 C 1 T 145 017395 - 2 + 134 017998 A 2 T 178 018034 G 16 A 164 018149 G 6 A 172 018165 G 1 T 177 018186 T 1 C 177 018487 A 2 G 176 018537 T 15 C 163 018844 T 8 G 170 018852 A 2 G 176 019044 T 2 C 178 019184 A 14 G 118 019558 A 17 G 159 019756 A 2 G 178 019901 G 5 A 111 020705 A 18 G 152 021250 A 60 T 74 021385 T 1 C 137 021945 T 22 C 146 021946 A 2 G 162 022105 T 18 C 116 022770 C 2 A 170 022780 T 1 G 171 022975 G 1 T 159 023093 G 2 T 150 023124 T 3 C 143 023130 A 2 G 142 023167 T 1 C 137 023231 G 10 A 82 024049 A 25 G 135 024180 T 3 A 143 024191 A 4 C 146 024263 C 2 T 52 024524 A 5 G 43 024693 A 2 G 124 025414 G 53 A 95 025869 C 3 G 173 026061 C 56 T 102 026209 A 5 G 157 026296 T 46 G 124 026512 G 15 A 125 026996 T 51 C 103 027044 G 18 C 144 027243 T 1 C 175 027298 - 1 + 171 027344 C 2 T 160 027373 G 2 T 170 027483 T 1 C 169 027516 G 14 A 150 027567 - 1 + 153 027610 C 2 G 134 027648 T 39 C 85 027783 G 4 A 142 027899 G 2 A 154 028213 T 2 C 160 028235 A 1 G 161 028310 C 2 A 162 028479 A 1 G 135 028489 T 9 A 119 028808 G 1 C 177 028938 G 66 A 98 029038 T 29 C 151 029106 G 1 A 179 029128 T 1 A 179 029229 T 2 G 178 029450 A 16 G 164 029497 A 4 G 176 029735 C 5 T 143 030090 A 4 G 102 030169 G 48 T 102 030325 T 2 C 156 030369 G 41 A 107 030717 T 2 G 162 030836 C 59 T 99 031108 C 1 T 163 031222 A 1 G 179 031255 T 1 C 173 034034 + 4 - 134 034274 G 1 A 157 034601 A 7 G 149 034733 T 3 C 151 034799 G 7 T 141 034845 G 3 C 159 034945 C 40 G 130 035121 A 2 G 168 035151 - 64 + 92 035204 A 1 G 179 035212 G 81 C 99 035226 A 4 G 176 035256 T 1 C 179 035266 A 2 G 178 035285 T 1 C 179 035402 T 1 C 169 035479 T 1 C 175 036192 G 4 A 136 037107 C 32 T 148 037492 T 13 C 167 037724 C 1 T 175 038011 T 4 G 172 038327 C 7 G 139 038497 A 8 C 170 038654 A 2 G 176 038822 G 1 A 167 038824 A 1 C 167 038924 C 1 T 167 039058 C 24 T 138 039173 G 1 T 171 039178 T 26 C 140 039513 A 1 G 167 039908 T 1 C 169 040147 C 1 T 169 040228 C 10 G 168 040239 - 2 + 172 040503 A 1 G 169 040961 A 27 G 153 041473 T 14 C 164 041478 T 5 G 175 041765 A 31 G 149 041781 T 1 C 179 041900 T 2 C 178 041939 C 4 T 176 042000 + 4 - 176 042170 G 1 A 173 042172 T 1 C 173 042278 A 1 G 179 042423 T 59 C 121 042570 T 1 A 157 042587 A 5 G 141 042733 A 18 G 118 042839 T 2 C 130 043490 G 2 A 134 043849 T 1 C 179 044160 T 1 C 175 044166 A 66 G 110 044203 A 1 G 165 044247 A 21 G 121 044266 C 32 A 116 044894 G 1 A 179 044925 A 2 G 176 045019 A 29 G 137 045169 A 1 G 177 045341 A 83 C 95 046043 T 1 C 177 046169 C 1 T 175 046450 G 1 A 171 046907 G 7 A 161 047228 A 1 G 173 047397 C 32 A 148 047701 C 6 G 174 047867 T 1 C 167 048100 C 1 T 167 048243 A 1 C 167 048275 G 28 A 140 048445 G 51 A 115 Note: Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002812: c 005557: ag 006739: T 006771: att 015715: caGAGG 015772: TG 017395: taata 027298: C 027567: c 034034: T 035151: G 040239: GAA 042000: c