SMUG1 Color FASTA
The longest form of insertion/deletion sites is shown in the FASTA sequence and contain a '-' as the alternate allele in the variation tag.
*Display courtesy of GeneSNPs

TCATTCGATT CCTTCCTCAC TTCCCGGATT TGATGTCAGA GAAGTCTGAC 50
ATCAGTCTGA AGTCGGCCCT TGGTGGTCAG CCTTATCGCT TGGTCCAACT 100
CCGCTGTCTT TGTGCTTAAT GTAGTATGAC ACCGTATTTT ATAAAATATC 150
TACATTTCTT AAGCCTCTGG CTCTTGGGGC GACTTTGGGT AGAACTTACA 200
AGTTCCTCCT TTGGGTTCTC TTAGTGTTTT GTTCCGGGTA TTAAAGCTCA 250
CATCACACTG TATTACAGTT AGTTGTTTAT TTGCCCTCAC AGCAGATTAT 300 | Exon 1 | UTR
GAGCTTACAG AAAGCCTGGC CTACATTTTA CTCTTTTTGG ATTTCTTCCT 350
CATCAAGAGA CTGCTGCAGT GCCTGTCAT
G TAAGAGACTC ATAAGTATTG 400 | var(368):[G:0.35]
AAAAAAAAAA TGAGTTAACA GGTGGTAGGT TGGATGGAGT ATGTGATTTT 450
CCATAGAGAA GAGAGTTAAA TGAGTTGCTC AAGAGAACCT TCTTAGAGAT 500
GAAACAGGAG TAGAATTCAA ATCAATTGAC TTCCAGCCTG TGGCTCTTGC 550
TATGAGATCA GGCTTTGAAG TTATGGAACA ATGAAAGTAG TATCTTGCCA 600
CTCTTTTCCC CAGCCTTGCT GTTTCCAACA CAGGTGTCTA AATGTCAAAG 650
GTGGGCTCAA GACTTCTCGA GATTCTAGAG CTGGAGCAGC CAATCTGCTA 700 | var(668):[T:0.34]
ATGTTGGTGT TGCATGGGGA GATGCAAAGC AAGGTCCCCT GAAACACTGG 750 | var(708):[C:0.01]
CGTTCTCCAC AGCACCCTTC TCAGCTTTTG TATGAGCCCA GTTTGTCCTG 800
GGTAGCCACC TGGACAACAG ATCAGTTAAA GACTACTGAG ACAGTCAGGG 850
AAGGACTTCC TAAGTTGGGC CTCTGATTTC TTTTCTCTCC CACTTCCCCT 900 | var(880):[T:0.37]
AGGCTAGGGT GAGAAAATAG GTTTATCGAG CTGTTGTGTC AACCTTGAGT 950 | var(918):[C:0.37]
TCTTATCTTG GAGAAGTCAC TCCTGACCCA GGCAGAAAGT TGAGAGGAAG 1000
GAATGACAAT GGTCCTTGTC GCATGGGAGG CACACATATG ATGGGCACAG 1050 | var(1046):[T:0.36]
ACCCAGAGTC TGGAAAACAA GCAGAGTGCA AAGTGGGCAG CTAAGCCTTG 1100
AGTGAACTCA GGATATAGAA GTGGAGAAGG ATCCATCAGG AGTGCCTCCT 1150
TGGTAAAAGC TGTTTATTTT ATTTTTATAT TTACAGATGG GGTCTCATTA 1200 | REPEAT
TGTCAGCCAG GCTGGTCTTG AACTCCTGGC CTCAAGCAAT TCTTCTGCCT 1250
TGGCCTCTCA AAGTGCTGGG ATTACAGGCA TGAGCCACTG TGCCCAGCAC 1300 | var(1291):[C:0.01]
AGAAGGTAGT TTTAAACAAA AGTGAAAAAG AAGATGGACA TTGCTGAGCA 1350
GGTGTTTGTT GAGTACCTAA TAAGGGCCAG GACCTTGGGC TTATGGAGGG 1400
AGATTGAACA AGGCCTGGCT CTTGATCTGC CCAAGTTTAG CTGGGGAGGC 1450 | NOT SCANNED
AAAAGGAATT CATTAAGACG ACGGTAACCA TGGTGACACA CAGTGGTTCT 1500 | REPEAT
CAGCCTTCAC CAACCATCAG AATCACCCTG G
GAAGCTTGT TTAAAATACA 1550
GATTCCCAGG CTGGGCACGG TAGCTCACGT TTGTAATCCC AGCACTTTGG 1600 | REPEAT
GAGGCTGAGG CAGGCAGATC ATGAGGTCAG GAGTTCGAGA CCAGCCTGAC 1650
CAACATGGTG AAACCCTGTC TCTACTGAAA ATACGAAAAT TAGCCGGGTG 1700 | var(1699):[C:0.48]
TGGTGCTGCG CACCTGTAAT CCCAGTACCC AGGAGGCTAA GGTGGGAGAA 1750 | var(1709):[T:0.39]
TCACTTGAAC CCGGGAGGCA GAGGTTGCAG TGAGCTGAGA TCGCGCCACT 1800
GCACTCCAGT CTGGGCGACA GAGCAAGATT CTGTCTCAAA AAAAAAACAA 1850
AACAAAACAA AACAAAAAAC ACAGATTCCC AGGCCTCACA CGGGACCTAC 1900
TTGTGTTGGG GGTGGGGTTG GGACACTATG GCAAATACTG CAGTGTTCTG 1950
AGGAGGGAAG ACTTTATCAA AGGGATGGTT TGAGCTGCAT TTTGAAGGAT 2000
GGGAGTGATT TGGATATGTG GACAGGTTGG GGAATCAACA GTCCTAGTTG 2050
ACTGGATGAC TGCTGGATGA TGTCCTGGTT GACTTCAGGA GTGTATTTGG 2100
TTGGACTGTA GAAATGGTAT GTGCAAGGTT TTGGGAGTTG AGGCAGGAAA 2150 | var(2121):[A:0.01]
GGCATTTTGA AAATGTGAGT AGAATGGTCA GGTTGGAACA CTGGGTTTGA 2200
ATGGGAGTGG AGTGAAGCAA TGGCCTTTGC AGTTTACAAA GCTTGCTGTC 2250 | var(2246):[T:0.01]
ATGTTCCTGC CCCCTCCCTT CTCCTTCCTC CCACCTCCCT TCTCTCTTCC 2300
CTTTCTTCTT CCTCTCCCAT TTCTTTTCTC CCTTCACCTA AACATAACAT 2350
CTCATTCCAT CCTTACGTCT GTTTGTTTGT TTTGAGACAG TCTCCCTCTG 2400 | REPEAT
TAGCCCAGGC TGGAGTGCAG TGGCACAATC TCGGCTCACT GCAACCTCTG 2450
CCTCCCAGGT CCTGGTTCAA GCAATTCTCC TGCCTCAGCC TCCCATGTAG 2500
CTGGAATTAC AGGCACGTGC CACCATGCCC AGCTAATTTT TGTATTTTTA 2550
GTTGAGACGG GGTTTCACCA TGTTGGCCAG GTTGATCTTG AACTCCTGAC 2600
CTCGTGATCC ACCTGCCTCA GCCTCCCAAA GTACTGGGAT TACAGGCATG 2650
AGCTGTTGCG CCCGGCAAAT TTATTTATTT ATTTATTTAT TTATTTATTT 2700 | var(2667):[G:0.01] | NOT SCANNED
ATTTATTTAT TTTTTATTTT ATTTTTTTTT GAGATGGAGT CTTGCTCTTT 2750 | REPEAT
TGCCCAGGCT TGAGTGCAGT GGCACGATCT TGGCTCACTG CAACCTCAGC 2800
CTCCCGGGTT CAGGCAGTTC TCCCTGCCTC AGCCTCCCGA GTAGCTGGGA 2850
TTACAGGTGC CCACCACAAC GCCCAGCTAA T
TTTTTTTTT TTGAGACAGA 2900 | REPEAT | var(2897):[G:0.49]
GTTTCACTGT TGTTGCCCGT GCTGGAGTGC AATGGCACGA TCTTGGCTCA 2950 | var(2903):[A:0.01]
CCGCAACCTC CACCTTTCAG GTTCAAATGA TTCTGCCTCA GCCTCCAGAG 3000
TAGCCGGGAT TACAGGCACG TACCACCATG CCTGACTAAT TTGTATTTTT 3050
AGTAGAGGTG GGAGTTTCTC CATTTTGGTC AGGCTGGTCT CGAACTCCCG 3100 | var(3100):[A:0.36]
A
CCTCAGGTG ATCTGCCCAC CTCAGCCTCC TAAAGTGCTG GGATTACAGG 3150
CTTGAGCCAC CACGCCCAGC ATGCCCAGCT AATTTTTGTA ATTTTTAGTA 3200 | REPEAT
GAGACGGGGT TTCGCCATGT TGGCCAGGCC AGTTTTGAAC GCCTGACCTA 3250
AGGTGATTCA GCCGCCTTGG CCTCCCAAAG TGCTGGGATT ACAGGCATGA 3300
GCCACCATGC CTGGCCTTCC TTATGTCAAC ATTATTAAGT GGATATTATT 3350
ATTCTTTGTA TTTGAAGGTG GAAACCTGAG GCTCTGGCCA TGGTTGTGTA 3400
GCTCGTAAGA TTCTATGAGG AGTCTGTAAT CATCCTACTC GGTATTCCTG 3450
AGTGTGGGAA AGAAGCTAGG CTGGGGTTAG GGGGTTGTAG AATTAGCAGG 3500
GTGGCTGATC AAACCATCTA AGGCAAGATG GCGTGGGTGG TTAAAGCATA 3550 | REPEAT
GCCTTGAGCC AGAGAGATTG GGCTCAACCA AATCCAGCTT TATTACTTAC 3600
TAACTGTAAG ACCTTGGGCA AGTTGCTTAA TCTTGCTAAG CCTCAGTGTC 3650
CTCACTTATA ACAGGGGAGC AGTAATACCC ACCTCATGGG ATTGTTGTGA 3700
GGATCAATGA GGTGTACCTG GTGCAGAGCA GTCGCTCACC ACCTGGAAGC 3750
TATTGTAATT AGCCTTCCCA GGTCTCTGGG CTGTGGCTGT GCACTTGCAT 3800
TTCATTCTTC AGCGCCGTGC TTTCCAGAAC AGTCCATTCT GGCTGGGCTT 3850
TTCTTTTTTA GGATGACCTT AAAGGTGCTG AAAGGATGCC ACCAGTAAAT 3900 | REPEAT
GTTTATTGAA AACCTACTAT GTGCTCGGCA TAGCCCAGGA ACTAGTGACC 3950
TATGCCTGAT GGAAAGGAGA TTTGGAGTGG GAGATGTTTG GTGGCTATGG 4000
CTTATCCTCA CCAGGTGCCA TGTGAAGAGG ACAGATAATG GAAGTGGGGA 4050
GGGAAAGGGC CCTTCATTAC CAAGAACTGA GATGAGTTCA GTCCTACTTG 4100
GTGGTTGGTA GATGACTGAC ATGGTCTCTT AGGGTCCCTT CTGAGCCCAG 4150
GAAATGGTAG TGGGGGCCCT GGCAAGCATG GATCCCTCCT ACTCTGTGGC 4200
TGAGGGTTGA TGGGGCTTCT GTCCATCTCT TTTCCCAGGT GACAGCGGCA 4250 | Exon 2 | UTR
TGGACATA
TG CCCCAGGCTT TCCTGCTGGG GTCCATCCAT GAGCCTGCAG 4300 | var(4264):[T:0.01]
        M   P  Q  A   F  L  L  G   S  I  H   E  P  A   14
GTGCCCTCAT GGAGCCCCAG CCCTGCCCTG GAAGCTTGGC TGAGAGCTTC 4350 | var(4301):[T:0.02]
G  A  L  M   E  P  Q   P  C  P   G  S  L  A   E  S  F  31
CTGGAGGAGG AGCTTCGGCT CAATGCTGAG CTGAGCCAGC TGCAGTTTTC 4400
 L  E  E   E  L  R  L   N  A  E   L  S  Q   L  Q  F  S 48
GGAGCCTGTG GGCATCATCT ACAATCCCGT GGAGTATGCA TGGGAGCCAC 4450
  E  P  V   G  I  I   Y  N  P  V   E  Y  A   W  E  P   64
ATCGCAACTA CGTGACTCGC TACTGCCAGG GCCCCAAGGA AGTACTCTTC 4500
H  R  N  Y   V  T  R   Y  C  Q   G  P  K  E   V  L  F  81
CTGGGCATGA ACCCTGGACC TTTTGGCATG GCCCAGACTG GGGTAAAGGG 4550
 L  G  M   N  P  G  P   F  G  M   A  Q  T   G          95
TTTGGCTTCC CCAGTGGGTG GAGTGGGGGG TTCTAGGTGG ATGCTTGGCT 4600
GGGTGTGCTG TGGAGAAGGA GCATGTGCAT GGCTGTAGAC ATGTGTAGGT 4650
CCTCCCGCCC CATTCTGTCT CAACACATAT ACTGGCTCCT GTGGTCCGTC 4700 | var(4699):[-:0.99]
CGAGGCCCTC TCCCAGCGTC TCTGCCCGTA ATTAACCAAG CACATTAATG 4750
GTAGTTTCGT TTTCCCTGTG AGCTGGCCAG TAATTGCCTC TGAGAGCCCT 4800
TCCTTCCGCC AGCCCCATCC TTACTTTACT GGATCTCCCC TGTCCCTGAA 4850 | var(4839):[G:0.04]
GTGTGGTTGG GGTCAGAAGA GGGACTAGGA CTGCTGGGTC CTCAGAAGAG 4900
ACTGGTTGAC AGGGGTGGGT ATGTAAGAGA TGCAGGGCGT TCTGGGAACC 4950
TGGGTTCTGT TTCCTAGCTA AGGCGAGGTT CAAAACAGAG CCTGGCTCCA 5000 | var(4974):[T:0.01]
GTGCCTGCCC GCTTTTCTTT CAGGGCTCAG GATGAGTGAC TGCCCCCAGT 5050
GGGGGTGCTT GGCAGGTGGG GGAGGGGAAG AGGCTTCAGG GCAGAAGGCT 5100
CAATCGCTTT TATTGACCCC AACTGGGTGA TGAAAGGTGA TCAATGATGA 5150
TCGATGGAAA TGACAGCCTG AGGCTTGGGG CTGAGAGGGC ATCCAGACAG 5200
CAGTGGTCAG CCCATCCTTG TGCCTCCTTT AACCCTGGCT GCCTTTCTGT 5250
CTCAGACCAT CTGTCTGTCC CCAGTACTAA CCATCAAACC CTGTGTAGGG 5300
CTAGATATCT CAATGTAGTC CCTGTACTTA GTCCCAAAGG CTAGTTGGGC 5350
TAGAGGGAAA CAAATTCTTC TGGACCACGG TTCACAATGA AGAACTGGAA 5400
AAAGACAGAC AGGCTCAAAC CATAGGGCCA AGAATCCTTG TCTCAGGCCT 5450 | var(5404):[-:0.03]
TTGGGTGAAG GTAGGGGTAG GGGGTGCAGG CTGGATCCTC ATGTAAGGTA 5500
TAAAGAAGTC AGTTGGTCCA GAGCCCGGGC CTCAGGTCTC CAGTTTGAAG 5550
CCTTTCATGT CTCTCTCCTT CCTCACAGGT GCCCTTTGGG GAAGTAAGCA 5600 | Exon 3
                               V   P  F  G   E  V  S   102
TGGTCCGGGA CTGGTTGGGC ATTGTGGGGC CTGTGCTGAC CCCTCCCCAA 5650 | var(5606):[T:0.01]
M  V  R  D   W  L  G   I  V  G   P  V  L  T   P  P  Q  119
GAGCATCCTA AACGACCAGT GCTGGGACTG GAGTGCCCAC AGTCAGAAGT 5700
 E  H  P   K  R  P  V   L  G  L   E  C  P   Q  S  E  V 136
GAGTGGTGCC CGATTCTGGG GCTTTTTCCG GAACCTCTGT GGACAGCCTG 5750
  S  G  A   R  F  W   G  F  F  R   N  L  C   G  Q  P   152
AGGTCTTCTT CCATCACTGT TTTGTCCACA ATCTATGCCC TCTGCTTTTC 5800
E  V  F  F   H  H  C   F  V  H   N  L  C  P   L  L  F  169
CTGGCTCCCA GCGGGCGCAA CCTTACTCCT GCTGAGCTGC CTGCCAAGCA 5850
 L  A  P   S  G  R  N   L  T  P   A  E  L   P  A  K  Q 186
GCGAGAACAG CTTCTTGGGA TCTGTGATGC AGCCCTCTGC CGGCAGGTGC 5900
  R  E  Q   L  L  G   I  C  D  A   A  L  C   R  Q  V   202
AGCTGCTGGG GGTGCGGCTG GTGGTGGGAG TTGGGCGACT GGCAGAGCAG 5950
Q  L  L  G   V  R  L   V  V  G   V  G  R  L   A  E  Q  219
CGGGCACGAC GGGCTCTGGC AGGCCTGATG CCAGAGGTCC AGGTGGAAGG 6000
 R  A  R   R  A  L  A   G  L  M   P  E  V   Q  V  E  G 236
GCTCCTGCAT CCCTCTCCCC GTAACCCACA GGCCAACAAG GGCTGGGAGG 6050
  L  L  H   P  S  P   R  N  P  Q   A  N  K   G  W  E   252
CAGTGGCCAA GGAAAGATTG AATGAGCTGG GGCTGCTGCC ACTGCTGTTG 6100
A  V  A  K   E  R  L   N  E  L   G  L  L  P   L  L  L  269
AAATGAGTGC CCTTGGGGCC TTGCATGGGA CACATTCAAG ACCTCGAAGT 6150 | UTR
 K                                                     270
CATTCTTGGC CAAGCAGATG ACAACACATC TCCTGGACTG GAGCAAAAGG 6200 | var(6186):[T:0.33]
TCCTTCTGTG CACCCTGGTC GCTGGGAAAC GTATTCTTTG ATCTGTTGAA 6250
CTGTCTTCCA ACCTGCCATG GCAGTTTTGA CACTACTCCT GTTTGCCCTC 6300 | var(6268):[G:0.01]
CTGATTCCTG CTTTCTTTAC CTTTTAACAT TGCCCCTTTC AGGGGACCCC 6350
ACTTTGTAGG GAATCTGCAG AAGGTGTGCT TTTGCACTTG CAGACTGCTC 6400 | var(6366):[C:0.01]
TACCTCAGTG TTTCCTTGGG AGACTTTATT CAGCTGAGAG TGCCCTAGAC 6450 | var(6440):[A:0.03]
AGTAACTTCT AAGGTCACGT TTACTATTTC AGAGGAAATA TCTTGCCAGG 6500
ATACCTACCC ATCCTTATAG AACAGTTGCC TTTAGCTGAC CCCTTTCCTC 6550 | var(6518):[C:0.01] | var(6528):[A:0.35]
ACAGGGACCA AGACAAAGCA TGGGACATGA AATTAAGAGT GAACTTCTTA 6600 | var(6577):[C:0.01]
TGGGAGGCTG CAGCTGGATC AGAGGAAAAA TCCAGTGTGA CAGAGTGCAA 6650 | REPEAT
GTCAGAAGAC CTGGCTTTTC ATCCCAGCTT TGAAACTTGG AACTTTTTGA 6700
TTGACAAATT AATAAACCTC TCTATGCCTC AGGC
T
CCTCA TCTGTAAAAC 6750
AGGGATGCCT ACCTTATGGG GTTGGTGTGA GGATTAACTG AGATCACACT 6800
TGAAAGTGCC TTGCATGGGC TTGGCATGTG GGTGCTCATT ACATAGTCTT 6850
CTTGTTTTCT TGCCTCTGGG TTGAGGATTC ACAGCACTGC ACTACAAGGG 6900
TAGCCCCTCT CCATTCTGGA TACCTTGCTA GGAGAGAGTC TGGGCTTCCA 6950
CCTGCGGCCA GGGTGAAGGG AAAATTCTTG CCATGTCAGA GATGGATCAA 7000
TGACTATGAA AAAACTAGCC TGTGATTTTT TTTCACTCTA AGCATTAAGA 7050
GCTCCTAAAG CCTTTTGTCT TGTTACTTTT TTCCCCCTCT TGCATGCTAG 7100
AGGTGGAAGG TAGTCATTTA GATTTCCCCC CTCTTCCCTC TTCATTGTTG 7150 | var(7131):[G:0.01]
GCCAGGGGTT CTCTTGGGCA GCTGGGGGAA GGATGTAGTA GATCTCTCTT 7200 | REPEAT
TTTTTTTTTT TTTTGAGATG GAGTCTCATG CTGTTGCCCA GGCTGGAGTG 7250
CAGTGGCATG GTCTCAGTTC ACTGCAACAT CTGCTTTCCC GGTTCAAGTG 7300 | var(7285):[C:0.10]
ATTCTCCTGC CTCAGCCTCC TGTATAGCTG GAATTACAGG CATGTGCCAC 7350
CACGCCTGGC TAATTTTTGT ATTTTTATTA AAGACAGTGT TTCACCATGT 7400
TGGCCAGGCT GGTCTCAAAC TCCTGACTTC AAGTAATCCA CCTGTCTTGG 7450
CCTCCCAAAG TGCTGCTGCC TGGCTGGATG TAGCAGATCT CCAATTGCCT 7500
TACCAAACCT GCAGGGTCTC TGTTAAGTGT CTGTTAGGGG TCTTATATGA 7550
TACTCTGGAC ACCGTGAGAA ACAGGTGATG GGGCAGATGG GAACCTGGTA 7600
TCCAACTCAT TTTTTATGTC TGCTGAATGG TTGACTGGGT GCCCCTTTGG 7650
TAAGGGCTGG GAAAGTGAAC CAAGTTGGGA GCAGAGCAGG TCTTGAGACC 7700
ACCTTAATGA GGAACACATG GTCTACTTCC TATCTCCTGG GACACAGGTC 7750
ATTTCCAGCT TCCAGAATTA GTAAGATTTT TCATATAAAT CCTCCCCTAC 7800 | var(7773):[G:0.01]
TTCATTGTAT AATAAAGAAT TTGGCCTTTG TCTTCAGTTC CTGAGAAGGA 7850 | REPEAT | REPEAT
GACTCTAAAT CCTTGGAATT TCCCAAGTAA TAGGAGTATC TTTGT
TTTTC 7900 | var(7869):[C:0.01]
GTGGCAGGTC CCTGAAACTA CACCTGAATT TATGTTGAGA TTTGACCTTA 7950
GGCTGCACCT AATTTTATAT TGAATTTGAT CTCAGACCAC ACCTGAGTTT 8000
GCTGTAAGAT TTGACTGAGG ATGGAGGCTG ACCATGCCAG AATGACCAAC 8050 | REPEAT
CATATAGTTA CAGGGCTGGG ACTTTGAGCT GGATGATACC AGCTTGATCC 8100
CCAGGGAGGG GAGAGGGGCT AGAGATTGAG TTCAGCCACA TGCCGATGAT 8150
TTTAACCAAT TATATCTATG GTAAAACTCT AGATATAAAA ACTTCTGACA 8200 | var(8167):[-:0.05]
CAGGTTTTGG TCAGCTTCCT GGCTGGTGAA CACATGGATG TGCTGAGGGA 8250
TGTGCATTGG TATCCTGTTT C