Site Genotype1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 HD-chi2 XD-chi2 Total-chi2 000275 CC 1 0 0 0 1 CT 9 4 3 2 18 TT 17 18 18 20 73 0.020 0.220 0.124 0.050 0.009 000279 GG 24 22 21 22 89 GT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.000 0.000 0.025 000374 AA 0 1 0 0 1 AT 0 0 4 0 4 TT 27 21 17 21 86 0.000 22.000 0.233 0.000 8.779 000499 CC 27 18 17 20 82 CT 0 4 3 2 9 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.220 0.131 0.050 0.246 000612 CC 21 17 15 17 70 CT 1 4 4 4 13 TT 1 1 1 0 3 9.521 1.144 0.930 0.233 4.582 001641 CC 0 1 1 0 2 CG 4 6 4 0 14 GG 23 15 17 24 79 0.173 0.153 1.144 0.000 1.884 001656 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 001773 GG 26 22 22 23 93 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 001914 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 2 2 CC 26 22 22 22 92 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 002352 AA 0 2 1 0 3 AC 3 3 5 5 16 CC 24 17 16 19 76 0.093 5.290 0.499 0.324 2.993 002739 AA 23 19 17 19 78 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 002997 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 0 1 ++ 23 19 17 19 78 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 003006 CC 0 0 0 0 0 CG 2 0 0 0 2 GG 22 19 17 19 77 0.045 0.000 0.000 0.000 0.013 004097 AA 1 0 0 0 1 AC 7 3 1 2 13 CC 19 19 21 21 80 0.120 0.118 0.012 0.048 0.318 004331 AA 25 18 16 22 81 AG 2 4 6 1 13 GG 0 0 0 0 0 0.040 0.220 0.548 0.011 0.519 004403 AA 12 10 9 18 49 AG 12 5 10 5 32 GG 2 7 3 0 12 0.181 6.340 0.007 0.342 3.095 004556 -- 27 18 19 20 84 +- 0 4 3 2 9 ++ 0 0 0 0 0 0.000 0.220 0.118 0.050 0.240 004610 CC 0 0 0 0 0 CT 0 4 3 2 9 TT 27 18 19 20 84 0.000 0.220 0.118 0.050 0.240 004710 GG 25 18 16 21 80 GT 2 4 6 1 13 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.220 0.548 0.012 0.525 004717 CC 1 0 0 0 1 CT 7 3 1 2 13 TT 19 19 21 20 79 0.120 0.118 0.012 0.050 0.305 005156 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 0 1 1 TT 25 18 16 22 81 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 005233 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 19 18 15 22 74 0.053 0.000 0.000 0.000 0.014 005243 -- 15 16 13 18 62 +- 4 0 0 2 6 ++ 1 1 0 0 2 0.930 17.000 0.000 0.055 8.764 005459 AA 20 16 13 19 68 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.013 0.004 005762 AA 24 16 16 21 77 AT 1 1 0 2 4 TT 0 1 0 0 1 0.010 7.289 0.000 0.048 7.780 006111 AA 13 9 9 18 49 AG 11 3 5 4 23 GG 1 5 2 0 8 0.514 6.670 0.825 0.220 3.878 006380 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 24 21 20 22 87 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 006478 CC 0 0 0 0 0 CT 0 4 3 2 9 TT 25 17 17 19 78 0.000 0.233 0.131 0.053 0.259 006479 CC 25 17 17 19 78 CT 0 4 3 2 9 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.233 0.131 0.053 0.259 006777 CC 26 16 19 20 81 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.016 0.000 0.000 0.003 006778 AA 0 0 0 0 0 AG 4 0 0 0 4 GG 22 17 19 20 78 0.181 0.000 0.000 0.000 0.051 006940 -- 0 0 0 0 0 +- 1 3 1 1 6 ++ 24 17 19 20 80 0.010 0.131 0.013 0.012 0.112 011165 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 22 21 22 23 88 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 011240 CC 19 22 22 23 86 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.118 0.000 0.000 0.000 0.026 011452 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 19 20 21 21 81 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 012108 -- 0 0 0 0 0 +- 2 0 0 0 2 ++ 24 21 22 24 91 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 012139 AA 0 0 0 0 0 AG 5 0 0 0 5 GG 21 21 22 24 88 0.294 0.000 0.000 0.000 0.071 012264 AA 23 21 22 24 90 AT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 012424 AA 0 0 0 0 0 AG 1 4 3 2 10 GG 23 17 19 22 81 0.011 0.233 0.118 0.045 0.308 012949 GG 12 10 11 19 52 GT 13 5 10 4 32 TT 2 7 1 1 11 0.364 6.340 0.468 1.361 2.814 013073 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 013528 CC 26 18 19 22 85 CT 1 4 3 1 9 TT 0 0 0 1 1 0.010 0.220 0.118 9.967 1.644 013654 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 1 2 4 TT 27 21 21 22 91 0.000 0.012 0.012 0.045 0.044 013915 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 0 1 1 GG 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 014113 GG 8 10 10 19 47 GT 12 5 11 4 32 TT 5 7 1 1 14 0.017 6.340 0.889 1.361 4.207 014571 AA 26 22 21 21 90 AG 0 0 0 3 3 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.107 0.025 014852 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 24 22 22 24 92 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 014994 CC 0 0 0 0 0 CT 11 0 0 0 11 TT 15 22 20 24 81 1.872 0.000 0.000 0.000 0.372 015095 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 25 22 20 24 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 015110 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 26 22 20 23 91 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 025110 GG 24 19 21 24 88 GT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 025133 -- 25 16 18 22 81 +- 1 3 3 1 8 ++ 0 0 0 1 1 0.010 0.140 0.124 9.967 2.105 025187 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 25 15 18 23 81 0.000 0.017 0.000 0.000 0.003 025252 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 25 16 18 22 81 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 025374 CC 26 20 19 21 86 CT 0 0 0 2 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.048 0.012 025375 AA 8 6 1 1 16 AG 15 5 7 3 30 GG 3 10 11 19 43 1.021 5.374 0.007 2.457 5.902 025431 CC 27 21 22 24 94 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 025443 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 21 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 025647 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 25 21 22 23 91 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 025899 CC 0 0 0 1 1 CT 0 0 0 1 1 TT 26 21 21 22 90 0.000 0.000 0.000 9.967 40.214 025930 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 26 19 21 24 90 0.000 0.013 0.000 0.000 0.003 026001 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 26 20 21 24 91 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 026152 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 25 22 22 22 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 026195 CC 19 18 19 22 78 CT 8 4 3 1 16 TT 0 0 0 0 0 0.817 0.220 0.118 0.011 0.813 026352 AA 27 22 21 24 94 AC 0 0 1 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 026357 CC 0 0 0 1 1 CT 8 4 3 1 16 TT 19 18 19 22 78 0.817 0.220 0.118 9.967 0.031 026501 CC 24 22 22 24 92 CG 3 0 0 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.000 0.000 0.024 026554 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 24 22 21 22 89 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 026838 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 22 22 24 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 026843 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 23 22 22 24 91 0.043 0.000 0.000 0.000 0.011 027226 CC 26 18 19 22 85 CT 1 4 3 0 8 TT 0 0 0 1 1 0.010 0.220 0.118 23.000 2.260 027335 AA 27 21 22 24 94 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 027344 AA 25 22 22 24 93 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 027413 CC 0 0 0 0 0 CT 0 3 0 0 3 TT 27 19 22 24 92 0.000 0.118 0.000 0.000 0.024 027701 CC 25 22 20 23 90 CG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 027702 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 1 1 CC 26 22 20 23 91 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 027705 GG 26 22 20 23 91 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 027807 AA 24 22 20 24 90 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 027857 AA 25 22 21 24 92 AT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 028640 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 23 18 19 20 80 0.000 0.014 0.000 0.000 0.003 028895 CC 15 10 12 17 54 CG 9 6 7 3 25 GG 2 4 1 0 7 0.154 2.321 0.000 0.131 2.515 029112 CC 23 20 19 19 81 CG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.000 0.000 0.012 032229 CC 6 7 1 1 15 CT 14 5 9 4 32 TT 7 10 11 19 47 0.040 6.340 0.247 1.361 4.968 032287 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 26 22 21 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 032324 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 25 22 21 24 92 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 032425 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 26 22 21 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 032528 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 032913 CC 27 22 22 23 94 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 032958 CC 0 0 0 0 0 CT 4 0 0 0 4 TT 23 22 22 24 91 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 032998 CC 0 0 0 0 0 CG 2 0 0 0 2 GG 25 22 22 24 93 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 033032 AA 0 0 0 0 0 AC 0 1 0 0 1 CC 27 20 22 23 92 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 033103 AA 11 9 10 17 47 AC 10 5 10 4 29 CC 6 7 1 1 15 1.465 5.666 0.583 1.144 6.767 033138 AA 23 17 18 20 78 AG 4 4 3 1 12 GG 0 0 0 1 1 0.173 0.233 0.124 9.075 0.464 033189 AA 0 1 0 0 1 AT 1 2 4 6 13 TT 26 18 17 16 77 0.010 4.203 0.233 0.548 0.280 033190 AA 0 1 0 0 1 AG 1 2 4 6 13 GG 26 18 17 16 77 0.010 4.203 0.233 0.548 0.280 033456 GG 25 22 22 24 93 GT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 033527 AA 27 22 21 24 94 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 033549 AA 0 0 0 0 0 AC 4 0 0 0 4 CC 23 22 22 24 91 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 033586 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 033628 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 033715 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 2 2 TT 27 22 22 22 93 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 033961 AA 6 7 1 1 15 AC 10 5 10 3 28 CC 10 10 10 18 48 1.170 6.340 0.583 2.296 7.729 034295 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 24 21 21 21 87 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 034619 CC 25 18 17 23 83 CG 1 4 5 1 11 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.220 0.362 0.011 0.363 034787 CC 26 22 22 23 93 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 035272 AA 4 4 1 0 9 AG 9 7 7 3 26 GG 11 11 14 20 56 0.780 1.875 0.011 0.112 4.432 035399 AA 6 7 1 1 15 AG 11 5 10 4 30 GG 7 10 11 19 47 0.160 6.340 0.468 1.361 6.127 035547 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 25 22 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 035588 CC 0 0 0 0 0 CG 1 1 0 0 2 GG 25 21 22 24 92 0.010 0.012 0.000 0.000 0.011 035819 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 23 22 21 23 89 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 035884 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 24 22 22 22 90 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 035890 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 24 22 22 22 90 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 035989 AA 0 0 0 1 1 AG 0 4 3 1 8 GG 23 18 19 21 81 0.000 0.220 0.118 9.521 2.105 036010 AA 10 10 14 20 54 AG 8 7 7 3 25 GG 3 4 1 0 8 0.429 1.577 0.011 0.112 3.560 036054 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 1 2 4 TT 24 21 21 21 87 0.000 0.012 0.012 0.048 0.046 036742 AA 2 0 0 0 2 AG 1 0 1 0 2 GG 23 22 21 23 89 15.767 0.000 0.012 0.000 39.967 036750 CC 3 10 11 19 43 CT 13 5 10 3 31 TT 10 7 1 1 19 0.159 6.340 0.468 2.457 7.595 036942 AA 12 11 14 21 58 AG 11 7 7 2 27 GG 4 4 1 0 9 0.308 1.875 0.011 0.048 4.192 037406 AA 3 4 1 0 8 AG 9 7 6 2 24 GG 12 11 14 20 57 0.389 1.875 0.114 0.050 4.549 037546 CC 25 22 22 23 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 037584 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 1 0 2 GG 26 21 21 23 91 0.000 0.012 0.012 0.000 0.011 037602 CC 25 22 22 23 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 037811 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 037812 AA 0 0 0 0 0 AG 4 10 2 0 16 GG 23 12 20 24 79 0.173 1.903 0.050 0.000 0.803 038044 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 038076 CC 27 21 21 24 93 CT 0 1 1 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.012 0.000 0.011 038130 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 038144 AA 25 12 20 24 81 AC 2 10 2 0 14 CC 0 0 0 0 0 0.040 1.903 0.050 0.000 0.601 038387 CC 0 0 0 0 0 CT 0 3 0 0 3 TT 27 19 22 23 91 0.000 0.118 0.000 0.000 0.025 045894 GG 6 7 1 1 15 GT 8 5 9 3 25 TT 11 9 11 19 50 2.778 5.666 0.247 2.457 10.740 046602 GG 25 22 21 23 91 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 046798 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 1 0 1 GG 25 22 20 24 91 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 047632 CC 26 22 19 23 90 CG 0 0 2 1 3 GG 0 0 1 0 1 0.000 0.000 4.455 0.011 13.832 047685 CC 24 21 21 24 90 CT 1 0 1 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.012 0.000 0.011 047706 AA 2 0 0 0 2 AG 7 4 6 1 18 GG 18 17 16 23 74 1.089 0.233 0.548 0.011 0.506 047840 CC 26 18 19 22 85 CT 1 3 3 1 8 TT 0 0 0 1 1 0.010 0.124 0.118 9.967 2.260 047977 CC 27 20 21 24 92 CT 0 1 1 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.012 0.000 0.011 048072 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 048162 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 0 1 1 GG 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 048169 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 27 22 21 24 94 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 048199 CC 27 22 22 22 93 CT 0 0 0 2 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 048321 AA 11 11 14 21 57 AG 11 7 7 3 28 GG 4 4 1 0 9 0.200 1.875 0.011 0.107 3.542 048421 CC 26 22 21 24 93 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 048472 CC 15 16 16 20 67 CG 7 5 5 3 20 GG 2 0 1 0 3 0.730 0.383 0.499 0.112 0.916 048617 AA 1 0 0 0 1 AC 4 10 2 0 16 CC 20 10 19 24 73 1.469 2.222 0.053 0.000 0.014 048735 GG 0 0 0 0 0 GT 2 0 0 0 2 TT 24 22 22 24 92 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 048736 AA 26 20 19 19 84 AC 0 2 2 5 9 CC 0 0 1 0 1 0.000 0.050 4.455 0.324 1.612 048777 CC 0 0 0 1 1 CG 1 4 3 1 9 GG 25 18 19 22 84 0.010 0.220 0.118 9.967 1.612 048903 AA 27 21 21 24 93 AG 0 1 1 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.012 0.000 0.011 048996 CC 2 0 1 0 3 CT 8 5 5 3 21 TT 17 17 16 21 71 0.551 0.362 0.499 0.107 0.829 049274 AA 0 0 0 0 0 AG 2 10 1 0 13 GG 24 11 19 24 78 0.042 2.051 0.013 0.000 0.538 049290 AA 1 0 0 0 1 AG 5 10 2 0 17 GG 20 11 19 24 74 0.793 2.051 0.053 0.000 0.000 049453 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 049581 CC 25 22 22 24 93 CG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 049794 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 27 22 22 21 92 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 049835 GG 26 18 17 23 84 GT 1 3 5 0 9 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.124 0.362 0.000 0.240 049870 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 049903 CC 27 22 22 23 94 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 050028 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 21 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 050224 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 0 1 ++ 26 20 22 24 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 050339 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 050444 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 050463 AA 11 10 11 19 51 AG 9 5 10 4 28 GG 6 7 1 1 15 2.055 6.340 0.468 1.361 8.565 050625 AA 6 7 1 1 15 AG 13 5 10 4 32 GG 7 10 11 19 47 0.000 6.340 0.468 1.361 4.968 050867 AA 24 17 15 20 76 AT 1 4 3 1 9 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.233 0.149 0.012 0.266 051050 AA 11 10 11 16 48 AG 9 4 5 3 21 GG 5 7 1 1 14 1.392 7.843 0.172 1.976 12.750 051182 CC 24 9 13 20 66 CT 1 10 2 0 13 TT 0 0 0 0 0 0.010 2.423 0.077 0.000 0.635 051682 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 24 22 20 21 87 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 051699 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 25 22 20 21 88 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 051840 AA 4 7 1 1 13 AG 10 5 9 3 27 GG 12 10 10 18 50 0.588 6.340 0.330 2.296 6.954 051917 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 23 21 19 21 84 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 052085 AA 25 22 22 23 92 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 052202 AA 6 7 1 1 15 AT 10 5 10 4 29 TT 11 10 11 17 49 1.465 6.340 0.468 1.144 7.298 052269 GG 24 18 19 20 81 GT 3 4 3 1 11 TT 0 0 0 1 1 0.093 0.220 0.118 9.075 0.758 052304 AA 0 0 0 0 0 AG 3 0 0 0 3 GG 24 21 22 22 89 0.093 0.000 0.000 0.000 0.025 052489 AA 26 20 22 23 91 AG 1 2 0 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.050 0.000 0.000 0.025 052498 CC 5 7 1 1 14 CG 9 5 10 4 28 GG 13 10 11 18 52 1.956 6.340 0.468 1.252 7.790 052532 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 052570 CC 24 22 22 23 91 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.000 0.000 0.025 052575 AA 0 0 0 1 1 AG 1 4 3 1 9 GG 26 18 19 21 84 0.010 0.220 0.118 9.521 1.612 052651 CC 0 0 0 0 0 CT 4 0 0 0 4 TT 23 22 22 23 90 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 052670 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 27 22 22 22 93 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 052721 CC 11 10 11 19 51 CT 10 5 10 4 29 TT 6 7 1 1 15 1.465 6.340 0.468 1.361 7.831 052761 AA 4 7 1 1 13 AG 10 5 10 4 29 GG 13 10 11 19 53 0.750 6.340 0.468 1.361 6.319 052779 CC 0 0 0 0 0 CT 3 0 0 0 3 TT 21 22 22 23 88 0.107 0.000 0.000 0.000 0.026 052864 AA 0 0 0 1 1 AG 1 4 3 1 9 GG 22 18 19 21 80 0.011 0.220 0.118 9.521 1.488 052890 AA 7 10 11 18 46 AG 10 5 10 4 29 GG 6 7 1 1 15 0.381 6.340 0.468 1.252 6.503 052893 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 22 22 22 23 89 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 052941 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 23 22 22 22 89 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 052974 -- 0 0 0 0 0 +- 2 0 0 0 2 ++ 21 22 22 23 88 0.048 0.000 0.000 0.000 0.011 053048 AA 20 21 21 22 84 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 053073 CC 6 7 1 1 15 CG 9 5 9 4 27 GG 6 10 11 18 45 0.429 6.340 0.247 1.252 7.599 053326 CC 21 19 22 23 85 CT 0 3 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.118 0.000 0.000 0.026 053506 CC 20 18 19 21 78 CT 1 4 3 1 9 TT 0 0 0 1 1 0.012 0.220 0.118 9.521 1.425 053518 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 2 2 GG 21 22 22 21 86 0.000 0.000 0.000 0.048 0.012 053617 AA 4 10 11 18 43 AG 12 5 10 4 31 GG 5 7 1 1 14 0.444 6.340 0.468 1.252 3.867 053664 CC 0 0 0 1 1 CT 1 4 3 1 9 TT 20 18 19 21 78 0.012 0.220 0.118 9.521 1.425 066285 CC 11 2 2 0 15 CT 7 8 8 6 29 TT 5 12 12 16 45 2.767 0.153 0.153 0.548 6.240 066433 GG 0 0 0 1 1 GT 1 4 3 1 9 TT 22 18 19 20 79 0.011 0.220 0.118 9.075 1.456 066715 AA 0 0 0 1 1 AC 1 4 3 1 9 CC 21 18 19 22 80 0.012 0.220 0.118 9.967 1.488 066796 AA 21 22 22 24 89 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 066914 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 1 1 CC 25 22 22 23 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 067003 GG 22 18 17 21 78 GT 4 0 0 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.181 0.000 0.000 0.000 0.051 067068 -- 24 17 17 21 79 +- 2 1 0 0 3 ++ 0 0 0 0 0 0.042 0.015 0.000 0.000 0.028 067152 GG 0 0 0 0 0 GT 2 8 2 0 12 TT 22 9 14 21 66 0.045 1.609 0.071 0.000 0.542 067218 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 23 17 16 21 77 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 067438 AA 25 14 14 20 73 AG 1 4 3 0 8 GG 0 0 0 1 1 0.010 0.281 0.159 21.000 1.797 067496 AA 25 17 17 21 80 AT 1 1 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.015 0.000 0.000 0.012 067659 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 24 18 17 20 79 0.042 0.000 0.000 0.000 0.013 067722 AA 2 2 3 15 22 AC 2 8 15 8 33 CC 23 11 3 1 38 10.547 0.093 3.857 0.003 6.713 067765 CC 26 19 16 23 84 CG 1 3 5 1 10 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.118 0.383 0.011 0.297 068071 AA 22 17 18 23 80 AC 2 0 0 0 2 CC 0 0 0 0 0 0.045 0.000 0.000 0.000 0.012 068107 CC 0 0 0 0 0 CG 4 0 0 0 4 GG 21 16 18 23 78 0.189 0.000 0.000 0.000 0.051 068239 CC 0 0 0 0 0 CG 3 7 1 0 11 GG 21 11 17 20 69 0.107 1.049 0.015 0.000 0.436 068328 AA 15 10 13 17 55 AC 8 6 4 1 19 CC 1 3 0 0 4 0.003 1.377 0.302 0.015 1.732 068748 AA 26 21 20 24 91 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 068787 AA 26 22 21 24 93 AT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 068986 GG 0 0 0 0 0 GT 4 0 0 0 4 TT 23 22 22 24 91 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 069029 AA 0 1 4 15 20 AG 0 11 14 7 32 GG 27 10 4 2 43 0.000 0.889 1.636 0.730 7.682 069110 AA 22 19 21 20 82 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 069113 AA 0 0 0 1 1 AG 1 4 2 1 8 GG 21 15 16 18 70 0.012 0.263 0.062 8.183 1.683 069158 CC 0 0 0 0 0 CG 0 1 0 0 1 GG 22 18 19 20 79 0.000 0.014 0.000 0.000 0.003 069270 AA 14 22 21 24 81 AT 10 0 0 0 10 TT 2 0 0 0 2 0.013 0.000 0.000 0.000 4.816 069349 AA 0 0 0 0 0 AC 3 3 3 0 9 CC 23 19 19 24 85 0.097 0.118 0.118 0.000 0.238 069781 AA 0 0 0 0 0 AG 3 9 1 0 13 GG 21 10 20 18 69 0.107 1.830 0.012 0.000 0.608 069838 AA 0 1 4 11 16 AG 0 8 12 6 26 GG 25 9 4 2 40 0.000 0.209 0.800 0.655 7.700 069874 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 18 21 19 82 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 069904 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 24 20 20 19 83 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 069998 GG 0 1 4 11 16 GT 0 9 11 6 26 TT 25 9 4 2 40 0.000 0.436 0.474 0.655 7.700 075860 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 1 0 1 GG 21 19 18 23 81 0.000 0.000 0.014 0.000 0.003 075935 CC 2 5 0 1 8 CT 8 5 9 2 24 TT 9 9 9 20 47 0.012 3.835 2.000 4.707 3.054 075998 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 19 19 19 23 80 0.013 0.000 0.000 0.000 0.003 076085 AA 18 10 17 23 68 AG 3 9 2 0 14 GG 0 0 0 0 0 0.124 1.830 0.059 0.000 0.714 076455 CC 12 1 2 0 15 CG 13 10 8 7 38 GG 2 11 12 17 42 0.364 0.468 0.153 0.700 1.598 076595 AA 0 2 4 14 20 AG 0 10 13 7 30 GG 27 10 4 2 43 0.000 0.050 1.190 0.616 9.100 076647 AA 0 0 0 0 0 AG 2 1 1 2 6 GG 25 19 21 22 87 0.040 0.013 0.012 0.045 0.103 076713 AA 3 9 12 17 41 AC 11 10 7 7 35 CC 12 0 2 0 14 0.039 2.423 0.399 0.700 1.900 076776 AA 2 10 11 21 44 AG 16 3 10 2 31 GG 9 5 1 1 16 1.977 7.345 0.468 4.959 5.571 076801 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 26 18 21 23 88 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 076810 AA 20 13 13 20 66 AT 7 5 8 2 22 TT 0 0 0 1 1 0.599 0.468 1.163 4.707 0.315 076821 AA 19 12 13 20 64 AC 7 6 9 2 24 CC 0 0 0 1 1 0.629 0.720 1.455 4.707 0.584 076829 CC 24 19 22 23 88 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.000 0.000 0.026 078555 CC 17 20 21 22 80 CG 4 0 0 0 4 GG 2 0 0 0 2 3.584 0.000 0.000 0.000 19.454 078629 CC 19 2 6 0 27 CT 5 11 7 7 30 TT 0 7 8 15 30 0.324 0.601 2.249 0.787 8.335 078917 GG 9 20 19 20 68 GT 7 0 0 0 7 TT 3 0 0 0 3 0.626 0.000 0.000 0.000 13.278 079001 CC 22 21 21 23 87 CG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 079074 CC 2 0 0 0 2 CT 9 0 0 0 9 TT 12 21 21 23 77 0.028 0.000 0.000 0.000 5.610 079094 AA 19 21 21 23 84 AG 5 0 0 0 5 GG 0 0 0 0 0 0.324 0.000 0.000 0.000 0.074 079185 AA 0 1 3 13 17 AG 2 9 12 8 31 GG 23 12 7 2 44 0.043 0.182 0.362 0.221 6.343 079234 AA 0 0 0 0 0 AC 4 12 2 0 18 CC 21 9 20 23 73 0.189 3.360 0.050 0.000 1.096 079257 CC 13 6 1 1 21 CT 9 10 10 4 33 TT 3 6 11 18 38 0.510 0.182 0.468 1.252 6.088 079263 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 23 22 22 23 90 0.043 0.000 0.000 0.000 0.011 079508 GG 0 0 0 1 1 GT 0 3 3 2 8 TT 27 19 19 21 86 0.000 0.118 0.118 4.959 2.299 079510 CC 25 22 22 24 93 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 079573 AA 4 0 0 0 4 AC 8 0 0 0 8 CC 12 18 20 18 68 1.500 0.000 0.000 0.000 15.802 079770 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 079919 CC 26 22 22 23 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 080004 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 24 22 22 24 92 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 080104 -- 0 0 0 0 0 +- 5 0 1 0 6 ++ 17 22 21 23 83 0.362 0.000 0.012 0.000 0.108 080150 AA 26 21 22 24 93 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 080288 CC 20 22 20 24 86 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 080320 CC 18 20 10 23 71 CT 1 2 7 1 11 TT 0 0 3 0 3 0.014 0.050 0.818 0.011 6.714 080322 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 18 22 21 24 85 0.014 0.000 0.000 0.000 0.003 080360 CC 18 21 21 24 84 CT 3 0 0 0 3 TT 2 0 0 0 2 5.624 0.000 0.000 0.000 27.304 080536 CC 24 21 21 23 89 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 080561 CC 0 5 2 0 7 CT 5 10 11 5 31 TT 20 6 7 19 52 0.309 0.043 0.601 0.324 0.598 080886 CC 0 0 0 0 0 CG 2 0 0 0 2 GG 21 21 18 23 83 0.048 0.000 0.000 0.000 0.012 081098 GG 0 0 0 0 0 GT 3 2 2 1 8 TT 19 17 16 22 74 0.118 0.059 0.062 0.011 0.216 081532 AA 20 20 19 22 81 AG 2 0 1 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.050 0.000 0.013 0.000 0.028 081536 AA 20 20 20 22 82 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.050 0.000 0.000 0.000 0.012 081615 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 1 2 GG 22 20 19 21 82 0.000 0.000 0.013 0.012 0.012 081872 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 21 21 19 21 82 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 082229 CC 0 0 0 0 0 CG 3 0 0 0 3 GG 23 19 16 22 80 0.097 0.000 0.000 0.000 0.028 082282 AA 26 20 16 21 83 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 082308 -- 0 0 0 1 1 +- 0 6 1 2 9 ++ 27 14 16 19 76 0.000 0.623 0.016 4.455 1.364 082338 CC 26 21 17 22 86 CG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 082349 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 21 18 22 87 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 082396 AA 14 17 15 22 68 AG 11 3 2 0 16 GG 2 0 0 0 2 0.006 0.131 0.066 0.000 0.772 082448 AA 0 1 4 17 22 AG 1 11 12 5 29 GG 26 10 5 2 43 0.010 0.889 0.444 2.400 11.552 082549 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 24 21 20 23 88 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 082806 AA 0 0 0 0 0 AT 2 0 1 0 3 TT 19 20 17 23 79 0.053 0.000 0.015 0.000 0.028 083009 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 1 0 3 GG 23 20 19 23 85 0.043 0.000 0.013 0.000 0.026 083044 CC 24 21 20 23 88 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 083133 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 26 20 20 23 89 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 083461 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 23 19 17 20 79 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 083529 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 22 20 17 20 79 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 083854 CC 19 17 9 20 65 CT 1 0 5 0 6 TT 0 0 0 0 0 0.013 0.000 0.662 0.000 0.138 083862 CC 21 10 12 17 60 CT 0 6 0 2 8 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.852 0.000 0.059 0.266 084024 AA 20 18 15 16 69 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.050 0.000 0.000 0.000 0.014 084252 GG 24 22 21 23 90 GT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.000 0.000 0.025 084329 AA 24 20 21 23 88 AG 3 0 0 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.000 0.000 0.026 084368 CC 26 21 21 23 91 CG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 084500 CC 27 21 21 23 92 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 084567 CC 0 0 0 0 0 CG 0 1 0 0 1 GG 27 21 20 23 91 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 085031 AA 26 21 21 23 91 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 085140 -- 9 6 2 3 20 +- 10 13 8 4 35 ++ 6 2 9 16 33 0.887 1.702 0.012 5.497 3.071 085305 AA 0 0 0 0 0 AG 5 2 2 0 9 GG 21 20 19 21 81 0.294 0.050 0.053 0.000 0.249 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002997: GTTA 004556: A 005243: AG 006940: a 012108: T 025133: A 050224: ga 052974: ATAAACAT 067068: T 080104: CA 082308: TA 085140: T