Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000275 C 0.20 0.09 0.07 0.05 0.11 T 0.80 0.91 0.93 0.95 0.89 0.32 0.17 0.13 0.09 0.19 000279 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 000374 A 0.00 0.05 0.10 0.00 0.03 T 1.00 0.95 0.90 1.00 0.97 0.00 0.09 0.17 0.00 0.06 000499 T 0.00 0.09 0.07 0.05 0.05 C 1.00 0.91 0.93 0.95 0.95 0.00 0.17 0.14 0.09 0.09 000612 T 0.07 0.14 0.15 0.10 0.11 C 0.93 0.86 0.85 0.90 0.89 0.12 0.24 0.26 0.17 0.20 001641 C 0.07 0.18 0.14 0.00 0.09 G 0.93 0.82 0.86 1.00 0.91 0.14 0.30 0.24 0.00 0.17 001656 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 001773 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 001914 A 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 002352 A 0.06 0.16 0.16 0.10 0.12 C 0.94 0.84 0.84 0.90 0.88 0.10 0.27 0.27 0.19 0.20 002739 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 002997 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 003006 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 004097 A 0.17 0.07 0.02 0.04 0.08 C 0.83 0.93 0.98 0.96 0.92 0.28 0.13 0.04 0.08 0.15 004331 G 0.04 0.09 0.14 0.02 0.07 A 0.96 0.91 0.86 0.98 0.93 0.07 0.17 0.24 0.04 0.13 004403 G 0.31 0.43 0.36 0.11 0.30 A 0.69 0.57 0.64 0.89 0.70 0.43 0.49 0.46 0.19 0.42 004556 + 0.00 0.09 0.07 0.05 0.05 - 1.00 0.91 0.93 0.95 0.95 0.00 0.17 0.13 0.09 0.09 004610 C 0.00 0.09 0.07 0.05 0.05 T 1.00 0.91 0.93 0.95 0.95 0.00 0.17 0.13 0.09 0.09 004710 T 0.04 0.09 0.14 0.02 0.07 G 0.96 0.91 0.86 0.98 0.93 0.07 0.17 0.24 0.04 0.13 004717 C 0.17 0.07 0.02 0.05 0.08 T 0.83 0.93 0.98 0.95 0.92 0.28 0.13 0.04 0.09 0.15 005156 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 005233 C 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.95 1.00 1.00 1.00 0.99 0.09 0.00 0.00 0.00 0.03 005243 + 0.15 0.06 0.00 0.05 0.07 - 0.85 0.94 1.00 0.95 0.93 0.26 0.11 0.00 0.10 0.13 005459 G 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.97 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 005762 T 0.02 0.08 0.00 0.04 0.04 A 0.98 0.92 1.00 0.96 0.96 0.04 0.15 0.00 0.08 0.07 006111 G 0.26 0.38 0.28 0.09 0.24 A 0.74 0.62 0.72 0.91 0.76 0.38 0.47 0.40 0.17 0.37 006380 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 006478 C 0.00 0.10 0.07 0.05 0.05 T 1.00 0.90 0.93 0.95 0.95 0.00 0.17 0.14 0.09 0.10 006479 T 0.00 0.10 0.07 0.05 0.05 C 1.00 0.90 0.93 0.95 0.95 0.00 0.17 0.14 0.09 0.10 006777 T 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.06 0.00 0.00 0.01 006778 A 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.05 006940 - 0.02 0.07 0.03 0.02 0.03 + 0.98 0.93 0.97 0.98 0.97 0.04 0.14 0.05 0.05 0.07 011165 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 011240 T 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.13 0.00 0.00 0.00 0.03 011452 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 012108 - 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 012139 A 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 012264 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 012424 A 0.02 0.10 0.07 0.04 0.05 G 0.98 0.90 0.93 0.96 0.95 0.04 0.17 0.13 0.08 0.10 012949 T 0.31 0.43 0.27 0.12 0.28 G 0.69 0.57 0.73 0.88 0.72 0.43 0.49 0.40 0.22 0.41 013073 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 013528 T 0.02 0.09 0.07 0.06 0.06 C 0.98 0.91 0.93 0.94 0.94 0.04 0.17 0.13 0.12 0.11 013654 C 0.00 0.02 0.02 0.04 0.02 T 1.00 0.98 0.98 0.96 0.98 0.00 0.04 0.04 0.08 0.04 013915 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 014113 T 0.44 0.43 0.30 0.12 0.32 G 0.56 0.57 0.70 0.88 0.68 0.49 0.49 0.42 0.22 0.44 014571 G 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 A 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 014852 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 014994 C 0.21 0.00 0.00 0.00 0.06 T 0.79 1.00 1.00 1.00 0.94 0.33 0.00 0.00 0.00 0.11 015095 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 015110 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 025110 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 025133 + 0.02 0.08 0.07 0.06 0.06 - 0.98 0.92 0.93 0.94 0.94 0.04 0.15 0.13 0.12 0.10 025187 C 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.06 0.00 0.00 0.01 025252 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 025374 T 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 025375 A 0.60 0.40 0.24 0.11 0.35 G 0.40 0.60 0.76 0.89 0.65 0.48 0.48 0.36 0.19 0.45 025431 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 025443 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 025647 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 025899 C 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 T 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 025930 C 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 026001 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 026152 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 026195 T 0.15 0.09 0.07 0.02 0.09 C 0.85 0.91 0.93 0.98 0.91 0.25 0.17 0.13 0.04 0.16 026352 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 026357 C 0.15 0.09 0.07 0.06 0.09 T 0.85 0.91 0.93 0.94 0.91 0.25 0.17 0.13 0.12 0.17 026501 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 026554 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 026838 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 026843 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 027226 T 0.02 0.09 0.07 0.04 0.05 C 0.98 0.91 0.93 0.96 0.95 0.04 0.17 0.13 0.08 0.10 027335 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 027344 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 027413 C 0.00 0.07 0.00 0.00 0.02 T 1.00 0.93 1.00 1.00 0.98 0.00 0.13 0.00 0.00 0.03 027701 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 027702 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 027705 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 027807 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 027857 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 028640 C 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 028895 G 0.25 0.35 0.23 0.07 0.23 C 0.75 0.65 0.78 0.93 0.77 0.38 0.45 0.35 0.14 0.35 029112 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 032229 C 0.48 0.43 0.26 0.12 0.33 T 0.52 0.57 0.74 0.88 0.67 0.50 0.49 0.39 0.22 0.44 032287 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 032324 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 032425 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 032528 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 032913 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 032958 C 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 032998 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 033032 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 033103 C 0.41 0.45 0.29 0.14 0.32 A 0.59 0.55 0.71 0.86 0.68 0.48 0.50 0.41 0.24 0.44 033138 G 0.07 0.10 0.07 0.07 0.08 A 0.93 0.90 0.93 0.93 0.92 0.14 0.17 0.13 0.13 0.14 033189 A 0.02 0.10 0.10 0.14 0.08 T 0.98 0.90 0.90 0.86 0.92 0.04 0.17 0.17 0.24 0.15 033190 A 0.02 0.10 0.10 0.14 0.08 G 0.98 0.90 0.90 0.86 0.92 0.04 0.17 0.17 0.24 0.15 033456 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 033527 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 033549 A 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 033586 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 033628 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 033715 C 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 033961 A 0.42 0.43 0.29 0.11 0.32 C 0.58 0.57 0.71 0.89 0.68 0.49 0.49 0.41 0.20 0.43 034295 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 034619 G 0.02 0.09 0.11 0.02 0.06 C 0.98 0.91 0.89 0.98 0.94 0.04 0.17 0.20 0.04 0.11 034787 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 035272 A 0.35 0.34 0.20 0.07 0.24 G 0.65 0.66 0.80 0.93 0.76 0.46 0.45 0.33 0.12 0.37 035399 A 0.48 0.43 0.27 0.12 0.33 G 0.52 0.57 0.73 0.88 0.67 0.50 0.49 0.40 0.22 0.44 035547 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 035588 C 0.02 0.02 0.00 0.00 0.01 G 0.98 0.98 1.00 1.00 0.99 0.04 0.04 0.00 0.00 0.02 035819 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 035884 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 035890 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 035989 A 0.00 0.09 0.07 0.07 0.06 G 1.00 0.91 0.93 0.93 0.94 0.00 0.17 0.13 0.12 0.10 036010 G 0.33 0.36 0.20 0.07 0.24 A 0.67 0.64 0.80 0.93 0.76 0.44 0.46 0.33 0.12 0.36 036054 C 0.00 0.02 0.02 0.04 0.02 T 1.00 0.98 0.98 0.96 0.98 0.00 0.04 0.04 0.08 0.04 036742 A 0.10 0.00 0.02 0.00 0.03 G 0.90 1.00 0.98 1.00 0.97 0.17 0.00 0.04 0.00 0.06 036750 T 0.63 0.43 0.27 0.11 0.37 C 0.37 0.57 0.73 0.89 0.63 0.46 0.49 0.40 0.19 0.47 036942 G 0.35 0.34 0.20 0.04 0.24 A 0.65 0.66 0.80 0.96 0.76 0.46 0.45 0.33 0.08 0.36 037406 A 0.31 0.34 0.19 0.05 0.22 G 0.69 0.66 0.81 0.95 0.78 0.43 0.45 0.31 0.09 0.35 037546 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 037584 A 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 G 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.04 0.00 0.02 037602 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 037811 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 037812 A 0.07 0.23 0.05 0.00 0.08 G 0.93 0.77 0.95 1.00 0.92 0.14 0.35 0.09 0.00 0.15 038044 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 038076 T 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 C 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.04 0.00 0.02 038130 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 038144 C 0.04 0.23 0.05 0.00 0.07 A 0.96 0.77 0.95 1.00 0.93 0.07 0.35 0.09 0.00 0.14 038387 C 0.00 0.07 0.00 0.00 0.02 T 1.00 0.93 1.00 1.00 0.98 0.00 0.13 0.00 0.00 0.03 045894 G 0.40 0.45 0.26 0.11 0.31 T 0.60 0.55 0.74 0.89 0.69 0.48 0.50 0.39 0.19 0.42 046602 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 046798 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 047632 G 0.00 0.00 0.09 0.02 0.03 C 1.00 1.00 0.91 0.98 0.97 0.00 0.00 0.17 0.04 0.05 047685 T 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 047706 A 0.20 0.10 0.14 0.02 0.12 G 0.80 0.90 0.86 0.98 0.88 0.32 0.17 0.24 0.04 0.21 047840 T 0.02 0.07 0.07 0.06 0.05 C 0.98 0.93 0.93 0.94 0.95 0.04 0.13 0.13 0.12 0.10 047977 T 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 C 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.05 0.04 0.00 0.02 048072 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 048162 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 048169 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 048199 T 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 048321 G 0.37 0.34 0.20 0.06 0.24 A 0.63 0.66 0.80 0.94 0.76 0.46 0.45 0.33 0.12 0.37 048421 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 048472 G 0.23 0.12 0.16 0.07 0.14 C 0.77 0.88 0.84 0.93 0.86 0.35 0.21 0.27 0.12 0.25 048617 A 0.12 0.25 0.05 0.00 0.10 C 0.88 0.75 0.95 1.00 0.90 0.21 0.38 0.09 0.00 0.18 048735 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 048736 C 0.00 0.05 0.09 0.10 0.06 A 1.00 0.95 0.91 0.90 0.94 0.00 0.09 0.17 0.19 0.11 048777 C 0.02 0.09 0.07 0.06 0.06 G 0.98 0.91 0.93 0.94 0.94 0.04 0.17 0.13 0.12 0.11 048903 G 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 A 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.04 0.00 0.02 048996 C 0.22 0.11 0.16 0.06 0.14 T 0.78 0.89 0.84 0.94 0.86 0.35 0.20 0.27 0.12 0.24 049274 A 0.04 0.24 0.03 0.00 0.07 G 0.96 0.76 0.97 1.00 0.93 0.07 0.36 0.05 0.00 0.13 049290 A 0.13 0.24 0.05 0.00 0.10 G 0.87 0.76 0.95 1.00 0.90 0.23 0.36 0.09 0.00 0.19 049453 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 049581 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 049794 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 049835 T 0.02 0.07 0.11 0.00 0.05 G 0.98 0.93 0.89 1.00 0.95 0.04 0.13 0.20 0.00 0.09 049870 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 049903 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 050028 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 050224 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 050339 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 050444 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 050463 G 0.40 0.43 0.27 0.12 0.31 A 0.60 0.57 0.73 0.88 0.69 0.48 0.49 0.40 0.22 0.43 050625 A 0.48 0.43 0.27 0.12 0.33 G 0.52 0.57 0.73 0.88 0.67 0.50 0.49 0.40 0.22 0.44 050867 T 0.02 0.10 0.08 0.02 0.05 A 0.98 0.90 0.92 0.98 0.95 0.04 0.17 0.15 0.05 0.10 051050 G 0.38 0.43 0.21 0.12 0.30 A 0.62 0.57 0.79 0.88 0.70 0.47 0.49 0.33 0.22 0.42 051182 T 0.02 0.26 0.07 0.00 0.08 C 0.98 0.74 0.93 1.00 0.92 0.04 0.39 0.12 0.00 0.15 051682 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 051699 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 051840 A 0.35 0.43 0.28 0.11 0.29 G 0.65 0.57 0.72 0.89 0.71 0.45 0.49 0.40 0.20 0.42 051917 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 052085 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 052202 A 0.41 0.43 0.27 0.14 0.32 T 0.59 0.57 0.73 0.86 0.68 0.48 0.49 0.40 0.24 0.43 052269 T 0.06 0.09 0.07 0.07 0.07 G 0.94 0.91 0.93 0.93 0.93 0.10 0.17 0.13 0.13 0.13 052304 A 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 052489 G 0.02 0.05 0.00 0.00 0.02 A 0.98 0.95 1.00 1.00 0.98 0.04 0.09 0.00 0.00 0.03 052498 C 0.35 0.43 0.27 0.13 0.30 G 0.65 0.57 0.73 0.87 0.70 0.46 0.49 0.40 0.23 0.42 052532 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 052570 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 052575 A 0.02 0.09 0.07 0.07 0.06 G 0.98 0.91 0.93 0.93 0.94 0.04 0.17 0.13 0.12 0.11 052651 C 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 052670 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 052721 T 0.41 0.43 0.27 0.12 0.31 C 0.59 0.57 0.73 0.88 0.69 0.48 0.49 0.40 0.22 0.43 052761 A 0.33 0.43 0.27 0.12 0.29 G 0.67 0.57 0.73 0.88 0.71 0.44 0.49 0.40 0.22 0.41 052779 C 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 052864 A 0.02 0.09 0.07 0.07 0.06 G 0.98 0.91 0.93 0.93 0.94 0.04 0.17 0.13 0.12 0.11 052890 G 0.48 0.43 0.27 0.13 0.33 A 0.52 0.57 0.73 0.87 0.67 0.50 0.49 0.40 0.23 0.44 052893 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 052941 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 052974 - 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 053048 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 053073 C 0.50 0.43 0.26 0.13 0.33 G 0.50 0.57 0.74 0.87 0.67 0.50 0.49 0.39 0.23 0.44 053326 T 0.00 0.07 0.00 0.00 0.02 C 1.00 0.93 1.00 1.00 0.98 0.00 0.13 0.00 0.00 0.03 053506 T 0.02 0.09 0.07 0.07 0.06 C 0.98 0.91 0.93 0.93 0.94 0.05 0.17 0.13 0.12 0.12 053518 A 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 053617 G 0.52 0.43 0.27 0.13 0.34 A 0.48 0.57 0.73 0.87 0.66 0.50 0.49 0.40 0.23 0.45 053664 C 0.02 0.09 0.07 0.07 0.06 T 0.98 0.91 0.93 0.93 0.94 0.05 0.17 0.13 0.12 0.12 066285 C 0.63 0.27 0.27 0.14 0.33 T 0.37 0.73 0.73 0.86 0.67 0.47 0.40 0.40 0.24 0.44 066433 G 0.02 0.09 0.07 0.07 0.06 T 0.98 0.91 0.93 0.93 0.94 0.04 0.17 0.13 0.13 0.12 066715 A 0.02 0.09 0.07 0.06 0.06 C 0.98 0.91 0.93 0.94 0.94 0.04 0.17 0.13 0.12 0.11 066796 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 066914 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 067003 T 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.05 067068 + 0.04 0.03 0.00 0.00 0.02 - 0.96 0.97 1.00 1.00 0.98 0.07 0.05 0.00 0.00 0.04 067152 G 0.04 0.24 0.06 0.00 0.08 T 0.96 0.76 0.94 1.00 0.92 0.08 0.36 0.12 0.00 0.14 067218 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 067438 G 0.02 0.11 0.09 0.05 0.06 A 0.98 0.89 0.91 0.95 0.94 0.04 0.20 0.16 0.09 0.11 067496 T 0.02 0.03 0.00 0.00 0.01 A 0.98 0.97 1.00 1.00 0.99 0.04 0.05 0.00 0.00 0.02 067659 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 067722 A 0.11 0.29 0.50 0.79 0.41 C 0.89 0.71 0.50 0.21 0.59 0.20 0.41 0.50 0.33 0.49 067765 G 0.02 0.07 0.12 0.02 0.05 C 0.98 0.93 0.88 0.98 0.95 0.04 0.13 0.21 0.04 0.10 068071 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 068107 C 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.15 0.00 0.00 0.00 0.05 068239 C 0.06 0.19 0.03 0.00 0.07 G 0.94 0.81 0.97 1.00 0.93 0.12 0.31 0.05 0.00 0.13 068328 C 0.21 0.32 0.12 0.03 0.17 A 0.79 0.68 0.88 0.97 0.83 0.33 0.43 0.21 0.05 0.29 068748 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 068787 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 068986 G 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 069029 A 0.00 0.30 0.50 0.77 0.38 G 1.00 0.70 0.50 0.23 0.62 0.00 0.42 0.50 0.35 0.47 069110 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 069113 A 0.02 0.11 0.06 0.07 0.06 G 0.98 0.89 0.94 0.93 0.94 0.04 0.19 0.10 0.14 0.12 069158 C 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 069270 T 0.27 0.00 0.00 0.00 0.08 A 0.73 1.00 1.00 1.00 0.92 0.39 0.00 0.00 0.00 0.14 069349 A 0.06 0.07 0.07 0.00 0.05 C 0.94 0.93 0.93 1.00 0.95 0.11 0.13 0.13 0.00 0.09 069781 A 0.06 0.24 0.02 0.00 0.08 G 0.94 0.76 0.98 1.00 0.92 0.12 0.36 0.05 0.00 0.15 069838 A 0.00 0.28 0.50 0.74 0.35 G 1.00 0.72 0.50 0.26 0.65 0.00 0.40 0.50 0.39 0.46 069874 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 069904 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 069998 G 0.00 0.29 0.50 0.74 0.35 T 1.00 0.71 0.50 0.26 0.65 0.00 0.41 0.50 0.39 0.46 075860 C 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 075935 C 0.32 0.39 0.25 0.09 0.25 T 0.68 0.61 0.75 0.91 0.75 0.43 0.48 0.38 0.16 0.38 075998 C 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 076085 G 0.07 0.24 0.05 0.00 0.09 A 0.93 0.76 0.95 1.00 0.91 0.13 0.36 0.10 0.00 0.16 076455 C 0.69 0.27 0.27 0.15 0.36 G 0.31 0.73 0.73 0.85 0.64 0.43 0.40 0.40 0.25 0.46 076595 A 0.00 0.32 0.50 0.76 0.38 G 1.00 0.68 0.50 0.24 0.62 0.00 0.43 0.50 0.36 0.47 076647 A 0.04 0.03 0.02 0.04 0.03 G 0.96 0.97 0.98 0.96 0.97 0.07 0.05 0.04 0.08 0.06 076713 C 0.67 0.26 0.26 0.15 0.35 A 0.33 0.74 0.74 0.85 0.65 0.44 0.39 0.39 0.25 0.45 076776 G 0.63 0.36 0.27 0.08 0.35 A 0.37 0.64 0.73 0.92 0.65 0.47 0.46 0.40 0.15 0.45 076801 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 076810 T 0.13 0.14 0.19 0.09 0.13 A 0.87 0.86 0.81 0.91 0.87 0.23 0.24 0.31 0.16 0.23 076821 C 0.13 0.17 0.20 0.09 0.15 A 0.87 0.83 0.80 0.91 0.85 0.23 0.28 0.33 0.16 0.25 076829 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 078555 G 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 C 0.83 1.00 1.00 1.00 0.95 0.29 0.00 0.00 0.00 0.09 078629 C 0.90 0.38 0.45 0.16 0.48 T 0.10 0.62 0.55 0.84 0.52 0.19 0.47 0.50 0.27 0.50 078917 T 0.34 0.00 0.00 0.00 0.08 G 0.66 1.00 1.00 1.00 0.92 0.45 0.00 0.00 0.00 0.15 079001 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 079074 C 0.28 0.00 0.00 0.00 0.07 T 0.72 1.00 1.00 1.00 0.93 0.41 0.00 0.00 0.00 0.14 079094 G 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 079185 A 0.04 0.25 0.41 0.74 0.35 G 0.96 0.75 0.59 0.26 0.65 0.08 0.38 0.48 0.39 0.46 079234 A 0.08 0.29 0.05 0.00 0.10 C 0.92 0.71 0.95 1.00 0.90 0.15 0.41 0.09 0.00 0.18 079257 C 0.70 0.50 0.27 0.13 0.41 T 0.30 0.50 0.73 0.87 0.59 0.42 0.50 0.40 0.23 0.48 079263 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 079508 G 0.00 0.07 0.07 0.08 0.05 T 1.00 0.93 0.93 0.92 0.95 0.00 0.13 0.13 0.15 0.10 079510 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 079573 A 0.33 0.00 0.00 0.00 0.10 C 0.67 1.00 1.00 1.00 0.90 0.44 0.00 0.00 0.00 0.18 079770 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 079919 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 080004 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 080104 - 0.11 0.00 0.02 0.00 0.03 + 0.89 1.00 0.98 1.00 0.97 0.20 0.00 0.04 0.00 0.07 080150 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 080288 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 080320 T 0.03 0.05 0.33 0.02 0.10 C 0.97 0.95 0.68 0.98 0.90 0.05 0.09 0.44 0.04 0.18 080322 A 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 080360 T 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 C 0.85 1.00 1.00 1.00 0.96 0.26 0.00 0.00 0.00 0.08 080536 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 080561 C 0.10 0.48 0.38 0.10 0.25 T 0.90 0.52 0.62 0.90 0.75 0.18 0.50 0.47 0.19 0.38 080886 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 081098 G 0.07 0.05 0.06 0.02 0.05 T 0.93 0.95 0.94 0.98 0.95 0.13 0.10 0.10 0.04 0.09 081532 G 0.05 0.00 0.03 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.97 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 0.00 0.04 081536 G 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.95 1.00 1.00 1.00 0.99 0.09 0.00 0.00 0.00 0.02 081615 A 0.00 0.00 0.03 0.02 0.01 G 1.00 1.00 0.97 0.98 0.99 0.00 0.00 0.05 0.04 0.02 081872 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 082229 C 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.04 082282 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 082308 - 0.00 0.15 0.03 0.09 0.06 + 1.00 0.85 0.97 0.91 0.94 0.00 0.26 0.06 0.17 0.12 082338 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 082349 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 082396 G 0.28 0.07 0.06 0.00 0.12 A 0.72 0.93 0.94 1.00 0.88 0.40 0.14 0.11 0.00 0.21 082448 A 0.02 0.30 0.48 0.81 0.39 G 0.98 0.70 0.52 0.19 0.61 0.04 0.42 0.50 0.30 0.48 082549 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 082806 A 0.05 0.00 0.03 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.97 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 0.00 0.04 083009 A 0.04 0.00 0.03 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.97 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 0.00 0.03 083044 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 083133 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 083461 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 083529 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 083854 T 0.03 0.00 0.18 0.00 0.04 C 0.97 1.00 0.82 1.00 0.96 0.05 0.00 0.29 0.00 0.08 083862 T 0.00 0.19 0.00 0.05 0.06 C 1.00 0.81 1.00 0.95 0.94 0.00 0.30 0.00 0.10 0.11 084024 G 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.95 1.00 1.00 1.00 0.99 0.09 0.00 0.00 0.00 0.03 084252 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 084329 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 084368 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 084500 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 084567 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 085031 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 085140 - 0.56 0.60 0.32 0.22 0.43 + 0.44 0.40 0.68 0.78 0.57 0.49 0.48 0.43 0.34 0.49 085305 A 0.10 0.05 0.05 0.00 0.05 G 0.90 0.95 0.95 1.00 0.95 0.17 0.09 0.09 0.00 0.10 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002997: GTTA 004556: A 005243: AG 006940: a 012108: T 025133: A 050224: ga 052974: ATAAACAT 067068: T 080104: CA 082308: TA 085140: T