Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000122 T 0.46 0.34 0.43 0.42 0.41 C 0.54 0.66 0.57 0.58 0.59 0.50 0.45 0.49 0.49 0.49 000185 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 000209 A 0.48 0.34 0.48 0.42 0.43 C 0.52 0.66 0.52 0.58 0.57 0.50 0.45 0.50 0.49 0.49 000244 G 0.67 0.34 0.48 0.42 0.48 T 0.33 0.66 0.52 0.58 0.52 0.44 0.45 0.50 0.49 0.50 000254 A 0.67 0.34 0.48 0.42 0.48 G 0.33 0.66 0.52 0.58 0.52 0.44 0.45 0.50 0.49 0.50 000315 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000687 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000693 T 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 A 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.04 0.00 0.02 000862 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001567 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 001573 T 0.00 0.07 0.00 0.02 0.02 C 1.00 0.93 1.00 0.98 0.98 0.00 0.13 0.00 0.04 0.04 001664 A 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 G 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.05 0.04 0.00 0.02 001845 - 0.11 0.02 0.00 0.00 0.04 + 0.89 0.98 1.00 1.00 0.96 0.20 0.04 0.00 0.00 0.07 002006 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 002008 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 003222 T 0.12 0.02 0.03 0.03 0.05 C 0.88 0.98 0.97 0.97 0.95 0.22 0.05 0.05 0.05 0.10 004127 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 004179 A 0.04 0.00 0.03 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.97 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 0.00 0.03 005100 T 0.20 0.33 0.38 0.37 0.31 C 0.80 0.68 0.62 0.63 0.69 0.32 0.44 0.47 0.47 0.43 005743 G 0.20 0.00 0.03 0.00 0.07 A 0.80 1.00 0.97 1.00 0.93 0.32 0.00 0.05 0.00 0.12 005793 A 0.24 0.00 0.03 0.00 0.08 G 0.76 1.00 0.97 1.00 0.92 0.37 0.00 0.05 0.00 0.14 005974 T 0.19 0.33 0.39 0.39 0.31 C 0.81 0.68 0.61 0.61 0.69 0.30 0.44 0.47 0.47 0.43 006009 G 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.06 006049 C 0.04 0.00 0.03 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.97 1.00 0.98 0.07 0.00 0.05 0.00 0.03 006125 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 006126 T 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 006180 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 006363 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 006408 T 0.59 0.34 0.47 0.37 0.45 C 0.41 0.66 0.53 0.63 0.55 0.48 0.45 0.50 0.47 0.50 006470 G 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 006563 A 0.13 0.00 0.03 0.00 0.04 G 0.87 1.00 0.97 1.00 0.96 0.23 0.00 0.05 0.00 0.08 006590 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 006591 T 0.13 0.00 0.05 0.00 0.05 A 0.87 1.00 0.95 1.00 0.95 0.23 0.00 0.10 0.00 0.09 006616 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 006665 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 006719 T 0.00 0.00 0.12 0.00 0.03 C 1.00 1.00 0.88 1.00 0.97 0.00 0.00 0.22 0.00 0.05 006788 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 006810 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 006865 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 007232 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 007525 C 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.07 0.00 0.04 0.00 0.03 007526 T 0.04 0.18 0.09 0.25 0.14 G 0.96 0.82 0.91 0.75 0.86 0.07 0.30 0.17 0.38 0.24 007646 G 0.69 0.36 0.45 0.38 0.48 A 0.31 0.64 0.55 0.62 0.52 0.43 0.46 0.50 0.47 0.50 007657 A 0.67 0.34 0.45 0.35 0.46 G 0.33 0.66 0.55 0.65 0.54 0.44 0.45 0.50 0.45 0.50 007835 C 0.00 0.03 0.03 0.00 0.01 A 1.00 0.97 0.97 1.00 0.99 0.00 0.05 0.05 0.00 0.02 008193 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 008242 C 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 008331 C 0.07 0.33 0.38 0.36 0.27 T 0.93 0.68 0.62 0.64 0.73 0.12 0.44 0.47 0.46 0.40 008386 - 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 008464 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 008574 A 0.04 0.11 0.05 0.00 0.05 T 0.96 0.89 0.95 1.00 0.95 0.07 0.20 0.09 0.00 0.09 008602 C 0.59 0.34 0.43 0.36 0.44 T 0.41 0.66 0.57 0.64 0.56 0.48 0.45 0.49 0.46 0.49 008671 A 0.09 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.91 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 009367 T 0.69 0.36 0.48 0.38 0.49 C 0.31 0.64 0.52 0.62 0.51 0.43 0.46 0.50 0.47 0.50 009704 T 0.60 0.34 0.43 0.38 0.44 G 0.40 0.66 0.57 0.62 0.56 0.48 0.45 0.49 0.47 0.49 009763 G 0.00 0.11 0.00 0.00 0.03 T 1.00 0.89 1.00 1.00 0.97 0.00 0.20 0.00 0.00 0.05 010019 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 010267 A 0.19 0.23 0.24 0.17 0.21 G 0.81 0.78 0.76 0.82 0.79 0.31 0.35 0.36 0.29 0.33 010271 C 0.19 0.23 0.21 0.17 0.20 T 0.81 0.78 0.79 0.82 0.80 0.31 0.35 0.34 0.29 0.32 010283 T 0.19 0.23 0.21 0.17 0.20 G 0.81 0.78 0.79 0.82 0.80 0.31 0.35 0.34 0.29 0.32 010286 + 0.19 0.23 0.21 0.17 0.20 - 0.81 0.78 0.79 0.82 0.80 0.31 0.35 0.34 0.29 0.32 010697 A 0.13 0.00 0.02 0.00 0.04 G 0.87 1.00 0.98 1.00 0.96 0.23 0.00 0.04 0.00 0.08 010703 G 0.69 0.36 0.45 0.35 0.47 C 0.31 0.64 0.55 0.65 0.53 0.43 0.46 0.50 0.45 0.50 010784 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 011154 T 0.12 0.00 0.02 0.00 0.04 A 0.88 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.04 0.00 0.07 011199 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 011334 T 0.08 0.24 0.20 0.48 0.25 C 0.92 0.76 0.80 0.52 0.75 0.14 0.36 0.33 0.50 0.37 011421 T 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 011498 A 0.58 0.33 0.45 0.38 0.44 G 0.42 0.67 0.55 0.62 0.56 0.49 0.44 0.50 0.47 0.49 011504 T 0.67 0.36 0.48 0.38 0.48 C 0.33 0.64 0.52 0.62 0.52 0.44 0.46 0.50 0.47 0.50 011624 G 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 012837 - 0.59 0.36 0.48 0.38 0.46 + 0.41 0.64 0.52 0.62 0.54 0.48 0.46 0.50 0.47 0.50 012846 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 012847 A 0.02 0.19 0.09 0.25 0.13 G 0.98 0.81 0.91 0.75 0.87 0.04 0.31 0.17 0.38 0.23 012882 C 0.00 0.17 0.30 0.12 0.14 T 1.00 0.83 0.70 0.88 0.86 0.00 0.28 0.42 0.22 0.24 012977 A 0.44 0.36 0.43 0.38 0.40 G 0.56 0.64 0.57 0.62 0.60 0.49 0.46 0.49 0.47 0.48 013358 - 0.14 0.00 0.00 0.00 0.03 + 0.86 1.00 1.00 1.00 0.97 0.24 0.00 0.00 0.00 0.06 013388 + 0.20 0.00 0.02 0.00 0.07 - 0.80 1.00 0.98 1.00 0.93 0.32 0.00 0.04 0.00 0.12 013439 C 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 013936 T 0.02 0.19 0.09 0.25 0.13 C 0.98 0.81 0.91 0.75 0.87 0.04 0.31 0.17 0.38 0.23 014418 T 0.02 0.00 0.03 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.05 0.00 0.03 014540 T 0.00 0.00 0.00 0.17 0.04 C 1.00 1.00 1.00 0.83 0.96 0.00 0.00 0.00 0.28 0.08 014994 G 0.69 0.31 0.45 0.39 0.47 A 0.31 0.69 0.55 0.61 0.53 0.43 0.43 0.50 0.48 0.50 015031 G 0.09 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.91 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 015139 G 0.24 0.00 0.03 0.00 0.08 A 0.76 1.00 0.97 1.00 0.92 0.37 0.00 0.05 0.00 0.14 015242 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 015263 G 0.09 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.91 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 015484 T 0.69 0.36 0.45 0.38 0.48 C 0.31 0.64 0.55 0.62 0.52 0.43 0.46 0.50 0.47 0.50 015537 C 0.59 0.34 0.45 0.38 0.45 A 0.41 0.66 0.55 0.62 0.55 0.48 0.45 0.50 0.47 0.49 016087 G 0.02 0.05 0.02 0.00 0.02 C 0.98 0.95 0.98 1.00 0.98 0.04 0.10 0.05 0.00 0.04 016216 T 0.00 0.00 0.11 0.07 0.04 C 1.00 1.00 0.89 0.93 0.96 0.00 0.00 0.20 0.12 0.08 016278 T 0.19 0.33 0.40 0.35 0.31 G 0.81 0.67 0.60 0.65 0.69 0.30 0.44 0.48 0.45 0.43 016322 T 0.24 0.00 0.02 0.00 0.08 C 0.76 1.00 0.98 1.00 0.92 0.37 0.00 0.04 0.00 0.14 016342 G 0.59 0.33 0.45 0.35 0.44 A 0.41 0.67 0.55 0.65 0.56 0.48 0.44 0.50 0.45 0.49 016366 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 016616 T 0.06 0.00 0.02 0.00 0.02 G 0.94 1.00 0.98 1.00 0.98 0.10 0.00 0.04 0.00 0.04 016617 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 016624 A 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 016731 G 0.09 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.91 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 016930 + 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 - 1.00 1.00 0.95 1.00 0.99 0.00 0.00 0.09 0.00 0.02 017027 C 0.02 0.00 0.02 0.19 0.06 A 0.98 1.00 0.98 0.81 0.94 0.04 0.00 0.04 0.30 0.11 017173 * 017395 + 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 - 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 017427 - 0.09 0.00 0.00 0.00 0.03 + 0.91 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 017542 G 0.66 0.38 0.43 0.38 0.46 A 0.34 0.62 0.57 0.62 0.54 0.45 0.47 0.49 0.47 0.50 017547 A 0.68 0.38 0.43 0.38 0.47 G 0.32 0.62 0.57 0.62 0.53 0.43 0.47 0.49 0.47 0.50 017685 C 0.69 0.39 0.43 0.37 0.48 T 0.31 0.61 0.57 0.63 0.52 0.43 0.47 0.49 0.47 0.50 018153 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 018349 A 0.69 0.39 0.45 0.38 0.48 G 0.31 0.61 0.55 0.62 0.52 0.43 0.47 0.50 0.47 0.50 018365 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018837 + 0.04 0.34 0.27 0.12 0.18 - 0.96 0.66 0.73 0.88 0.82 0.07 0.45 0.40 0.22 0.30 019143 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 019285 T 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 A 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.04 0.00 0.02 019326 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 019689 A 0.13 0.00 0.02 0.00 0.04 G 0.87 1.00 0.98 1.00 0.96 0.23 0.00 0.04 0.00 0.08 019706 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 019997 G 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.07 0.00 0.04 0.00 0.03 020040 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 020070 - 0.06 0.36 0.38 0.38 0.28 + 0.94 0.64 0.62 0.62 0.72 0.11 0.46 0.47 0.47 0.41 020119 G 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 020172 C 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 020564 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 020627 G 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 020639 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 020643 T 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 020653 T 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 020666 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 020712 T 0.60 0.36 0.45 0.38 0.45 C 0.40 0.64 0.55 0.62 0.55 0.48 0.46 0.50 0.47 0.50 020797 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 020804 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 021108 C 0.61 0.38 0.41 0.36 0.43 T 0.39 0.62 0.59 0.64 0.57 0.48 0.47 0.48 0.46 0.49 021225 G 0.23 0.00 0.00 0.00 0.06 A 0.77 1.00 1.00 1.00 0.94 0.36 0.00 0.00 0.00 0.10 021532 C 0.58 0.32 0.47 0.47 0.47 G 0.42 0.68 0.53 0.53 0.53 0.49 0.44 0.50 0.50 0.50 021565 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 021836 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 022416 - 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 + 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.07 022650 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 022789 A 0.58 0.38 0.44 0.38 0.46 C 0.42 0.62 0.56 0.62 0.54 0.49 0.47 0.49 0.47 0.50 022924 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 022949 T 0.04 0.00 0.03 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.97 1.00 0.98 0.07 0.00 0.05 0.00 0.03 023004 C 0.00 0.09 0.00 0.02 0.03 G 1.00 0.91 1.00 0.98 0.97 0.00 0.17 0.00 0.04 0.05 023008 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 023396 A 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 023418 - 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 + 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 023515 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 023729 G 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 024198 T 0.23 0.00 0.02 0.00 0.07 A 0.77 1.00 0.98 1.00 0.93 0.36 0.00 0.04 0.00 0.13 024253 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 024350 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 024562 G 0.58 0.36 0.45 0.38 0.45 A 0.42 0.64 0.55 0.62 0.55 0.49 0.46 0.50 0.47 0.49 024574 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 024687 - 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 + 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 024748 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 024781 G 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 025048 C 0.00 0.16 0.27 0.12 0.13 G 1.00 0.84 0.73 0.88 0.87 0.00 0.27 0.40 0.22 0.23 025159 T 0.27 0.00 0.02 0.00 0.08 C 0.73 1.00 0.98 1.00 0.92 0.39 0.00 0.04 0.00 0.14 025185 T 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 025308 C 0.00 0.19 0.09 0.06 0.08 A 1.00 0.81 0.91 0.94 0.92 0.00 0.31 0.17 0.12 0.15 025426 + 0.27 0.00 0.02 0.00 0.08 - 0.73 1.00 0.98 1.00 0.92 0.39 0.00 0.04 0.00 0.14 025822 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 025927 A 0.59 0.36 0.45 0.40 0.46 G 0.41 0.64 0.55 0.60 0.54 0.48 0.46 0.50 0.48 0.50 025989 - 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 + 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 026040 T 0.06 0.36 0.36 0.38 0.28 C 0.94 0.64 0.64 0.62 0.72 0.10 0.46 0.46 0.47 0.40 026089 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 026261 A 0.14 0.00 0.02 0.00 0.04 G 0.86 1.00 0.98 1.00 0.96 0.24 0.00 0.04 0.00 0.08 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000862: c 001845: accc 008386: tct 010286: AA 012837: ctt 013358: agtt 013388: T 016930: t 017395: G 017427: a 018837: A 020070: caaa 022416: c 023418: gttac 024687: ta 025426: G 025822: caga 025989: ag Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop 017173 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 0.98 0.99