Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 chi2 000463 CC 19 21 85 CG 5 0 5 GG 2 0 2 2.800 0.000 15.911 000620 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 27 20 92 0.000 0.050 0.011 000655 AA 0 0 0 AG 6 2 9 GG 21 20 85 0.422 0.050 0.238 000720 CC 19 8 66 CT 7 10 20 TT 1 4 8 0.120 0.079 9.201 000754 AA 10 6 50 AG 9 11 29 GG 8 4 15 2.934 0.069 7.564 000802 CC 18 21 80 CT 5 0 5 TT 2 0 2 2.600 0.000 14.922 000860 CC 20 19 80 CT 5 2 7 TT 0 0 0 0.309 0.053 0.153 001013 CC 25 20 86 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.003 001235 AA 0 0 0 AG 0 0 1 GG 25 21 86 0.000 0.000 0.003 005175 AA 0 0 0 AG 4 2 7 GG 21 20 83 0.189 0.050 0.147 005282 AA 0 0 0 AG 0 0 5 GG 26 22 88 0.000 0.000 0.071 005531 AA 25 20 91 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.010 0.000 0.003 005596 ++ 26 20 92 +- 1 0 1 -- 0 0 0 0.010 0.000 0.003 005777 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 25 22 92 0.010 0.000 0.003 005861 CC 0 0 0 CT 0 0 3 TT 26 22 90 0.000 0.000 0.025 005864 GG 2 4 9 GT 9 12 25 TT 15 6 59 0.154 0.220 5.527 005918 CC 3 4 10 CT 8 12 24 TT 15 6 59 1.236 0.220 7.582 005925 AA 0 0 0 AG 0 0 5 GG 26 22 88 0.000 0.000 0.071 005956 AA 2 4 9 AG 9 12 25 GG 15 6 59 0.154 0.220 5.527 006012 GG 8 4 15 GT 8 12 29 TT 10 6 49 3.773 0.220 7.298 006219 CC 26 22 87 CT 0 0 6 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.103 007557 ++ 26 22 93 +- 1 0 1 -- 0 0 0 0.010 0.000 0.003 008068 AA 26 22 92 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.003 008190 CC 15 6 60 CG 9 12 25 GG 3 4 10 0.773 0.220 7.030 008228 CC 25 22 93 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.040 0.000 0.011 008349 AA 26 22 94 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.010 0.000 0.003 008553 CC 26 22 94 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.010 0.000 0.003 008951 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 21 20 79 0.012 0.000 0.003 008967 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 20 80 0.012 0.000 0.003 008974 CC 18 18 74 CT 4 2 7 TT 0 0 0 0.220 0.055 0.165 008982 CC 12 5 51 CT 8 11 22 TT 2 4 8 0.153 0.211 4.808 008996 AA 22 20 80 AG 0 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.003 009276 CC 12 5 51 CT 8 11 22 TT 2 4 8 0.153 0.211 4.808 016110 AA 26 22 93 AG 0 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.003 016390 CC 0 0 0 CT 0 0 1 TT 26 22 93 0.000 0.000 0.003 016555 AA 18 22 86 AG 6 0 6 GG 2 0 2 1.719 0.000 12.612 016602 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 25 22 93 0.040 0.000 0.011 016897 AA 12 6 56 AC 10 12 26 CC 3 4 9 0.164 0.220 4.432 017268 ++ 8 4 14 +- 9 12 31 -- 9 6 46 2.445 0.220 4.507 017269 CC 20 21 84 CT 6 1 7 TT 0 0 0 0.442 0.012 0.146 017336 GG 0 0 0 GT 0 0 1 TT 26 22 91 0.000 0.000 0.003 017563 GG 24 22 89 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.003 033440 AA 21 20 86 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.003 033453 CC 21 21 87 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.003 033492 GG 13 7 59 GT 7 9 19 TT 1 4 7 0.002 0.126 6.931 033520 GG 21 20 85 GT 0 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.003 033588 ++ 14 19 75 +- 4 0 4 -- 2 0 2 2.812 0.000 18.201 033621 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 25 22 91 0.010 0.000 0.003 033688 AA 0 0 0 AG 5 5 11 GG 22 17 83 0.281 0.362 0.363 033887 AA 0 0 0 AG 0 0 1 GG 27 22 94 0.000 0.000 0.003 034086 AA 1 4 8 AT 8 10 21 TT 18 8 66 0.009 0.079 8.277 034115 CC 23 22 90 CT 4 0 5 TT 0 0 0 0.173 0.000 0.069 035008 ++ 18 7 63 +- 8 10 21 -- 1 4 8 0.009 0.016 7.715 035017 CC 13 11 61 CT 4 0 8 TT 2 0 2 2.554 0.000 5.245 035240 AA 25 20 89 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.010 0.000 0.003 045874 ++ 27 22 94 +- 0 0 1 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.003 046126 CC 24 11 72 CT 1 11 17 TT 0 0 0 0.010 2.444 0.992 046212 CC 25 18 83 CG 0 4 6 GG 0 0 0 0.000 0.220 0.108 046576 AA 25 22 89 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.003 046585 CC 26 21 88 CT 0 1 2 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.011 048016 AA 2 0 2 AG 5 2 8 GG 17 15 73 2.400 0.066 6.572 066832 AA 11 6 18 AC 12 10 30 CC 2 5 39 0.265 0.043 6.234 066889 CC 0 0 0 CT 0 0 1 TT 25 21 86 0.000 0.000 0.003 067023 CC 23 21 86 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.043 0.000 0.012 067124 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 23 21 86 0.043 0.000 0.012 067142 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 23 21 86 0.043 0.000 0.012 067200 AA 0 1 1 AT 5 6 16 TT 20 14 71 0.309 0.114 0.009 067427 AA 22 21 85 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.012 067470 CC 0 0 0 CT 0 0 3 TT 24 21 83 0.000 0.000 0.027 067623 ++ 26 20 90 +- 1 0 1 -- 0 0 0 0.010 0.000 0.003 067824 CC 24 21 91 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.093 0.000 0.025 068047 ++ 25 21 92 +- 2 0 2 -- 0 0 0 0.040 0.000 0.011 068053 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 25 21 92 0.040 0.000 0.011 068141 GG 0 0 0 GT 5 1 6 TT 22 20 88 0.281 0.012 0.102 068165 AA 27 20 93 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.003 068233 CC 27 20 93 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.003 068398 AA 10 5 17 AG 10 10 28 GG 7 7 50 1.687 0.153 10.323 069031 AA 25 22 93 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.040 0.000 0.011 069372 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 24 22 92 0.093 0.000 0.024 069386 AA 27 20 93 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.050 0.011 069406 GG 0 0 0 GT 6 0 6 TT 21 22 89 0.422 0.000 0.101 069432 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 25 22 93 0.040 0.000 0.011 069645 CC 15 20 79 CT 10 2 13 TT 2 0 2 0.034 0.050 2.385 082026 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 23 22 84 0.043 0.000 0.012 097772 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 25 22 92 0.040 0.000 0.011 097977 CC 26 22 93 CT 0 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.003 099128 AA 0 1 1 AG 5 7 18 GG 20 11 63 0.309 0.007 0.051 122878 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 24 22 92 0.093 0.000 0.024 123047 AA 26 22 93 AC 0 0 1 CC 0 0 0 0.000 0.000 0.003 123049 AA 15 20 76 AC 9 2 16 CC 2 0 2 0.154 0.050 1.032 123102 CC 2 0 2 CT 8 2 15 TT 15 20 76 0.377 0.050 1.355 123112 ++ 25 22 93 +- 1 0 1 -- 0 0 0 0.010 0.000 0.003 123422 CC 26 22 93 CT 0 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.003 123431 AA 9 1 10 AG 10 11 33 GG 7 10 51 1.330 0.889 1.661 123477 CC 24 22 92 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.042 0.000 0.011 123683 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 25 20 91 0.040 0.000 0.011 123966 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 27 19 92 0.000 0.013 0.003 123971 AA 23 20 89 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.173 0.000 0.045 124043 CC 26 19 91 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.013 0.003 135698 AA 0 0 0 AG 0 0 1 GG 27 22 94 0.000 0.000 0.003 135781 CC 27 22 94 CT 0 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.003 135876 CC 14 20 75 CT 11 2 18 TT 2 0 2 0.006 0.050 0.530 135952 AA 27 22 94 AG 0 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.003 136202 AA 2 0 2 AG 11 2 18 GG 14 20 75 0.006 0.050 0.530 136272 CC 12 2 15 CT 13 9 33 TT 1 10 44 1.236 0.000 3.809 160506 AA 27 22 94 AG 0 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.003 160603 ++ 27 21 93 +- 0 1 2 -- 0 0 0 0.000 0.012 0.011 160840 AA 0 0 0 AG 0 0 1 GG 27 21 93 0.000 0.000 0.003 161045 CC 9 1 10 CT 10 10 31 TT 8 10 51 1.801 0.583 2.328 175458 AA 22 20 86 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.003 175883 ++ 16 20 77 +- 9 2 16 -- 2 0 2 0.210 0.050 1.065 175899 CC 25 22 93 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.003 175962 GG 3 10 47 GT 13 11 36 TT 10 1 11 0.159 0.889 0.985 176032 GG 22 22 90 GT 4 0 4 TT 0 0 0 0.181 0.000 0.044 176169 AA 20 22 85 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.012 176220 CC 0 0 0 CT 0 0 1 TT 19 22 85 0.000 0.000 0.003 176258 ++ 17 21 83 +- 3 1 4 -- 0 0 0 0.131 0.012 0.048 176469 CC 0 0 0 CG 6 0 6 GG 15 22 82 0.583 0.000 0.110 176483 ++ 0 0 0 +- 2 0 2 -- 20 22 87 0.050 0.000 0.011 176588 AA 23 19 87 AG 0 3 3 GG 0 0 0 0.000 0.118 0.026 176827 GG 25 22 87 GT 0 0 5 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.072 201680 CC 26 22 93 CT 0 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.003 202109 AA 24 22 92 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.042 0.000 0.011 202135 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 24 21 91 0.042 0.000 0.011 202344 AA 0 0 0 AG 0 0 1 GG 26 22 91 0.000 0.000 0.003 202561 AA 27 22 94 AG 0 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.003 202890 ++ 26 22 93 +- 0 0 1 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.003 203612 CC 0 0 0 CT 2 0 3 TT 24 22 91 0.042 0.000 0.025 235462 CC 27 21 93 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.003 235681 CC 0 0 0 CG 0 0 1 GG 27 22 94 0.000 0.000 0.003 235788 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 27 21 94 0.000 0.012 0.003 236149 CC 19 12 70 CG 7 9 23 GG 1 1 2 0.120 0.182 0.005 237652 AA 25 22 93 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.010 0.000 0.003 256557 ++ 21 22 89 +- 4 0 4 -- 0 0 0 0.189 0.000 0.045 256652 CC 24 22 92 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.003 256790 CC 25 22 90 CT 0 0 3 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.025 256842 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 23 22 91 0.043 0.000 0.011 256875 AA 0 0 0 AC 2 1 4 CC 23 21 89 0.043 0.012 0.045 256940 AA 0 1 1 AG 0 5 11 GG 25 16 81 0.000 0.499 0.758 257289 CC 0 0 0 CG 1 7 14 GG 25 14 79 0.010 0.840 0.616 257297 CC 26 21 92 CG 0 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.003 257341 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 25 21 92 0.010 0.000 0.003 257532 CC 26 20 92 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.003 257570 CC 25 21 92 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.003 257578 CC 25 21 92 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.003 257621 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 25 21 92 0.010 0.000 0.003 258125 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 24 22 92 0.042 0.000 0.011 258203 CC 23 22 91 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.097 0.000 0.025 258484 ++ 15 20 75 +- 9 2 16 -- 2 0 2 0.154 0.050 0.998 258677 AA 24 22 90 AG 0 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.003 269023 CC 14 1 15 CT 10 7 24 TT 0 9 37 1.662 0.057 7.335 269562 CC 22 20 81 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.102 0.000 0.028 292721 CC 0 0 0 CT 0 0 1 TT 25 17 78 0.000 0.000 0.003 292842 CC 26 20 85 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.003 292999 AA 27 21 92 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.003 293087 AA 27 21 91 AG 0 1 2 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.011 293386 CC 13 0 13 CT 9 10 31 TT 4 10 45 1.185 2.222 3.558 293440 GG 25 21 91 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.040 0.000 0.011 293443 AA 27 20 92 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.012 0.003 293448 AA 27 21 92 AG 0 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.003 293539 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 27 20 92 0.000 0.012 0.003 293621 GG 0 0 0 GT 2 0 2 TT 25 21 89 0.040 0.000 0.011 294006 AA 24 21 91 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.042 0.000 0.011 294183 AA 0 0 0 AC 0 0 1 CC 23 19 78 0.000 0.000 0.003 294367 AA 25 21 87 AT 0 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.003 294540 CC 25 21 89 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.003 294633 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 23 22 88 0.043 0.000 0.011 294681 AA 5 0 5 AG 13 0 16 GG 7 22 69 0.055 0.000 7.092 294769 ++ 25 22 91 +- 0 0 1 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.003 294805 AA 8 22 71 AG 13 0 16 GG 4 0 4 0.113 0.000 4.901 326848 GG 24 22 91 GT 3 0 4 TT 0 0 0 0.093 0.000 0.044 327033 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 25 22 93 0.040 0.000 0.011 327081 AA 26 22 94 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.010 0.000 0.003 327138 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 27 21 94 0.000 0.012 0.003 327180 AA 0 0 1 AG 0 0 0 GG 27 22 94 0.000 0.000 95.000 327264 AA 26 22 94 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.010 0.000 0.003 327302 AA 26 22 94 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.010 0.000 0.003 327489 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 26 22 93 0.010 0.000 0.003 327578 CC 23 22 90 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.173 0.000 0.044 328265 ++ 18 12 68 +- 6 10 23 -- 0 0 0 0.490 1.903 1.904 328281 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 22 88 0.198 0.000 0.045 328416 AA 12 12 63 AG 10 10 27 GG 2 0 2 0.002 1.903 0.207 328438 AA 0 0 0 AG 2 1 3 GG 22 21 89 0.045 0.012 0.025 328508 CC 23 22 91 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.003 328526 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 22 89 0.107 0.000 0.025 328594 CC 22 22 90 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.011 328645 CC 23 22 91 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.003 372412 ++ 13 8 50 +- 8 6 17 -- 2 0 3 0.221 1.041 0.935 372556 CC 0 0 0 CG 0 1 2 GG 27 21 93 0.000 0.012 0.011 372668 CC 16 12 67 CT 9 10 26 TT 2 0 2 0.210 1.903 0.081 372902 AA 16 11 60 AT 8 8 21 TT 1 0 1 0.000 1.351 0.315 373970 GG 23 22 91 GT 4 0 4 TT 0 0 0 0.173 0.000 0.044 374086 AA 27 22 94 AG 0 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.003 411927 ++ 0 0 0 +- 3 0 3 -- 18 18 71 0.124 0.000 0.032 412026 CC 21 18 73 CT 0 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.003 412819 AA 25 22 93 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.040 0.000 0.011 443742 AA 24 22 92 AT 2 0 2 TT 0 0 0 0.042 0.000 0.011 443828 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 27 21 94 0.000 0.012 0.003 443936 CC 0 9 45 CT 7 11 24 TT 20 2 26 0.599 0.279 21.316 443950 CC 27 22 94 CG 0 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.003 443990 CC 11 2 17 CT 13 11 31 TT 3 9 47 0.084 0.279 7.188 444145 CC 17 22 85 CT 8 0 8 TT 2 0 2 0.551 0.000 7.901 445392 AA 17 20 75 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.131 0.000 0.030 445510 CC 21 21 81 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.003 445916 CC 22 21 81 CT 0 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.003 473979 GG 26 22 92 GT 1 0 3 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.024 474029 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 23 22 91 0.173 0.000 0.044 474063 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 24 22 92 0.093 0.000 0.024 474086 CC 3 0 4 CT 11 0 15 TT 13 22 76 0.084 0.000 6.324 474362 GG 24 22 92 GT 3 0 3 TT 0 0 0 0.093 0.000 0.024 474405 AA 27 21 94 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.012 0.003 474891 CC 19 21 83 CG 7 0 7 GG 1 0 1 0.120 0.000 3.006 474973 AA 23 21 87 AC 4 0 4 CC 0 0 0 0.173 0.000 0.046 475003 AA 0 0 0 AG 0 0 1 GG 27 21 90 0.000 0.000 0.003 475104 CC 0 0 0 CT 1 0 3 TT 26 21 88 0.010 0.000 0.026 475160 GG 27 21 90 GT 0 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.003 475254 GG 27 21 90 GT 0 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.003 475331 GG 24 21 87 GT 3 0 3 TT 0 0 0 0.093 0.000 0.026 475509 AA 27 17 85 AC 0 4 6 CC 0 0 0 0.000 0.233 0.106 475652 CC 22 2 27 CT 5 9 21 TT 0 10 43 0.281 0.000 24.961 475696 CC 12 21 75 CT 11 0 12 TT 4 0 4 0.308 0.000 9.667 475856 GG 0 0 0 GT 10 0 11 TT 16 21 79 1.474 0.000 0.381 475895 AA 0 0 0 AG 0 0 1 GG 27 21 90 0.000 0.000 0.003 500332 AA 22 18 82 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.003 500394 CC 21 22 88 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.189 0.000 0.045 500395 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 21 22 88 0.189 0.000 0.045 500410 AA 7 11 41 AG 12 11 40 GG 6 0 11 0.037 2.444 0.067 500588 AA 2 8 28 AG 8 11 42 GG 16 3 23 0.462 0.065 0.824 500650 AA 0 0 1 AG 0 0 2 GG 26 22 90 0.000 0.000 22.239 500794 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 25 22 92 0.010 0.000 0.003 500844 AA 1 0 1 AG 12 6 22 GG 13 16 70 0.778 0.548 0.256 501432 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 21 89 0.011 0.000 0.003 501505 CC 0 0 1 CT 0 0 2 TT 24 21 88 0.000 0.000 21.739 501810 AA 6 0 11 AG 12 11 40 GG 7 10 40 0.037 2.644 0.042 501881 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 22 85 0.011 0.000 0.003 501967 GG 22 22 84 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.012 502171 AA 24 22 85 AG 0 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.003 502298 CC 2 0 2 CT 14 6 24 TT 8 16 60 1.434 0.548 0.049 502308 AA 0 8 26 AG 7 11 34 GG 17 3 27 0.700 0.065 4.146 502504 AA 21 3 30 AG 3 11 31 GG 0 8 23 0.107 0.065 5.537 502517 AA 17 17 70 AG 7 5 14 GG 0 0 0 0.700 0.362 0.694 527613 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 25 21 89 0.000 0.012 0.003 527991 CC 21 22 85 CT 4 0 6 TT 0 0 0 0.189 0.000 0.106 528045 CC 22 22 89 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.102 0.000 0.025 528173 CC 0 8 29 CT 4 11 33 TT 21 3 30 0.189 0.065 7.343 528181 CC 18 17 78 CT 7 5 14 TT 0 0 0 0.663 0.362 0.624 528267 CC 0 8 29 CT 4 11 33 TT 21 3 30 0.189 0.065 7.343 528337 CC 0 0 0 CT 0 0 2 TT 25 22 90 0.000 0.000 0.011 547394 CC 25 21 92 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.003 547421 CC 25 21 87 CT 1 0 6 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.103 547601 AA 0 1 3 AG 1 7 10 GG 26 13 81 0.010 0.002 9.438 547710 AA 27 14 86 AG 0 7 8 GG 0 0 0 0.000 0.840 0.186 548201 GG 26 22 94 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.003 548325 CC 14 10 64 CT 9 6 17 TT 1 1 4 0.091 0.006 3.494 548478 AA 17 5 30 AG 9 13 45 GG 1 4 20 0.020 0.747 0.168 548540 AA 24 22 92 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.093 0.000 0.024 548564 AA 25 22 92 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.040 0.000 0.011 548603 CC 0 0 0 CT 0 0 2 TT 25 22 89 0.000 0.000 0.011 548724 CC 25 17 84 CT 2 4 9 TT 0 0 0 0.040 0.233 0.240 548850 AA 0 0 0 AG 0 0 1 GG 27 21 92 0.000 0.000 0.003 548950 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 26 22 94 0.010 0.000 0.003 562713 AA 24 18 80 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.014 0.003 562968 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 22 21 85 0.181 0.000 0.047 562987 CC 24 21 87 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.042 0.000 0.011 563328 CC 26 19 85 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.013 0.003 563345 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 24 20 84 0.042 0.000 0.012 563512 AA 26 21 92 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.010 0.000 0.003 563520 CC 3 0 6 CG 6 8 32 GG 18 13 55 3.444 1.163 0.209 563773 AA 1 4 15 AG 7 12 43 GG 16 5 28 0.044 0.444 0.047 563902 CC 24 21 88 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.010 0.012 0.011 564113 CC 22 22 89 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.281 0.000 0.070 564154 CC 0 1 3 CT 4 9 17 TT 23 12 74 0.173 0.182 2.342 564393 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 25 22 93 0.010 0.000 0.003 564583 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 18 22 84 0.055 0.000 0.012 564731 ++ 14 5 28 +- 9 12 44 -- 1 4 17 0.091 0.444 0.001 592761 AA 5 3 22 AG 7 11 39 GG 14 6 29 3.919 0.314 1.476 593040 CC 0 1 1 CT 1 1 2 TT 17 16 70 0.015 7.289 17.236 593481 CC 22 22 88 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.102 0.000 0.026 593549 AA 12 16 52 AG 8 6 33 GG 5 0 8 2.334 0.548 0.682 593704 CC 26 22 92 CT 0 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.011 593880 AA 12 3 21 AC 8 8 38 CC 5 11 34 2.334 0.577 2.578 594093 AA 19 11 41 AG 7 8 39 GG 1 3 15 0.120 0.577 1.202 594271 CC 16 21 81 CT 9 1 11 TT 1 0 1 0.037 0.012 0.758 594447 AA 9 17 59 AG 6 3 18 GG 4 2 6 1.963 5.290 5.946 594497 AA 0 0 0 AG 0 5 7 GG 23 17 83 0.000 0.362 0.147 594602 CC 22 22 88 CT 4 0 5 TT 1 0 1 1.688 0.000 6.261 621796 CC 8 2 11 CT 11 9 26 TT 6 11 53 0.327 0.007 6.148 622265 CC 26 22 94 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.003 622277 CC 0 2 3 CT 2 8 17 TT 25 12 75 0.040 0.153 2.404 622344 AA 25 12 75 AG 2 8 17 GG 0 2 3 0.040 0.153 2.404 622372 ++ 2 0 2 +- 8 0 8 -- 15 22 81 0.377 0.000 7.458 648682 AA 26 18 83 AC 1 2 10 CC 0 2 2 0.010 8.295 4.977 648695 AA 23 22 91 AC 4 0 4 CC 0 0 0 0.173 0.000 0.044 648754 AA 0 0 0 AG 0 0 2 GG 27 22 93 0.000 0.000 0.011 648760 AA 0 0 0 AG 0 2 3 GG 27 20 92 0.000 0.050 0.024 648798 ++ 0 0 0 +- 0 0 1 -- 27 22 94 0.000 0.000 0.003 648864 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 26 22 93 0.010 0.000 0.003 648888 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 26 22 94 0.010 0.000 0.003 649056 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 26 22 94 0.010 0.000 0.003 649198 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 26 22 94 0.010 0.000 0.003 650206 AA 0 3 16 AG 9 9 39 GG 18 10 39 1.080 0.177 1.295 650376 AA 26 22 93 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.003 650628 AA 9 3 19 AG 14 6 37 GG 4 13 38 0.147 2.148 3.020 650914 AA 7 3 17 AG 12 6 36 GG 8 13 41 0.326 2.148 3.067 651146 CC 18 21 80 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.003 651262 ++ 20 21 87 +- 1 0 1 -- 0 0 0 0.012 0.000 0.003 651275 CC 0 0 0 CG 10 1 12 GG 11 20 76 2.051 0.012 0.471 651344 ++ 21 21 88 +- 6 0 6 -- 0 0 0 0.422 0.000 0.102 659589 AA 22 14 70 AG 4 6 17 GG 0 2 4 0.181 1.099 4.079 659651 CC 25 22 90 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.010 0.000 0.003 659663 GG 8 2 17 GT 13 7 35 TT 5 13 39 0.005 0.505 3.048 659677 AA 0 0 0 AC 0 0 1 CC 26 22 90 0.000 0.000 0.003 659690 CC 26 21 90 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.003 659761 CC 8 3 18 CT 13 6 34 TT 5 13 39 0.005 2.148 4.040 659980 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 21 22 89 0.422 0.000 0.101 660020 AA 0 0 0 AG 0 0 3 GG 27 22 92 0.000 0.000 0.024 660037 GG 27 22 94 GT 0 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.003 660139 AA 0 0 0 AG 4 1 6 GG 20 20 84 0.198 0.012 0.107 660210 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 24 21 90 0.010 0.000 0.003 Note: ED : European Descent AD : African Descent pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 005596: CTTT 007557: atctg 017268: A 033588: GGAAG 035008: A 045874: A 067623: T 068047: GT 123112: ACCTCT 160603: AATCCCTCCAGCCTCTGCGTT 175883: TT 176258: t 176483: T 202890: TGT 256557: tctt 258484: GGAGC 294769: g 328265: CT 372412: T 411927: GCTGCCTGTTCAGT 564731: attt 622372: T 648798: CCTC 651262: gct 651344: c