Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000174 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 000499 A 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 C 0.83 1.00 1.00 1.00 0.95 0.28 0.00 0.00 0.00 0.09 000528 A 0.28 0.00 0.05 0.00 0.09 C 0.72 1.00 0.95 1.00 0.91 0.40 0.00 0.09 0.00 0.17 000827 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 000878 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 000900 + 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 001220 A 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.06 0.00 0.00 0.00 0.01 001401 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 001762 - 0.05 0.45 0.33 0.02 0.21 + 0.95 0.55 0.67 0.98 0.79 0.10 0.50 0.44 0.05 0.33 001809 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001848 + 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001870 + 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 002050 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 002303 G 0.17 0.57 0.59 0.60 0.48 A 0.83 0.43 0.41 0.40 0.52 0.29 0.49 0.48 0.48 0.50 003013 G 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 C 0.85 1.00 1.00 1.00 0.96 0.25 0.00 0.00 0.00 0.07 003046 T 0.44 0.42 0.23 0.23 0.33 C 0.56 0.57 0.78 0.77 0.67 0.49 0.49 0.35 0.36 0.44 015560 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 015761 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 015844 G 0.24 0.00 0.05 0.00 0.08 A 0.76 1.00 0.95 1.00 0.92 0.37 0.00 0.09 0.00 0.15 015915 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 015998 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 016123 T 0.19 0.52 0.55 0.54 0.44 C 0.81 0.48 0.45 0.46 0.56 0.30 0.50 0.50 0.50 0.49 016131 C 0.61 0.07 0.11 0.19 0.26 T 0.39 0.93 0.89 0.81 0.74 0.48 0.13 0.20 0.30 0.39 016384 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 016447 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 016454 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 016635 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 016793 C 0.19 0.00 0.02 0.00 0.06 T 0.81 1.00 0.98 1.00 0.94 0.30 0.00 0.04 0.00 0.11 017026 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 017440 A 0.21 0.53 0.53 0.53 0.43 C 0.79 0.47 0.47 0.47 0.57 0.33 0.50 0.50 0.50 0.49 017543 T 0.33 0.48 0.42 0.23 0.36 G 0.67 0.52 0.57 0.78 0.64 0.44 0.50 0.49 0.35 0.46 017585 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 017885 T 0.04 0.31 0.11 0.00 0.11 A 0.96 0.69 0.89 1.00 0.89 0.07 0.43 0.20 0.00 0.19 017928 A 0.37 0.50 0.41 0.27 0.39 G 0.63 0.50 0.59 0.73 0.61 0.47 0.50 0.48 0.40 0.47 017966 G 0.63 0.50 0.45 0.26 0.47 A 0.37 0.50 0.55 0.74 0.53 0.47 0.50 0.50 0.39 0.50 018039 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018123 G 0.02 0.02 0.00 0.07 0.03 C 0.98 0.98 1.00 0.93 0.97 0.04 0.05 0.00 0.13 0.05 018128 A 0.02 0.00 0.00 0.19 0.05 G 0.98 1.00 1.00 0.81 0.95 0.04 0.00 0.00 0.31 0.09 018136 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 018855 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 018934 A 0.17 0.52 0.57 0.50 0.43 G 0.83 0.48 0.42 0.50 0.57 0.29 0.50 0.49 0.50 0.49 069436 A 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 G 0.86 1.00 1.00 1.00 0.96 0.24 0.00 0.00 0.00 0.07 069637 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 069673 A 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.10 0.00 0.00 0.02 070115 + 0.31 0.05 0.00 0.15 0.15 - 0.69 0.95 1.00 0.85 0.85 0.43 0.09 0.00 0.26 0.26 070192 T 0.30 0.50 0.18 0.23 0.30 A 0.70 0.50 0.82 0.77 0.70 0.42 0.50 0.30 0.35 0.42 070310 A 0.26 0.42 0.68 0.53 0.46 G 0.74 0.58 0.32 0.47 0.54 0.39 0.49 0.43 0.50 0.50 070461 A 0.28 0.05 0.00 0.12 0.12 G 0.72 0.95 1.00 0.88 0.88 0.41 0.10 0.00 0.22 0.22 070688 A 0.04 0.48 0.19 0.07 0.19 G 0.96 0.52 0.81 0.93 0.81 0.07 0.50 0.31 0.13 0.31 070770 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 070802 C 0.04 0.00 0.07 0.26 0.09 T 0.96 1.00 0.93 0.74 0.91 0.07 0.00 0.13 0.39 0.16 070889 A 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.07 0.00 0.05 0.00 0.03 071040 A 0.24 0.00 0.00 0.00 0.07 G 0.76 1.00 1.00 1.00 0.93 0.37 0.00 0.00 0.00 0.13 071250 A 0.22 0.00 0.00 0.00 0.07 G 0.78 1.00 1.00 1.00 0.93 0.35 0.00 0.00 0.00 0.12 071317 A 0.28 0.43 0.71 0.57 0.48 G 0.72 0.57 0.29 0.43 0.52 0.40 0.49 0.41 0.49 0.50 071439 A 0.06 0.05 0.00 0.00 0.03 T 0.94 0.95 1.00 1.00 0.97 0.10 0.09 0.00 0.00 0.05 071440 T 0.02 0.00 0.10 0.00 0.03 A 0.98 1.00 0.90 1.00 0.97 0.04 0.00 0.17 0.00 0.05 071554 T 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.97 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 071617 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 071715 T 0.09 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.91 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 071744 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 071759 G 0.12 0.00 0.02 0.00 0.04 A 0.88 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.04 0.00 0.07 071820 G 0.25 0.48 0.32 0.10 0.28 C 0.75 0.52 0.68 0.90 0.72 0.38 0.50 0.43 0.19 0.40 071844 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 071920 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 071986 C 0.02 0.07 0.57 0.50 0.28 T 0.98 0.93 0.43 0.50 0.72 0.04 0.13 0.49 0.50 0.40 072016 A 0.19 0.00 0.02 0.00 0.06 G 0.81 1.00 0.98 1.00 0.94 0.31 0.00 0.04 0.00 0.11 072152 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 072272 A 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 072308 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 072411 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 072422 T 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 072439 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 072567 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 072623 T 0.02 0.05 0.00 0.00 0.02 A 0.98 0.95 1.00 1.00 0.98 0.04 0.09 0.00 0.00 0.03 072663 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 073036 C 0.04 0.00 0.07 0.23 0.08 A 0.96 1.00 0.93 0.77 0.92 0.07 0.00 0.13 0.35 0.15 073174 A 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 073187 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 073589 A 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 073711 C 0.30 0.00 0.34 0.21 0.22 T 0.70 1.00 0.66 0.79 0.78 0.42 0.00 0.45 0.34 0.34 073821 T 0.07 0.03 0.00 0.05 0.04 C 0.93 0.97 1.00 0.95 0.96 0.13 0.05 0.00 0.09 0.07 073822 T 0.00 0.06 0.00 0.02 0.02 G 1.00 0.94 1.00 0.98 0.98 0.00 0.10 0.00 0.05 0.04 073899 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 073923 C 0.34 0.00 0.24 0.12 0.18 A 0.66 1.00 0.76 0.88 0.82 0.45 0.00 0.36 0.21 0.30 073965 A 0.16 0.47 0.21 0.10 0.23 G 0.84 0.53 0.79 0.90 0.78 0.27 0.50 0.33 0.17 0.35 073966 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 074521 A 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 074868 T 0.35 0.00 0.02 0.00 0.11 C 0.65 1.00 0.98 1.00 0.89 0.46 0.00 0.04 0.00 0.19 075132 G 0.41 0.57 0.25 0.20 0.36 C 0.59 0.43 0.75 0.80 0.64 0.48 0.49 0.38 0.31 0.46 075206 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 075884 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 076030 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 076085 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 076101 A 0.26 0.47 0.53 0.48 0.42 C 0.74 0.53 0.47 0.52 0.58 0.39 0.50 0.50 0.50 0.49 076102 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 076120 T 0.02 0.29 0.14 0.07 0.12 C 0.98 0.71 0.86 0.93 0.88 0.04 0.42 0.24 0.13 0.21 076125 T 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 G 0.85 1.00 1.00 1.00 0.96 0.25 0.00 0.00 0.00 0.08 076168 A 0.25 0.47 0.61 0.50 0.44 G 0.75 0.53 0.39 0.50 0.56 0.38 0.50 0.48 0.50 0.49 076308 A 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.06 0.00 0.00 0.01 076390 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 076575 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 076616 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 076853 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 076965 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 076981 C 0.48 0.43 0.52 0.48 0.48 G 0.52 0.57 0.48 0.52 0.52 0.50 0.49 0.50 0.50 0.50 077129 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 077351 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 077584 T 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 G 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 077725 T 0.29 0.41 0.50 0.46 0.41 C 0.71 0.59 0.50 0.54 0.59 0.41 0.48 0.50 0.50 0.48 077818 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 077887 * 077907 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 077927 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 078511 A 0.00 0.18 0.02 0.00 0.05 G 1.00 0.82 0.98 1.00 0.95 0.00 0.30 0.04 0.00 0.09 078713 T 0.00 0.07 0.00 0.00 0.02 C 1.00 0.93 1.00 1.00 0.98 0.00 0.13 0.00 0.00 0.03 078725 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 078980 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 079150 T 0.40 0.48 0.20 0.07 0.30 A 0.60 0.52 0.80 0.93 0.70 0.48 0.50 0.33 0.14 0.42 079476 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 080105 A 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.88 1.00 1.00 1.00 0.97 0.21 0.00 0.00 0.00 0.06 080206 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 080426 A 0.00 0.07 0.00 0.00 0.02 G 1.00 0.93 1.00 1.00 0.98 0.00 0.13 0.00 0.00 0.03 080480 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 081102 G 0.05 0.53 0.23 0.08 0.23 A 0.95 0.47 0.77 0.92 0.77 0.10 0.50 0.35 0.15 0.35 081480 A 0.21 0.00 0.02 0.00 0.06 T 0.79 1.00 0.98 1.00 0.94 0.33 0.00 0.04 0.00 0.12 081622 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 081725 A 0.00 0.00 0.09 0.11 0.05 G 1.00 1.00 0.91 0.89 0.95 0.00 0.00 0.17 0.19 0.09 082036 C 0.21 0.00 0.00 0.00 0.06 A 0.79 1.00 1.00 1.00 0.94 0.33 0.00 0.00 0.00 0.11 082123 A 0.00 0.09 0.02 0.00 0.03 G 1.00 0.91 0.98 1.00 0.97 0.00 0.17 0.04 0.00 0.05 082304 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 082324 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 082349 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 082350 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 082354 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 082448 A 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 082504 C 0.09 0.00 0.02 0.00 0.03 T 0.91 1.00 0.98 1.00 0.97 0.17 0.00 0.04 0.00 0.06 082663 A 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 082869 A 0.06 0.02 0.00 0.00 0.02 G 0.94 0.98 1.00 1.00 0.98 0.11 0.04 0.00 0.00 0.04 083008 A 0.13 0.09 0.07 0.33 0.16 G 0.87 0.91 0.93 0.67 0.84 0.23 0.17 0.13 0.44 0.26 083239 A 0.07 0.06 0.00 0.00 0.03 G 0.93 0.94 1.00 1.00 0.97 0.12 0.10 0.00 0.00 0.06 083252 G 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 083272 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 083705 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 083762 C 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 084287 C 0.02 0.02 0.39 0.42 0.20 G 0.98 0.98 0.61 0.57 0.80 0.04 0.04 0.47 0.49 0.32 084341 G 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.95 1.00 0.99 0.00 0.00 0.09 0.00 0.02 084428 G 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 084535 T 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 084729 + 0.09 0.03 0.00 0.00 0.03 - 0.91 0.97 1.00 1.00 0.97 0.16 0.05 0.00 0.00 0.05 084876 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 084954 G 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 085052 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 085108 A 0.33 0.76 0.52 0.17 0.43 G 0.67 0.24 0.48 0.83 0.57 0.44 0.36 0.50 0.29 0.49 085182 G 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 085241 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 085263 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 085265 T 0.00 0.03 0.02 0.00 0.01 A 1.00 0.97 0.98 1.00 0.99 0.00 0.05 0.04 0.00 0.02 085290 C 0.00 0.07 0.00 0.09 0.04 T 1.00 0.93 1.00 0.91 0.96 0.00 0.14 0.00 0.16 0.07 085798 C 0.24 0.06 0.02 0.00 0.07 T 0.76 0.94 0.98 1.00 0.93 0.36 0.10 0.05 0.00 0.14 085813 G 0.26 0.06 0.03 0.00 0.08 A 0.74 0.94 0.97 1.00 0.92 0.39 0.10 0.05 0.00 0.15 085819 A 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 085851 C 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 085951 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 086267 T 0.00 0.05 0.42 0.45 0.21 C 1.00 0.95 0.58 0.55 0.79 0.00 0.09 0.49 0.50 0.33 086760 A 0.43 0.77 0.57 0.17 0.48 G 0.57 0.23 0.42 0.83 0.52 0.49 0.35 0.49 0.29 0.50 086919 T 0.30 0.73 0.53 0.23 0.43 C 0.70 0.27 0.47 0.77 0.57 0.42 0.40 0.50 0.35 0.49 087195 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 087288 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 087496 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 087621 T 0.31 0.68 0.52 0.27 0.44 C 0.69 0.32 0.48 0.73 0.56 0.43 0.43 0.50 0.39 0.49 087836 G 0.24 0.18 0.09 0.40 0.23 A 0.76 0.82 0.91 0.60 0.77 0.36 0.30 0.17 0.48 0.36 087840 G 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.13 0.00 0.00 0.00 0.03 087884 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 087928 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 088031 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 088411 T 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 088438 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 088448 G 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.97 0.99 0.00 0.00 0.00 0.06 0.01 088504 A 0.27 0.76 0.52 0.27 0.45 G 0.73 0.24 0.48 0.73 0.55 0.40 0.36 0.50 0.40 0.50 088675 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 088948 T 0.00 0.07 0.00 0.00 0.02 G 1.00 0.93 1.00 1.00 0.98 0.00 0.13 0.00 0.00 0.03 089129 G 0.35 0.78 0.57 0.28 0.49 A 0.65 0.23 0.43 0.72 0.51 0.45 0.35 0.49 0.40 0.50 089183 - 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 + 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.10 0.00 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000900: GGGCCCTGGGCGTGTT 001762: TGT 001848: TGTATG 001870: TG 070115: A 084729: C 089183: ctca Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop 077887 A 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.15 0.00 0.02 0.00 0.05 G 0.77 1.00 0.98 1.00 0.93