Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop hz 000149 C 0.01 T 0.99 0.02 000188 C 0.21 G 0.79 0.33 000647 C 0.03 T 0.97 0.05 000806 - 0.10 + 0.90 0.17 001589 G 0.12 C 0.88 0.20 001613 A 0.14 C 0.86 0.25 001810 G 0.13 A 0.87 0.23 002162 T 0.38 C 0.62 0.47 002282 T 0.12 C 0.88 0.20 002805 G 0.07 A 0.93 0.12 002996 C 0.01 T 0.99 0.02 003049 G 0.01 T 0.99 0.01 003357 A 0.01 G 0.99 0.01 003388 C 0.02 T 0.98 0.03 003407 A 0.22 G 0.78 0.34 003733 C 0.01 T 0.99 0.02 003822 C 0.22 A 0.78 0.35 003960 - 0.13 + 0.87 0.23 004471 A 0.01 G 0.99 0.01 004475 T 0.08 C 0.92 0.15 004493 C 0.01 A 0.99 0.02 004501 A 0.01 G 0.99 0.01 004873 T 0.14 C 0.86 0.24 004922 G 0.06 A 0.94 0.11 004937 T 0.14 C 0.86 0.24 004948 A 0.01 G 0.99 0.01 005095 T 0.01 C 0.99 0.01 005328 C 0.04 T 0.96 0.07 005699 G 0.01 C 0.99 0.01 006018 T 0.06 C 0.94 0.10 006027 C 0.12 G 0.88 0.22 006203 A 0.03 G 0.97 0.05 006438 T 0.13 C 0.87 0.23 006477 G 0.48 C 0.52 0.50 006574 A 0.12 G 0.88 0.21 006661 T 0.12 C 0.88 0.21 006700 C 0.01 A 0.99 0.01 006750 G 0.01 T 0.99 0.01 006785 A 0.01 G 0.99 0.01 007234 - 0.30 + 0.70 0.42 007274 G 0.11 C 0.89 0.19 007305 + 0.13 - 0.87 0.23 007325 C 0.01 G 0.99 0.01 007471 A 0.01 C 0.99 0.01 Note: pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000806: CT 003960: g 007234: CTGA 007305: T