Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Total-hz 000258 A 0.02 G 0.98 0.04 000922 + 0.07 - 0.93 0.13 001270 G 0.01 A 0.99 0.01 001351 C 0.12 T 0.88 0.21 001604 C 0.01 T 0.99 0.01 001683 C 0.01 G 0.99 0.01 001711 T 0.01 G 0.99 0.01 001785 G 0.01 T 0.99 0.02 001857 - 0.03 + 0.97 0.06 001860 T 0.02 C 0.98 0.04 001892 A 0.01 C 0.99 0.01 002270 A 0.01 G 0.99 0.01 002302 A 0.01 C 0.99 0.01 002471 A 0.11 G 0.89 0.19 002709 T 0.01 C 0.99 0.01 002841 T 0.01 C 0.99 0.01 003023 A 0.01 C 0.99 0.01 003306 A 0.14 G 0.86 0.25 003705 G 0.01 A 0.99 0.01 003710 - 0.01 + 0.99 0.01 004029 T 0.01 A 0.99 0.01 004176 G 0.41 A 0.59 0.48 004178 G 0.41 T 0.59 0.48 004341 T 0.01 C 0.99 0.01 004387 A 0.01 G 0.99 0.01 004534 A 0.01 G 0.99 0.03 004536 A 0.01 G 0.99 0.03 004661 G 0.01 T 0.99 0.01 005347 A 0.01 G 0.99 0.03 005873 G 0.02 A 0.98 0.04 016738 C 0.01 T 0.99 0.01 017035 G 0.01 A 0.99 0.02 017095 A 0.03 T 0.97 0.06 017133 T 0.08 G 0.92 0.15 017547 G 0.01 A 0.99 0.01 017586 T 0.01 C 0.99 0.01 017713 G 0.13 A 0.87 0.23 017880 G 0.01 A 0.99 0.02 017885 - 0.01 + 0.99 0.01 018217 T 0.01 A 0.99 0.02 026377 A 0.21 G 0.79 0.33 026798 G 0.01 A 0.99 0.01 027096 G 0.01 A 0.99 0.01 027230 - 0.10 + 0.90 0.19 027385 T 0.01 C 0.99 0.01 034289 G 0.01 A 0.99 0.01 034339 C 0.12 A 0.88 0.22 034423 C 0.19 T 0.81 0.31 034571 T 0.06 G 0.94 0.11 047027 G 0.01 A 0.99 0.02 047090 G 0.05 T 0.95 0.09 047605 G 0.01 A 0.99 0.01 048050 + 0.02 - 0.98 0.04 048222 G 0.01 A 0.99 0.01 056452 C 0.01 T 0.99 0.01 056525 C 0.10 T 0.90 0.19 056542 C 0.01 T 0.99 0.02 056840 G 0.12 A 0.88 0.21 057141 A 0.01 G 0.99 0.02 057328 - 0.12 + 0.88 0.21 057597 T 0.01 C 0.99 0.01 057626 C 0.01 T 0.99 0.01 057678 C 0.48 T 0.52 0.50 057742 A 0.01 G 0.99 0.01 057790 G 0.01 A 0.99 0.01 060934 C 0.22 A 0.78 0.34 061159 T 0.01 A 0.99 0.01 061438 A 0.01 G 0.99 0.01 061498 G 0.11 C 0.89 0.19 061534 T 0.02 A 0.98 0.03 061856 G 0.02 A 0.98 0.03 061955 G 0.01 A 0.99 0.01 062009 A 0.05 G 0.95 0.10 062211 G 0.19 C 0.81 0.31 078192 T 0.01 C 0.99 0.01 078441 - 0.01 + 0.99 0.01 078473 T 0.02 C 0.98 0.03 078601 G 0.01 A 0.99 0.02 078976 C 0.20 A 0.80 0.32 079272 T 0.01 G 0.99 0.01 079361 A 0.01 C 0.99 0.01 079419 - 0.01 + 0.99 0.01 079450 T 0.19 C 0.81 0.30 082794 A 0.01 G 0.99 0.01 082904 T 0.02 C 0.98 0.03 083296 C 0.01 A 0.99 0.02 083334 C 0.01 T 0.99 0.01 084015 C 0.47 G 0.53 0.50 084278 T 0.01 C 0.99 0.01 084452 C 0.01 T 0.99 0.01 084862 G 0.01 T 0.99 0.01 090275 G 0.01 A 0.99 0.01 090570 C 0.11 T 0.89 0.20 090988 G 0.01 A 0.99 0.01 091025 C 0.23 T 0.77 0.35 091415 G 0.01 A 0.99 0.03 091544 T 0.01 A 0.99 0.01 091839 C 0.03 A 0.97 0.06 091981 T 0.01 C 0.99 0.01 092314 A 0.01 C 0.99 0.01 092338 T 0.15 C 0.85 0.25 092536 T 0.01 C 0.99 0.01 094840 C 0.01 T 0.99 0.01 103784 + 0.23 - 0.77 0.36 103870 C 0.02 T 0.98 0.04 103991 T 0.01 C 0.99 0.01 104532 T 0.23 G 0.77 0.35 105198 G 0.01 A 0.99 0.01 105314 G 0.01 A 0.99 0.01 105442 T 0.01 C 0.99 0.01 105453 G 0.02 T 0.98 0.04 105479 A 0.26 G 0.74 0.38 105528 T 0.01 C 0.99 0.03 106375 C 0.01 T 0.99 0.01 106515 T 0.01 C 0.99 0.03 107096 A 0.01 G 0.99 0.01 107174 G 0.01 A 0.99 0.01 107672 C 0.01 G 0.99 0.01 107868 T 0.01 A 0.99 0.01 108365 C 0.01 T 0.99 0.01 108406 A 0.02 G 0.98 0.04 108472 A 0.13 C 0.87 0.23 108925 - 0.02 + 0.98 0.03 109053 A 0.07 G 0.93 0.13 109261 A 0.01 G 0.99 0.01 110186 T 0.22 C 0.78 0.34 110401 T 0.01 C 0.99 0.01 110520 A 0.01 G 0.99 0.01 110731 G 0.01 A 0.99 0.02 110920 T 0.01 C 0.99 0.01 110989 C 0.01 T 0.99 0.01 118645 C 0.01 G 0.99 0.01 118670 T 0.01 C 0.99 0.01 118771 C 0.01 T 0.99 0.01 118779 A 0.01 G 0.99 0.01 119064 C 0.11 G 0.89 0.19 121460 C 0.01 T 0.99 0.01 121741 C 0.01 T 0.99 0.01 121953 C 0.01 T 0.99 0.01 122511 + 0.01 - 0.99 0.01 122598 T 0.02 C 0.98 0.05 122989 C 0.23 T 0.77 0.35 123036 G 0.01 C 0.99 0.01 123115 T 0.01 G 0.99 0.01 123126 A 0.01 G 0.99 0.01 123388 C 0.11 T 0.89 0.19 123831 T 0.01 C 0.99 0.01 123834 + 0.01 - 0.99 0.03 123870 C 0.01 G 0.99 0.01 124125 T 0.01 C 0.99 0.01 124674 + 0.01 - 0.99 0.01 125735 + 0.01 - 0.99 0.01 126202 T 0.01 A 0.99 0.02 126703 G 0.01 T 0.99 0.01 126728 T 0.47 G 0.53 0.50 126980 A 0.01 G 0.99 0.02 127115 G 0.01 C 0.99 0.01 127263 G 0.10 A 0.90 0.18 127307 T 0.01 C 0.99 0.02 127390 T 0.01 G 0.99 0.01 Note: Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000922: C 001857: G 003710: TAC 017885: AT 027230: AG 048050: A 057328: A 078441: T 079419: AC 103784: ATTTA 108925: ATTTA 122511: at 123834: C 124674: ATGT 125735: A