Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Total-hz 000113 - 0.31 + 0.69 0.43 000328 C 0.05 T 0.95 0.10 000664 T 0.09 C 0.91 0.16 000763 + 0.30 - 0.70 0.42 001024 T 0.28 C 0.72 0.41 001219 T 0.30 C 0.70 0.42 001253 T 0.01 G 0.99 0.01 001289 C 0.26 G 0.74 0.39 001306 A 0.05 G 0.95 0.09 001430 G 0.01 A 0.99 0.03 001584 T 0.03 A 0.97 0.05 001628 T 0.02 C 0.98 0.03 001715 A 0.01 G 0.99 0.02 002420 G 0.05 C 0.95 0.10 002791 G 0.02 A 0.98 0.03 003342 T 0.01 G 0.99 0.01 003467 C 0.03 G 0.97 0.07 003839 G 0.33 C 0.67 0.44 004129 T 0.01 C 0.99 0.01 004277 A 0.01 C 0.99 0.02 004288 T 0.01 C 0.99 0.01 004373 + 0.45 - 0.55 0.50 004618 A 0.03 G 0.97 0.05 004638 T 0.03 C 0.97 0.05 004731 + 0.43 - 0.57 0.49 004774 T 0.04 C 0.96 0.07 004802 A 0.01 G 0.99 0.01 004955 A 0.01 G 0.99 0.01 005086 T 0.02 C 0.98 0.05 005101 - 0.01 + 0.99 0.01 005184 T 0.03 G 0.97 0.07 005230 A 0.01 G 0.99 0.01 005259 G 0.28 T 0.72 0.41 006175 G 0.09 A 0.91 0.16 006456 C 0.01 G 0.99 0.03 006496 T 0.01 C 0.99 0.01 006773 T 0.10 C 0.90 0.18 006860 G 0.01 C 0.99 0.02 007005 A 0.01 G 0.99 0.01 007057 G 0.01 C 0.99 0.01 007109 G 0.01 C 0.99 0.01 007138 G 0.01 C 0.99 0.01 007764 A 0.01 G 0.99 0.01 008234 A 0.01 G 0.99 0.01 008845 A 0.25 G 0.75 0.38 010105 T 0.01 C 0.99 0.01 010121 A 0.10 C 0.90 0.19 010307 A 0.01 G 0.99 0.01 010410 C 0.01 A 0.99 0.01 010815 T 0.01 C 0.99 0.01 010836 T 0.01 C 0.99 0.01 010844 * 010940 C 0.17 T 0.83 0.28 010993 G 0.01 A 0.99 0.01 010995 G 0.01 C 0.99 0.02 011002 T 0.01 C 0.99 0.02 011010 A 0.03 G 0.97 0.06 011017 T 0.27 C 0.73 0.40 011094 T 0.01 C 0.99 0.01 011097 G 0.01 C 0.99 0.01 011202 A 0.09 G 0.91 0.17 011454 T 0.04 C 0.96 0.07 011511 A 0.01 C 0.99 0.01 011872 T 0.01 C 0.99 0.01 011895 G 0.01 C 0.99 0.01 012027 A 0.01 G 0.99 0.01 012931 T 0.15 C 0.85 0.26 012981 - 0.02 + 0.98 0.03 013001 C 0.20 A 0.80 0.32 013130 T 0.01 C 0.99 0.02 013182 A 0.01 T 0.99 0.01 013574 A 0.01 G 0.99 0.01 013751 G 0.35 C 0.65 0.46 013785 T 0.01 C 0.99 0.01 013877 T 0.33 C 0.67 0.44 014359 A 0.33 G 0.67 0.44 014378 T 0.20 C 0.80 0.32 014427 - 0.33 + 0.67 0.44 014437 T 0.01 G 0.99 0.01 014744 T 0.01 C 0.99 0.01 014812 A 0.01 C 0.99 0.01 015132 A 0.19 G 0.81 0.31 015789 T 0.01 C 0.99 0.02 015804 A 0.46 G 0.54 0.50 016163 G 0.07 C 0.93 0.14 016239 T 0.01 C 0.99 0.02 016363 T 0.01 A 0.99 0.01 016510 T 0.24 G 0.76 0.36 016750 - 0.07 + 0.93 0.14 016775 G 0.02 C 0.98 0.03 017170 T 0.01 C 0.99 0.01 017219 T 0.05 C 0.95 0.10 017273 T 0.01 C 0.99 0.01 017446 G 0.01 A 0.99 0.02 017686 C 0.01 T 0.99 0.01 017966 T 0.01 A 0.99 0.01 018181 A 0.35 G 0.65 0.46 018230 A 0.01 G 0.99 0.01 018349 A 0.01 G 0.99 0.01 018449 T 0.01 C 0.99 0.01 018510 C 0.02 G 0.98 0.04 018643 T 0.01 C 0.99 0.01 018800 T 0.05 C 0.95 0.10 019005 A 0.01 G 0.99 0.01 019046 T 0.35 C 0.65 0.45 019346 T 0.49 A 0.51 0.50 019658 G 0.01 A 0.99 0.01 019731 T 0.01 C 0.99 0.02 019956 A 0.01 G 0.99 0.02 020176 G 0.01 C 0.99 0.01 020591 A 0.01 G 0.99 0.02 020741 G 0.01 C 0.99 0.01 021060 T 0.01 C 0.99 0.01 021184 G 0.01 A 0.99 0.02 021311 G 0.03 A 0.97 0.06 021429 A 0.49 G 0.51 0.50 022148 T 0.33 C 0.67 0.44 022231 T 0.01 C 0.99 0.01 022317 + 0.01 - 0.99 0.01 022318 A 0.06 G 0.94 0.11 022694 A 0.01 G 0.99 0.01 022719 T 0.34 C 0.66 0.45 022746 T 0.01 G 0.99 0.01 022906 A 0.02 C 0.98 0.04 022992 A 0.01 G 0.99 0.01 023159 A 0.01 G 0.99 0.01 023329 C 0.01 G 0.99 0.01 023747 G 0.01 A 0.99 0.03 023808 C 0.48 T 0.52 0.50 024079 A 0.35 G 0.65 0.46 024133 - 0.39 + 0.61 0.47 024457 T 0.15 C 0.85 0.25 024897 A 0.01 G 0.99 0.01 024918 A 0.01 G 0.99 0.01 024967 T 0.01 C 0.99 0.01 025048 G 0.01 C 0.99 0.01 Note: Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000113: TGATGA 000763: GT 004373: A 004731: C 005101: G 012981: gagacacgga 014427: CTGT 016750: tt 022317: C 024133: ag Tri-allelic sites: Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Allele3 Total-pop 010844 A 0.01 T 0.01 G 0.99