Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop hz 000235 A 0.01 G 0.99 0.01 000270 A 0.01 C 0.99 0.01 000323 G 0.29 C 0.71 0.41 000442 A 0.01 G 0.99 0.01 000492 T 0.02 C 0.98 0.04 000570 A 0.21 G 0.79 0.33 000573 T 0.21 C 0.79 0.34 000608 A 0.01 G 0.99 0.03 000651 T 0.20 C 0.80 0.32 000652 C 0.08 G 0.92 0.15 000755 T 0.01 C 0.99 0.02 000800 A 0.06 G 0.94 0.11 001691 T 0.01 C 0.99 0.01 001700 C 0.29 T 0.71 0.41 001716 T 0.01 C 0.99 0.01 001738 + 0.21 - 0.79 0.33 001775 G 0.06 A 0.94 0.11 001973 T 0.12 C 0.88 0.22 002017 + 0.10 - 0.90 0.19 002028 G 0.21 A 0.79 0.33 002156 T 0.01 A 0.99 0.01 002199 C 0.01 A 0.99 0.01 002243 T 0.02 C 0.98 0.03 002282 G 0.02 C 0.98 0.03 002339 A 0.02 G 0.98 0.03 002346 C 0.01 T 0.99 0.01 002405 T 0.21 C 0.79 0.33 002563 G 0.01 A 0.99 0.02 002654 T 0.03 C 0.97 0.05 002666 C 0.02 G 0.98 0.04 002668 G 0.02 T 0.98 0.04 002829 G 0.01 A 0.99 0.01 002852 T 0.01 C 0.99 0.01 002919 G 0.02 C 0.98 0.04 002947 G 0.19 A 0.81 0.30 002948 T 0.16 C 0.84 0.27 003157 C 0.02 G 0.98 0.03 003180 C 0.02 G 0.98 0.03 003195 C 0.01 T 0.99 0.02 003204 A 0.01 G 0.99 0.02 003230 C 0.01 T 0.99 0.01 003331 C 0.12 T 0.88 0.21 003414 C 0.26 G 0.74 0.39 003432 A 0.01 G 0.99 0.01 003604 G 0.12 A 0.88 0.21 003643 T 0.01 C 0.99 0.01 003644 G 0.22 C 0.78 0.35 003860 C 0.23 T 0.77 0.36 003968 A 0.01 G 0.99 0.01 004220 A 0.08 G 0.92 0.14 004979 A 0.01 G 0.99 0.01 004985 C 0.21 G 0.79 0.33 004996 G 0.24 A 0.76 0.37 005260 G 0.49 A 0.51 0.50 005600 A 0.01 G 0.99 0.01 005620 C 0.01 T 0.99 0.01 006030 C 0.01 G 0.99 0.01 006216 A 0.01 G 0.99 0.01 006363 T 0.26 A 0.74 0.39 006438 G 0.01 C 0.99 0.01 006458 G 0.01 C 0.99 0.02 006516 T 0.01 G 0.99 0.02 006628 G 0.04 A 0.96 0.08 006696 G 0.30 A 0.70 0.42 006825 T 0.01 C 0.99 0.01 006874 C 0.01 A 0.99 0.01 007191 C 0.28 A 0.72 0.41 007207 A 0.27 G 0.73 0.39 007226 A 0.01 G 0.99 0.01 007495 T 0.15 C 0.85 0.26 007684 T 0.01 C 0.99 0.01 008226 T 0.01 C 0.99 0.01 008402 T 0.01 C 0.99 0.01 008521 T 0.01 G 0.99 0.01 008664 A 0.01 G 0.99 0.01 008845 A 0.01 C 0.99 0.01 008892 C 0.14 T 0.86 0.25 008905 T 0.01 C 0.99 0.01 009008 A 0.16 G 0.84 0.27 009638 T 0.29 C 0.71 0.41 009884 G 0.01 C 0.99 0.01 Note: pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001738: CTGT 002017: T