Site Genotype1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 HD-chi2 XD-chi2 Total-chi2 000370 AA 0 1 0 0 1 AG 0 3 0 0 3 GG 26 18 22 22 88 0.000 2.296 0.000 0.000 13.512 000592 AA 26 21 22 24 93 AC 0 1 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 000661 AA 26 19 20 24 89 AG 0 3 2 0 5 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.118 0.050 0.000 0.070 000673 CC 23 22 22 24 91 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.000 0.000 0.011 000805 CC 0 0 0 0 0 CG 3 3 1 3 10 GG 24 19 21 21 85 0.093 0.118 0.012 0.107 0.293 001040 CC 7 8 6 1 22 CG 9 10 8 6 33 GG 8 4 8 7 27 1.484 0.079 1.564 0.035 3.027 001144 AA 8 8 6 2 24 AG 11 10 11 14 46 GG 7 4 5 7 23 0.605 0.079 0.000 1.775 0.011 001348 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 5 6 TT 26 22 21 18 87 0.000 0.000 0.012 0.342 0.103 001380 CC 2 1 0 2 5 CG 10 5 1 4 20 GG 14 16 21 17 68 0.013 0.499 0.012 3.584 3.913 001435 GG 0 0 0 2 2 GT 9 4 1 5 19 TT 17 18 21 16 72 1.139 0.220 0.012 2.200 0.306 001443 CC 7 4 5 7 23 CT 10 10 11 14 45 TT 9 8 6 2 25 1.330 0.079 0.000 1.775 0.094 001654 AA 25 21 22 24 92 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001789 CC 26 21 21 18 86 CT 0 0 1 6 7 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.490 0.142 001966 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 24 22 22 24 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 002122 CC 22 22 22 24 90 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.102 0.000 0.000 0.000 0.025 002167 GG 25 22 22 23 92 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 002232 CC 0 0 4 1 5 CG 2 5 11 15 33 GG 23 17 7 8 55 0.043 0.362 0.008 3.219 0.000 002289 AA 25 21 22 24 92 AG 1 1 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.012 0.000 0.000 0.011 002486 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 20 21 22 16 79 0.000 0.000 0.000 0.016 0.003 002529 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 1 0 1 GG 20 20 21 24 85 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 007798 AA 2 0 0 1 3 AG 12 3 1 6 22 GG 12 19 20 16 67 0.181 0.118 0.012 0.195 0.494 008058 CC 24 17 7 11 59 CT 3 5 11 11 30 TT 0 0 3 1 4 0.093 0.362 0.159 0.741 0.006 008092 CC 0 0 0 1 1 CT 0 0 0 2 2 TT 26 22 21 17 86 0.000 0.000 0.000 3.951 21.239 008154 CC 26 22 21 17 86 CT 0 0 0 2 2 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 3.951 21.239 008304 CC 0 0 0 0 0 CG 3 0 1 0 4 GG 23 22 21 23 89 0.097 0.000 0.012 0.000 0.045 008379 CC 26 21 21 23 91 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 008456 AA 25 21 22 23 91 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 008524 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 26 21 22 22 91 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 008600 CC 0 0 0 1 1 CT 0 0 0 4 4 TT 26 21 22 18 87 0.000 0.000 0.000 1.252 8.890 008621 AA 26 21 22 18 87 AG 0 0 0 4 4 GG 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 1.252 8.890 008663 CC 1 0 0 1 2 CT 5 0 0 4 9 TT 20 21 22 18 81 0.793 0.000 0.000 1.252 5.985 008979 CC 2 0 0 1 3 CT 4 0 0 4 8 TT 20 22 22 17 81 4.351 0.000 0.000 1.144 13.391 009015 CC 25 22 22 17 86 CG 1 0 0 4 5 GG 0 0 0 1 1 0.010 0.000 0.000 1.144 6.099 009043 AA 0 0 0 1 1 AG 1 0 0 4 5 GG 25 22 22 17 86 0.010 0.000 0.000 1.144 6.099 009045 CC 0 0 0 1 1 CT 1 0 0 4 5 TT 25 22 22 17 86 0.010 0.000 0.000 1.144 6.099 009052 CC 25 22 22 17 86 CT 1 0 0 4 5 TT 0 0 0 1 1 0.010 0.000 0.000 1.144 6.099 009129 AA 24 22 21 24 91 AT 3 0 1 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.012 0.000 0.044 009167 CC 27 22 22 18 89 CT 0 0 0 5 5 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 0.644 6.343 009272 AA 0 0 0 1 1 AG 1 0 0 5 6 GG 23 22 21 18 84 0.011 0.000 0.000 0.644 4.227 009343 GG 23 22 21 24 90 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 009400 CC 23 22 21 18 84 CT 1 0 0 5 6 TT 0 0 0 1 1 0.011 0.000 0.000 0.644 4.227 009411 AA 0 0 0 1 1 AG 1 0 0 5 6 GG 23 22 21 18 84 0.011 0.000 0.000 0.644 4.227 009442 AA 9 12 8 2 31 AT 12 8 10 14 44 TT 3 2 3 8 16 0.107 0.153 0.002 1.434 0.003 009526 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 21 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 009619 AA 21 17 15 14 67 AG 2 3 0 6 11 GG 1 0 0 1 2 4.959 0.131 0.000 0.114 2.913 009623 CC 0 0 0 1 1 CT 0 0 0 0 0 TT 24 20 15 20 79 0.000 0.000 0.000 21.000 80.000 009643 CC 0 0 2 4 6 CT 2 5 7 7 21 TT 22 15 6 10 53 0.045 0.408 0.000 1.577 3.145 009659 AA 0 0 0 1 1 AG 0 0 0 0 0 GG 24 20 15 20 79 0.000 0.000 0.000 21.000 80.000 009688 AA 19 20 15 20 74 AG 5 0 0 0 5 GG 0 0 0 1 1 0.324 0.000 0.000 21.000 5.122 009779 CC 0 0 0 0 0 CT 5 0 0 0 5 TT 19 20 15 21 75 0.324 0.000 0.000 0.000 0.083 009879 CC 0 0 0 0 0 CT 6 0 0 0 6 TT 18 19 15 21 73 0.490 0.000 0.000 0.000 0.123 009890 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 23 19 15 19 76 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 015089 AA 20 16 8 10 54 AC 1 6 11 11 29 CC 0 0 2 1 3 0.012 0.548 0.416 0.889 0.139 015104 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 21 21 21 22 85 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 015126 CC 17 22 21 22 82 CG 3 0 0 0 3 GG 1 0 0 0 1 2.136 0.000 0.000 0.000 12.552 015136 CC 21 22 21 20 84 CT 0 0 0 2 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.050 0.012 015143 AA 17 22 21 17 77 AG 2 0 0 4 6 GG 2 0 0 1 3 7.843 0.000 0.000 1.144 18.396 015302 CC 23 21 22 23 89 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 015368 AA 1 0 2 1 4 AG 4 6 11 12 33 GG 18 16 9 10 53 1.252 0.548 0.279 1.239 0.161 015542 AA 0 0 0 1 1 AC 1 0 0 5 6 CC 22 21 22 17 82 0.011 0.000 0.000 0.571 4.103 015830 CC 25 21 22 17 85 CT 1 0 0 3 4 TT 0 0 0 1 1 0.010 0.000 0.000 2.136 8.668 015878 AA 0 0 0 1 1 AG 1 0 0 3 4 GG 25 21 22 17 85 0.010 0.000 0.000 2.136 8.668 015903 CC 26 21 22 17 86 CT 0 0 0 3 3 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 2.136 13.192 015970 GG 25 21 22 17 85 GT 1 0 0 3 4 TT 0 0 0 1 1 0.010 0.000 0.000 2.136 8.668 016095 CC 11 10 8 2 31 CT 12 9 11 14 46 TT 3 3 3 7 16 0.010 0.177 0.065 1.775 0.023 016264 AA 3 2 3 6 14 AG 11 9 8 14 42 GG 11 10 6 2 29 0.010 0.000 0.014 2.200 0.034 016429 CC 25 21 19 22 87 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 016659 AA 0 0 0 1 1 AG 1 1 0 4 6 GG 24 18 22 17 81 0.010 0.014 0.000 1.144 4.041 016707 AA 19 19 22 17 77 AG 3 0 0 4 7 GG 2 0 0 1 3 5.958 0.000 0.000 1.144 15.205 016833 CC 26 21 22 18 87 CT 1 0 0 4 5 TT 0 0 0 1 1 0.010 0.000 0.000 1.252 6.180 016855 AA 8 2 3 14 27 AG 15 10 12 9 46 GG 4 9 7 1 21 0.500 0.107 0.362 0.091 0.028 016982 CC 22 17 21 14 74 CT 1 0 0 5 6 TT 0 0 0 1 1 0.011 0.000 0.000 0.360 3.608 033091 AA 25 21 21 16 83 AC 0 0 0 6 6 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.548 0.108 033108 CC 1 0 0 0 1 CT 3 0 0 0 3 TT 21 21 21 22 85 2.778 0.000 0.000 0.000 13.032 033110 AA 25 21 21 16 83 AG 0 0 0 6 6 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.548 0.108 033122 GG 25 21 21 16 83 GT 0 0 0 6 6 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.548 0.108 033354 CC 24 21 21 22 88 CG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 033464 AA 26 21 21 16 84 AG 0 0 0 6 6 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.548 0.107 033488 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 0 6 6 TT 26 21 21 16 84 0.000 0.000 0.000 0.548 0.107 033597 AA 20 13 17 12 62 AC 0 0 0 6 6 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.720 0.145 033610 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 19 13 17 18 67 0.013 0.000 0.000 0.000 0.004 034009 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 6 6 GG 26 21 22 15 84 0.000 0.000 0.000 0.583 0.107 034233 CC 25 21 22 21 89 CG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 034365 AA 26 21 22 15 84 AG 0 0 0 6 6 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.583 0.107 034390 CC 14 17 17 13 61 CT 10 4 5 7 26 TT 2 0 0 1 3 0.013 0.233 0.362 0.002 0.013 034468 GG 20 22 22 22 86 GT 0 0 0 0 0 TT 1 0 0 0 1 21.000 0.000 0.000 0.000 87.000 034473 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 5 5 TT 21 22 22 17 82 0.000 0.000 0.000 0.362 0.076 034687 AA 27 22 22 18 89 AG 0 0 0 6 6 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.490 0.101 034728 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 034807 AA 27 22 22 17 88 AC 0 0 0 5 5 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.362 0.071 034837 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 5 5 GG 27 22 22 17 88 0.000 0.000 0.000 0.362 0.071 034912 AA 21 22 22 22 87 AG 5 0 0 0 5 GG 1 0 0 0 1 0.868 0.000 0.000 0.000 6.180 034920 AA 27 22 22 17 88 AT 0 0 0 5 5 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.362 0.071 034948 AA 26 22 22 22 92 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 035012 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 5 5 GG 27 22 22 17 88 0.000 0.000 0.000 0.362 0.071 035214 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 6 6 TT 27 22 22 18 89 0.000 0.000 0.000 0.490 0.101 035244 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 035251 GG 27 22 22 18 89 GT 0 0 0 6 6 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.490 0.101 035368 CC 27 22 21 24 94 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 035455 AA 27 22 22 18 89 AG 0 0 0 6 6 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.490 0.101 035634 AA 0 0 0 0 0 AT 3 1 0 5 9 TT 18 11 21 15 65 0.124 0.023 0.000 0.408 0.310 035739 CC 23 18 22 17 80 CG 4 2 0 7 13 GG 0 1 0 0 1 0.173 4.203 0.000 0.700 0.318 035844 CC 27 22 22 18 89 CT 0 0 0 6 6 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.490 0.101 036086 CC 27 22 22 18 89 CG 0 0 0 6 6 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.490 0.101 036237 AA 25 22 21 24 92 AC 2 0 1 0 3 CC 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.012 0.000 0.024 036298 CC 27 22 22 23 94 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 036299 AA 1 0 0 1 2 AG 11 4 5 8 28 GG 15 18 17 15 65 0.354 0.220 0.362 0.003 0.259 036344 AA 0 0 0 0 0 AC 2 0 1 0 3 CC 25 22 21 24 92 0.040 0.000 0.012 0.000 0.024 036363 CC 27 22 22 18 89 CT 0 0 0 6 6 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.490 0.101 036959 AA 27 22 22 18 89 AG 0 0 0 6 6 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.490 0.101 037026 AA 15 19 17 15 66 AT 11 3 5 8 27 TT 1 0 0 1 2 0.354 0.118 0.362 0.003 0.158 037111 AA 16 18 17 15 66 AG 11 3 5 8 27 GG 0 0 0 1 1 1.767 0.124 0.362 0.003 0.956 037169 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 26 21 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 037171 CC 27 21 21 24 93 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 037250 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 1 0 2 TT 26 20 21 24 91 0.010 0.000 0.012 0.000 0.011 037373 CC 17 19 20 18 74 CT 0 0 0 6 6 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.490 0.121 037658 GG 16 19 20 24 79 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.016 0.000 0.000 0.000 0.003 037717 GG 27 22 22 18 89 GT 0 0 0 6 6 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.490 0.101 037826 GG 0 0 0 0 0 GT 3 0 0 0 3 TT 24 20 20 22 86 0.093 0.000 0.000 0.000 0.026 037832 CC 27 20 20 17 84 CT 0 0 0 5 5 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.362 0.074 038061 AA 27 22 22 18 89 AG 0 0 0 6 6 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.490 0.101 038436 CC 27 22 22 19 90 CT 0 0 0 5 5 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.324 0.069 038867 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 5 5 CC 27 22 22 19 90 0.000 0.000 0.000 0.324 0.069 038906 CC 26 22 22 17 87 CT 0 0 0 6 6 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.517 0.103 038932 AA 25 22 22 17 86 AG 1 0 0 6 7 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.517 0.142 039040 CC 26 22 22 22 92 CG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 039246 AA 26 22 22 17 87 AG 0 0 0 6 6 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.517 0.103 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population