Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000370 A 0.00 0.11 0.00 0.00 0.03 G 1.00 0.89 1.00 1.00 0.97 0.00 0.20 0.00 0.00 0.05 000592 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 000661 G 0.00 0.07 0.05 0.00 0.03 A 1.00 0.93 0.95 1.00 0.97 0.00 0.13 0.09 0.00 0.05 000673 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 000805 C 0.06 0.07 0.02 0.06 0.05 G 0.94 0.93 0.98 0.94 0.95 0.10 0.13 0.04 0.12 0.10 001040 C 0.48 0.59 0.45 0.29 0.47 G 0.52 0.41 0.55 0.71 0.53 0.50 0.48 0.50 0.41 0.50 001144 G 0.48 0.41 0.48 0.61 0.49 A 0.52 0.59 0.52 0.39 0.51 0.50 0.48 0.50 0.48 0.50 001348 C 0.00 0.00 0.02 0.11 0.03 T 1.00 1.00 0.98 0.89 0.97 0.00 0.00 0.04 0.19 0.06 001380 C 0.27 0.16 0.02 0.17 0.16 G 0.73 0.84 0.98 0.83 0.84 0.39 0.27 0.04 0.29 0.27 001435 G 0.17 0.09 0.02 0.20 0.12 T 0.83 0.91 0.98 0.80 0.88 0.29 0.17 0.04 0.31 0.22 001443 C 0.46 0.41 0.48 0.61 0.49 T 0.54 0.59 0.52 0.39 0.51 0.50 0.48 0.50 0.48 0.50 001654 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001789 T 0.00 0.00 0.02 0.12 0.04 C 1.00 1.00 0.98 0.88 0.96 0.00 0.00 0.04 0.22 0.07 001966 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 002122 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 002167 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 002232 C 0.04 0.11 0.43 0.35 0.23 G 0.96 0.89 0.57 0.65 0.77 0.08 0.20 0.49 0.46 0.36 002289 G 0.02 0.02 0.00 0.00 0.01 A 0.98 0.98 1.00 1.00 0.99 0.04 0.04 0.00 0.00 0.02 002486 A 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.97 0.99 0.00 0.00 0.00 0.06 0.01 002529 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 007798 A 0.31 0.07 0.02 0.17 0.15 G 0.69 0.93 0.98 0.83 0.85 0.43 0.13 0.05 0.29 0.26 008058 T 0.06 0.11 0.40 0.28 0.20 C 0.94 0.89 0.60 0.72 0.80 0.10 0.20 0.48 0.41 0.33 008092 C 0.00 0.00 0.00 0.10 0.02 T 1.00 1.00 1.00 0.90 0.98 0.00 0.00 0.00 0.18 0.04 008154 T 0.00 0.00 0.00 0.10 0.02 C 1.00 1.00 1.00 0.90 0.98 0.00 0.00 0.00 0.18 0.04 008304 C 0.06 0.00 0.02 0.00 0.02 G 0.94 1.00 0.98 1.00 0.98 0.11 0.00 0.04 0.00 0.04 008379 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 008456 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 008524 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 008600 C 0.00 0.00 0.00 0.13 0.03 T 1.00 1.00 1.00 0.87 0.97 0.00 0.00 0.00 0.23 0.06 008621 G 0.00 0.00 0.00 0.13 0.03 A 1.00 1.00 1.00 0.87 0.97 0.00 0.00 0.00 0.23 0.06 008663 C 0.13 0.00 0.00 0.13 0.07 T 0.87 1.00 1.00 0.87 0.93 0.23 0.00 0.00 0.23 0.13 008979 C 0.15 0.00 0.00 0.14 0.08 T 0.85 1.00 1.00 0.86 0.92 0.26 0.00 0.00 0.24 0.14 009015 G 0.02 0.00 0.00 0.14 0.04 C 0.98 1.00 1.00 0.86 0.96 0.04 0.00 0.00 0.24 0.07 009043 A 0.02 0.00 0.00 0.14 0.04 G 0.98 1.00 1.00 0.86 0.96 0.04 0.00 0.00 0.24 0.07 009045 C 0.02 0.00 0.00 0.14 0.04 T 0.98 1.00 1.00 0.86 0.96 0.04 0.00 0.00 0.24 0.07 009052 T 0.02 0.00 0.00 0.14 0.04 C 0.98 1.00 1.00 0.86 0.96 0.04 0.00 0.00 0.24 0.07 009129 T 0.06 0.00 0.02 0.00 0.02 A 0.94 1.00 0.98 1.00 0.98 0.10 0.00 0.04 0.00 0.04 009167 T 0.00 0.00 0.00 0.15 0.04 C 1.00 1.00 1.00 0.85 0.96 0.00 0.00 0.00 0.25 0.07 009272 A 0.02 0.00 0.00 0.15 0.04 G 0.98 1.00 1.00 0.85 0.96 0.04 0.00 0.00 0.25 0.08 009343 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 009400 T 0.02 0.00 0.00 0.15 0.04 C 0.98 1.00 1.00 0.85 0.96 0.04 0.00 0.00 0.25 0.08 009411 A 0.02 0.00 0.00 0.15 0.04 G 0.98 1.00 1.00 0.85 0.96 0.04 0.00 0.00 0.25 0.08 009442 T 0.38 0.27 0.38 0.62 0.42 A 0.62 0.73 0.62 0.38 0.58 0.47 0.40 0.47 0.47 0.49 009526 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 009619 G 0.08 0.07 0.00 0.19 0.09 A 0.92 0.93 1.00 0.81 0.91 0.15 0.14 0.00 0.31 0.17 009623 C 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.95 0.99 0.00 0.00 0.00 0.09 0.02 009643 C 0.04 0.12 0.37 0.36 0.21 T 0.96 0.88 0.63 0.64 0.79 0.08 0.22 0.46 0.46 0.33 009659 A 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.95 0.99 0.00 0.00 0.00 0.09 0.02 009688 G 0.10 0.00 0.00 0.05 0.04 A 0.90 1.00 1.00 0.95 0.96 0.19 0.00 0.00 0.09 0.08 009779 C 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.19 0.00 0.00 0.00 0.06 009879 C 0.12 0.00 0.00 0.00 0.04 T 0.88 1.00 1.00 1.00 0.96 0.22 0.00 0.00 0.00 0.07 009890 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 015089 C 0.02 0.14 0.36 0.30 0.20 A 0.98 0.86 0.64 0.70 0.80 0.05 0.24 0.46 0.42 0.32 015104 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 015126 G 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.88 1.00 1.00 1.00 0.97 0.21 0.00 0.00 0.00 0.06 015136 T 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.95 0.99 0.00 0.00 0.00 0.09 0.02 015143 G 0.14 0.00 0.00 0.14 0.07 A 0.86 1.00 1.00 0.86 0.93 0.24 0.00 0.00 0.24 0.13 015302 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 015368 A 0.13 0.14 0.34 0.30 0.23 G 0.87 0.86 0.66 0.70 0.77 0.23 0.24 0.45 0.42 0.35 015542 A 0.02 0.00 0.00 0.15 0.04 C 0.98 1.00 1.00 0.85 0.96 0.04 0.00 0.00 0.26 0.09 015830 T 0.02 0.00 0.00 0.12 0.03 C 0.98 1.00 1.00 0.88 0.97 0.04 0.00 0.00 0.21 0.06 015878 A 0.02 0.00 0.00 0.12 0.03 G 0.98 1.00 1.00 0.88 0.97 0.04 0.00 0.00 0.21 0.06 015903 T 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 C 1.00 1.00 1.00 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.21 0.05 015970 T 0.02 0.00 0.00 0.12 0.03 G 0.98 1.00 1.00 0.88 0.97 0.04 0.00 0.00 0.21 0.06 016095 T 0.35 0.34 0.39 0.61 0.42 C 0.65 0.66 0.61 0.39 0.58 0.45 0.45 0.47 0.48 0.49 016264 A 0.34 0.31 0.41 0.59 0.41 G 0.66 0.69 0.59 0.41 0.59 0.45 0.43 0.48 0.48 0.48 016429 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 016659 A 0.02 0.03 0.00 0.14 0.05 G 0.98 0.97 1.00 0.86 0.95 0.04 0.05 0.00 0.24 0.09 016707 G 0.15 0.00 0.00 0.14 0.07 A 0.85 1.00 1.00 0.86 0.93 0.25 0.00 0.00 0.24 0.14 016833 T 0.02 0.00 0.00 0.13 0.04 C 0.98 1.00 1.00 0.87 0.96 0.04 0.00 0.00 0.23 0.07 016855 G 0.43 0.67 0.59 0.23 0.47 A 0.57 0.33 0.41 0.77 0.53 0.49 0.44 0.48 0.35 0.50 016982 T 0.02 0.00 0.00 0.17 0.05 C 0.98 1.00 1.00 0.82 0.95 0.04 0.00 0.00 0.29 0.09 033091 C 0.00 0.00 0.00 0.14 0.03 A 1.00 1.00 1.00 0.86 0.97 0.00 0.00 0.00 0.24 0.07 033108 C 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.18 0.00 0.00 0.00 0.05 033110 G 0.00 0.00 0.00 0.14 0.03 A 1.00 1.00 1.00 0.86 0.97 0.00 0.00 0.00 0.24 0.07 033122 T 0.00 0.00 0.00 0.14 0.03 G 1.00 1.00 1.00 0.86 0.97 0.00 0.00 0.00 0.24 0.07 033354 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 033464 G 0.00 0.00 0.00 0.14 0.03 A 1.00 1.00 1.00 0.86 0.97 0.00 0.00 0.00 0.24 0.06 033488 G 0.00 0.00 0.00 0.14 0.03 T 1.00 1.00 1.00 0.86 0.97 0.00 0.00 0.00 0.24 0.06 033597 C 0.00 0.00 0.00 0.17 0.04 A 1.00 1.00 1.00 0.83 0.96 0.00 0.00 0.00 0.28 0.08 033610 A 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 034009 A 0.00 0.00 0.00 0.14 0.03 G 1.00 1.00 1.00 0.86 0.97 0.00 0.00 0.00 0.24 0.06 034233 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 034365 G 0.00 0.00 0.00 0.14 0.03 A 1.00 1.00 1.00 0.86 0.97 0.00 0.00 0.00 0.24 0.06 034390 T 0.27 0.10 0.11 0.21 0.18 C 0.73 0.90 0.89 0.79 0.82 0.39 0.17 0.20 0.34 0.29 034468 T 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.95 1.00 1.00 1.00 0.99 0.09 0.00 0.00 0.00 0.02 034473 C 0.00 0.00 0.00 0.11 0.03 T 1.00 1.00 1.00 0.89 0.97 0.00 0.00 0.00 0.20 0.06 034687 G 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 A 1.00 1.00 1.00 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.22 0.06 034728 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 034807 C 0.00 0.00 0.00 0.11 0.03 A 1.00 1.00 1.00 0.89 0.97 0.00 0.00 0.00 0.20 0.05 034837 A 0.00 0.00 0.00 0.11 0.03 G 1.00 1.00 1.00 0.89 0.97 0.00 0.00 0.00 0.20 0.05 034912 G 0.13 0.00 0.00 0.00 0.04 A 0.87 1.00 1.00 1.00 0.96 0.23 0.00 0.00 0.00 0.07 034920 T 0.00 0.00 0.00 0.11 0.03 A 1.00 1.00 1.00 0.89 0.97 0.00 0.00 0.00 0.20 0.05 034948 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 035012 A 0.00 0.00 0.00 0.11 0.03 G 1.00 1.00 1.00 0.89 0.97 0.00 0.00 0.00 0.20 0.05 035214 C 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 T 1.00 1.00 1.00 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.22 0.06 035244 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 035251 T 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 G 1.00 1.00 1.00 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.22 0.06 035368 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 035455 G 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 A 1.00 1.00 1.00 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.22 0.06 035634 A 0.07 0.04 0.00 0.12 0.06 T 0.93 0.96 1.00 0.88 0.94 0.13 0.08 0.00 0.22 0.11 035739 G 0.07 0.10 0.00 0.15 0.08 C 0.93 0.90 1.00 0.85 0.92 0.14 0.17 0.00 0.25 0.15 035844 T 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 C 1.00 1.00 1.00 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.22 0.06 036086 G 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 C 1.00 1.00 1.00 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.22 0.06 036237 C 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.07 0.00 0.04 0.00 0.03 036298 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 036299 A 0.24 0.09 0.11 0.21 0.17 G 0.76 0.91 0.89 0.79 0.83 0.37 0.17 0.20 0.33 0.28 036344 A 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.07 0.00 0.04 0.00 0.03 036363 T 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 C 1.00 1.00 1.00 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.22 0.06 036959 G 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 A 1.00 1.00 1.00 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.22 0.06 037026 T 0.24 0.07 0.11 0.21 0.16 A 0.76 0.93 0.89 0.79 0.84 0.37 0.13 0.20 0.33 0.27 037111 G 0.20 0.07 0.11 0.21 0.15 A 0.80 0.93 0.89 0.79 0.85 0.32 0.13 0.20 0.33 0.26 037169 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 037171 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 037250 A 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 037373 T 0.00 0.00 0.00 0.12 0.04 C 1.00 1.00 1.00 0.88 0.96 0.00 0.00 0.00 0.22 0.07 037658 T 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.06 0.00 0.00 0.00 0.01 037717 T 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 G 1.00 1.00 1.00 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.22 0.06 037826 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 037832 T 0.00 0.00 0.00 0.11 0.03 C 1.00 1.00 1.00 0.89 0.97 0.00 0.00 0.00 0.20 0.05 038061 G 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 A 1.00 1.00 1.00 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.22 0.06 038436 T 0.00 0.00 0.00 0.10 0.03 C 1.00 1.00 1.00 0.90 0.97 0.00 0.00 0.00 0.19 0.05 038867 A 0.00 0.00 0.00 0.10 0.03 C 1.00 1.00 1.00 0.90 0.97 0.00 0.00 0.00 0.19 0.05 038906 T 0.00 0.00 0.00 0.13 0.03 C 1.00 1.00 1.00 0.87 0.97 0.00 0.00 0.00 0.23 0.06 038932 G 0.02 0.00 0.00 0.13 0.04 A 0.98 1.00 1.00 0.87 0.96 0.04 0.00 0.00 0.23 0.07 039040 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 039246 G 0.00 0.00 0.00 0.13 0.03 A 1.00 1.00 1.00 0.87 0.97 0.00 0.00 0.00 0.23 0.06 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population