Site Genotype1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 HD-chi2 XD-chi2 Total-chi2 000308 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 3 3 CC 13 12 14 13 52 0.000 0.000 0.000 0.171 0.043 000347 CC 13 12 14 13 52 CT 0 0 0 3 3 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.171 0.043 000373 AA 10 12 14 13 49 AG 3 0 0 3 6 GG 0 0 0 0 0 0.221 0.000 0.000 0.171 0.183 000481 CC 17 17 20 22 76 CG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 000613 CC 10 12 15 20 57 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004 000687 AA 10 12 15 16 53 AG 0 0 0 5 5 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.383 0.118 000716 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 9 12 15 21 57 0.028 0.000 0.000 0.000 0.004 000957 CC 22 21 21 24 88 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.102 0.000 0.000 0.000 0.026 001029 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 6 6 TT 25 21 21 18 85 0.000 0.000 0.000 0.490 0.106 001061 AA 15 17 15 15 62 AG 10 4 6 8 28 GG 0 0 0 1 1 1.562 0.233 0.583 0.003 1.257 001200 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 21 21 24 90 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001245 CC 15 17 16 15 63 CT 10 4 5 8 27 TT 0 0 0 1 1 1.562 0.233 0.383 0.003 1.052 001284 CC 23 21 21 24 89 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.000 0.000 0.011 001305 AA 0 0 0 0 0 AC 0 1 0 0 1 CC 25 20 21 24 90 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 001534 CC 26 22 21 19 88 CT 0 0 0 4 4 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 1.361 9.001 001588 AA 19 17 18 16 70 AG 4 3 0 7 14 GG 1 0 0 0 1 1.361 0.131 0.000 0.741 0.099 001644 CC 23 20 18 17 78 CT 0 0 0 5 5 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 0.571 5.447 001791 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 2 0 2 GG 24 20 16 23 83 0.000 0.000 0.062 0.000 0.012 001826 GG 24 20 18 22 84 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 001860 AA 0 0 0 1 1 AG 0 0 0 5 5 GG 24 20 18 17 79 0.000 0.000 0.000 0.571 5.529 001865 CC 15 17 13 15 60 CG 9 3 5 7 24 GG 0 0 0 1 1 1.278 0.131 0.468 0.025 0.685 001916 CC 0 0 0 1 1 CG 0 0 0 4 4 GG 25 22 21 17 85 0.000 0.000 0.000 1.144 8.668 001968 CC 21 19 22 14 76 CT 3 3 0 7 13 TT 1 0 0 0 1 2.778 0.118 0.000 0.840 0.268 002058 AA 0 0 0 0 0 AT 0 1 0 0 1 TT 25 20 22 13 80 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 002304 CC 27 21 22 18 88 CG 0 0 0 4 4 GG 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 1.252 9.001 002331 AA 0 0 0 1 1 AG 0 0 0 4 4 GG 27 21 22 18 88 0.000 0.000 0.000 1.252 9.001 002395 CC 27 21 22 18 88 CT 0 0 0 4 4 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 1.252 9.001 002512 CC 21 21 21 21 84 CG 5 0 1 2 8 GG 0 0 0 0 0 0.294 0.000 0.012 0.048 0.190 002627 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 25 21 22 23 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 002643 AA 2 2 3 12 19 AG 14 8 9 9 40 GG 10 11 10 2 33 0.934 0.093 0.177 0.028 1.110 002656 CC 26 21 22 18 87 CT 0 0 0 4 4 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 1.252 8.890 002668 -- 26 21 21 18 86 +- 0 0 0 4 4 ++ 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 1.252 8.779 002735 CC 26 21 19 22 88 CT 0 0 2 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.053 0.000 0.011 004183 AA 1 1 1 4 7 AC 4 1 1 4 10 CC 17 17 15 10 59 1.144 7.736 6.842 4.500 19.398 004203 AA 1 0 0 4 5 AG 10 4 5 5 24 GG 11 13 11 6 41 0.468 0.302 0.549 1.548 0.321 004234 AA 1 0 0 1 2 AG 10 4 4 5 23 GG 10 13 11 9 43 0.583 0.302 0.355 0.070 0.269 004246 AA 11 13 11 6 41 AT 10 4 5 5 24 TT 1 0 0 4 5 0.468 0.302 0.549 1.548 0.321 004270 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 22 16 16 15 69 0.000 0.016 0.000 0.000 0.004 004286 CC 22 17 16 10 65 CT 0 0 0 4 4 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 0.417 6.447 004340 AA 12 13 12 6 43 AG 9 4 4 5 22 GG 1 0 0 4 5 0.182 0.302 0.327 1.548 0.829 004497 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 22 20 21 21 84 0.045 0.000 0.000 0.000 0.012 004574 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 1 2 GG 26 22 22 21 91 0.010 0.000 0.000 0.012 0.011 004612 AA 0 0 0 1 1 AG 0 0 0 3 3 GG 27 21 22 15 85 0.000 0.000 0.000 1.815 13.032 004867 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 2 3 TT 26 22 22 22 92 0.010 0.000 0.000 0.045 0.024 005146 CC 19 14 13 8 54 CT 7 6 8 12 33 TT 1 1 1 4 7 0.120 0.114 0.027 0.020 0.383 005302 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 005567 CC 23 22 22 23 90 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.097 0.000 0.000 0.000 0.025 005577 AA 0 0 0 0 0 AC 0 2 5 0 7 CC 26 20 17 23 86 0.000 0.050 0.362 0.000 0.142 005868 AA 24 20 21 18 83 AG 0 0 0 5 5 GG 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 0.644 5.854 006135 AA 19 21 22 17 79 AG 0 0 0 4 4 GG 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 1.144 8.002 006199 AA 0 0 0 1 1 AG 0 0 0 4 4 GG 19 21 22 17 79 0.000 0.000 0.000 1.144 8.002 006206 AA 17 21 22 22 82 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.059 0.000 0.000 0.000 0.012 006267 AA 9 15 17 17 58 AG 9 6 5 4 24 GG 1 0 0 1 2 0.436 0.583 0.362 1.144 0.069 006334 CC 19 21 22 17 79 CT 0 0 0 4 4 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 1.144 8.002 006369 CC 0 0 0 1 1 CT 0 0 0 4 4 TT 19 21 22 17 79 0.000 0.000 0.000 1.144 8.002 006493 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 14 21 22 22 79 0.071 0.000 0.000 0.000 0.013 006528 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 4 4 TT 19 22 21 17 79 0.000 0.000 0.000 0.233 0.051 006573 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 0 4 4 GG 22 22 22 17 83 0.000 0.000 0.000 0.233 0.048 006816 CC 1 0 0 3 4 CG 10 6 5 9 30 GG 16 16 17 11 60 0.138 0.548 0.362 0.277 0.010 006829 CC 0 0 0 1 1 CT 0 0 0 5 5 TT 27 22 22 18 89 0.000 0.000 0.000 0.644 6.343 007041 AA 27 22 22 23 94 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 007065 CC 27 22 22 18 89 CT 0 0 0 5 5 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 0.644 6.343 007095 GG 0 0 0 1 1 GT 0 0 0 5 5 TT 27 22 22 18 89 0.000 0.000 0.000 0.644 6.343 007204 AA 1 1 1 4 7 AC 6 6 8 12 32 CC 20 15 13 8 56 0.386 0.153 0.027 0.020 0.641 007267 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 007327 AA 24 22 22 24 92 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 009287 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 23 21 20 22 86 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 009829 CC 0 0 0 1 1 CG 1 0 0 5 6 GG 25 22 20 18 85 0.010 0.000 0.000 0.644 4.289 009914 CC 0 0 0 1 1 CT 1 0 0 5 6 TT 25 22 20 18 85 0.010 0.000 0.000 0.644 4.289 009915 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 26 22 20 23 91 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 010004 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 2 0 2 TT 26 22 18 24 90 0.000 0.000 0.055 0.000 0.011 010097 -- 0 0 0 1 1 +- 0 0 0 5 5 ++ 26 22 21 18 87 0.000 0.000 0.000 0.644 6.180 010326 CC 25 22 21 24 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 010756 CC 25 22 20 20 87 CT 0 0 0 4 4 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.198 0.046 010779 CC 5 10 11 12 38 CT 11 6 6 11 34 TT 9 6 3 1 19 0.235 4.180 1.633 0.618 4.352 010780 AA 0 0 0 1 1 AC 1 0 0 5 6 CC 24 22 20 18 84 0.010 0.000 0.000 0.644 4.227 010876 AA 24 22 20 24 90 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 011048 CC 24 22 21 18 85 CT 1 0 0 5 6 TT 0 0 0 1 1 0.010 0.000 0.000 0.644 4.289 011424 CC 0 0 0 1 1 CT 1 0 0 4 5 TT 23 22 21 18 84 0.011 0.000 0.000 1.252 5.936 011571 CC 24 21 21 23 89 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 011634 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 23 22 21 23 89 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 011654 AA 0 0 0 1 1 AC 1 0 0 4 5 CC 23 22 21 18 84 0.011 0.000 0.000 1.252 5.936 011758 AA 0 3 0 1 4 AG 7 5 6 6 24 GG 16 14 15 16 61 0.741 3.414 0.583 0.195 0.652 012027 AA 0 0 0 1 1 AT 1 0 0 5 6 TT 25 22 22 18 87 0.010 0.000 0.000 0.644 4.413 012171 AA 0 0 0 1 1 AC 1 0 0 5 6 CC 25 22 22 18 87 0.010 0.000 0.000 0.644 4.413 012212 CC 0 0 0 1 1 CT 1 0 0 5 6 TT 23 22 21 18 84 0.011 0.000 0.000 0.644 4.227 012229 AA 0 4 1 2 7 AG 8 6 6 6 26 GG 16 12 14 16 58 0.960 3.035 0.114 1.407 2.535 012323 GG 16 13 14 17 60 GT 8 7 6 6 27 TT 0 2 1 1 4 0.960 0.505 0.114 0.240 0.183 012537 GG 24 22 20 24 90 GT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 012778 GG 5 12 15 20 52 GT 14 5 5 4 28 TT 4 5 2 0 11 1.110 5.374 2.001 0.198 4.726 012803 CC 21 21 22 18 82 CT 2 1 0 5 8 TT 0 0 0 1 1 0.048 0.012 0.000 0.644 2.144 012993 AA 0 0 0 1 1 AG 0 0 0 5 5 GG 24 22 22 18 86 0.000 0.000 0.000 0.644 6.099 013069 AA 0 0 0 0 0 AT 0 0 4 1 5 TT 24 21 17 23 85 0.000 0.000 0.233 0.011 0.073 013072 CC 0 0 0 0 0 CG 0 1 0 0 1 GG 24 20 21 24 89 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 013373 GG 24 21 22 23 90 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 013512 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 22 20 21 20 83 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 013533 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 22 20 21 20 83 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 013564 CC 0 0 0 1 1 CT 0 2 2 5 9 TT 23 18 19 14 74 0.000 0.055 0.053 0.360 1.302 013705 CC 20 19 22 24 85 CG 5 1 0 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.309 0.013 0.000 0.000 0.106 013757 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 25 20 22 23 90 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 014014 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 19 15 20 19 73 0.013 0.000 0.000 0.000 0.003 014058 CC 1 1 7 5 14 CG 11 7 10 12 40 GG 8 7 3 2 20 1.286 0.185 0.035 1.659 0.576 014073 AA 0 2 0 1 3 AG 8 5 6 3 22 GG 13 11 15 14 53 1.163 1.210 0.583 1.655 0.140 014174 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 24 21 21 24 90 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 014313 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 26 17 20 22 85 0.000 0.015 0.000 0.000 0.003 014510 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 014564 AA 27 21 22 24 94 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 014901 CC 24 22 22 24 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 014932 CC 25 22 22 21 90 CT 0 0 0 3 3 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.107 0.025 015044 CC 0 0 0 1 1 CT 0 0 0 5 5 TT 22 20 22 16 80 0.000 0.000 0.000 0.499 5.610 015113 GG 4 3 2 0 9 GT 9 6 5 4 24 TT 9 11 15 18 53 0.414 1.633 2.001 0.220 5.118 015156 CC 9 11 15 18 53 CT 9 6 5 4 24 TT 4 3 2 0 9 0.414 1.633 2.001 0.220 5.118 015162 AA 11 6 3 1 21 AG 9 10 11 15 45 GG 2 4 8 6 20 0.007 0.002 0.065 4.219 0.187 015228 CC 23 20 20 16 79 CT 1 0 2 5 8 TT 0 0 0 1 1 0.011 0.000 0.050 0.499 2.028 015619 CC 3 6 3 4 16 CT 2 3 5 5 15 TT 1 3 3 3 10 0.375 2.613 0.091 0.310 2.609 015768 AA 0 0 0 1 1 AG 0 0 0 2 2 GG 10 12 12 12 46 0.000 0.000 0.000 2.685 11.230 015901 CC 26 21 22 24 93 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 015904 CC 14 13 15 7 49 CT 6 7 6 12 31 TT 6 2 1 5 14 6.248 0.505 0.153 0.001 5.159 015932 AA 22 20 16 21 79 AG 4 2 6 3 15 GG 0 0 0 0 0 0.181 0.050 0.548 0.107 0.707 015948 AA 11 13 10 12 46 AG 11 7 10 8 36 GG 4 2 2 4 12 0.200 0.505 0.050 1.500 1.326 015962 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 1 0 1 GG 26 22 21 24 93 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 015969 CC 26 22 22 23 93 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 015971 CC 24 22 20 24 90 CG 2 0 2 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.050 0.000 0.044 015975 -- 9 5 2 4 20 +- 16 10 11 9 46 ++ 1 7 9 11 28 3.360 0.153 0.279 0.780 0.019 016045 CC 6 3 2 4 15 CG 14 14 11 13 52 GG 5 5 9 6 25 0.371 1.766 0.279 0.445 1.906 016117 AA 25 21 22 23 91 AC 0 1 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 016121 AA 2 2 0 2 6 AC 13 10 9 10 42 CC 10 10 13 11 44 0.629 0.050 1.455 0.017 0.936 016231 CC 27 21 21 23 92 CT 0 1 1 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.012 0.000 0.011 016232 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 016275 CC 23 13 18 17 71 CT 4 9 4 5 22 TT 0 0 0 1 1 0.173 1.455 0.220 0.571 0.243 016295 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 27 22 20 23 92 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 016319 GG 17 4 6 3 30 GT 8 9 8 13 38 TT 2 9 7 7 25 0.551 0.414 1.173 0.631 3.028 016545 -- 0 0 0 0 0 +- 0 0 0 2 2 ++ 26 22 20 20 88 0.000 0.000 0.000 0.050 0.011 016831 AA 3 0 0 1 4 AC 6 0 2 5 13 CC 18 22 20 18 78 3.444 0.000 0.050 0.644 8.781 016844 AA 24 22 22 24 92 AC 2 0 0 0 2 CC 1 0 0 0 1 5.713 0.000 0.000 0.000 22.739 016963 * 016996 AA 27 22 22 18 89 AT 0 0 0 5 5 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 0.644 6.343 017006 CC 27 22 22 18 89 CT 0 0 0 5 5 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 0.644 6.343 017017 -- 0 0 0 1 1 +- 0 0 0 5 5 ++ 27 22 22 18 89 0.000 0.000 0.000 0.644 6.343 017049 -- 27 22 22 18 89 +- 0 0 0 5 5 ++ 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 0.644 6.343 017068 CC 24 12 19 22 77 CT 3 10 3 2 18 TT 0 0 0 0 0 0.093 1.903 0.118 0.045 1.040 017145 GG 12 12 10 10 44 GT 9 7 8 10 34 TT 5 1 4 4 14 1.672 0.000 1.010 0.296 2.751 017460 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 26 20 22 22 90 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 017507 CC 23 10 19 22 74 CT 3 10 3 1 17 TT 0 0 0 0 0 0.097 2.222 0.118 0.011 0.966 017554 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 25 20 22 22 89 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 017565 CC 0 0 0 1 1 CT 0 0 0 4 4 TT 26 19 22 16 83 0.000 0.000 0.000 1.037 8.446 017576 CC 0 0 0 1 1 CT 0 0 0 4 4 TT 25 19 22 16 82 0.000 0.000 0.000 1.037 8.335 017594 AA 24 19 22 16 81 AG 0 0 0 4 4 GG 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 1.037 8.224 017988 AA 13 10 10 9 42 AC 9 11 8 10 38 CC 5 1 4 4 14 1.956 0.889 1.010 0.175 1.195 018030 AA 27 22 21 23 93 AT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 018293 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 27 21 22 23 93 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 018786 AA 22 20 20 17 79 AG 3 0 2 0 5 GG 1 0 0 0 1 2.938 0.000 0.050 0.000 5.529 018941 CC 19 19 20 15 73 CG 0 0 0 2 2 GG 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 3.445 17.987 019009 AA 19 18 20 17 74 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.013 0.000 0.000 0.000 0.003 019064 GG 5 0 3 4 12 GT 6 5 9 10 30 TT 13 17 10 10 50 4.594 0.362 0.177 0.296 4.200 019080 AA 0 0 0 1 1 AT 0 0 0 5 5 TT 26 22 22 18 88 0.000 0.000 0.000 0.644 6.261 019145 AA 27 22 21 24 94 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 019148 CC 20 7 16 22 65 CT 6 12 6 2 26 TT 1 3 0 0 4 0.386 0.362 0.548 0.045 0.447 019200 AA 8 4 8 8 28 AG 12 13 7 12 44 GG 7 5 7 4 23 0.326 0.747 2.888 0.020 0.480 019225 CC 26 22 22 24 94 CG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 019346 CC 7 5 7 4 23 CT 12 13 7 12 44 TT 8 4 8 8 28 0.326 0.747 2.888 0.020 0.480 019371 GG 26 22 22 24 94 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 019381 AA 0 0 0 0 0 AC 7 10 5 2 24 CC 20 12 17 22 71 0.599 1.903 0.362 0.045 1.986 019696 CC 4 4 8 8 24 CT 17 15 9 12 53 TT 5 3 5 4 17 2.493 2.954 0.609 0.020 1.687 020376 CC 23 10 18 15 66 CT 3 8 3 2 16 TT 0 0 0 0 0 0.097 1.469 0.124 0.066 0.958 020390 AA 0 0 0 1 1 AG 2 0 2 1 5 GG 23 18 19 17 77 0.043 0.000 0.053 7.736 5.366 020413 CC 24 17 19 13 73 CG 0 0 0 3 3 GG 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 1.495 11.111 020801 AA 23 22 20 23 88 AG 3 0 2 0 5 GG 1 0 0 0 1 3.099 0.000 0.050 0.000 6.261 020865 GG 24 22 20 23 89 GT 2 0 2 0 4 TT 1 0 0 0 1 5.713 0.000 0.050 0.000 9.113 020942 AA 0 0 0 0 0 AG 5 0 0 0 5 GG 22 22 22 23 89 0.281 0.000 0.000 0.000 0.070 020978 AA 6 7 8 14 35 AC 9 13 10 9 41 CC 12 2 4 1 19 2.409 1.333 0.079 0.091 1.184 021081 AA 23 22 20 24 89 AG 3 0 2 0 5 GG 1 0 0 0 1 3.099 0.000 0.050 0.000 6.343 021160 CC 17 20 13 8 58 CT 7 2 4 9 22 TT 3 0 5 6 14 2.283 0.050 7.425 1.028 15.084 021183 AA 23 16 22 24 85 AG 3 0 0 0 3 GG 1 0 0 0 1 3.099 0.000 0.000 0.000 13.032 021213 AA 27 16 21 23 87 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 021333 AA 27 16 22 23 88 AG 0 0 0 0 0 GG 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 24.000 89.000 021334 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 27 16 22 23 88 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 021440 AA 0 0 0 0 0 AC 4 0 0 0 4 CC 22 16 22 23 83 0.181 0.000 0.000 0.000 0.048 021465 CC 1 0 4 2 7 CG 4 2 6 7 19 GG 20 14 12 11 57 1.469 0.071 3.035 0.299 6.572 021668 AA 1 0 2 5 8 AT 7 4 5 7 23 TT 19 18 15 12 64 0.120 0.220 2.001 3.153 6.321 021705 AA 27 22 22 23 94 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 021725 AA 1 1 5 13 20 AC 9 7 10 8 34 CC 17 14 7 3 41 0.020 0.011 0.153 0.897 5.816 021809 AA 0 0 0 0 0 AC 3 10 3 2 18 CC 24 12 18 21 75 0.093 1.903 0.124 0.048 1.068 021922 GG 8 7 7 11 33 GT 11 13 11 8 43 TT 8 2 3 0 13 0.926 1.333 0.159 1.351 0.028 021963 GG 27 20 20 14 81 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 6.395 36.213 022937 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 25 22 21 23 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 022969 CC 25 22 21 23 91 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 023089 CC 1 3 0 0 4 CT 9 12 4 2 27 TT 16 7 17 21 61 0.037 0.362 0.233 0.048 0.206 023169 AA 1 3 0 0 4 AT 14 12 4 2 32 TT 11 7 17 21 56 1.811 0.362 0.233 0.048 0.045 023180 CC 24 17 11 11 63 CT 2 5 8 9 24 TT 0 0 2 3 5 0.042 0.362 0.093 0.277 1.655 023364 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 24 22 22 24 92 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 024175 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 025319 CC 0 0 0 1 1 CT 0 0 0 5 5 TT 27 20 20 15 82 0.000 0.000 0.000 0.429 5.773 025367 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 20 20 21 87 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 025446 AA 26 20 20 21 87 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 026076 AA 26 21 19 17 83 AG 0 0 0 4 4 GG 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 1.144 8.446 026095 CC 16 14 18 20 68 CT 8 7 1 2 18 TT 2 0 0 0 2 0.462 0.840 0.014 0.050 0.371 026114 AA 23 19 18 23 83 AG 3 2 1 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.097 0.053 0.014 0.000 0.108 026225 CC 16 10 8 9 43 CT 6 12 9 8 35 TT 3 0 3 4 10 2.926 3.094 0.032 0.777 0.487 026673 AA 0 0 0 1 1 AG 0 0 0 5 5 GG 26 22 21 18 87 0.000 0.000 0.000 0.644 6.180 026703 -- 17 10 9 5 41 +- 7 11 9 13 40 ++ 2 1 3 6 12 0.968 0.889 0.093 0.174 0.207 026897 CC 25 22 21 24 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 027082 CC 0 0 0 0 0 CT 2 7 1 0 10 TT 25 15 21 24 85 0.040 0.787 0.012 0.000 0.293 027247 AA 3 1 3 6 13 AG 10 12 9 13 44 GG 14 9 10 5 38 0.338 1.455 0.177 0.174 0.002 027379 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 2 0 2 GG 27 22 20 24 93 0.000 0.000 0.050 0.000 0.011 027409 CC 0 0 1 1 2 CT 1 1 2 8 12 TT 17 16 16 14 63 0.015 0.016 3.698 0.011 2.047 028248 * 028278 AA 0 0 3 4 7 AG 5 10 7 11 33 GG 22 8 12 8 50 0.281 2.663 1.223 0.004 0.223 028887 AA 0 0 1 1 2 AG 5 3 3 8 19 GG 22 18 18 15 73 0.281 0.124 2.296 0.003 0.325 028924 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 6 6 GG 27 21 22 18 88 0.000 0.000 0.000 0.490 0.102 029201 * 029764 AA 12 14 18 21 65 AG 14 8 4 3 29 GG 0 0 0 0 0 3.529 1.086 0.220 0.107 3.127 029917 CC 0 0 1 1 2 CG 5 2 3 6 16 GG 21 19 18 15 73 0.294 0.053 2.296 0.153 0.933 029974 AA 1 0 3 4 8 AG 6 11 8 11 36 GG 19 10 11 7 47 0.336 2.644 0.577 0.008 0.086 029992 CC 22 10 19 20 71 CT 4 11 3 2 20 TT 0 0 0 0 0 0.181 2.644 0.118 0.050 1.387 030078 AA 3 2 5 6 16 AG 13 13 8 10 44 GG 9 5 9 6 29 0.268 2.177 1.352 0.182 0.009 030222 AA 17 9 10 8 44 AG 4 12 6 11 33 GG 4 0 6 3 13 7.879 3.360 4.180 0.065 2.539 030333 GG 23 22 19 22 86 GT 0 0 2 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.053 0.000 0.012 030473 CC 15 9 8 8 40 CT 4 12 7 11 34 TT 4 0 5 3 12 6.933 3.360 1.612 0.065 1.148 030474 AA 4 0 6 3 13 AG 4 12 6 11 33 GG 15 9 8 8 40 6.933 3.360 3.104 0.065 1.900 030477 CC 15 9 8 8 40 CG 4 11 6 10 31 GG 4 1 6 4 15 6.933 1.068 3.104 0.079 3.884 030669 CC 24 21 20 21 86 CT 1 1 0 0 2 TT 1 0 0 0 1 10.859 0.012 0.000 0.000 21.239 030778 CC 1 0 0 0 1 CG 1 1 0 0 2 GG 23 21 20 21 85 10.413 0.012 0.000 0.000 20.989 030823 AA 25 22 19 16 82 AC 0 0 0 5 5 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.383 0.076 030896 CC 22 15 17 18 72 CT 3 6 1 2 12 TT 0 0 0 0 0 0.102 0.583 0.015 0.055 0.497 030998 AA 4 0 6 3 13 AG 2 7 2 6 17 GG 19 15 12 13 59 14.062 0.787 12.175 2.148 20.397 031062 CC 0 1 0 2 3 CG 5 7 2 1 15 GG 20 13 18 18 69 0.309 0.002 0.055 12.547 3.064 031114 AA 4 0 6 3 13 AG 2 4 0 0 6 GG 19 16 14 16 65 14.062 0.247 20.000 19.000 49.595 031266 CC 20 16 14 16 66 CT 1 4 0 0 5 TT 4 0 6 3 13 18.684 0.247 20.000 19.000 54.058 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002668: aT 010097: caattatata 015975: c 016545: t 017017: t 017049: A 026703: A Tri-allelic sites: Site Genotype AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop 016963 AA 0 0 0 0 0 016963 AG 0 0 0 1 1 016963 AT 0 0 0 0 0 016963 GG 27 22 22 17 88 016963 GT 0 0 0 5 5 016963 TT 0 0 0 1 1 028248 CC 4 0 1 3 8 028248 CG 16 6 7 9 38 028248 CT 0 0 0 0 0 028248 GG 2 4 6 2 14 028248 GT 5 8 5 5 23 028248 TT 0 1 3 4 8 029201 CC 20 14 17 23 74 029201 CG 1 6 4 1 12 029201 CT 3 2 1 0 6 029201 GG 0 0 0 0 0 029201 GT 0 0 0 0 0 029201 TT 0 0 0 0 0