************************************************************* **** **** **** Output from PHASE v2.0 **** **** Code by M Stephens, with contributions from N Li **** **** **** ************************************************************* BEGIN COMMAND_LINE /usr/local/genome/lib/phase/PHASE2 -d1 mmp2x.phase.inp mmp2x.phase.out END COMMAND_LINE BEGIN OUTFILE_LIST mmp2x.phase.out_freqs : haplotype frequency estimates mmp2x.phase.out_pairs : most likely haplotype pairs for each individual mmp2x.phase.out_recom : estimates of recombination parameters mmp2x.phase.out_monitor : file for monitoring convergence END OUTFILE_LIST BEGIN INPUT_SUMMARY Number of Individuals: 90 Number of Loci: 82 Positions of loci: 401 670 917 1021 1186 2195 2487 3447 4064 4279 4457 4485 4559 5259 5337 5572 5631 6026 6096 6343 7122 7474 7614 7741 8014 8399 8471 8924 9174 9442 9472 10589 11064 11098 12227 12571 12648 12864 13342 13750 14026 14779 15353 15577 15578 15742 15892 15979 16164 16288 16548 16757 16852 16870 16993 17025 17533 18277 18987 19167 19222 19628 19638 20126 20560 20613 20987 21325 21626 22137 22452 25489 25554 25594 27844 28058 28481 29623 29694 29729 29840 29907 END INPUT_SUMMARY List of haplotypes found in best reconstruction, with counts. (See file mmp2x.phase.out_freqs for haplotype population frequency estimates) BEGIN LIST_SUMMARY 1 GCGCTGCCCCGTTGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACGAAGACGGCTTATACCDTGIATGTTACTGCTGA 2 TGCG 1.000000 2 GCGCTGCCCCGTTGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACGAAGACGGCTTATACCITGIATGTAACTGCTGA 2 TGCG 1.000000 3 GCGCTGCCCCGTTGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACGAAGACGGCTTATACCITGIATGTTACCATCCC 4 TGTT 4.000000 4 GCGCTGCCCCGTTGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACGAAGACGGCTTATACCITGIATGTTACTGCTGA 2 TGCG 8.000000 5 GCGCTGCCCCGTTGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACGAAGACGGCTTATACCITGIATGTTAACATCCC 4 TGTT 3.000000 6 GCGCTGCCCCGTTGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACTAAGACGGCTTATACCITGIATGTTACTGCTGA 2 TGCG 4.000000 7 GCGCTGCCCCGTTGGAGGAICCGAIGCACCAGGGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAGACATCCC 4 TGTT 1.000000 8 GCGCTGCCCCACAAAAAGAICTTGICCACTATCGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAGCTGCTGA 2 TGCG 1.000000 9 GCGCTGCCCCACAAAAAGAICTTGICCACTATCGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAGACATCCC 4 TGTT 11.000000 10 GCGCTGCCCCACAAAAAGAICTTGICCACTATCGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAGATGCTGA 2 TGCG 1.000000 11 GCGCTGCCCCACAAAAAGAICTTGICCACTATCGDTGTACCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCIGTDATGTTACTGCTGA 2 TGCG 1.000000 12 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACTAAGACGGCTAATACCITGIATGTTACTGCTGA 2 TGCG 1.000000 13 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACTAAGACGGCTTATACCITGIATGTTACTGCTGA 2 TGCG 12.000000 14 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACTAAGACGGCTTATACCITGIATGTTGCCATCCC 4 TGTT 1.000000 15 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAGACATCCC 4 TGTT 1.000000 16 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAICTTGICCACTATCGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAGACATCCC 4 TGTT 1.000000 17 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAITCGAIGCACCAGGGDCCTGCCCATGAAGACGGCGTATACCIGGIATGTAACCACCCA 3 GGCG 2.000000 18 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAITCGAIGCACCAGGGDCCTGCCCATGAAGACGGCGTATACCIGGIATGTAAATGCTGA 2 TGCG 2.000000 19 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAITCGAIGTACCAGCGICGTATCCGCGGTAATGATGAATATTDGGIGCGCAACCACCCA 2 GCCG 2.000000 20 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAITCGAIGTACCAGCGICGTATCCGCGGTAATGATGAATATTDGGIGCGCAACCACCCA 3 GGCG 2.000000 21 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAITCGAIGTACCAGCGICGTATCCGCGGTAATGATGAATATTDGGIGCGCAACCACCCC 4 TGTT 2.000000 22 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAITCGAIGTACCAGCGICGTATCCGCGGTAATGATGAATATTDGGIGCGCAACCATCCC 4 TGTT 1.000000 23 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAITCGAIGTACCAGCGICGTATCCGCGGTAATGATGAATATTDGGIGCGCAACTGCTGA 2 TGCG 4.000000 24 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAITCGAIGTACCAGCGICGTATCCGCGGTAATGATGAATATTDGGIGCGCAGCTGCTGA 2 TGCG 1.000000 25 GCGCTGCCTCGTAGGAGAAITCGAIGTACCAGGGICGCACCCGCGGTGACGGCTTATACCIGGIGCGCAACCACCCA 3 GGCG 1.000000 26 GCGCTGCCTCGTAGAAAGAICTTGIGCACCATCGICGTGCCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCDGGIATGTTACCATCCC 4 TGTT 1.000000 27 GCGCTGCCTCGTAGAAAGAICTTGIGCACCATCGICGTGCCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCDGGIATGTTAACACCCA 2 GCCG 1.000000 28 GCGCTGCCTCGTAGAAAGGICTTADGCATCAGCADCGTGCCCATGGTAATGGCGTGTGCCDGGIATGTAACTGCTGA 2 TGCG 1.000000 29 GCGCTGCCTCGTAAAAAGAICTTGICCACTATCGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAGACATCCC 4 TGTT 1.000000 30 GCGCTGCCTCGTTGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACGAAGACGGCTTATACCITGIATGTTACTGCTGA 2 TGCG 1.000000 31 GCGCTGCCTCATAGAAAGAICTTGIGCACCATCGICGTGCCCATGAAGACGGCGTATACCIGGIATGTTAACACCCA 4 TGTT 1.000000 32 GCGCTGCCTAGTAGGTGAGICTTADGCATCAGCADCGCGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGCCIGGIATGTAACCACCCA 3 GGCG 1.000000 33 GCGCTGCCTAGTAGGTGAGICTTADGCATCAGCADCGCGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGCCIGGIATGTAACCATCCC 4 TGTT 1.000000 34 GCGCTGCCTAGTAGGTGAGDCCGAIGCGCCGGGGDTGTACCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCIGTIATGTAACCACTGA 2 TGCG 3.000000 35 GCGCTGCCTAGTAGGTGAGDCCGAIGCGCCGGGGDTGTACCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCIGTIATGTAACTGCTGA 2 TGCG 11.000000 36 GCGCTGCCTAGTAGGTGAGDCCGAIGCGCCGGGGDTGTACCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCIGTIATGTAACTGCTGA 3 GCCG 1.000000 37 GCGCTGCCTAGTAGGTGAGDCCGAIGCGCCGGGGDTGTACCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCIGTIATGTAGACATCCC 4 TGTT 1.000000 38 GCGCTGCCTAGTAGGTGAGDCCGAIGCGCCGGGGDTGTACCGGTGGAGGTAGCGTGTGCCIGTIATGTAACTGCTGA 2 TGCG 1.000000 39 GCGCTGCTCCGTTGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACGAAGACGGCTTATACCITGIATGTTACTGCTGA 2 TGCG 1.000000 40 GCGCTGCTCCGTTGGAAGAICTTAIGCACCAGCADCCTGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGCCDGGIATATTGCCATCCC 4 TGTT 1.000000 41 GCGATGCCCCGTTGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACGAAGACGGCTTATACCITGIATGTTACTGCTGA 2 TGCG 3.000000 42 GCGATGCCCCGTTGAAAGAICTTAIGCACCAGCGICGTATCGGCGGAGGTGGCGTGTACCIGGIATGTTACCACCCA 2 GCCG 1.000000 43 GCGATGCCTCGTAGAAAGAICTTAIGCACCAGCGDCGCGCCCACGGTAATGGCGTATACCIGGIATATTACCATCCC 4 TGTT 2.000000 44 GCGATGCCTCGTAGAAAGAICTTGIGCACCAGCGICGTACCCACGAAGACGGCGTATGCCDGGIATGTAAACACCGA 3 GCCG 1.000000 45 GCGATGCCTCGTAGAAAGAICTTGIGCACCAGCGDCGTACCCACGAAGACGGCGTATACCDGGIATGTTAACACCGA 3 GCCG 1.000000 46 GCGATGCCTCGTAGAAAGAICTTGIGCACCATCGICGTGCCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCDGGIATGTTAACACCCA 2 GCCG 1.000000 47 GCGATGCCTCGTAGAAAGGICTTADGCATCAGCADCGTGCCCATGGTAATGGCGTGTGCCDGGIATGTAACCACCCA 2 TGCG 2.000000 48 GCGATGCCTCATAGAAAGAICTTGIGCACCATCGICGTGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGCTDGGIACGCAACCACTGA 2 TGCG 1.000000 49 GCGATGCCTCATAGAAAGAICTTGIGCACCATCGICGTGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGCTDGGIACGCAACCACCCA 3 GCCG 1.000000 50 GCGATGCCTCATAGAAAGAICTTGIGCACCATCGICGTGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGCTDGGIACGCAACTGCTGA 2 TGCG 2.000000 51 GCGATGCCTCATAGAAAGGICTTADGCATCAGCADCGTGCCCATGGTAATGGCGTGTGCCDGGIATGTAACCACCCA 3 GGCG 1.000000 52 GCGATGCCTAGTAGGTGAGICCGAIGCGCCAGGGDTGTACCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCIGTIATGTAACTGCTGA 2 TGCG 3.000000 53 GCGATGCCTAGTAGGTGAGICTTADGCATCAGCADCGCGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGCCIGGIATGTAACCACCCA 3 GGCG 3.000000 54 GCGATGCCTAGTAGGTGAGICTTADGCATCAGCADCGCGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGCCIGGIATGTAACTGCTGA 2 TGCG 1.000000 55 GCGATGCCTAGTAGGTGAGICTTADGCATCAGCADCGCGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGTTDGGIGCGCAGACATCCC 4 TGTT 1.000000 56 GCGATGCTCCGTTGGAAGAICTTAIGCACCAGCADCCTGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGCCDGGIATATAGCCATCCC 4 TGTT 1.000000 57 GCGATGCTCCGTTGGAAGAICTTAIGCACCAGCADCCTGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGCCDGGIATATTGCCACCCA 2 GCCG 1.000000 58 GCGATGCTCCGTTGGAAGAICTTAIGCACCAGCADCCTGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGCCDGGIATATTGCCATCCC 4 TGTT 3.000000 59 GCGATGCTCCGTTGGAAGAICTTAIGCACCAGCADCCTGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGCCDGGIATATTGACATCCC 4 TGTT 1.000000 60 GCGATGCTTCGTAGAAAGAICTTGIGCACCATCGICGTGCCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCDGGIATGTTAACACCCA 2 GCCG 2.000000 61 GCGATGCTTAGTAGGTGAGICCGAIGCGCCAGGGDTGTACCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCIGTDATGTAACCACCCA 2 GCCG 1.000000 62 GCGATGCTTAGTAGGTGAGICTTADGCATCAGCADCGCGCCGGCGGAGGTGGCGTGTGCCIGGIATGTAACCACCCA 3 GGCG 1.000000 63 GCGAGGTCCCACAAAAAGAICTTGICCACTATCGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAGACATCCC 4 TGTT 1.000000 64 GCAATCCCCCGTTGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACGAAGACGGCTTATACCITGIATGTTACTGCTGA 2 TGCG 6.000000 65 GCAATCCCCCACAAAAAGAICTTGICCACTATCGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAGACATCCC 4 TGTT 3.000000 66 GCAATCCCCCACAAAAAGAICTTGICCACTATCGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAGATGCTGA 2 TGCG 1.000000 67 GCAATCCCCCACAAAAAGAITCGAIGTACCAGCGICGTATCCGCGGTAATGATGAATATTDGGIGCGCAACTGCCCC 4 TGTT 1.000000 68 GCAATCCCTCGTAGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACTAAGACGGCTTATACCITGIATGTTACTGCTGA 2 TGCG 1.000000 69 GCAATCCCTCGTAGGAGAAITCGAIGTACCAGCGICGTATCCGCGGTAATGATGAATATTDGGIGCGCAACCACCCA 3 GGCG 1.000000 70 GCAATCCCTAGTAGGTGAGICCGAIGCGCCAGGGICGTACCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCIGTDATGTAACTGCTGA 2 TGCG 1.000000 71 GCAATCCCTAGTAGGTGAGICCGAIGCGCCAGGGDTGTACCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCIGTDATGTAACCACCCA 3 GGCG 1.000000 72 GCAATCCCTAGTAGGTGAGICCGAIGCGCCAGGGDTGTACCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCIGTDATGTAACTGCTGA 2 TGCG 8.000000 73 GCAAGGTCTAGTAGGTGAGICCGAIGCGCCAGGGDTGTACCGGCGGAGGTAGCGTGTGCCIGTDATGTAACTGCTGA 2 TGCG 1.000000 74 ATGAGGCCCCACAAAAAGAICTTGICCACTATCGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAGACATCCC 4 TGTT 1.000000 75 ATGAGGTCCCGTTGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACGAAGACGGCTTATACCITGIATGTTACCATCCC 4 TGTT 1.000000 76 ATGAGGTCCCGTTGGAGAAICCGAIGCACCAGGGDCGCACCCACGAAGACGGCTTATACCITGIATGTTACTGCTGA 2 TGCG 3.000000 77 ATGAGGTCCCACAAAAAGAICTTGICCACTATCGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACACTDGGIGCGCAGACATCCC 4 TGTT 1.000000 78 ATGAGGTCCCACAAAAAGAICTTGICCACTATCGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAAACATCCC 4 TGTT 1.000000 79 ATGAGGTCCCACAAAAAGAICTTGICCACTATCGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAGACATCCC 4 TGTT 16.000000 80 ATGAGGTCCCACAAAAAGAICTTGICCACTATCGICGTGTTCGCGGTAATGATGAACATTDGGIGCGCAGATGCTGA 2 TGCG 1.000000 81 ATGAGGTCTCGTAGGAGAAICCGAIGCACCAGCGDCGCACCCACGAAGACGGCTTATACCITGIATGTTACTGCTGA 2 TGCG 1.000000 END LIST_SUMMARY Summary of best reconstruction (numbers refer to the list of haplotypes given above) BEGIN BESTPAIRS_SUMMARY P001: (3,20) P002: (8,41) P003: (27,35) P004: (43,47) P005: (9,72) P006: (74,79) P007: (13,79) P008: (4,6) P009: (9,64) P010: (4,37) P011: (3,44) P012: (3,63) P013: (22,58) P014: (23,69) P015: (9,71) P016: (16,67) P017: (9,61) P018: (17,18) P019: (6,13) P020: (10,41) P021: (43,53) P022: (59,79) P023: (35,35) P024: (13,64) P025: (4,57) P026: (24,79) P027: (9,23) P028: (9,64) P029: (13,52) P030: (6,35) P031: (29,65) P032: (36,79) P033: (14,65) P034: (13,66) P035: (35,58) P036: (25,72) P037: (64,72) P038: (26,46) P039: (53,60) P040: (9,35) P041: (34,54) P042: (51,52) P043: (72,72) P044: (5,79) P045: (21,55) P046: (4,79) P047: (4,41) P048: (62,64) P049: (7,11) P050: (19,30) P051: (64,76) P052: (9,79) P053: (32,72) P054: (13,72) P055: (38,53) P056: (34,52) P057: (42,50) P058: (3,79) P059: (21,79) P060: (5,65) P061: (31,48) P062: (78,79) P063: (35,35) P064: (17,50) P065: (45,60) P066: (4,13) P067: (2,56) P068: (9,13) P069: (6,9) P070: (13,58) P071: (33,40) P072: (9,79) P073: (13,19) P074: (23,79) P075: (70,80) P076: (72,81) P077: (15,73) P078: (20,79) P079: (49,68) P080: (18,35) P081: (12,13) P082: (1,79) P083: (4,5) P084: (35,39) P085: (4,76) P086: (13,75) P087: (23,35) P088: (47,76) P089: (28,34) P090: (77,79) END BESTPAIRS_SUMMARY Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in []: BEGIN BESTPAIRS1 0 P001 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C C A T C C C 4 T G T T G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A A C C A C C C A 3 G G C G 0 P002 G C G (C) T G C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G C T G C T G A 2 T G C G G C G (A) T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P003 G C G C T G C C T C G T A G A A A G A I C T T G I G C A C C A T C G I C G T G C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C D G G I A T G T T A A C A C C C A 2 G C C G G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P004 G C G A T G C C T C G T A G A A A G A I C T T A I G C A C C A G C G D C G C G C C C A C G G T A A T G G C G T A T A C C I G G I A T A T T A C C A T C C C 4 T G T T G C G A T G C C T C G T A G A A A G G I C T T A D G C A T C A G C A D C G T G C C C A T G G T A A T G G C G T G T G C C D G G I A T G T A A C C A C C C A 2 T G C G 0 P005 G C G C T G C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T G C A A T C C C T A G T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T D A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P006 A T G A G G C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P007 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P008 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P009 G C (G) (C) T [G] C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T G C (A) (A) T [C] C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P010 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G [T] A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P011 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C C A T C C C 4 T G T T G C G A T G C C T C G T A G A A A G A I C T T G I G C A C C A G C G I C G T A C C C A C G A A G A C G G C G T A T G C C D G G I A T G T A A A C A C C G A 3 G C C G 0 P012 G C G (C) (T) G (C) C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A [C] C A T C C C 4 T G T T G C G (A) (G) G (T) C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P013 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A [A] [C] C A T C C C 4 T G T T G C G A T G C T C C G T T G G A A G A I C T T A I G C A C C A G C A D C C T G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C C D G G I A T A T [T] G C C A T C C C 4 T G T T 0 P014 G C (G) (C) T (G) C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A A C T G C T G A 2 T G C G G C (A) (A) T (C) C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A A C C A C C C A 3 G G C G 0 P015 G C G C T G C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T G C A A T C C C T A G T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T D A T G T A A C C A C C C A 3 G G C G 0 P016 G C (G) (C) T (G) C C T C G T A G G A G A A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T G C (A) (A) T (C) C C C C A C A A A A A G A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A A C T G C [C] C C 4 T G T T 0 P017 G C G (C) T G C (C) C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T G C G (A) T G C (T) T A G T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T D A T G T A A C C A C C C A 2 G C C G 0 P018 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G C A C C A G G G D C C T G C C C A T G A A G A C G G C G T A T A C C I G G I A T G T A A C C A C C C A 3 G G C G G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G C A C C A G G G D C C T G C C C A T G A A G A C G G C G T A T A C C I G G I A T G T A A A T G C T G A 2 T G C G 0 P019 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P020 G C G (C) T G C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A T G C T G A 2 T G C G G C G (A) T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P021 G C G A T G C C T C G T A G A A A G A I C T T A I G C A C C A G C G D C G C G C C C A C G G T A A T G G C G T A T A C C I G G I A T A T T A C C A T C C C 4 T G T T G C G A T G C C T A G T A G G T G A G I C T T A D G C A T C A G C A D C G C G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C C I G G I A T G T A A C C A C C C A 3 G G C G 0 P022 G C G A T G C T C C G T T G G A A G A I C T T A I G C A C C A G C A D C C T G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C C D G G I A T A T T G A C A T C C C 4 T G T T A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P023 G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P024 G C (G) (C) T (G) C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C (A) (A) T (C) C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P025 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C [G] A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C G A T G C T C C G T T G G A A G A I C T T A I G C A C C A G C A D C C T G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C C D G G I A T A T T G C C A C C C A [2] G C C G 0 P026 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A G (C) (T) (G) (C) (T) (G) (A) (2) T G (C) (G) A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G (A) (C) (A) (T) (C) (C) (C) (4) T G (T) (T) 0 P027 G C G C T G C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P028 G C (G) (C) T (G) C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T G C (A) (A) T (C) C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P029 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C G A T G C C T A G T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P030 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P031 G C (G) (C) T [G] C C [T] C (G) (T) A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T G C (A) (A) T [C] C C C C (A) (C) A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P032 G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C [T] G A 3 G C C G A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P033 G C (G) (C) T [G] C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T G C C A T C C C 4 T G T T G C (A) (A) T [C] C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P034 G C (G) (C) T (G) C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C (A) (A) T (C) C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G [A] T G C T G A 2 T G C G 0 P035 G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G G C G A T G C T C C G T T G G A A G A I C T T A I G C A C C A G C A D C C T G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C C D G G I A T A T T G C C A T C C C 4 T G T T 0 P036 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G G G (I) C G C A C C C G C G G T G A C G G C T T A T A C C I G G I G C G C A A C (C) (A) C (C) (C) A (3) (G) G C G G C A A T C C C T A G T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G G G (D) T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T D A T G T A A C (T) (G) C (T) (G) A (2) (T) G C G 0 P037 G C A A T C C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C A A T C C C T A G T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T D A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P038 G C G (C) T G C C T C G T A G A A A G A I C T T G I G C A C C A T C G I C G T G C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C D G G I A T G T T A C C A T C C C 4 T G T T G C G (A) T G C C T C G T A G A A A G A I C T T G I G C A C C A T C G I C G T G C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C D G G I A T G T T A A C A C C C A 2 G C C G 0 P039 G C G A T G C (C) T A G T A G G T G A G I C T T A D G C A T C A G C A D C G C G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C C I G G I A T G T A A C C A C C C A 3 G G C G G C G A T G C (T) T C G T A G A A A G A I C T T G I G C A C C A T C G I C G T G C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C D G G I A T G T T A A C A C C C A 2 G C C G 0 P040 G C G C T G C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P041 G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C (C) (A) C T G A 2 T G C G G C G A T G C C T A G T A G G T G A G I C T T A D G C A T C A G C A D C G C G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C C I G G I A T G T A A C (T) (G) C T G A 2 T G C G 0 P042 G C G A T G C C T C (A) T A G A A A G G I C T T A D G C A T C A G C A D C G T G C C C A T G G T A A T G G C G T G T G C C D G G I A T G T A A C (C) (A) C (C) (C) A (3) (G) G C G G C G A T G C C T A (G) T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C (T) (G) C (T) (G) A (2) (T) G C G 0 P043 G C A A T C C C T A G T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T D A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G G C A A T C C C T A G T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T D A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P044 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A A C A T C C C 4 T G T T A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P045 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A A C C A C C C C 4 T G T T G C G A T G C C T A G T A G G T G A G I C T T A D G C A T C A G C A D C G C G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P046 (G) (C) G (C) (T) G (C) C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G (A) (T) G (A) (G) G (T) C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P047 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T [T] A C T G C T G A 2 T G C G G C G A T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P048 G C G A T G C (T) T A G T A G G T G A G I C T T A D G C A T C A G C A D C G C G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C C I G G I A T G T A A C C A C C C A 3 G G C G G C A A T C C (C) C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P049 G C G C T G C C C C G T T G G A G G A I C C G A I G C A C C A G [G] G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T G C G C T G C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T [C] G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T D A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P050 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A A C C A C C C A 2 G C C G G C G C T G C C T C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T [T] A C T G C T G A 2 T G C G 0 P051 G C A A T C C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G A T G A G G T C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P052 G C G C T G C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P053 G C G C T G C C T A G T A G G T G A G I C T T A D G C A T C A G C A D C G C G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C C I G G I A T G T A A C C A C C C A 3 G G C G G C A A T C C C T A G T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T D A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P054 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C A A T C C C T A G T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T D A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P055 G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G (T) G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G G C G A T G C C T A G T A G G T G A G I C T T A D G C A T C A G C A D C G C G C C G G (C) G G A G G T G G C G T G T G C C I G G I A T G T A A C C A C C C A 3 G G C G 0 P056 G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C C A C T G A 2 T G C G G C G A T G C C T A G T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P057 G C G A T G C C C C G T T G A A A G A I C T T A I G C A C C A G C G I C G T A T C G G C G G A G G T G G C G T G T A C C I G G I A T G T T A C (C) (A) C (C) (C) A 2 (G) (C) C G G C G A T G C C T C A T A G A A A G A I C T T G I G C A C C A T C G I C G T G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C T D G G I A C G C A A C (T) (G) C (T) (G) A 2 (T) (G) C G 0 P058 (G) (C) G (C) (T) G (C) C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C C A T C C C 4 T G T T (A) (T) G (A) (G) G (T) C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P059 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A A C C A C C C C 4 T G T T A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P060 G C (G) (C) T (G) C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A A C A T C C C 4 T G T T G C (A) (A) T (C) C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P061 G C G (C) T G C C T C A T A G A A A G A I C T T G I G C A C C A T C G I C G T G C C C A T G A A G A C G G C G T A T A C C I G G I A T G T T A A C A C (C) (C) [A] (4) T G (T) (T) G C G (A) T G C C T C A T A G A A A G A I C T T G I G C A C C A T C G I C G T G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C T D G G I A C G C A A C C A C (T) (G) [A] (2) T G (C) (G) 0 P062 A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A A A C A T C C C 4 T G T T A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P063 G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P064 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G C A C C A G G G D C C T G C C C A T G A A G A C G G C G T A T A C C I G G I A T G T A A C C A C C C A 3 G G C G G C G A T G C C T C A T A G A A A G A I C T T G I G C A C C A T C G I C G T G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C T D G G I A C G C A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P065 G C G A T G C (C) T C G T A G A A A G A I C T T G I G C A C C A G C G D C G T A C C C A C G A A G A C G G C G T A T A C C D G G I A T G T T A A C A C C G A 3 G C C G G C G A T G C (T) T C G T A G A A A G A I C T T G I G C A C C A T C G I C G T G C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C D G G I A T G T T A A C A C C C A 2 G C C G 0 P066 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C [G] A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P067 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G G C G A T G C T C C G T T G G A A G A I C T T A I G C A C C A G C A D C C T G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C C D G G I A T A T A G C C A T C C C 4 T G T T 0 P068 G C G C T G C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P069 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P070 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C G A T G C T C C G T T G G A A G A I C T T A I G C A C C A G C A D C C T G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C C D G G I A T A T T G C C A T C C C 4 T G T T 0 P071 G C G C T G C C T A G T A G G T G A G I C T T A D G C A T C A G C A D C G C G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C C I G G I A T G T A A C C A T C C C 4 T G T T G C G C T G C T C C G T T G G A A G A I C T T A I G C A C C A G C A D C C T G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C C D G G I A T A T T G C C A T C C C 4 T G T T 0 P072 G C G C T G C C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P073 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A A C C A C C C A 2 G C C G 0 P074 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A A C T G C T G A 2 T G C G A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P075 (G) (C) (A) A (T) (C) (C) C (T) (A) (G) (T) A (G) (G) (T) (G) (A) (G) I C (C) (G) (A) I (G) C (G) C (C) A (G) (G) G I C G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T D A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G (A) (T) (G) A (G) (G) (T) C (C) (C) (A) (C) A (A) (A) (A) (A) (G) (A) I C (T) (T) (G) I (C) C (A) C (T) A (T) (C) G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A T G C T G A 2 T G C G 0 P076 (G) (C) (A) A (T) (C) (C) C T A G T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G (G) G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T D A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G (A) (T) (G) A (G) (G) (T) C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G (C) G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P077 G C (G) (C) (T) G (C) C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T G C (A) (A) (G) G (T) C T A G T A G G T G A G I C C G A I G C G C C A G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T D A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P078 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A A C C A C C C A 3 G G C G A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P079 G C G A T G C C T C A T A G A A A G A I C T T G I G C A C C A T C G I C G T G C C G G C G G A G G T G G C G T G T G C T D G G I A C G C A A C (C) (A) C (C) (C) A (3) (G) (C) C G G C A A T C C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C (T) (G) C (T) (G) A (2) (T) (G) C G 0 P080 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G C A C C A G G G D C C T G C C C A T G A A G A C G G C G T A T A C C I G G I A T G T A A A T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P081 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T A A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C T A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P082 (G) (C) G (C) (T) G (C) C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C D T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G (A) (T) G (A) (G) G (T) C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T 0 P083 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C [G] A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A A C A T C C C 4 T G T T 0 P084 G C G C T G C (C) T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C (T) C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P085 G C G C T G C C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G A T G A G G T C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P086 (G) (C) G (C) [T] G (C) C (T) C G T (A) G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C (T) A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G (A) (T) G (A) [G] G (T) C (C) C G T (T) G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C (G) A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C C A T C C C 4 T G T T 0 P087 G C G C T G C C T C G T A G G A G A A I T C G A I G T A C C A G C G I C G T A T C C G C G G T A A T G A T G A A T A T T D G G I G C G C A A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G 0 P088 G C G A T G C C T C G T A G A A A G G I C T T A D G C A T C A G C A D C G T G C C C A T G G T A A T G G C G T G T G C C D G G I A T G T A A C C A C C C A 2 T G C G A T G A G G T C C C G T T G G A G A A I C C G A I G C A C C A G G G D C G C A C C C A C G A A G A C G G C T T A T A C C I T G I A T G T T A C T G C T G A 2 T G C G 0 P089 G C G C T G C C T C G T A G A A A G G I C T T A D G C A T C A G C A D C G T G C C C A T G G T A A T G G C G T G T G C C D G G I A T G T A A C T G C T G A 2 T G C G G C G C T G C C T A G T A G G T G A G D C C G A I G C G C C G G G G D T G T A C C G G C G G A G G T A G C G T G T G C C I G T I A T G T A A C C A C T G A 2 T G C G 0 P090 A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A C T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T A T G A G G T C C C A C A A A A A G A I C T T G I C C A C T A T C G I C G T G T T C G C G G T A A T G A T G A A C A T T D G G I G C G C A G A C A T C C C 4 T G T T END BESTPAIRS1 Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in [] with phase known positions indicated by = BEGIN BESTPAIRS2 0 P001 = = = = ? ? = ? C = = = T = = = = = = = ? ? ? ? = = C = = = = = G = D ? ? C = C = = A = = A A G = C = G C T T = = = C C ? T = = A T = T T = = = = T ? = ? 4 T = T ? = = = = ? ? = ? T = = = A = = = = = = = ? ? ? ? = = T = = = = = C = I ? ? T = T = = G = = G T A = T = A T G A = = = T T ? G = = G C = C A = = = = C ? = ? 3 G = C ? 0 P002 = = = (C) = = = = = = A C A A A = A G = = = T T G = C = = = ? ? T C = I = = T G T T = G = = G T A = T = A ? ? A = C = T T ? G = = G C = C A G = = = = = = = = = = = = = = = (A) = = = = = = G T T G G = G A = = = C G A = G = = = ? ? G G = D = = C A C C = A = = A A G = C = G ? ? T = T = C C ? T = = A T = T T A = = = = = = = = = = = = 0 P003 = = = = = = = = ? ? = = = = A A A G A I = T T G = = = A = = A T C = I C = = G = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? = G = = = = = ? = A C A = C C = ? ? ? ? ? = = = = = = = = ? ? = = = = G T G A G D = C G A = = = G = = G G G = D T = = A = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? = T = = = = = ? = C T G = T G = ? ? ? ? ? 0 P004 = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = A = ? = ? = I = = = C = = = = G = = = C = = = = = C = = = = = = = = = = = A ? A = = ? = = = = = A = T = = = = T ? = C 4 = = T T = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = G = ? = ? = D = = = T = = = = A = = = T = = = = = T = = = = = = = = = = = G ? G = = ? = = = = = G = A = = = = C ? = A 2 = = C G 0 P005 = = G C = ? = = C C A C = A A A A G A = = T T G = C = A = T = T C = I C = = G T T C = = = = T A A = G A T = A A C A T T ? = G I G C = C = G A C A T C C C 4 = = T T = = A A = ? = = T A G T = G G T G A G = = C G A = G = G = C = G G = D T = = A C C G = = = = A G G = A G C = T G T G C C ? = T D A T = T = A C T G C T G A 2 = = C G 0 P006 = = = = = = C = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = 0 P007 G C = C T = C ? T = G T = G G = G A = = ? C G A = G = = = C = G G = D = = C A ? ? = A = T A A G = C = G C T T = ? = C C ? T = = ? ? = T T A C T G C ? G A 2 = = C G A T = A G = T ? C = A C = A A = A G = = ? T T G = C = = = T = T C = I = = T G ? ? = G = G G T A = T = A T G A = ? = T T ? G = = ? ? = C A G A C A T ? C C 4 = = T T 0 P008 = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = ? ? = = = = = = ? = = = ? ? = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = ? ? = = = = = = ? = = = ? ? = = = = = = = = ? ? = = = = = = 0 P009 = = (G) (C) = ? = ? ? = A C A ? ? = ? G = = = T T G = C = = = T = T C = ? = = T G T T = G = = G T A = ? = A T G A = C = T T ? G = = G C = ? A G ? C A T C C C 4 = = T T = = (A) (A) = ? = ? ? = G T T ? ? = ? A = = = C G A = G = = = C = G G = ? = = C A C C = A = = A A G = ? = G C T T = T = C C ? T = = A T = ? T A ? T G C T G A 2 = = C G 0 P010 = = = = = = ? = ? ? = = T = = A = = A I = = = = = ? ? A = ? ? = = = = C = C = = = C A = = A = = A C G = = T = A = A = = ? T G = = = = ? ? A C T G C T G A 2 = = C G = = = = = = ? = ? ? = = A = = T = = G D = = = = = ? ? G = ? ? = = = = T = T = = = G G = = G = = G T A = = G = G = G = = ? G T = = = = ? ? G A C A T C C C 4 = = T T 0 P011 = = = C = = = = ? = = = T = G = G A = = = C ? ? ? ? ? = = = = = G = D = = C = = = ? ? ? ? = = = = = = = = T = = = A = = ? ? ? ? = = = ? T = C = = T = C C ? ? ? ? ? = = = A = = = = ? = = = A = A = A G = = = T ? ? ? ? ? = = = = = C = I = = T = = = ? ? ? ? = = = = = = = = G = = = G = = ? ? ? ? = = = ? A = A = = C = G A ? ? ? ? ? 0 P012 = = = (C) (T) = (C) = = = G T T G G = G A = = = C G A = G = ? ? ? ? G G = ? = = C A ? ? ? ? ? ? A A G = ? = G C T T = ? = C C ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = (A) (G) = (T) = = = A C A A A = A G = = = T T G = C = ? ? ? ? T C = ? = = T G ? ? ? ? ? ? G T A = ? = A T G A = ? = T T ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = 0 P013 = = = C = = = C ? = = = A = = = G A = = T C G = = = T = = = = = = G I = G = A T = C = = = ? ? ? ? ? = A T = A A = A T T = ? ? ? ? ? G C ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = A = = = T ? = = = T = = = A G = = C T T = = = C = = = = = = A D = C = G C = G = = = ? ? ? ? ? = G C = T G = G C C = ? ? ? ? ? A T ? ? ? = = = = = = = = = = = 0 P014 = = (G) (C) = (G) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = T G = T G = 2 T = = = = = (A) (A) = (C) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = C A = C C = 3 G = = = 0 P015 = = G C = G = = C C A C = A A A A G A = = ? ? G = C = A = T = T C = I C = ? ? T T C = = = = T A A = G A T = A A C A T T ? = G ? ? ? = C ? ? ? = = T ? = C 4 T = T T = = A A = C = = T A G T = G G T G A G = = ? ? A = G = G = C = G G = D T = ? ? C C G = = = = A G G = A G C = T G T G C C ? = T ? ? ? = T ? ? ? = = C ? = A 3 G = C G 0 P016 ? ? (G) (C) = (G) = = T = G T = G G = G A = = C T T G = C C = = T = T = = = = = = G ? ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = C = = = = ? ? ? ? ? = = ? ? A C A T ? = = = = = = = ? ? (A) (A) = (C) = = C = A C = A A = A G = = T C G A = G T = = C = G = = = = = = A ? ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = T = = = = ? ? ? ? ? = = ? ? C T G C ? = = = = = = = 0 P017 = = = (C) = = = (C) C C A C = A A A A G A = = T T G = C = A = T = T C = ? C = = G T T ? = = = = T A A ? G A T = A A C A T T ? = G I G C = ? = G A = = T = = C 4 T G T T = = = (A) = = = (T) T A G T = G G T G A G = = C G A = G = G = C = G G = ? T = = A C C ? = = = = A G G ? A G C = T G T G C C ? = T D A T = ? = A C = = C = = A 2 G C C G 0 P018 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = ? = = C C A = C C = 3 G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = ? = = A T G = T G = 2 T = = = 0 P019 = = = = = = = = C = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = ? = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = ? = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? 0 P020 = = = (C) = = = = = = A C A A A = A G = = = T T G = C = = = T = T C = I = = T G T T = G = = G T A = T = A ? ? A = C = T T D G = = G C = C A G A = = = = = = = = = = = = = = (A) = = = = = = G T T G G = G A = = = C G A = G = = = C = G G = D = = C A C C = A = = A A G = C = G ? ? T = T = C C I T = = A T = T T A C = = = = = = = = = = = 0 P021 = = = = = = = = = C = = = = A A A G A = = = = = I = = = ? ? ? = = G = = = = = = = C A = = = T A A = = = = = = A = A = = = = = = ? ? A = ? ? ? = = T = = C 4 T = T T = = = = = = = = = A = = = = G T G A G = = = = = D = = = ? ? ? = = A = = = = = = = G G = = = A G G = = = = = = G = G = = = = = = ? ? G = ? ? ? = = C = = A 3 G = C G 0 P022 G C = = T = C T ? = G T T G G = = = = = = = = A = G = = = C = G = A D = C = = C C G = = = = A G G = = G C = T G T G C C = = = = A T A T T = = ? ? = = = = = = = = = A T = = G = T C ? = A C A A A = = = = = = = = G = C = = = T = T = G I = G = = T T C = = = = T A A = = A T = A A C A T T = = = = G C G C A = = ? ? = = = = = = = = = 0 P023 = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = ? = = = = = = = 0 P024 = = (G) (C) = (G) = = ? ? = = A = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? ? ? = = = ? ? = = = = = = = = (A) (A) = (C) = = ? ? = = T = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? ? ? = = = ? ? = = = = = = 0 P025 = = = C = = = C = = = = = = = = G A = = = C G = = = = = = = = = G G = = G C A = = C ? ? ? A = = A C = = = T = A = A = = I T = = = = G = = A = T G = T G = ? ? G = = = = = A = = = T = = = = = = = = A G = = = T T = = = = = = = = = C A = = C T G = = G ? ? ? G = = G T = = = G = G = G = = D G = = = = A = = G = C A = C C = ? ? C = = 0 P026 G C = C T = C = ? = G T = G G = G A = = T C G A = G T = = C = G = = = = = = A = C = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = (C) (T) (G) (C) (T) (G) (A) (2) = = (C) (G) A T = A G = T = ? = A C = A A = A G = = C T T G = C C = = T = T = = = = = = G = T = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = (A) (C) (A) (T) (C) (C) (C) (4) = = (T) (T) 0 P027 = = = = = = = = C = A C = A A = A G = = C T T G = C C = = T = T = = = = = = G = T = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = ? = G A C A T C C C 4 = = ? ? = = = = = = = = T = G T = G G = G A = = T C G A = G T = = C = G = = = = = = A = C = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = ? = A C T G C T G A 2 = = ? ? 0 P028 = = (G) (C) = (G) = = = = A C A A A = A G = = = T T G = C = = = T = T C = I = = T G T ? = G = = G T A = T = A T G A = C = T T D G = = G C = C A G A C A T C C C 4 = = T T = = (A) (A) = (C) = = = = G T T G G = G A = = = C G A = G = = = C = G G = D = = C A C ? = A = = A A G = C = G C T T = T = C C I T = = A T = T T A C T G C T G A 2 = = C G 0 P029 = = = C ? = = = = C = = = = = A = = A = = = = = = = = ? = = = = = = = C = C = = = C A = T A = = A C G = = T = A = A = = = T G = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = A ? = = = = A = = = = = T = = G = = = = = = = = ? = = = = = = = T = T = = = G G = G G = = G T A = = G = G = G = = = G T = = = = = A = = = = = = = = = = = = = 0 P030 = = = = = = = = C C = = T = = A = = A I = = = = = = = ? = = A = = = = C = C = = = C A = T A = = A C G = = T = A = A = = = T G = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T A = = A = = T = = G D = = = = = = = ? = = G = = = = T = T = = = G G = G G = = G T A = = G = G = G = = = G T = = = = = A = = = = = = = = = = = = = 0 P031 = = (G) (C) = ? = = ? = (G) (T) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = (A) (A) = ? = = ? = (A) (C) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = 0 P032 G C = C T = C = T A G T = G G T G A G D = C ? ? ? ? ? G = C G G G = D T = = A C C G = = = = A G G = A G C = T G T G C C I = T = A T = T = A C T G C ? G A 3 G C C G A T = A G = T = C C A C = A A A A G A I = T ? ? ? ? ? A = T A T C = I C = = G T T C = = = = T A A = G A T = A A C A T T D = G = G C = C = G A C A T ? C C 4 T G T T 0 P033 = = (G) (C) = ? = = T = G T = G G = G A = = = C G A = G = = = C = G G = D = = C A C C = A = T A A G = C = G C T T = T = C C I T = = A T = ? T = C = = = = = = = = = = = = = (A) (A) = ? = = C = A C = A A = A G = = = T T G = C = = = T = T C = I = = T G T T = G = G G T A = T = A T G A = C = T T D G = = G C = ? A = A = = = = = = = = = = = 0 P034 = = (G) (C) = (G) = = T = G T = G G = G A = = = C G A = G = = = C = G G = D = = C A C C = ? ? ? A A G = C = G C T T = T = C C I T = = A T = T ? ? ? = = = = = = = = = = = = = (A) (A) = (C) = = C = A C = A A = A G = = = T T G = C = = = T = T C = I = = T G T T = ? ? ? G T A = T = A T G A = C = T T D G = = G C = C ? ? ? = = = = = = = = = = = 0 P035 = = = C = = = C ? A = = A = = T G A G D = C G = = = = G = = G = G G = T G = A = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = I = T = = = G = A A = T G C T G A ? ? ? ? ? = = = A = = = T ? C = = T = = A A G A I = T T = = = = A = = A = C A = C C = G = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = D = G = = = A = T G = C A T C C C ? ? ? ? ? 0 P036 = = G C = G = = = C = = = = = A = = A = T = = = = = T A = = = = = = (I) C = C = = = C = = = = T = A C G = = T = A = A = = = = G I G C = C = = = (C) (A) = (C) (C) = (3) (G) = = = = = A A = C = = = A = = = = = T = = G = C = = = = = C G = = = = = = (D) T = T = = = G = = = = A = G T A = = G = G = G = = = = T D A T = T = = = (T) (G) = (T) (G) = (2) (T) = = = 0 P037 = = = = = = = = C C = = T = = A = = A = = = = = = = = A = = = = = = = C = C = = = C A = = A = = A C G = = T = A = A = = = T G I = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T A = = A = = T = = G = = = = = = = = G = = = = = = = T = T = = = G G = = G = = G T A = = G = G = G = = = G T D = = = = A = = = = = = = = = = = = = 0 P038 = = = (C) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = C = = T = = C 4 T G T T = = = (A) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = A = = C = = A 2 G C C G 0 P039 = = = = = = = (C) = A = = = = G T G A G = = = ? A D = = = ? = = G = A D = = C = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = I = = = = = = = A ? C = = = = = = 3 = G = = = = = = = = = (T) = C = = = = A A A G A = = = ? G I = = = ? = = T = G I = = T = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = D = = = = = = = T ? A = = = = = = 2 = C = = 0 P040 = = = = = = = = C C A C = ? ? A A G A I = T T G ? ? ? ? = ? ? T C = I C = = G T T C = = = = T A A = G A T = A A C A T T D = G = G C = C = G A C A T ? ? C 4 = = T T = = = = = = = = T A G T = ? ? T G A G D = C G A ? ? ? ? = ? ? G G = D T = = A C C G = = = = A G G = A G C = T G T G C C I = T = A T = T = A C T G C ? ? A 2 = = C G 0 P041 = = = C = = = = = = = = = = = = = = = D = C G = ? ? ? G C = G = G G = T = T A = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = T ? = = = = = = = (C) (A) = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = I = T T = ? ? ? A T = A = C A = C = C G = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = G ? = = = = = = = (T) (G) = = = = = = = = = 0 P042 = = = = = = = = ? C (A) = = = A A A G = = = T T = D = = A T = = = C A = C = = G = = ? A T = = T A A = G = = = = = = = = = D = G ? = = = = = ? = (C) (A) = (C) (C) = (3) (G) = = = = = = = = = = = ? A (G) = = = G T G A = = = C G = I = = G C = = = G G = T = = A = = ? G C = = A G G = A = = = = = = = = = I = T ? = = = = = ? = (T) (G) = (T) (G) = (2) (T) = = = 0 P043 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? 0 P044 G C = C T = C = = = G T T G G = G A = = = C G A = G = = = C = G G = ? = = C A C C = A = = A A G = C = G C T T = T = C C I T = = A T = T T A = = = = = = = = = = = = A T = A G = T = = = A C A A A = A G = = = T T G = C = = = T = T C = ? = = T G T T = G = = G T A = T = A T G A = C = T T D G = = G C = C A G = = = = = = = = = = = = 0 P045 = = = C = = = = = C = = = = = A = = A = T C G = I = T = C = = = = G I = = T A T = C = = = = T A A = = A T = A A = A = = = = = = = = = = = A C = = C = = = = = = = = = = = A = = = = = A = = = = = T = = G = C T T = D = C = T = = = = A D = = C G C = G = = = = A G G = = G C = T G = G = = = = = = = = = = = G A = = T = = = = = = = = 0 P046 (G) (C) = (C) (T) = (C) = = = G T T G G = G A = = = C G A = G = = = C = G G = D = = C A C C = A = = A A G = C = G C T T = T = C C I T = ? A T = T T A C T G C T G A 2 = = C G (A) (T) = (A) (G) = (T) = = = A C A A A = A G = = = T T G = C = = = T = T C = I = = T G T T = G = = G T A = T = A T G A = C = T T D G = ? G C = C A G A C A T C C C 4 = = T T 0 P047 = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = 0 P048 = = G = = G = (T) T A = = A = = T = = G = = T T = D = = = T = = = C A = = = = G = = G G = = G = = G T = = = G = G = G = = = G = = = = = = A = = C A = ? C = 3 G = = = = = A = = C = (C) C C = = T = = A = = A = = C G = I = = = C = = = G G = = = = A = = C A = = A = = A C = = = T = A = A = = = T = = = = = = T = = T G = ? G = 2 T = = = 0 P049 = = = = ? = = = = = G T T G G = G = = = = C G A = G = = = C = G ? ? I C = = G T T C = = = = T A A = G A T = A A C ? T T D = G I G ? = C A G A C A T C C C 4 = = T T = = = = ? = = = = = A C A A A = A = = = = T T G = C = = = T = T ? ? D T = = A C C G = = = = A G G = A G C = T G T ? C C I = T D A ? = T T A C T G C T G A 2 = = C G 0 P050 = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = T = = = = = T = = = = = C = I = = T = T = = G = = G T A = T = A T G A = = = T T D G = = G C = ? ? ? = C A = C C = = G C = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = C = = = = = C = = = = = G = D = = C = C = = A = = A A G = C = G C T T = = = C C I T = = A T = ? ? ? = T G = T G = = T G = = 0 P051 G C A = T C C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A T G = G G T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 P052 G C = C T = C ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A T = A G = T ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 P053 = = G C = G = = = = = = = = = = = = = = = T T = D = = A T = = = C A = C = C G = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = G I = = = = = = = C A = C C = 3 G = = = = = A A = C = = = = = = = = = = = = = = = C G = I = = G C = = = G G = T = T A = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = T D = = = = = = = T G = T G = 2 T = = = 0 P054 = = G C = G = = = C = = = = = A = = A = = = = = = = = A = = = = = = = C = C = = = C A = T A = = A C G = = ? = A = A = = = T G I = = = = T = = = = = ? = = = = = = = = = A A = C = = = A = = = = = T = = G = = = = = = = = G = = = = = = = T = T = = = G G = G G = = G T A = = ? = G = G = = = G T D = = = = A = = = = = ? = = = = = = = 0 P055 = = = C = = = = = = = = = = = = = = = D = C G = I = = G C = G = G G = T = T A = = = = (T) = = = = = = A = = = = = = = = = = = T ? = = = = = = = T G = T G = 2 T = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = I = T T = D = = A T = A = C A = C = C G = = = = (C) = = = = = = G = = = = = = = = = = = G ? = = = = = = = C A = C C = 3 G = = = 0 P056 = = = C = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C A = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T G = = = = = = = = = 0 P057 = = = = = = = = C = G = T = = = = = = = = = = A ? = = = = = = G ? = ? = = = A T = = ? ? ? = = = = = = = = ? = = = A = C I = = = = T = T T = = (C) (A) = (C) (C) = = (G) (C) = = = = = = = = = = T = A = A = = = = = = = = = = G ? = = = = = = T ? = ? = = = G C = = ? ? ? = = = = = = = = ? = = = G = T D = = = = C = C A = = (T) (G) = (T) (G) = = (T) (G) = = 0 P058 (G) (C) = (C) (T) = (C) = = = G T T G G = G A = = = C G A = G = = = C = G G = D = = C A C C = A = = A A G = C = G C T T = T = C C I T = = A T = ? T A C = = = = = = = = = = = (A) (T) = (A) (G) = (T) = = = A C A A A = A G = = = T T G = C = = = T = T C = I = = T G T T = G = = G T A = T = A T G A = C = T T D G = = G C = ? A G A = = = = = = = = = = = 0 P059 G C = C ? = C = T = G T = G G = G A = = T C G A = G T = = C = G = = = = = = A = C = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = A C = = C = = = ? ? ? ? ? A T = A ? = T = C = A C = A A = A G = = C T T G = C C = = T = T = = = = = = G = T = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = G A = = T = = = ? ? ? ? ? 0 P060 = = (G) (C) = (G) = = = = G T T G G = G A = = = C G A = G = = = C = G G = D = = C A C C = A = = A A G = C = G ? T T = T = C C I T = = A T = T T A = = = = = = = = = = = = = = (A) (A) = (C) = = = = A C A A A = A G = = = T T G = C = = = T = T C = I = = T G T T = G = = G T A = T = A ? G A = C = T T D G = = G C = C A G = = = = = = = = = = = = 0 P061 = = = (C) ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = C A T = A = = A C = = = = = A = A = C I = = = = T = T T = A = = = (C) (C) ? (4) = = (T) (T) = = = (A) ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = G G C = G = = G T = = = = = G = G = T D = = = = C = C A = C = = = (T) (G) ? (2) = = (C) (G) 0 P062 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = 0 P063 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 P064 = = = C = = = = = = G ? ? = G = G A = ? T C G A = = = = = = = G G = D = C = = = = C A T = A = = A C = = = = = A = A = C I = = = = T = T = = ? C A = ? ? = 3 G = = = = = = A = = = = = = A ? ? = A = A G = ? C T T G = = = = = = = T C = I = G = = = = G G C = G = = G T = = = = = G = G = T D = = = = C = C = = ? T G = ? ? = 2 T = = = 0 P065 = = = = = = = (C) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = G = = D = = = A = = C ? ? ? A = = A C G = = ? = A = A = = = = = = = = = ? = = = = = = = G = 3 = = = = = = = = = = = (T) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = T = = I = = = G = = G ? ? ? G = = G T A = = ? = G = G = = = = = = = = = ? = = = = = = = C = 2 = = = = 0 P066 = = = = = = = = C = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 P067 = = = C ? = = ? ? = = = = = = = G A = = = C G = = = = = = = = = G G = = G C A = = C A = = A = = A C = = = T = A = A = = I T = = = = G = = A = T G C T G A ? ? ? ? ? = = = A ? = = ? ? = = = = = = = A G = = = T T = = = = = = = = = C A = = C T G = = G G = = G = = G T = = = G = G = G = = D G = = = = A = = G = C A T C C C ? ? ? ? ? 0 P068 = = = = = = = ? C = A C = A A = A G = = = T T G = C = = = T = T C = I = = T G T T = G = G G T A = T = A T G A = C = T T D G = = G C = C A G A C A T C C C 4 = = T T = = = = = = = ? T = G T = G G = G A = = = C G A = G = = = C = G G = D = = C A C C = A = T A A G = C = G C T T = T = C C I T = = A T = T T A C T G C T G A 2 = = C G 0 P069 = = = = = = = = = = G T T G G = G A = = = C G A = G = = = C = G G = D = = C A C C = ? = T A A G = C = G C T T = T = C C I T = = A T = T T A C T G C T G A 2 = = C G = = = = = = = = = = A C A A A = A G = = = T T G = C = = = T = T C = I = = T G T T = ? = G G T A = T = A T G A = C = T T D G = = G C = C A G A C A T C C C 4 = = T T 0 P070 = = = C = = = C ? = = = A = = = G A = = = C G = = = = = = = = = G G ? = G C A = = ? ? ? ? A = = A C = = ? T = A = A = = I T = = = = G = = A = T G C T G A 2 = = C G = = = A = = = T ? = = = T = = = A G = = = T T = = = = = = = = = C A ? = C T G = = ? ? ? ? G = = G T = = ? G = G = G = = D G = = = = A = = G = C A T C C C 4 = = T T 0 P071 = = = = = = = C ? A = = A = = T G A G = = = = = D = = = T = = = = = = = G C = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = I = = = = = G = A A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T ? C = = T = = A A G A = = = = = I = = = C = = = = = = = C T = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = = A = T G = = = = = = = = = = = = 0 P072 G C = C T = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A T = A G = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 P073 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = C = = = = = G = D = = C ? C = = ? ? ? A A G = ? = G ? ? T = = = C C I T = ? A T = T T = = T G = T G = = T G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = T = = = = = C = I = = T ? T = = ? ? ? G T A = ? = A ? ? A = = = T T D G = ? G C = C A = = C A = C C = = G C = = 0 P074 G C = C T = C = T = G T = G G = G A = = T C G A = G T = = C = G = = = = = = A = ? = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = A C T G C T G A 2 = = C G A T = A G = T = C = A C = A A = A G = = C T T G = C C = = T = T = = = = = = G = ? = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = G A C A T C C C 4 = = T T 0 P075 (G) (C) (A) = (T) (C) (C) = (T) (A) (G) (T) = (G) (G) (T) (G) (A) (G) = = (C) (G) (A) = (G) = (G) = (C) = (G) (G) = = = = = A C ? G = = = = A G G = A G C = T G T G C C I = T D A T = T = A C = = = = = = ? ? ? ? ? (A) (T) (G) = (G) (G) (T) = (C) (C) (A) (C) = (A) (A) (A) (A) (G) (A) = = (T) (T) (G) = (C) = (A) = (T) = (T) (C) = = = = = G T ? C = = = = T A A = G A T = A A C A T T D = G I G C = C = G A = = = = = = ? ? ? ? ? 0 P076 (G) (C) (A) = (T) (C) (C) = = A = = = = = T = = G = = = = = = = = G = = = = (G) = = T = T = = = G G = = G = = G T A = = G = G = G = = = G T D = = = = A = = = = = = = = = = = = = (A) (T) (G) = (G) (G) (T) = = C = = = = = A = = A = = = = = = = = A = = = = (C) = = C = C = = = C A = = A = = A C G = = T = A = A = = = T G I = = = = T = = = = = = = = = = = = = 0 P077 = = (G) (C) (T) = (C) = = C = = = = = A = = A = = = = = = = = A = = = = = = ? C = C G T T C ? = = = T A A = G A T = A A C A T T D = G I G ? = C = G A C A T C C C 4 = = T T = = (A) (A) (G) = (T) = = A = = = = = T = = G = = = = = = = = G = = = = = = ? T = T A C C G ? = = = A G G = A G C = T G T G C C I = T D A ? = T = A C T G C T G A 2 = = C G 0 P078 G C = C ? ? ? = T = G T = G G = G A = = ? C G A = G T = = C = G = = = = = = A = C = ? = ? = = = = = = = = = = = T = = = = = = ? = = = = = A C = = C = = A 3 G = C G A T = A ? ? ? = C = A C = A A = A G = = ? T T G = C C = = T = T = = = = = = G = T = ? = ? = = = = = = = = = = = C = = = = = = ? = = = = = G A = = T = = C 4 T = T T 0 P079 = = G = = G = = = = A = = = A = A G = = ? T T G = = = = = = = T C = I = = T G = = G G = G G = = G T = = = G = G = G = T D G = = = C = C A = = (C) (A) = (C) (C) = (3) (G) (C) = = = = A = = C = = = = G = = = G = G A = = ? C G A = = = = = = = G G = D = = C A = = C A = T A = = A C = = = T = A = A = C I T = = = T = T T = = (T) (G) = (T) (G) = (2) (T) (G) = = 0 P080 = = = = ? = = = = C = = = = = A = = A I T = = = = = = A = = A = = = = C C ? ? = = C A T = A = = A C G = = = = A = A = = = = G = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = A = = = = = T = = G D C = = = = = = G = = G = = = = T G ? ? = = G G C = G = = G T A = = = = G = G = = = = T = = = = = = = C = = = = = = = = = = = 0 P081 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 P082 (G) (C) = (C) (T) = (C) = = = G T T G G = G A = = = C G A = ? ? = = C = G G = D = = C A ? ? = ? ? ? A A G = C = G C T T = T ? ? C = T = = A T ? ? T A C T G C T G A 2 = = C G (A) (T) = (A) (G) = (T) = = = A C A A A = A G = = = T T G = ? ? = = T = T C = I = = T G ? ? = ? ? ? G T A = T = A T G A = C ? ? T = G = = G C ? ? A G A C A T C C C 4 = = T T 0 P083 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = C T G C T G A ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = A C A T C C C ? ? ? ? ? 0 P084 = = = = = = = (C) T A = = A = = T = = G D = = = = = = = G = = G = = = = T = T = = = G ? ? ? G = = G T A = = G = G = G = = = G T = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = (T) C C = = T = = A = = A I = = = = = = = A = = A = = = = C = C = = = C ? ? ? A = = A C G = = T = A = A = = = T G = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = 0 P085 G C = C T = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = A T = A G = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 P086 (G) (C) = (C) ? = (C) = (T) = = = (A) = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = ? = (T) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = T G C T G A 2 = = C G (A) (T) = (A) ? = (T) = (C) = = = (T) = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = ? = (G) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = C A T C C C 4 = = T T 0 P087 = = = = = = = = = C = = = = = A = = A I T = = = = = T ? = = A = C = I C = = = T = C = = = = T A A = G A T = A A = A T T D = G = G C = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = T = = G D C = = = = = C ? = = G = G = D T = = = C = G = = = = A G G = A G C = T G = G C C I = T = A T = T = = = = = = = = = = = = = = 0 P088 G C = = T = C = T = = = A = A = A G G = = T T = D = = = T = = = C A = = = T G = = = ? ? = G T A = T = = = G = G = G = = D G = = = = = = A = = ? ? ? ? C = = = = = = A T = = G = T = C = = = T = G = G A A = = C G = I = = = C = = = G G = = = C A = = = ? ? = A A G = C = = = T = A = A = = I T = = = = = = T = = ? ? ? ? G = = = = = = 0 P089 = = = = ? = = = = C = = = = A A A G = I ? T ? = D = = A T ? A = C A = C = = ? ? ? ? ? ? ? = T A A = G = ? = = = = = = = D = G = ? ? = = = ? ? T G = ? = = ? ? ? ? ? = = = = ? = = = = A = = = = G T G A = D ? C ? = I = = G C ? G = G G = T = = ? ? ? ? ? ? ? = A G G = A = ? = = = = = = = I = T = ? ? = = = ? ? C A = ? = = ? ? ? ? ? 0 P090 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = ? = = ? C = = ? ? ? ? ? = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = ? = = ? T = = ? ? ? ? ? = = = ? ? = = = = = = = = = = = END BESTPAIRS2 Phase probabilities at each site with phase known positions indicated by = and missing data positions indicated by ? BEGIN PHASEPROBS = = = = ? ? = ? 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = ? ? ? ? = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 ? ? 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 ? 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 ? = ? 1.00 1.00 = 1.00 ? = = = 0.72 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = ? ? 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 ? ? 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 ? 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? = 1.00 = = = = = ? = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = ? ? ? ? ? = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = 1.00 = ? = ? = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 ? 1.00 = = ? = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 ? = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = 0.96 0.96 = ? = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 0.99 0.99 0.99 0.99 0.99 0.99 0.99 = = 0.99 0.99 = = = = = = 1.00 = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = 0.96 0.96 = 0.96 0.96 = 0.96 ? 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 ? ? = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? = 1.00 1.00 ? 1.00 = = ? ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 0.99 0.99 0.99 ? 0.99 0.99 0.99 = = 0.99 0.99 = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = ? ? = = = = = = ? = = = ? ? = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = 0.63 0.63 = ? = ? ? = 1.00 1.00 1.00 ? ? = ? 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = ? = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 ? 1.00 = = 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 ? 0.93 0.93 0.93 0.93 0.93 0.93 0.93 = = 0.93 0.93 = = = = = = ? = ? ? = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = ? ? 1.00 = ? ? = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = ? 1.00 1.00 = = = = ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 0.98 = = = = ? = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 ? ? ? ? ? = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = ? ? ? ? = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = ? ? ? ? = = = ? 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 ? ? ? ? ? = = = 0.87 0.87 = 0.87 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = ? ? ? ? 1.00 1.00 = ? = = 1.00 1.00 ? ? ? ? ? ? 1.00 1.00 1.00 = ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? = 1.00 1.00 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 ? = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = ? ? ? ? ? = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = ? ? ? ? ? 1.00 1.00 ? ? ? = = = = = = = = = = = = = 0.50 0.50 = 0.50 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = 0.92 0.92 = 0.92 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = ? ? 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = ? ? 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 ? ? ? = 1.00 ? ? ? = = 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 ? ? 0.60 0.60 = 0.60 = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 ? ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = ? ? ? ? ? = = ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 ? = = = = = = = = = = 0.77 = = = 0.76 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = ? 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 ? = = = = 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = ? = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = ? = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = 0.73 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 ? ? 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 0.97 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = ? ? ? = = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = ? ? 1.00 = ? ? ? = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = ? = = = = = = = = = 0.78 0.78 = 0.78 = = ? ? = = 0.97 = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.98 = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? ? ? = = = ? ? = = = = = = = = = 0.94 = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 ? ? ? 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = ? ? 1.00 = = 0.96 0.96 = 0.96 0.96 = 0.96 = ? = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = 0.68 0.63 0.63 0.63 0.63 0.63 0.63 0.63 = = 0.63 0.63 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = ? = 1.00 0.98 0.96 0.96 0.96 0.96 0.96 0.96 0.96 = = ? ? = = 0.68 0.68 = 0.68 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 0.98 0.95 0.95 0.95 0.95 0.95 0.95 0.95 = = 0.95 0.95 = = = 1.00 ? = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = ? = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = ? = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 0.66 0.66 = ? = = ? = 0.87 0.87 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = 0.99 0.99 = 0.99 0.99 = 0.99 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? ? ? ? ? 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 0.53 0.53 = ? = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = ? 1.00 = 0.99 = = = = = = = = = = = = = 0.50 0.50 = 0.50 = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? ? ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = 0.98 = = = 1.00 ? 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 0.99 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? ? ? ? = = 0.99 0.99 = 0.99 = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = 0.66 1.00 = 0.95 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 0.83 0.83 = 0.83 0.83 = 0.83 0.83 = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = 0.51 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = 0.71 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = ? 1.00 1.00 = = = ? = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 ? 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 ? ? ? ? = ? ? 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 0.97 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = ? ? ? 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 ? = = = = = = = 0.59 0.59 = = = = = = = = = = = = = = = = = ? 1.00 0.62 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = ? 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 ? = = = = = ? = 0.83 0.83 = 0.83 0.83 = 0.83 0.83 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? 0.94 0.94 = 0.94 0.94 = 0.94 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = ? = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 0.98 = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = 0.98 0.98 = = 0.98 = = = = = = = = 0.71 0.71 = 0.71 0.71 = 0.71 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 0.98 0.95 0.95 0.95 0.95 0.95 0.95 0.95 = = 0.95 0.95 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = 0.92 = = 0.92 = 0.83 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = ? 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = ? = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 ? ? 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = ? ? ? = 0.96 0.96 = 0.96 0.96 = = 0.96 0.96 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.93 0.93 = 0.93 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = 0.94 0.94 = 0.94 0.94 = 0.94 0.94 = = = = = 0.97 0.97 = 0.97 = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = ? = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = = ? = = = = = = = = = = 0.97 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 0.51 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 ? = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.97 0.97 = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 ? = = = = = = 1.00 ? = ? = = = 1.00 1.00 = = ? ? ? = = = = = = = = ? = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 0.52 0.52 = 0.52 0.52 = = 0.52 0.52 = = 0.83 0.83 = 0.83 0.83 = 0.83 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = 0.97 0.97 = 0.97 ? = 0.97 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = ? ? ? ? ? = = 0.70 0.70 = 0.70 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 ? 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 0.51 ? = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = 0.55 0.55 ? 0.55 = = 0.55 0.55 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 ? ? = 1.00 = 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = ? 1.00 1.00 = ? ? = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = 0.87 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 ? ? ? 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = ? = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = ? = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = 0.99 = = = 0.99 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.93 ? = = ? ? = = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? ? ? ? = = = = = = = ? 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 0.99 0.99 0.99 0.99 0.99 0.99 0.99 = = 0.99 0.99 = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 0.99 0.99 0.99 0.99 0.99 0.99 0.99 = = 0.99 0.99 = = = 0.98 = = = 1.00 ? = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = 1.00 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 = = ? ? ? ? 1.00 = = 1.00 1.00 = = ? 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = 0.93 ? 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 ? 1.00 = = ? ? ? 1.00 1.00 1.00 = ? = 1.00 ? ? 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 0.97 0.97 = 0.97 0.97 = = 0.97 0.97 = = 0.98 0.98 = 0.98 0.98 = 0.98 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = ? = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 0.98 0.99 0.97 0.97 0.97 0.97 0.97 0.97 0.97 = = 0.97 0.97 0.75 0.75 0.75 = 0.75 0.75 0.75 = 0.77 0.77 0.77 0.77 = 0.77 0.77 0.77 0.77 0.77 0.77 = = 0.77 0.77 0.77 = 0.77 = 0.77 = 0.77 = 0.77 0.77 = = = = = 1.00 1.00 ? 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = ? ? ? ? ? 0.88 0.88 0.88 = 0.88 0.88 0.88 = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = 0.56 = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 0.71 0.78 0.78 = 0.78 = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = ? 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 0.97 0.97 = 0.97 ? ? ? = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = ? = ? = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = ? = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 0.98 = = 0.98 = = = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = ? 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 0.75 0.75 = 0.75 0.75 = 0.75 0.75 0.75 = = = = = = ? = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 ? ? = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.84 0.84 = 0.84 0.84 = 0.84 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = ? ? = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 ? ? = ? ? ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? ? 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 ? ? 1.00 1.00 1.00 0.97 0.97 0.97 0.97 0.97 0.97 0.97 = = 0.97 0.97 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = 0.98 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? ? ? ? = = = = = = = 0.64 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 ? ? ? 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.50 0.50 = 0.50 ? = 0.50 = 0.74 = = = 0.74 = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = ? = 0.73 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 ? = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 0.96 0.96 = = 0.96 = 0.96 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = ? ? = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = ? ? ? ? 1.00 = = = = = = = = = = ? = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? 1.00 ? = 1.00 = = 1.00 1.00 ? 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = ? ? ? ? ? ? ? = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = ? = = = = = = = 1.00 = 1.00 = ? ? = = = ? ? 1.00 1.00 = ? = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = ? = = ? 1.00 = = ? ? ? ? ? = = = ? ? = = = = = = = = = = = END PHASEPROBS