Site Genotype1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 HD-chi2 XD-chi2 Total-chi2 000114 CC 21 17 20 21 79 CG 5 4 1 3 13 GG 1 1 0 0 2 0.868 1.144 0.012 0.107 2.385 000215 CC 26 21 21 24 92 CG 1 1 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.012 0.000 0.000 0.011 000236 AA 26 22 21 24 93 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 000713 AA 0 0 0 0 0 AC 0 1 0 0 1 CC 27 21 22 23 93 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 000851 AA 0 0 1 0 1 AG 4 1 8 2 15 GG 23 21 13 22 79 0.173 0.012 0.027 0.045 0.091 000895 GG 23 21 13 22 79 GT 4 1 8 2 15 TT 0 0 1 0 1 0.173 0.012 0.027 0.045 0.091 000901 AA 27 22 22 21 92 AG 0 0 0 3 3 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.107 0.024 000990 CC 17 16 12 19 64 CG 8 5 8 3 24 GG 1 1 1 0 3 0.002 0.499 0.053 0.118 0.161 001065 CC 25 22 22 23 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001431 AA 4 15 7 18 44 AC 7 4 8 4 23 CC 5 1 2 0 8 0.236 0.930 0.016 0.220 3.092 001510 CC 20 20 20 21 81 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 001584 CC 23 21 21 23 88 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.000 0.000 0.011 002141 -- 21 17 19 21 78 +- 0 1 0 0 1 ++ 0 0 0 0 0 0.000 0.015 0.000 0.000 0.003 002471 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 18 14 15 18 65 0.014 0.000 0.000 0.000 0.004 002767 CC 23 22 22 23 90 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.097 0.000 0.000 0.000 0.025 002815 -- 0 0 0 0 0 +- 3 0 0 0 3 ++ 23 22 22 23 90 0.097 0.000 0.000 0.000 0.025 003000 AA 8 1 2 0 11 AG 13 7 9 6 35 GG 5 14 10 18 47 0.005 0.011 0.000 0.490 1.222 003116 GG 24 22 18 22 86 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 003137 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 26 22 18 22 88 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 003176 AA 22 22 21 23 88 AG 4 0 1 0 5 GG 1 0 0 0 1 1.688 0.000 0.012 0.000 6.261 003183 AA 27 22 22 22 93 AC 0 0 0 1 1 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 003184 -- 27 21 13 23 84 +- 0 1 8 0 9 ++ 0 0 1 0 1 0.000 0.012 0.027 0.000 1.612 016308 CC 16 1 3 0 20 CT 10 11 11 8 40 TT 1 10 7 16 34 0.138 0.889 0.159 0.960 1.580 016497 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 25 22 22 24 93 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 016503 AA 23 22 22 24 91 AG 4 0 0 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 016614 -- 0 0 0 0 0 +- 0 1 0 0 1 ++ 27 19 22 24 92 0.000 0.013 0.000 0.000 0.003 016703 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 017048 CC 21 21 22 24 88 CT 5 0 0 0 5 TT 0 0 0 0 0 0.294 0.000 0.000 0.000 0.071 017189 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 22 20 20 22 84 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 017207 CC 18 20 20 22 80 CT 5 0 0 0 5 TT 0 0 0 0 0 0.342 0.000 0.000 0.000 0.078 017213 CC 22 20 20 21 83 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 017248 AA 23 19 16 22 80 AG 0 2 4 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.053 0.247 0.000 0.112 017298 AA 25 21 21 22 89 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 017307 AA 0 0 0 0 0 AG 4 0 1 0 5 GG 22 22 20 23 87 0.181 0.000 0.012 0.000 0.072 017333 AA 24 22 20 23 89 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 017670 AA 0 0 0 0 0 AG 5 0 1 0 6 GG 22 22 19 24 87 0.281 0.000 0.013 0.000 0.103 017756 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 25 22 21 24 92 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 017758 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 21 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 017952 AA 23 18 10 23 74 AG 0 0 11 1 12 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 2.644 0.011 0.484 017983 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 22 18 21 24 85 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 018041 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 23 19 21 23 86 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 018047 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 23 19 21 23 86 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 018146 -- 23 18 21 21 83 +- 0 0 0 3 3 ++ 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.107 0.027 018161 GG 3 12 9 19 43 GT 9 9 11 5 34 TT 14 1 2 0 17 0.639 0.182 0.279 0.324 4.413 018260 CC 16 4 9 8 37 CT 10 10 12 13 45 TT 0 8 1 3 12 1.474 0.079 1.455 0.421 0.086 026581 GG 20 17 21 20 78 GT 4 0 0 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.198 0.000 0.000 0.000 0.051 026700 AA 21 17 20 20 78 AG 3 0 1 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.107 0.000 0.012 0.000 0.051 027015 CC 23 18 22 22 85 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.000 0.000 0.012 027143 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 24 18 22 21 85 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 027229 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 23 17 22 22 84 0.043 0.000 0.000 0.000 0.012 027289 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 23 18 21 22 84 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 027348 AA 20 19 21 23 83 AG 4 0 1 0 5 GG 1 0 0 0 1 1.469 0.000 0.012 0.000 5.854 027378 AA 2 0 2 0 4 AG 7 1 9 2 19 GG 16 17 10 21 64 0.848 0.015 0.000 0.048 2.428 027552 AA 24 20 22 24 90 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 027568 CC 0 0 0 0 0 CG 0 1 1 0 2 GG 25 19 21 24 89 0.000 0.013 0.012 0.000 0.011 027605 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 0 1 1 TT 25 21 22 23 91 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 028110 -- 0 0 0 0 0 +- 0 1 0 0 1 ++ 25 18 20 24 87 0.000 0.014 0.000 0.000 0.003 028114 CC 24 18 20 24 86 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 028120 CC 25 18 20 23 86 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 028354 AA 26 22 21 24 93 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 028394 GG 27 20 21 24 92 GT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 028416 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 27 20 21 24 92 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 028420 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 0 1 1 GG 27 21 22 23 93 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 028475 AA 24 17 22 22 85 AG 2 4 0 2 8 GG 1 1 0 0 2 5.713 1.144 0.000 0.045 7.901 028513 GG 26 22 22 24 94 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 028514 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 028774 AA 9 17 9 21 56 AG 14 5 9 3 31 GG 4 0 1 0 5 0.147 0.362 0.436 0.107 0.068 035759 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 035835 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 27 21 22 24 94 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 035884 GG 26 22 22 24 94 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 036054 CC 0 0 2 0 2 CT 5 4 9 2 20 TT 22 18 11 22 73 0.281 0.220 0.007 0.045 0.203 036075 -- 26 22 22 24 94 +- 1 0 0 0 1 ++ 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 036103 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 25 22 22 24 93 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 036165 AA 12 1 2 0 15 AT 10 9 11 5 35 TT 5 12 9 19 45 1.144 0.182 0.279 0.324 3.131 036249 AA 1 0 0 0 1 AG 4 0 1 0 5 GG 20 22 21 24 87 1.469 0.000 0.012 0.000 6.180 036265 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 0 1 1 TT 25 22 22 23 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 036274 AA 0 0 0 0 0 AG 4 0 1 0 5 GG 20 22 21 24 87 0.198 0.000 0.012 0.000 0.072 036417 AA 21 22 21 24 88 AG 4 0 1 0 5 GG 0 0 0 0 0 0.189 0.000 0.012 0.000 0.071 036445 GG 0 0 0 0 0 GT 3 2 3 3 11 TT 21 20 19 21 81 0.107 0.050 0.118 0.107 0.372 036519 CC 11 18 10 22 61 CG 11 4 10 2 27 GG 2 0 2 0 4 0.107 0.220 0.050 0.045 0.206 036529 AA 23 20 21 23 87 AG 1 2 1 1 5 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.050 0.012 0.011 0.072 036544 CC 0 0 0 0 0 CT 1 2 1 1 5 TT 23 20 21 23 87 0.011 0.050 0.012 0.011 0.072 044112 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 0 2 2 GG 27 22 20 21 90 0.000 0.000 0.000 0.048 0.011 044259 AA 27 21 21 24 93 AC 0 1 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 044423 AA 22 22 20 24 88 AG 4 0 1 0 5 GG 1 0 0 0 1 1.688 0.000 0.012 0.000 6.261 044597 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 044819 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 27 21 22 24 94 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 045211 CC 0 0 0 0 0 CT 5 0 0 0 5 TT 17 13 19 18 67 0.362 0.000 0.000 0.000 0.093 045214 AA 9 1 3 0 13 AC 9 6 8 5 28 CC 3 6 7 13 29 0.093 0.090 0.076 0.468 1.701 045369 GG 25 22 21 24 92 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 045426 AA 25 22 21 21 89 AG 0 0 0 3 3 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.107 0.025 045427 GG 25 19 19 24 87 GT 0 3 2 0 5 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.118 0.053 0.000 0.072 045667 AA 1 0 0 0 1 AG 3 0 0 0 3 GG 16 16 20 20 72 1.976 0.000 0.000 0.000 10.951 045904 -- 1 0 0 0 1 +- 0 2 0 2 4 ++ 20 12 21 19 72 21.000 0.083 0.000 0.053 7.224 045908 CC 19 11 21 20 71 CT 0 2 0 2 4 TT 1 0 0 0 1 20.000 0.090 0.000 0.050 7.113 051143 -- 27 21 21 22 91 +- 0 0 0 2 2 ++ 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 051226 CC 25 22 21 24 92 CG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 051422 AA 5 1 0 0 6 AG 11 5 0 3 19 GG 11 16 21 21 69 0.551 0.499 0.000 0.107 6.655 051440 CC 25 22 21 24 92 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 051684 AA 24 22 20 24 90 AG 3 0 1 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.012 0.000 0.044 052078 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 25 22 22 23 92 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 052107 CC 5 1 0 0 6 CT 11 5 1 2 19 TT 11 16 21 21 69 0.551 0.499 0.012 0.048 6.655 052143 AA 25 22 22 23 92 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 052156 AA 0 0 1 0 1 AG 3 1 8 2 14 GG 24 21 13 21 79 0.093 0.012 0.027 0.048 0.179 052507 AA 22 18 11 21 72 AG 5 4 9 2 20 GG 0 0 2 0 2 0.281 0.220 0.007 0.048 0.188 052537 AA 0 0 0 0 0 AG 5 0 1 0 6 GG 22 21 21 23 87 0.281 0.000 0.012 0.000 0.103 052574 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 26 21 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 052583 AA 25 21 21 24 91 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 052713 AA 0 0 0 0 0 AG 3 0 0 0 3 GG 22 21 22 24 89 0.102 0.000 0.000 0.000 0.025 052871 CC 21 22 21 24 88 CG 5 0 1 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.294 0.000 0.012 0.000 0.102 053063 GG 24 20 22 24 90 GT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 069001 CC 26 22 22 24 94 CG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 069105 CC 12 16 21 21 70 CT 9 5 1 3 18 TT 5 1 0 0 6 1.672 0.499 0.012 0.107 7.693 069247 AA 25 22 22 24 93 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 069372 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 27 21 22 24 94 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 069411 AA 5 1 0 0 6 AC 10 5 1 3 19 CC 12 16 21 21 70 1.144 0.499 0.012 0.107 6.803 069635 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 069738 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 070598 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 27 21 21 24 93 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 070620 CC 5 0 0 0 5 CG 9 5 1 3 18 GG 12 15 21 21 69 1.672 0.408 0.012 0.107 5.377 070694 AA 24 21 22 24 91 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 070926 CC 19 21 21 24 85 CT 4 0 0 0 4 TT 1 0 0 0 1 1.361 0.000 0.000 0.000 8.668 070946 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 26 21 20 24 91 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 071004 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 27 20 21 24 92 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 071258 CC 26 21 20 24 91 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 071274 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 21 20 24 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 078342 GG 0 0 0 0 0 GT 0 1 0 0 1 TT 23 18 19 22 82 0.000 0.014 0.000 0.000 0.003 078630 AA 13 20 19 22 74 AG 9 0 1 0 10 GG 0 0 0 0 0 1.455 0.000 0.013 0.000 0.336 078640 CC 0 10 13 17 40 CG 6 9 7 5 27 GG 16 1 0 0 17 0.548 0.330 0.900 0.362 7.816 078754 CC 0 0 0 0 0 CG 0 1 0 0 1 GG 23 20 19 22 84 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 079069 AA 0 0 0 0 0 AG 5 0 0 0 5 GG 18 18 20 22 78 0.342 0.000 0.000 0.000 0.080 079257 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 0 1 ++ 24 22 21 22 89 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 079791 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 080462 GG 16 22 18 23 79 GT 10 0 1 0 11 TT 0 0 0 0 0 1.474 0.000 0.014 0.000 0.381 080526 AA 11 21 18 21 71 AG 11 1 1 1 14 GG 4 0 0 0 4 0.200 0.012 0.014 0.012 6.677 084847 CC 23 20 21 24 88 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 084884 -- 14 19 20 24 77 +- 10 0 1 0 11 ++ 0 0 0 0 0 1.662 0.000 0.012 0.000 0.391 085091 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 085425 AA 23 18 21 24 86 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.014 0.000 0.000 0.003 085547 CC 2 0 0 0 2 CT 7 1 1 1 10 TT 13 18 20 23 74 0.505 0.014 0.012 0.011 4.255 085656 AA 19 16 18 21 74 AG 2 3 2 0 7 GG 0 0 0 0 0 0.053 0.140 0.055 0.000 0.165 085717 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 21 18 20 22 81 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 086060 AA 24 17 19 23 83 AG 2 3 1 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.042 0.131 0.013 0.000 0.108 086118 GG 0 0 0 0 0 GT 4 0 0 0 4 TT 23 21 21 24 89 0.173 0.000 0.000 0.000 0.045 086544 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 26 20 22 24 92 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 086604 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 21 21 24 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 096236 CC 26 22 20 24 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 096334 AA 26 21 20 23 90 AC 1 1 0 1 3 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.012 0.000 0.011 0.025 096765 CC 16 10 18 17 61 CT 0 4 1 2 7 TT 1 1 0 0 2 17.000 0.417 0.014 0.059 6.700 096982 AA 0 0 0 0 0 AT 3 0 0 0 3 TT 17 18 20 20 75 0.131 0.000 0.000 0.000 0.030 097020 AA 14 17 19 17 67 AG 5 0 0 0 5 GG 0 0 0 0 0 0.436 0.000 0.000 0.000 0.093 097202 AA 24 22 21 24 91 AG 3 0 1 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.012 0.000 0.044 097483 AA 2 10 3 3 18 AC 6 8 9 14 37 CC 18 3 8 7 36 1.719 0.429 0.032 0.960 2.150 097523 GG 3 1 0 0 4 GT 3 5 1 3 12 TT 21 14 17 21 73 9.720 0.360 0.015 0.107 9.346 097561 AA 3 1 0 0 4 AG 6 8 5 3 22 GG 18 13 16 21 68 3.444 0.027 0.383 0.107 1.526 097576 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 25 22 21 23 91 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 097820 AA 25 22 21 24 92 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 107320 -- 2 10 3 3 18 +- 7 8 9 13 37 ++ 13 2 7 6 28 0.505 0.045 0.001 0.917 0.754 107363 -- 0 0 0 0 0 +- 2 0 0 0 2 ++ 22 21 20 23 86 0.045 0.000 0.000 0.000 0.012 107544 CC 19 16 20 21 76 CT 3 5 1 3 12 TT 3 1 0 0 4 8.806 0.499 0.012 0.107 9.827 107603 AA 20 22 21 24 87 AG 4 0 0 0 4 GG 1 0 0 0 1 1.469 0.000 0.000 0.000 8.890 107672 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 26 22 21 22 91 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 107734 CC 24 22 21 23 90 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 108004 GG 0 0 0 0 0 GT 6 0 0 0 6 TT 20 20 20 24 84 0.442 0.000 0.000 0.000 0.107 108036 AA 0 0 0 0 0 AG 3 0 0 0 3 GG 23 21 20 24 88 0.097 0.000 0.000 0.000 0.026 108043 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 1 0 1 GG 26 21 19 24 90 0.000 0.000 0.013 0.000 0.003 108370 CC 7 1 0 0 8 CT 13 7 5 3 28 TT 6 11 15 21 53 0.000 0.007 0.408 0.107 2.129 108417 AA 24 17 18 22 81 AG 0 3 1 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.131 0.014 0.000 0.049 108509 AA 0 0 0 0 0 AT 0 1 0 0 1 TT 27 19 20 22 88 0.000 0.013 0.000 0.000 0.003 109021 -- 0 0 0 0 0 +- 2 0 0 0 2 ++ 21 18 22 24 85 0.048 0.000 0.000 0.000 0.012 109226 AA 26 20 19 23 88 AG 0 0 2 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.053 0.000 0.011 109250 CC 25 21 21 23 90 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 109257 AA 25 20 21 23 89 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 109374 CC 19 14 4 3 40 CT 4 3 13 14 34 TT 1 0 4 4 9 1.361 0.159 1.190 2.376 0.191 109579 -- 21 16 21 21 79 +- 3 5 1 3 12 ++ 3 1 0 0 4 9.720 0.499 0.012 0.107 10.309 115584 AA 25 21 22 24 92 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 115618 GG 18 3 8 7 36 GT 4 10 11 14 39 TT 2 7 3 3 15 3.840 0.035 0.065 0.960 0.626 115619 AA 18 3 8 7 36 AT 4 10 11 14 39 TT 2 7 3 3 15 3.840 0.035 0.065 0.960 0.626 116092 AA 2 1 0 0 3 AG 4 5 1 3 13 GG 21 15 21 21 78 4.606 0.429 0.012 0.107 5.363 116120 AA 27 20 22 24 93 AC 0 1 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 116522 CC 0 0 0 0 0 CT 1 2 2 0 5 TT 22 15 19 24 80 0.011 0.066 0.053 0.000 0.078 116715 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 18 13 17 19 67 0.014 0.000 0.000 0.000 0.004 116868 CC 0 0 0 0 0 CT 2 4 1 0 7 TT 17 15 14 20 66 0.059 0.263 0.018 0.000 0.185 116907 -- 10 16 4 2 32 +- 8 4 11 16 39 ++ 2 0 4 3 9 0.045 0.247 0.474 5.838 0.316 117072 AA 26 21 20 24 91 AG 0 1 1 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.012 0.000 0.011 117600 CC 4 1 0 0 5 CT 9 5 2 3 19 TT 14 16 19 21 70 1.396 0.499 0.053 0.107 4.773 117615 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 2 2 CC 27 22 21 22 92 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 117616 AA 27 22 21 22 92 AG 0 0 0 2 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 117791 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 1 3 5 TT 27 20 20 21 88 0.000 0.012 0.012 0.107 0.071 123386 -- 0 0 0 0 0 +- 5 0 0 0 5 ++ 21 22 22 23 88 0.294 0.000 0.000 0.000 0.071 123430 * 123458 CC 18 22 22 23 85 CT 7 0 0 0 7 TT 1 0 0 0 1 0.092 0.000 0.000 0.000 3.103 123572 CC 25 22 22 23 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 123628 AA 0 0 0 0 0 AG 10 0 1 0 11 GG 16 22 21 24 83 1.474 0.000 0.012 0.000 0.363 124459 -- 0 0 0 0 0 +- 6 0 0 0 6 ++ 21 22 22 24 89 0.422 0.000 0.000 0.000 0.101 124518 AA 11 17 4 5 37 AG 12 5 14 16 47 GG 4 0 4 3 11 0.060 0.362 1.636 2.818 0.460 124567 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 124573 CC 27 20 22 24 93 CT 0 2 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.050 0.000 0.000 0.011 124689 CC 23 18 19 24 84 CT 4 4 3 0 11 TT 0 0 0 0 0 0.173 0.220 0.118 0.000 0.359 124714 AA 24 22 22 24 92 AG 3 0 0 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.000 0.000 0.024 125055 CC 1 0 0 0 1 CT 1 2 1 1 5 TT 20 15 19 16 70 9.075 0.066 0.013 0.016 4.797 125108 AA 1 0 0 0 1 AG 2 3 1 1 7 GG 21 16 18 16 71 4.959 0.140 0.014 0.016 2.426 125219 GG 0 0 0 0 0 GT 10 0 0 0 10 TT 14 21 15 18 68 1.662 0.000 0.000 0.000 0.366 130764 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 130863 AA 27 20 22 23 92 AG 0 2 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.050 0.000 0.000 0.011 130942 AA 17 19 19 22 77 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.015 0.000 0.000 0.000 0.003 131204 CC 24 17 19 22 82 CT 1 4 3 0 8 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.233 0.118 0.000 0.195 131224 AA 11 17 4 5 37 AG 9 4 14 15 42 GG 5 0 4 3 12 1.392 0.233 1.636 2.272 0.000 131260 AA 23 22 21 23 89 AG 3 0 1 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.097 0.000 0.012 0.000 0.045 131496 AA 24 22 22 22 90 AT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 132018 -- 14 0 7 3 24 +- 7 9 12 16 44 ++ 6 13 3 5 27 5.029 1.455 0.362 2.818 0.503 132056 CC 15 18 18 24 75 CT 10 4 4 0 18 TT 2 0 0 0 2 0.034 0.220 0.220 0.000 0.530 132179 AA 21 22 22 24 89 AT 6 0 0 0 6 TT 0 0 0 0 0 0.422 0.000 0.000 0.000 0.101 132214 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 1 1 CC 26 22 22 23 93 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 132340 AA 20 22 22 24 88 AG 6 0 0 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.442 0.000 0.000 0.000 0.102 132548 AA 13 15 16 21 65 AG 9 3 4 0 16 GG 2 0 0 0 2 0.061 0.149 0.247 0.000 0.678 141566 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 24 21 22 24 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 141587 AA 15 18 4 5 42 AC 8 3 14 16 41 CC 2 0 3 3 8 0.377 0.124 2.376 2.818 0.204 141677 AA 24 21 22 24 91 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 142503 AA 24 22 21 22 89 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 142595 CC 10 22 22 22 76 CT 9 0 0 0 9 TT 5 0 0 0 5 1.119 0.000 0.000 0.000 19.916 142631 GG 0 0 0 0 0 GT 3 0 0 0 3 TT 21 22 22 22 87 0.107 0.000 0.000 0.000 0.026 142653 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 0 1 ++ 24 22 22 22 90 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 142692 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 25 22 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 142742 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 150127 CC 26 21 21 22 90 CG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 150156 AA 27 22 21 21 91 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 150427 AA 15 18 4 4 41 AG 7 4 14 16 41 GG 4 0 4 2 10 3.079 0.220 1.636 4.791 0.003 150602 AA 0 0 0 0 0 AT 0 1 0 0 1 TT 27 21 22 24 94 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 150899 AA 25 20 21 21 87 AC 0 0 0 1 1 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 151920 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 25 22 21 21 89 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 151987 CC 26 21 21 20 88 CG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 152009 AA 0 0 0 0 0 AT 0 1 0 0 1 TT 26 21 21 21 89 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 152044 CC 18 5 8 6 37 CT 6 8 10 12 36 TT 2 9 3 2 16 1.719 1.352 0.002 1.250 1.828 152264 AA 25 20 17 20 82 AT 0 1 4 0 5 TT 0 1 0 0 1 0.000 9.075 0.233 0.000 5.773 159098 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 26 20 21 21 88 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 159116 CC 23 20 21 23 87 CG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.000 0.000 0.011 159205 CC 3 0 0 0 3 CT 4 1 3 0 8 TT 20 19 18 23 80 6.998 0.013 0.124 0.000 13.206 160576 AA 20 21 19 24 84 AG 4 1 3 0 8 GG 3 0 0 0 3 6.998 0.012 0.118 0.000 13.944 160738 CC 3 0 0 0 3 CT 4 1 3 0 8 TT 20 21 19 24 84 6.998 0.012 0.118 0.000 13.944 160931 CC 27 22 19 19 87 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.013 0.003 187538 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 0 1 ++ 24 22 22 24 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 187575 AA 22 22 21 19 84 AC 3 0 1 4 8 CC 0 0 0 1 1 0.102 0.000 0.012 1.361 2.221 187818 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 187856 GG 27 22 22 23 94 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 187970 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 188254 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 189150 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 189216 CC 12 13 13 9 47 CT 8 8 7 11 34 TT 7 1 2 4 14 4.030 0.027 0.505 0.042 3.286 189333 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 189414 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 4 7 12 ++ 26 22 18 17 83 0.010 0.000 0.220 0.700 0.432 189711 AA 19 18 14 12 63 AC 2 0 0 0 2 CC 0 0 0 0 0 0.053 0.000 0.000 0.000 0.016 189730 -- 0 0 0 0 0 +- 4 0 1 4 9 ++ 22 18 14 12 66 0.181 0.000 0.018 0.327 0.306 194646 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 20 21 20 24 85 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 194740 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 20 19 19 23 81 0.000 0.013 0.000 0.000 0.003 194944 CC 23 21 18 23 85 CT 1 0 0 1 2 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.011 0.012 195551 AA 25 16 17 17 75 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.015 0.000 0.003 195613 -- 13 13 10 7 43 +- 9 5 7 9 30 ++ 4 1 2 3 10 1.185 0.294 0.207 0.001 1.659 195709 -- 4 1 2 3 10 +- 11 7 7 8 33 ++ 10 9 10 7 36 0.110 0.057 0.207 0.076 0.314 195864 CC 2 0 0 0 2 CT 4 1 10 2 17 TT 20 20 10 21 71 4.351 0.012 2.222 0.048 0.628 196115 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 23 20 19 17 79 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 196314 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 0 1 ++ 22 20 18 15 75 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 196360 AA 22 20 17 17 76 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 196435 AA 0 0 0 0 0 AG 3 0 0 3 6 GG 20 19 18 15 72 0.112 0.000 0.000 0.149 0.125 196710 -- 0 0 0 0 0 +- 0 3 1 0 4 ++ 25 19 20 19 83 0.000 0.118 0.012 0.000 0.048 196734 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 23 22 21 19 85 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 196794 AA 0 0 0 0 0 AG 0 2 0 0 2 GG 20 20 21 18 79 0.000 0.050 0.000 0.000 0.013 196803 AA 16 20 20 15 71 AT 2 0 0 3 5 TT 0 0 0 0 0 0.062 0.000 0.000 0.149 0.088 205038 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 22 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 205072 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 25 22 22 22 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 205127 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 1 0 1 TT 26 22 21 22 91 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 205692 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 5 8 14 CC 23 21 17 15 76 0.011 0.000 0.362 1.019 0.640 206005 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 206028 CC 0 0 0 0 0 CG 0 1 0 0 1 GG 27 21 21 24 93 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 206050 AA 26 22 21 24 93 AT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 206057 -- 21 21 20 23 85 +- 3 0 0 0 3 ++ 0 0 0 0 0 0.107 0.000 0.000 0.000 0.026 206205 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 26 20 20 24 90 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 206686 -- 22 21 12 22 77 +- 4 1 10 2 17 ++ 1 0 0 0 1 1.688 0.012 1.903 0.045 0.003 206896 AA 0 9 3 7 19 AG 6 8 11 12 37 GG 21 5 8 5 39 0.422 1.352 0.065 0.001 3.249 207213 AA 26 21 21 24 92 AG 1 1 1 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.012 0.012 0.000 0.024 209146 AA 26 22 21 24 93 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 209263 AA 25 22 21 24 92 AT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 209365 GG 0 9 3 9 21 GT 5 8 10 10 33 TT 22 5 8 5 40 0.281 1.352 0.002 0.490 6.750 209551 CC 27 22 21 23 93 CG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 209581 AA 0 9 3 7 19 AG 6 8 10 12 36 GG 21 5 8 5 39 0.422 1.352 0.002 0.001 3.675 209758 AA 27 20 21 24 92 AG 0 2 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.050 0.000 0.000 0.011 209844 CC 27 21 21 22 91 CG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 209898 CC 25 20 21 23 89 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 210249 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 26 19 19 23 87 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 210508 CC 23 16 14 16 69 CT 1 2 1 0 4 TT 0 1 0 0 1 0.011 3.698 0.018 0.000 6.891 211415 AA 0 0 0 0 0 AT 0 1 0 0 1 TT 27 21 21 24 93 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 211481 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 211502 CC 27 22 21 24 94 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 211596 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 27 21 21 24 93 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 212646 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 212659 CC 27 22 21 24 94 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 212804 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 212933 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 25 22 21 23 91 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 213333 AA 26 22 21 23 92 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 213388 AA 1 0 0 0 1 AG 4 1 10 0 15 GG 22 21 11 23 77 1.688 0.012 2.051 0.000 0.078 224234 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 224320 -- 15 14 17 11 57 +- 9 7 4 13 33 ++ 3 1 1 0 5 0.773 0.011 1.144 3.311 0.006 224467 AA 7 1 1 0 9 AT 10 7 5 9 31 TT 6 11 14 11 42 0.381 0.007 0.360 1.686 0.784 224771 AA 21 18 16 15 70 AG 6 3 4 9 22 GG 0 1 2 0 3 0.422 2.296 3.327 1.278 0.585 224774 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 224820 CC 3 10 7 9 29 CT 11 11 12 15 49 TT 13 1 3 0 17 0.084 0.889 0.362 4.959 0.222 224831 AA 25 22 22 24 93 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 224876 AA 0 0 0 0 0 AG 4 0 0 0 4 GG 23 22 22 24 91 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 225051 AA 26 18 14 21 79 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 225101 CC 0 0 0 0 0 CT 0 2 0 0 2 TT 26 16 15 22 79 0.000 0.062 0.000 0.000 0.013 225350 AA 22 17 15 16 70 AC 4 0 0 6 10 CC 0 0 0 0 0 0.181 0.000 0.000 0.548 0.356 225432 CC 0 1 0 0 1 CT 2 1 2 0 5 TT 20 16 13 22 71 0.050 7.289 0.077 0.000 4.878 225601 CC 3 0 0 0 3 CT 7 2 2 0 11 TT 16 16 13 22 67 2.068 0.062 0.077 0.000 6.219 225873 AA 21 21 13 22 77 AT 4 1 9 2 16 TT 2 0 0 0 2 4.606 0.012 1.455 0.045 1.065 226119 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 27 21 22 24 94 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 226137 AA 26 19 17 14 76 AG 1 3 4 10 18 GG 0 0 1 0 1 0.010 0.118 1.144 1.662 0.003 226420 CC 22 22 22 23 89 CT 5 0 0 0 5 TT 0 0 0 0 0 0.281 0.000 0.000 0.000 0.070 226423 CC 0 0 0 0 0 CT 6 0 1 6 13 TT 21 22 21 17 81 0.422 0.000 0.012 0.517 0.519 226454 GG 1 5 3 12 21 GT 9 8 10 9 36 TT 17 9 9 2 37 0.020 1.352 0.007 0.028 4.192 226476 AA 26 22 22 23 93 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 226528 AA 0 0 0 0 0 AC 0 2 1 0 3 CC 27 20 21 23 91 0.000 0.050 0.012 0.000 0.025 234989 GG 27 22 22 23 94 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 234995 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 0 1 ++ 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 235065 AA 26 22 21 24 93 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 235090 AA 27 22 22 23 94 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 235249 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 4 4 TT 27 22 22 20 91 0.000 0.000 0.000 0.198 0.044 235563 AA 0 1 0 0 1 AC 0 7 4 0 11 CC 26 14 18 24 82 0.000 0.011 0.220 0.000 0.778 235657 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 1 0 1 TT 26 22 21 24 93 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 235682 AA 0 1 0 0 1 AG 0 7 4 0 11 GG 26 14 18 23 81 0.000 0.011 0.220 0.000 0.758 235816 AA 27 21 21 24 93 AG 0 1 1 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.012 0.000 0.011 235947 AA 0 0 0 0 0 AG 4 0 0 0 4 GG 23 22 22 24 91 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 236034 AA 23 13 18 16 70 AG 4 9 4 8 25 GG 0 0 0 0 0 0.173 1.455 0.220 0.960 2.181 236199 AA 18 13 9 20 60 AG 7 8 13 4 32 GG 2 1 0 0 3 1.089 0.027 3.869 0.198 0.263 236457 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 4 0 4 CC 27 22 18 24 91 0.000 0.000 0.220 0.000 0.044 236650 CC 27 20 22 24 93 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 236721 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 0 1 ++ 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 236778 CC 0 0 0 0 0 CT 4 0 1 6 11 TT 23 22 21 18 84 0.173 0.000 0.012 0.490 0.359 236937 AA 0 1 0 0 1 AG 0 7 4 0 11 GG 27 14 18 24 83 0.000 0.011 0.220 0.000 0.799 236955 GG 25 22 22 24 93 GT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 237210 CC 27 22 21 24 94 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 237250 GG 23 22 22 24 91 GT 4 0 0 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 244362 CC 2 1 2 1 6 CG 11 8 8 16 43 GG 10 10 8 4 32 0.179 0.140 0.000 6.481 2.733 244413 CC 5 2 3 4 14 CT 13 9 9 15 46 TT 6 8 6 2 22 0.174 0.052 0.015 4.096 1.445 244482 CC 0 0 0 0 0 CT 4 0 0 0 4 TT 20 19 18 21 78 0.198 0.000 0.000 0.000 0.051 244616 AA 24 18 18 21 81 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.014 0.000 0.000 0.003 245745 -- 17 19 11 18 65 +- 5 0 7 4 16 ++ 2 0 0 0 2 2.400 0.000 1.049 0.220 0.678 245907 AA 5 8 2 1 16 AG 5 6 7 9 27 GG 9 3 2 6 20 3.835 0.878 0.818 0.974 1.224 246041 GG 14 9 6 10 39 GT 3 6 6 8 23 TT 0 2 0 0 2 0.159 0.382 1.333 1.469 0.405 246129 -- 17 19 12 19 67 +- 6 0 8 4 18 ++ 2 0 0 0 2 1.562 0.000 1.250 0.209 0.350 246221 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 1 0 1 CC 25 20 20 23 88 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 246231 AA 25 19 21 21 86 AG 0 0 0 2 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.048 0.012 252713 CC 0 0 1 0 1 CT 3 0 6 0 9 TT 16 18 12 21 67 0.140 0.000 0.048 0.000 1.088 253021 AA 23 17 18 23 81 AC 3 5 4 0 12 CC 0 0 0 0 0 0.097 0.362 0.220 0.000 0.442 253174 CC 6 1 4 5 16 CT 12 9 10 17 48 TT 8 12 8 1 29 0.133 0.182 0.079 6.324 0.260 253279 AA 18 13 15 12 58 AC 8 6 7 11 32 CC 0 3 0 0 3 0.860 2.148 0.787 2.272 0.316 253300 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 25 22 22 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 253677 GG 19 21 13 23 76 GT 7 1 8 1 17 TT 1 0 0 0 1 0.120 0.012 1.163 0.011 0.002 253687 CC 19 21 13 23 76 CG 7 1 8 1 17 GG 1 0 0 0 1 0.120 0.012 1.163 0.011 0.002 253816 GG 24 17 17 18 76 GT 3 5 5 5 18 TT 0 0 0 1 1 0.093 0.362 0.362 0.644 0.003 253825 GG 27 22 21 18 88 GT 0 0 1 5 6 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.012 0.644 4.475 253852 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 253965 AA 19 21 12 23 75 AG 7 1 9 1 18 GG 1 0 0 0 1 0.120 0.012 1.562 0.011 0.005 254138 CC 27 22 20 18 87 CT 0 0 1 5 6 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.012 0.644 4.413 254155 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 25 22 21 24 92 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 254177 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 21 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 254259 CC 23 20 21 23 87 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 254624 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 254644 AA 0 1 0 0 1 AG 0 7 4 0 11 GG 27 14 18 24 83 0.000 0.011 0.220 0.000 0.799 254721 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 255757 GG 0 0 0 0 0 GT 2 0 0 0 2 TT 23 22 21 22 88 0.043 0.000 0.000 0.000 0.011 255761 AA 24 22 21 22 89 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 255797 CC 20 20 20 17 77 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 263269 CC 23 22 21 22 88 CT 2 0 0 1 3 TT 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.000 0.011 0.026 263319 CC 25 22 21 23 91 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 263323 -- 25 22 21 23 91 +- 1 0 0 0 1 ++ 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 263511 AA 26 22 21 21 90 AG 0 0 0 2 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.048 0.011 263551 AA 26 21 21 23 91 AC 0 1 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 264484 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 21 17 14 21 73 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 265116 GG 7 7 0 2 16 GT 13 7 10 9 39 TT 4 5 7 10 26 0.243 1.235 2.951 0.000 0.040 265205 AA 7 6 0 3 16 AG 13 7 10 9 39 GG 3 4 6 10 23 0.631 0.462 3.306 0.177 0.005 271336 GG 17 19 18 20 74 GT 5 0 1 0 6 TT 0 0 0 0 0 0.362 0.000 0.014 0.000 0.121 271530 CC 1 0 0 0 1 CT 9 8 5 0 22 TT 11 12 13 21 57 0.247 1.250 0.468 0.000 0.492 271566 AA 16 12 14 21 63 AG 5 8 4 0 17 GG 0 0 0 0 0 0.383 1.250 0.281 0.000 1.131 271751 GG 18 19 16 18 71 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.014 0.000 0.000 0.000 0.004 272426 CC 25 20 17 17 79 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 2 2 0.000 0.000 0.000 11.902 51.658 272577 AA 26 22 21 24 93 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 272588 AA 8 6 10 9 33 AG 13 2 7 11 33 GG 4 14 3 4 25 0.113 13.747 0.818 0.042 6.589 272799 CC 25 22 22 24 93 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 273063 -- 27 22 22 23 94 +- 0 0 0 1 1 ++ 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 273552 CC 26 20 21 23 90 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 273566 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 26 21 21 22 90 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 273890 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 1 0 2 CC 25 21 20 23 89 0.010 0.000 0.012 0.000 0.011 273915 CC 26 21 20 23 90 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 281179 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 1 0 1 GG 25 20 20 23 88 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 281309 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 19 21 23 87 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 281544 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 24 22 22 23 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 281860 -- 2 0 5 9 16 +- 11 11 13 11 46 ++ 12 11 3 3 29 0.057 2.444 1.307 0.016 0.093 282621 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 25 22 20 22 89 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 282662 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 25 21 20 23 89 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 282949 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 1 0 2 GG 25 21 19 23 88 0.000 0.012 0.013 0.000 0.011 282993 AA 25 22 20 21 88 AG 0 0 0 2 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.048 0.011 283278 CC 3 0 1 0 4 CT 10 9 5 0 24 TT 13 13 16 23 65 0.246 1.455 0.499 0.000 0.824 283316 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 25 22 22 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 283592 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 0 1 ++ 25 22 22 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 283760 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 25 22 21 23 91 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 283800 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 0 1 ++ 25 22 22 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 285365 AA 26 21 22 22 91 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 285377 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 25 22 22 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 285410 AA 26 21 22 22 91 AG 0 1 0 1 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.011 0.011 285434 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 26 22 21 23 92 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 286008 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 26 22 22 22 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 286160 AA 0 0 0 0 0 AT 0 0 0 2 2 TT 26 22 22 21 91 0.000 0.000 0.000 0.048 0.011 286338 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 26 22 21 23 92 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 286749 AA 26 22 20 23 91 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 286788 AA 25 22 21 23 91 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 286815 CC 1 0 0 0 1 CT 5 0 0 0 5 TT 20 22 21 23 86 0.793 0.000 0.000 0.000 6.099 287153 -- 0 0 0 0 0 +- 7 0 1 0 8 ++ 19 22 20 23 84 0.629 0.000 0.012 0.000 0.190 287868 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 25 21 22 23 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 287937 -- 1 0 1 0 2 +- 5 7 4 0 16 ++ 20 14 17 23 74 0.793 0.840 1.144 0.000 0.965 287945 -- 25 21 21 18 85 +- 0 0 0 2 2 ++ 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.055 0.012 288082 CC 26 21 22 23 92 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 288733 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 25 17 21 22 85 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 289039 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 1 0 1 CC 26 17 20 16 79 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 289202 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 0 1 1 TT 27 18 21 23 89 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 289392 CC 26 18 21 24 89 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 289437 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 26 18 21 24 89 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 289896 AA 7 7 9 9 32 AG 15 8 11 12 46 GG 5 3 1 3 12 0.371 0.076 1.068 0.107 0.511 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002141: TAC 002815: c 003184: A 016614: TA 018146: tTCTCTCtt 028110: a 036075: A 045904: aat 051143: a 079257: g 084884: t 107320: T 107363: T 109021: gaa 109579: T 116907: T 123386: c 124459: gact 132018: A 142653: c 187538: t 189414: GA 189730: CA 195613: A 195709: t 196314: gtct 196710: t 206057: ga 206686: A 224320: GTCA 234995: a 236721: tagccata 245745: TTGT 246129: T 263323: t 273063: T 281860: tagc 283592: aaaa 283800: aaagaacctt 287153: T 287937: cttttttt 287945: cttttttt Tri-allelic sites: Site Genotype AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop 123430 AA 0 0 0 0 0 123430 AG 5 4 3 0 12 123430 AT 0 0 0 0 0 123430 GG 21 18 19 22 80 123430 GT 0 0 0 1 1 123430 TT 0 0 0 0 0