Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000114 G 0.13 0.14 0.02 0.06 0.09 C 0.87 0.86 0.98 0.94 0.91 0.23 0.24 0.05 0.12 0.16 000215 G 0.02 0.02 0.00 0.00 0.01 C 0.98 0.98 1.00 1.00 0.99 0.04 0.04 0.00 0.00 0.02 000236 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000713 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 000851 A 0.07 0.02 0.23 0.04 0.09 G 0.93 0.98 0.77 0.96 0.91 0.14 0.04 0.35 0.08 0.16 000895 T 0.07 0.02 0.23 0.04 0.09 G 0.93 0.98 0.77 0.96 0.91 0.14 0.04 0.35 0.08 0.16 000901 G 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 A 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 000990 G 0.19 0.16 0.24 0.07 0.16 C 0.81 0.84 0.76 0.93 0.84 0.31 0.27 0.36 0.13 0.28 001065 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001431 C 0.53 0.15 0.35 0.09 0.26 A 0.47 0.85 0.65 0.91 0.74 0.50 0.26 0.46 0.17 0.38 001510 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 001584 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 002141 + 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 - 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 002471 A 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.02 002767 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 002815 - 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 + 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 003000 A 0.56 0.20 0.31 0.12 0.31 G 0.44 0.80 0.69 0.88 0.69 0.49 0.33 0.43 0.22 0.43 003116 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 003137 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 003176 G 0.11 0.00 0.02 0.00 0.04 A 0.89 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.04 0.00 0.07 003183 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 003184 + 0.00 0.02 0.23 0.00 0.06 - 1.00 0.98 0.77 1.00 0.94 0.00 0.04 0.35 0.00 0.11 016308 C 0.78 0.30 0.40 0.17 0.43 T 0.22 0.70 0.60 0.83 0.57 0.35 0.42 0.48 0.28 0.49 016497 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 016503 G 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 016614 - 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 + 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 016703 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 017048 T 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 017189 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 017207 T 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.19 0.00 0.00 0.00 0.06 017213 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 017248 G 0.00 0.05 0.10 0.00 0.03 A 1.00 0.95 0.90 1.00 0.97 0.00 0.09 0.18 0.00 0.07 017298 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 017307 A 0.08 0.00 0.02 0.00 0.03 G 0.92 1.00 0.98 1.00 0.97 0.14 0.00 0.05 0.00 0.05 017333 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 017670 A 0.09 0.00 0.03 0.00 0.03 G 0.91 1.00 0.97 1.00 0.97 0.17 0.00 0.05 0.00 0.06 017756 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 017758 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 017952 G 0.00 0.00 0.26 0.02 0.07 A 1.00 1.00 0.74 0.98 0.93 0.00 0.00 0.39 0.04 0.13 017983 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018041 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018047 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018146 + 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 - 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 018161 T 0.71 0.25 0.34 0.10 0.36 G 0.29 0.75 0.66 0.90 0.64 0.41 0.38 0.45 0.19 0.46 018260 T 0.19 0.59 0.32 0.40 0.37 C 0.81 0.41 0.68 0.60 0.63 0.31 0.48 0.43 0.48 0.46 026581 T 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.15 0.00 0.00 0.00 0.05 026700 G 0.06 0.00 0.02 0.00 0.02 A 0.94 1.00 0.98 1.00 0.98 0.12 0.00 0.05 0.00 0.05 027015 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 027143 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 027229 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 027289 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 027348 G 0.12 0.00 0.02 0.00 0.04 A 0.88 1.00 0.98 1.00 0.96 0.21 0.00 0.04 0.00 0.08 027378 A 0.22 0.03 0.31 0.04 0.16 G 0.78 0.97 0.69 0.96 0.84 0.34 0.05 0.43 0.08 0.26 027552 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 027568 C 0.00 0.03 0.02 0.00 0.01 G 1.00 0.97 0.98 1.00 0.99 0.00 0.05 0.04 0.00 0.02 027605 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 028110 - 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 + 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 028114 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 028120 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 028354 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 028394 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 028416 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 028420 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 028475 G 0.07 0.14 0.00 0.04 0.06 A 0.93 0.86 1.00 0.96 0.94 0.14 0.24 0.00 0.08 0.12 028513 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 028514 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 028774 G 0.41 0.11 0.29 0.06 0.22 A 0.59 0.89 0.71 0.94 0.78 0.48 0.20 0.41 0.12 0.35 035759 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 035835 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 035884 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 036054 C 0.09 0.09 0.30 0.04 0.13 T 0.91 0.91 0.70 0.96 0.87 0.17 0.17 0.42 0.08 0.22 036075 + 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 036103 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 036165 A 0.63 0.25 0.34 0.10 0.34 T 0.37 0.75 0.66 0.90 0.66 0.47 0.38 0.45 0.19 0.45 036249 A 0.12 0.00 0.02 0.00 0.04 G 0.88 1.00 0.98 1.00 0.96 0.21 0.00 0.04 0.00 0.07 036265 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 036274 A 0.08 0.00 0.02 0.00 0.03 G 0.92 1.00 0.98 1.00 0.97 0.15 0.00 0.04 0.00 0.05 036417 G 0.08 0.00 0.02 0.00 0.03 A 0.92 1.00 0.98 1.00 0.97 0.15 0.00 0.04 0.00 0.05 036445 G 0.06 0.05 0.07 0.06 0.06 T 0.94 0.95 0.93 0.94 0.94 0.12 0.09 0.13 0.12 0.11 036519 G 0.31 0.09 0.32 0.04 0.19 C 0.69 0.91 0.68 0.96 0.81 0.43 0.17 0.43 0.08 0.31 036529 G 0.02 0.05 0.02 0.02 0.03 A 0.98 0.95 0.98 0.98 0.97 0.04 0.09 0.04 0.04 0.05 036544 C 0.02 0.05 0.02 0.02 0.03 T 0.98 0.95 0.98 0.98 0.97 0.04 0.09 0.04 0.04 0.05 044112 C 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 044259 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 044423 G 0.11 0.00 0.02 0.00 0.04 A 0.89 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.05 0.00 0.07 044597 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 044819 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 045211 C 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.07 045214 A 0.64 0.31 0.39 0.14 0.39 C 0.36 0.69 0.61 0.86 0.61 0.46 0.43 0.48 0.24 0.47 045369 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 045426 G 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 A 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 045427 T 0.00 0.07 0.05 0.00 0.03 G 1.00 0.93 0.95 1.00 0.97 0.00 0.13 0.09 0.00 0.05 045667 A 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.88 1.00 1.00 1.00 0.97 0.22 0.00 0.00 0.00 0.06 045904 - 0.05 0.07 0.00 0.05 0.04 + 0.95 0.93 1.00 0.95 0.96 0.09 0.13 0.00 0.09 0.07 045908 T 0.05 0.08 0.00 0.05 0.04 C 0.95 0.92 1.00 0.95 0.96 0.10 0.14 0.00 0.09 0.08 051143 + 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 - 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 051226 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 051422 A 0.39 0.16 0.00 0.06 0.16 G 0.61 0.84 1.00 0.94 0.84 0.48 0.27 0.00 0.12 0.28 051440 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 051684 G 0.06 0.00 0.02 0.00 0.02 A 0.94 1.00 0.98 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 0.00 0.04 052078 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 052107 C 0.39 0.16 0.02 0.04 0.16 T 0.61 0.84 0.98 0.96 0.84 0.48 0.27 0.04 0.08 0.28 052143 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 052156 A 0.06 0.02 0.23 0.04 0.09 G 0.94 0.98 0.77 0.96 0.91 0.10 0.04 0.35 0.08 0.16 052507 G 0.09 0.09 0.30 0.04 0.13 A 0.91 0.91 0.70 0.96 0.87 0.17 0.17 0.42 0.08 0.22 052537 A 0.09 0.00 0.02 0.00 0.03 G 0.91 1.00 0.98 1.00 0.97 0.17 0.00 0.04 0.00 0.06 052574 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 052583 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 052713 A 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 052871 G 0.10 0.00 0.02 0.00 0.03 C 0.90 1.00 0.98 1.00 0.97 0.17 0.00 0.04 0.00 0.06 053063 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 069001 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 069105 T 0.37 0.16 0.02 0.06 0.16 C 0.63 0.84 0.98 0.94 0.84 0.46 0.27 0.04 0.12 0.27 069247 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 069372 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 069411 A 0.37 0.16 0.02 0.06 0.16 C 0.63 0.84 0.98 0.94 0.84 0.47 0.27 0.04 0.12 0.27 069635 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 069738 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 070598 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 070620 C 0.37 0.12 0.02 0.06 0.15 G 0.63 0.88 0.98 0.94 0.85 0.46 0.22 0.04 0.12 0.26 070694 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 070926 T 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.88 1.00 1.00 1.00 0.97 0.22 0.00 0.00 0.00 0.06 070946 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 071004 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 071258 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 071274 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 078342 G 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 078630 G 0.20 0.00 0.03 0.00 0.06 A 0.80 1.00 0.97 1.00 0.94 0.33 0.00 0.05 0.00 0.11 078640 G 0.86 0.28 0.17 0.11 0.36 C 0.14 0.72 0.82 0.89 0.64 0.24 0.40 0.29 0.20 0.46 078754 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 079069 A 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.19 0.00 0.00 0.00 0.06 079257 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 079791 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 080462 T 0.19 0.00 0.03 0.00 0.06 G 0.81 1.00 0.97 1.00 0.94 0.31 0.00 0.05 0.00 0.11 080526 G 0.37 0.02 0.03 0.02 0.12 A 0.63 0.98 0.97 0.98 0.88 0.46 0.04 0.05 0.04 0.22 084847 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 084884 + 0.21 0.00 0.02 0.00 0.06 - 0.79 1.00 0.98 1.00 0.94 0.33 0.00 0.05 0.00 0.12 085091 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 085425 G 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 085547 C 0.25 0.03 0.02 0.02 0.08 T 0.75 0.97 0.98 0.98 0.92 0.38 0.05 0.05 0.04 0.15 085656 G 0.05 0.08 0.05 0.00 0.04 A 0.95 0.92 0.95 1.00 0.96 0.09 0.15 0.10 0.00 0.08 085717 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 086060 G 0.04 0.07 0.03 0.00 0.03 A 0.96 0.93 0.97 1.00 0.97 0.07 0.14 0.05 0.00 0.07 086118 G 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 086544 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 086604 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 096236 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 096334 C 0.02 0.02 0.00 0.02 0.02 A 0.98 0.98 1.00 0.98 0.98 0.04 0.04 0.00 0.04 0.03 096765 T 0.06 0.20 0.03 0.05 0.08 C 0.94 0.80 0.97 0.95 0.92 0.11 0.32 0.05 0.10 0.14 096982 A 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 097020 G 0.13 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.87 1.00 1.00 1.00 0.97 0.23 0.00 0.00 0.00 0.07 097202 G 0.06 0.00 0.02 0.00 0.02 A 0.94 1.00 0.98 1.00 0.98 0.10 0.00 0.04 0.00 0.04 097483 A 0.19 0.67 0.38 0.42 0.40 C 0.81 0.33 0.62 0.58 0.60 0.31 0.44 0.47 0.49 0.48 097523 G 0.17 0.17 0.03 0.06 0.11 T 0.83 0.82 0.97 0.94 0.89 0.28 0.29 0.05 0.12 0.20 097561 A 0.22 0.23 0.12 0.06 0.16 G 0.78 0.77 0.88 0.94 0.84 0.35 0.35 0.21 0.12 0.27 097576 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 097820 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 107320 - 0.25 0.70 0.39 0.43 0.44 + 0.75 0.30 0.61 0.57 0.56 0.38 0.42 0.48 0.49 0.49 107363 - 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 107544 T 0.18 0.16 0.02 0.06 0.11 C 0.82 0.84 0.98 0.94 0.89 0.30 0.27 0.05 0.12 0.19 107603 G 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.88 1.00 1.00 1.00 0.97 0.21 0.00 0.00 0.00 0.06 107672 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 107734 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 108004 G 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.88 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 108036 A 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 108043 C 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 108370 C 0.52 0.24 0.12 0.06 0.25 T 0.48 0.76 0.88 0.94 0.75 0.50 0.36 0.22 0.12 0.37 108417 G 0.00 0.07 0.03 0.00 0.02 A 1.00 0.93 0.97 1.00 0.98 0.00 0.14 0.05 0.00 0.05 108509 A 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 109021 - 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 109226 G 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.95 1.00 0.99 0.00 0.00 0.09 0.00 0.02 109250 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 109257 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 109374 T 0.12 0.09 0.50 0.52 0.31 C 0.88 0.91 0.50 0.48 0.69 0.22 0.16 0.50 0.50 0.43 109579 + 0.17 0.16 0.02 0.06 0.11 - 0.83 0.84 0.98 0.94 0.89 0.28 0.27 0.04 0.12 0.19 115584 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 115618 T 0.17 0.60 0.39 0.42 0.38 G 0.83 0.40 0.61 0.58 0.62 0.28 0.48 0.47 0.49 0.47 115619 T 0.17 0.60 0.39 0.42 0.38 A 0.83 0.40 0.61 0.58 0.62 0.28 0.48 0.47 0.49 0.47 116092 A 0.15 0.17 0.02 0.06 0.10 G 0.85 0.83 0.98 0.94 0.90 0.25 0.28 0.04 0.12 0.18 116120 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 116522 C 0.02 0.06 0.05 0.00 0.03 T 0.98 0.94 0.95 1.00 0.97 0.04 0.11 0.09 0.00 0.06 116715 A 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 116868 C 0.05 0.11 0.03 0.00 0.05 T 0.95 0.89 0.97 1.00 0.95 0.10 0.19 0.06 0.00 0.09 116907 + 0.30 0.10 0.50 0.52 0.36 - 0.70 0.90 0.50 0.48 0.64 0.42 0.18 0.50 0.50 0.46 117072 G 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 A 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.05 0.00 0.02 117600 C 0.31 0.16 0.05 0.06 0.15 T 0.69 0.84 0.95 0.94 0.85 0.43 0.27 0.09 0.12 0.26 117615 A 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 117616 G 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 117791 C 0.00 0.02 0.02 0.06 0.03 T 1.00 0.98 0.98 0.94 0.97 0.00 0.05 0.05 0.12 0.05 123386 - 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 + 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 123430 * 123458 T 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 C 0.83 1.00 1.00 1.00 0.95 0.29 0.00 0.00 0.00 0.09 123572 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 123628 A 0.19 0.00 0.02 0.00 0.06 G 0.81 1.00 0.98 1.00 0.94 0.31 0.00 0.04 0.00 0.11 124459 - 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 + 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 124518 G 0.37 0.11 0.50 0.46 0.36 A 0.63 0.89 0.50 0.54 0.64 0.47 0.20 0.50 0.50 0.46 124567 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 124573 T 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 124689 T 0.07 0.09 0.07 0.00 0.06 C 0.93 0.91 0.93 1.00 0.94 0.14 0.17 0.13 0.00 0.11 124714 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 125055 C 0.07 0.06 0.03 0.03 0.05 T 0.93 0.94 0.97 0.97 0.95 0.13 0.11 0.05 0.06 0.09 125108 A 0.08 0.08 0.03 0.03 0.06 G 0.92 0.92 0.97 0.97 0.94 0.15 0.15 0.05 0.06 0.11 125219 G 0.21 0.00 0.00 0.00 0.06 T 0.79 1.00 1.00 1.00 0.94 0.33 0.00 0.00 0.00 0.12 130764 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 130863 G 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 130942 G 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 131204 T 0.02 0.10 0.07 0.00 0.04 C 0.98 0.90 0.93 1.00 0.96 0.04 0.17 0.13 0.00 0.08 131224 G 0.38 0.10 0.50 0.46 0.36 A 0.62 0.90 0.50 0.54 0.64 0.47 0.17 0.50 0.50 0.46 131260 G 0.06 0.00 0.02 0.00 0.02 A 0.94 1.00 0.98 1.00 0.98 0.11 0.00 0.04 0.00 0.04 131496 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 132018 - 0.65 0.20 0.59 0.46 0.48 + 0.35 0.80 0.41 0.54 0.52 0.46 0.33 0.48 0.50 0.50 132056 T 0.26 0.09 0.09 0.00 0.12 C 0.74 0.91 0.91 1.00 0.88 0.38 0.17 0.17 0.00 0.20 132179 T 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 132214 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 132340 G 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.88 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 132548 G 0.27 0.08 0.10 0.00 0.12 A 0.73 0.92 0.90 1.00 0.88 0.39 0.15 0.18 0.00 0.21 141566 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 141587 C 0.24 0.07 0.48 0.46 0.31 A 0.76 0.93 0.52 0.54 0.69 0.36 0.13 0.50 0.50 0.43 141677 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 142503 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 142595 T 0.40 0.00 0.00 0.00 0.11 C 0.60 1.00 1.00 1.00 0.89 0.48 0.00 0.00 0.00 0.19 142631 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 142653 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 142692 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 142742 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 150127 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 150156 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 150427 G 0.29 0.09 0.50 0.45 0.33 A 0.71 0.91 0.50 0.55 0.67 0.41 0.17 0.50 0.50 0.44 150602 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 150899 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 151920 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 151987 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 152009 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 152044 T 0.19 0.59 0.38 0.40 0.38 C 0.81 0.41 0.62 0.60 0.62 0.31 0.48 0.47 0.48 0.47 152264 T 0.00 0.07 0.10 0.00 0.04 A 1.00 0.93 0.90 1.00 0.96 0.00 0.13 0.17 0.00 0.08 159098 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 159116 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 159205 C 0.19 0.03 0.07 0.00 0.08 T 0.81 0.97 0.93 1.00 0.92 0.30 0.05 0.13 0.00 0.14 160576 G 0.19 0.02 0.07 0.00 0.07 A 0.81 0.98 0.93 1.00 0.93 0.30 0.04 0.13 0.00 0.14 160738 C 0.19 0.02 0.07 0.00 0.07 T 0.81 0.98 0.93 1.00 0.93 0.30 0.04 0.13 0.00 0.14 160931 T 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.97 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 187538 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 187575 C 0.06 0.00 0.02 0.12 0.05 A 0.94 1.00 0.98 0.88 0.95 0.11 0.00 0.04 0.22 0.10 187818 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 187856 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 187970 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 188254 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 189150 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 189216 T 0.41 0.23 0.25 0.40 0.33 C 0.59 0.77 0.75 0.60 0.67 0.48 0.35 0.38 0.48 0.44 189333 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 189414 - 0.02 0.00 0.09 0.15 0.06 + 0.98 1.00 0.91 0.85 0.94 0.04 0.00 0.17 0.25 0.12 189711 C 0.05 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.95 1.00 1.00 1.00 0.98 0.09 0.00 0.00 0.00 0.03 189730 - 0.08 0.00 0.03 0.12 0.06 + 0.92 1.00 0.97 0.88 0.94 0.14 0.00 0.06 0.22 0.11 194646 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 194740 C 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 194944 T 0.02 0.00 0.00 0.02 0.01 C 0.98 1.00 1.00 0.98 0.99 0.04 0.00 0.00 0.04 0.02 195551 G 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 195613 + 0.33 0.18 0.29 0.39 0.30 - 0.67 0.82 0.71 0.61 0.70 0.44 0.30 0.41 0.48 0.42 195709 - 0.38 0.26 0.29 0.39 0.34 + 0.62 0.74 0.71 0.61 0.66 0.47 0.39 0.41 0.48 0.45 195864 C 0.15 0.02 0.25 0.04 0.12 T 0.85 0.98 0.75 0.96 0.88 0.26 0.05 0.38 0.08 0.21 196115 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 196314 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 196360 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 196435 A 0.07 0.00 0.00 0.08 0.04 G 0.93 1.00 1.00 0.92 0.96 0.12 0.00 0.00 0.15 0.07 196710 - 0.00 0.07 0.02 0.00 0.02 + 1.00 0.93 0.98 1.00 0.98 0.00 0.13 0.05 0.00 0.04 196734 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 196794 A 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 196803 T 0.06 0.00 0.00 0.08 0.03 A 0.94 1.00 1.00 0.92 0.97 0.10 0.00 0.00 0.15 0.06 205038 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 205072 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 205127 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 205692 A 0.02 0.00 0.11 0.17 0.08 C 0.98 1.00 0.89 0.83 0.92 0.04 0.00 0.20 0.29 0.14 206005 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 206028 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 206050 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 206057 + 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 - 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 206205 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 206686 + 0.11 0.02 0.23 0.04 0.10 - 0.89 0.98 0.77 0.96 0.90 0.20 0.04 0.35 0.08 0.18 206896 A 0.11 0.59 0.39 0.54 0.39 G 0.89 0.41 0.61 0.46 0.61 0.20 0.48 0.47 0.50 0.48 207213 G 0.02 0.02 0.02 0.00 0.02 A 0.98 0.98 0.98 1.00 0.98 0.04 0.04 0.04 0.00 0.03 209146 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 209263 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 209365 G 0.09 0.59 0.38 0.58 0.40 T 0.91 0.41 0.62 0.42 0.60 0.17 0.48 0.47 0.49 0.48 209551 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 209581 A 0.11 0.59 0.38 0.54 0.39 G 0.89 0.41 0.62 0.46 0.61 0.20 0.48 0.47 0.50 0.48 209758 G 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 209844 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 209898 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 210249 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 210508 T 0.02 0.11 0.03 0.00 0.04 C 0.98 0.89 0.97 1.00 0.96 0.04 0.19 0.06 0.00 0.08 211415 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 211481 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 211502 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 211596 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 212646 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 212659 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 212804 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 212933 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 213333 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 213388 A 0.11 0.02 0.24 0.00 0.09 G 0.89 0.98 0.76 1.00 0.91 0.20 0.04 0.36 0.00 0.17 224234 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 224320 + 0.28 0.20 0.14 0.27 0.23 - 0.72 0.80 0.86 0.73 0.77 0.40 0.33 0.24 0.39 0.35 224467 A 0.52 0.24 0.17 0.23 0.30 T 0.48 0.76 0.82 0.78 0.70 0.50 0.36 0.29 0.35 0.42 224771 G 0.11 0.11 0.18 0.19 0.15 A 0.89 0.89 0.82 0.81 0.85 0.20 0.20 0.30 0.30 0.25 224774 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 224820 T 0.69 0.30 0.41 0.31 0.44 C 0.31 0.70 0.59 0.69 0.56 0.43 0.42 0.48 0.43 0.49 224831 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 224876 A 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 225051 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 225101 C 0.00 0.06 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.94 1.00 1.00 0.99 0.00 0.10 0.00 0.00 0.02 225350 C 0.08 0.00 0.00 0.14 0.06 A 0.92 1.00 1.00 0.86 0.94 0.14 0.00 0.00 0.24 0.12 225432 C 0.05 0.08 0.07 0.00 0.05 T 0.95 0.92 0.93 1.00 0.95 0.09 0.15 0.12 0.00 0.09 225601 C 0.25 0.06 0.07 0.00 0.10 T 0.75 0.94 0.93 1.00 0.90 0.38 0.10 0.12 0.00 0.19 225873 T 0.15 0.02 0.20 0.04 0.11 A 0.85 0.98 0.80 0.96 0.89 0.25 0.04 0.33 0.08 0.19 226119 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 226137 G 0.02 0.07 0.14 0.21 0.11 A 0.98 0.93 0.86 0.79 0.89 0.04 0.13 0.24 0.33 0.19 226420 T 0.09 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.91 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 226423 C 0.11 0.00 0.02 0.13 0.07 T 0.89 1.00 0.98 0.87 0.93 0.20 0.00 0.04 0.23 0.13 226454 G 0.20 0.41 0.36 0.72 0.41 T 0.80 0.59 0.64 0.28 0.59 0.32 0.48 0.46 0.41 0.49 226476 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 226528 A 0.00 0.05 0.02 0.00 0.02 C 1.00 0.95 0.98 1.00 0.98 0.00 0.09 0.04 0.00 0.03 234989 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 234995 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 235065 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 235090 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 235249 C 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 T 1.00 1.00 1.00 0.92 0.98 0.00 0.00 0.00 0.15 0.04 235563 A 0.00 0.20 0.09 0.00 0.07 C 1.00 0.80 0.91 1.00 0.93 0.00 0.33 0.17 0.00 0.13 235657 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 235682 A 0.00 0.20 0.09 0.00 0.07 G 1.00 0.80 0.91 1.00 0.93 0.00 0.33 0.17 0.00 0.13 235816 G 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 A 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.04 0.00 0.02 235947 A 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 236034 G 0.07 0.20 0.09 0.17 0.13 A 0.93 0.80 0.91 0.83 0.87 0.14 0.33 0.17 0.28 0.23 236199 G 0.20 0.23 0.30 0.08 0.20 A 0.80 0.77 0.70 0.92 0.80 0.32 0.35 0.42 0.15 0.32 236457 A 0.00 0.00 0.09 0.00 0.02 C 1.00 1.00 0.91 1.00 0.98 0.00 0.00 0.17 0.00 0.04 236650 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 236721 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 236778 C 0.07 0.00 0.02 0.12 0.06 T 0.93 1.00 0.98 0.88 0.94 0.14 0.00 0.04 0.22 0.11 236937 A 0.00 0.20 0.09 0.00 0.07 G 1.00 0.80 0.91 1.00 0.93 0.00 0.33 0.17 0.00 0.13 236955 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 237210 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 237250 T 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 244362 C 0.33 0.26 0.33 0.43 0.34 G 0.67 0.74 0.67 0.57 0.66 0.44 0.39 0.44 0.49 0.45 244413 C 0.48 0.34 0.42 0.55 0.45 T 0.52 0.66 0.58 0.45 0.55 0.50 0.45 0.49 0.50 0.50 244482 C 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.15 0.00 0.00 0.00 0.05 244616 G 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 245745 + 0.19 0.00 0.19 0.09 0.12 - 0.81 1.00 0.81 0.91 0.88 0.30 0.00 0.31 0.17 0.21 245907 A 0.39 0.65 0.50 0.34 0.47 G 0.61 0.35 0.50 0.66 0.53 0.48 0.46 0.50 0.45 0.50 246041 T 0.09 0.29 0.25 0.22 0.21 G 0.91 0.71 0.75 0.78 0.79 0.16 0.42 0.38 0.35 0.33 246129 + 0.20 0.00 0.20 0.09 0.13 - 0.80 1.00 0.80 0.91 0.87 0.32 0.00 0.32 0.16 0.22 246221 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 246231 G 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 252713 C 0.08 0.00 0.21 0.00 0.07 T 0.92 1.00 0.79 1.00 0.93 0.15 0.00 0.33 0.00 0.13 253021 C 0.06 0.11 0.09 0.00 0.06 A 0.94 0.89 0.91 1.00 0.94 0.11 0.20 0.17 0.00 0.12 253174 C 0.46 0.25 0.41 0.59 0.43 T 0.54 0.75 0.59 0.41 0.57 0.50 0.38 0.48 0.48 0.49 253279 C 0.15 0.27 0.16 0.24 0.20 A 0.85 0.73 0.84 0.76 0.80 0.26 0.40 0.27 0.36 0.33 253300 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 253677 T 0.17 0.02 0.19 0.02 0.10 G 0.83 0.98 0.81 0.98 0.90 0.28 0.04 0.31 0.04 0.18 253687 G 0.17 0.02 0.19 0.02 0.10 C 0.83 0.98 0.81 0.98 0.90 0.28 0.04 0.31 0.04 0.18 253816 T 0.06 0.11 0.11 0.15 0.11 G 0.94 0.89 0.89 0.85 0.89 0.10 0.20 0.20 0.25 0.19 253825 T 0.00 0.00 0.02 0.15 0.04 G 1.00 1.00 0.98 0.85 0.96 0.00 0.00 0.04 0.25 0.08 253852 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 253965 G 0.17 0.02 0.21 0.02 0.11 A 0.83 0.98 0.79 0.98 0.89 0.28 0.04 0.34 0.04 0.19 254138 T 0.00 0.00 0.02 0.15 0.04 C 1.00 1.00 0.98 0.85 0.96 0.00 0.00 0.05 0.25 0.08 254155 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 254177 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 254259 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 254624 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 254644 A 0.00 0.20 0.09 0.00 0.07 G 1.00 0.80 0.91 1.00 0.93 0.00 0.33 0.17 0.00 0.13 254721 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 255757 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 255761 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 255797 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 263269 T 0.04 0.00 0.00 0.02 0.02 C 0.96 1.00 1.00 0.98 0.98 0.08 0.00 0.00 0.04 0.03 263319 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 263323 + 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 263511 G 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 263551 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 264484 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 265116 G 0.56 0.55 0.29 0.31 0.44 T 0.44 0.45 0.71 0.69 0.56 0.49 0.49 0.42 0.43 0.49 265205 A 0.59 0.56 0.31 0.34 0.46 G 0.41 0.44 0.69 0.66 0.54 0.48 0.49 0.43 0.45 0.50 271336 T 0.11 0.00 0.03 0.00 0.04 G 0.89 1.00 0.97 1.00 0.96 0.20 0.00 0.05 0.00 0.07 271530 C 0.26 0.20 0.14 0.00 0.15 T 0.74 0.80 0.86 1.00 0.85 0.39 0.32 0.24 0.00 0.26 271566 G 0.12 0.20 0.11 0.00 0.11 A 0.88 0.80 0.89 1.00 0.89 0.21 0.32 0.20 0.00 0.19 271751 T 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 272426 T 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 C 1.00 1.00 1.00 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.22 0.06 272577 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 272588 G 0.42 0.68 0.33 0.40 0.46 A 0.58 0.32 0.68 0.60 0.54 0.49 0.43 0.44 0.48 0.50 272799 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 273063 + 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 - 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 273552 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 273566 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 273890 A 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.05 0.00 0.02 273915 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 281179 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 281309 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 281544 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 281860 - 0.30 0.25 0.55 0.63 0.43 + 0.70 0.75 0.45 0.37 0.57 0.42 0.38 0.50 0.47 0.49 282621 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 282662 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 282949 A 0.00 0.02 0.03 0.00 0.01 G 1.00 0.98 0.97 1.00 0.99 0.00 0.04 0.05 0.00 0.02 282993 G 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 283278 C 0.31 0.20 0.16 0.00 0.17 T 0.69 0.80 0.84 1.00 0.83 0.43 0.33 0.27 0.00 0.28 283316 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 283592 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 283760 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 283800 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 285365 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 285377 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 285410 G 0.00 0.02 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.00 0.04 0.02 285434 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 286008 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 286160 A 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 286338 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 286749 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 286788 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 286815 C 0.13 0.00 0.00 0.00 0.04 T 0.87 1.00 1.00 1.00 0.96 0.23 0.00 0.00 0.00 0.07 287153 - 0.13 0.00 0.02 0.00 0.04 + 0.87 1.00 0.98 1.00 0.96 0.23 0.00 0.05 0.00 0.08 287868 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 287937 - 0.13 0.17 0.14 0.00 0.11 + 0.87 0.83 0.86 1.00 0.89 0.23 0.28 0.24 0.00 0.19 287945 + 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 - 1.00 1.00 1.00 0.95 0.99 0.00 0.00 0.00 0.10 0.02 288082 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 288733 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 289039 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 289202 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 289392 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 289437 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 289896 G 0.46 0.39 0.31 0.38 0.39 A 0.54 0.61 0.69 0.62 0.61 0.50 0.48 0.43 0.47 0.48 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002141: TAC 002815: c 003184: A 016614: TA 018146: tTCTCTCtt 028110: a 036075: A 045904: aat 051143: a 079257: g 084884: t 107320: T 107363: T 109021: gaa 109579: T 116907: T 123386: c 124459: gact 132018: A 142653: c 187538: t 189414: GA 189730: CA 195613: A 195709: t 196314: gtct 196710: t 206057: ga 206686: A 224320: GTCA 234995: a 236721: tagccata 245745: TTGT 246129: T 263323: t 273063: T 281860: tagc 283592: aaaa 283800: aaagaacctt 287153: T 287937: cttttttt 287945: cttttttt Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop 123430 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 0.10 0.09 0.07 0.00 0.06 G 0.90 0.91 0.93 0.98 0.93