Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Total-hz 000183 C 0.08 G 0.92 0.14 000201 C 0.03 G 0.97 0.07 000255 T 0.02 C 0.98 0.03 000345 A 0.15 C 0.85 0.25 000758 C 0.01 T 0.99 0.02 000852 T 0.02 C 0.98 0.05 001400 A 0.01 G 0.99 0.01 001430 G 0.02 A 0.98 0.03 001578 C 0.25 T 0.75 0.37 001592 T 0.49 G 0.51 0.50 001731 T 0.01 G 0.99 0.01 001754 A 0.01 G 0.99 0.01 001912 C 0.02 G 0.98 0.03 001965 A 0.01 G 0.99 0.01 001972 A 0.01 G 0.99 0.01 001977 C 0.15 T 0.85 0.25 002312 G 0.01 T 0.99 0.01 002563 C 0.03 A 0.97 0.05 002832 G 0.01 C 0.99 0.01 002848 A 0.01 G 0.99 0.01 003200 A 0.04 C 0.96 0.08 003715 T 0.01 G 0.99 0.01 003724 T 0.01 A 0.99 0.02 003796 A 0.01 G 0.99 0.01 004094 A 0.01 G 0.99 0.02 004132 G 0.06 C 0.94 0.11 004153 G 0.01 C 0.99 0.01 004254 A 0.01 G 0.99 0.02 004333 A 0.04 G 0.96 0.08 004400 T 0.01 C 0.99 0.02 004401 G 0.01 C 0.99 0.02 004581 T 0.02 A 0.98 0.03 004711 A 0.01 G 0.99 0.01 004735 T 0.01 G 0.99 0.01 005229 T 0.12 C 0.88 0.22 005481 - 0.01 + 0.99 0.01 005547 C 0.01 A 0.99 0.01 005624 - 0.01 + 0.99 0.02 005675 T 0.03 C 0.97 0.06 005741 G 0.03 C 0.97 0.06 005803 C 0.01 T 0.99 0.02 005808 G 0.19 C 0.81 0.31 005892 A 0.04 C 0.96 0.07 005944 A 0.06 G 0.94 0.12 006060 T 0.14 C 0.86 0.25 006079 G 0.43 C 0.57 0.49 006081 * 006168 G 0.07 C 0.93 0.14 006195 T 0.01 C 0.99 0.01 006414 T 0.41 C 0.59 0.49 006972 T 0.17 C 0.83 0.28 006973 + 0.17 - 0.83 0.28 007274 C 0.02 G 0.98 0.03 007320 T 0.01 C 0.99 0.01 007409 A 0.11 G 0.89 0.20 007875 A 0.01 G 0.99 0.01 007906 T 0.01 G 0.99 0.02 007931 A 0.01 C 0.99 0.01 008109 T 0.01 C 0.99 0.01 008137 G 0.16 A 0.84 0.27 008168 A 0.01 G 0.99 0.01 008224 G 0.04 A 0.96 0.07 008237 C 0.01 T 0.99 0.01 008329 A 0.02 G 0.98 0.04 008403 G 0.01 A 0.99 0.01 008483 G 0.11 C 0.89 0.20 008523 A 0.08 G 0.92 0.14 008647 T 0.41 C 0.59 0.48 008648 A 0.02 G 0.98 0.03 008792 G 0.43 C 0.57 0.49 008798 T 0.18 G 0.82 0.30 008804 C 0.19 G 0.81 0.31 008852 C 0.19 T 0.81 0.30 008901 T 0.01 C 0.99 0.01 009029 C 0.01 T 0.99 0.01 009062 T 0.01 G 0.99 0.01 009111 G 0.47 A 0.53 0.50 009186 - 0.01 + 0.99 0.02 009208 A 0.01 G 0.99 0.01 009281 A 0.01 G 0.99 0.03 009562 A 0.01 G 0.99 0.01 009685 T 0.01 C 0.99 0.01 009686 A 0.02 G 0.98 0.03 009904 T 0.01 C 0.99 0.01 010237 A 0.01 G 0.99 0.02 010292 T 0.01 C 0.99 0.02 010300 A 0.01 C 0.99 0.01 010360 A 0.01 G 0.99 0.01 010604 C 0.01 T 0.99 0.02 010754 T 0.01 C 0.99 0.01 010801 + 0.01 - 0.99 0.01 011068 T 0.01 C 0.99 0.01 011195 T 0.01 G 0.99 0.01 011198 T 0.01 C 0.99 0.01 011265 T 0.35 C 0.65 0.46 011486 A 0.01 G 0.99 0.01 011841 G 0.01 A 0.99 0.01 011843 - 0.06 + 0.94 0.12 011972 G 0.07 T 0.93 0.14 012346 A 0.01 G 0.99 0.01 012381 A 0.01 G 0.99 0.02 012444 T 0.01 C 0.99 0.03 012610 A 0.01 G 0.99 0.02 012872 A 0.01 C 0.99 0.01 012916 A 0.01 G 0.99 0.02 012975 A 0.03 G 0.97 0.05 012989 C 0.01 T 0.99 0.01 013130 G 0.10 C 0.90 0.19 013157 C 0.40 T 0.60 0.48 013199 G 0.05 T 0.95 0.10 013313 A 0.01 G 0.99 0.01 013327 C 0.01 T 0.99 0.02 013403 C 0.19 A 0.81 0.31 013451 T 0.31 C 0.69 0.43 013488 A 0.01 G 0.99 0.02 013759 G 0.36 A 0.64 0.46 013900 A 0.01 C 0.99 0.03 014114 C 0.20 A 0.80 0.32 014317 A 0.04 G 0.96 0.07 014370 C 0.11 T 0.89 0.20 014446 A 0.01 G 0.99 0.01 014463 G 0.02 A 0.98 0.03 014503 T 0.01 C 0.99 0.01 Note: Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 005481: G 005624: t 006973: t 009186: t 010801: CTCTC 011843: g Tri-allelic sites: Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Allele3 Total-pop 006081 G 0.01 C 0.17 T 0.83