Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Total-hz 000341 - 0.38 + 0.62 0.47 000545 A 0.01 T 0.99 0.01 000893 A 0.04 G 0.96 0.08 000946 A 0.01 G 0.99 0.02 000989 T 0.04 G 0.96 0.08 001013 C 0.11 T 0.89 0.19 001055 T 0.01 C 0.99 0.01 001108 A 0.22 G 0.78 0.35 001192 G 0.47 T 0.53 0.50 001428 G 0.23 A 0.77 0.35 001482 G 0.01 C 0.99 0.01 001525 T 0.46 A 0.54 0.50 001607 C 0.23 T 0.77 0.35 001627 C 0.32 T 0.68 0.44 001955 T 0.07 C 0.93 0.14 002135 A 0.32 G 0.68 0.43 002150 C 0.04 A 0.96 0.08 002151 T 0.04 A 0.96 0.08 002465 C 0.01 A 0.99 0.01 002815 A 0.07 G 0.93 0.13 003171 G 0.01 A 0.99 0.01 003242 T 0.01 C 0.99 0.01 003388 G 0.01 A 0.99 0.01 003390 - 0.01 + 0.99 0.01 003622 G 0.01 C 0.99 0.01 003774 A 0.28 G 0.72 0.41 003875 T 0.09 C 0.91 0.17 003987 T 0.01 A 0.99 0.02 004010 T 0.01 C 0.99 0.01 004027 G 0.01 A 0.99 0.01 004053 A 0.01 G 0.99 0.01 004182 A 0.08 C 0.92 0.15 004264 - 0.01 + 0.99 0.01 004280 T 0.24 G 0.76 0.37 004521 A 0.08 G 0.92 0.15 004673 G 0.07 A 0.93 0.14 004794 T 0.08 C 0.92 0.15 004800 C 0.03 T 0.97 0.05 004864 A 0.01 G 0.99 0.02 005153 T 0.16 A 0.84 0.27 005168 G 0.30 A 0.70 0.42 005567 A 0.20 G 0.80 0.32 005671 T 0.02 A 0.98 0.05 005739 G 0.01 A 0.99 0.02 006246 A 0.18 G 0.82 0.30 006308 G 0.01 A 0.99 0.01 006504 A 0.03 G 0.97 0.05 006735 A 0.01 G 0.99 0.01 006830 T 0.03 C 0.97 0.07 006942 T 0.01 C 0.99 0.01 006959 G 0.01 A 0.99 0.01 007129 C 0.15 A 0.85 0.26 007334 G 0.44 A 0.56 0.49 007355 A 0.24 T 0.76 0.37 007361 + 0.22 - 0.78 0.34 008071 C 0.01 T 0.99 0.01 008098 A 0.02 G 0.98 0.03 008118 G 0.01 C 0.99 0.01 008372 G 0.06 A 0.94 0.12 008877 A 0.02 C 0.98 0.04 008929 G 0.01 A 0.99 0.02 008948 T 0.01 C 0.99 0.01 008962 T 0.01 C 0.99 0.01 008997 G 0.01 A 0.99 0.01 009025 G 0.05 C 0.95 0.10 009081 T 0.05 C 0.95 0.10 009130 C 0.01 G 0.99 0.01 009173 T 0.35 C 0.65 0.45 009243 C 0.25 T 0.75 0.37 009257 - 0.02 + 0.98 0.03 009318 A 0.01 G 0.99 0.01 009320 A 0.01 T 0.99 0.01 009413 G 0.01 A 0.99 0.02 009467 A 0.03 G 0.97 0.07 009562 C 0.14 A 0.86 0.24 009739 G 0.26 A 0.74 0.38 009758 T 0.29 C 0.71 0.41 009819 C 0.01 T 0.99 0.01 009879 C 0.17 T 0.83 0.29 009964 T 0.23 C 0.77 0.36 010085 C 0.01 T 0.99 0.01 010274 A 0.05 G 0.95 0.09 010300 G 0.01 A 0.99 0.01 010431 T 0.08 C 0.92 0.14 010712 * 010741 T 0.03 C 0.97 0.05 010784 + 0.05 - 0.95 0.09 011042 T 0.01 C 0.99 0.03 011200 G 0.09 T 0.91 0.16 011201 A 0.09 C 0.91 0.16 011359 T 0.01 C 0.99 0.01 011360 A 0.01 G 0.99 0.01 011606 A 0.04 G 0.96 0.07 011645 A 0.01 T 0.99 0.01 011654 T 0.08 C 0.92 0.14 012032 A 0.08 G 0.92 0.14 Note: Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000341: G 003390: t 004264: ag 007361: C 009257: at 010784: T Tri-allelic sites: Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Allele3 Total-pop 010712 G 0.01 C 0.01 T 0.98