Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000779 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 000803 G 0.19 0.05 0.05 0.09 0.10 C 0.81 0.95 0.95 0.91 0.90 0.30 0.09 0.09 0.16 0.17 001432 T 0.00 0.05 0.05 0.00 0.02 C 1.00 0.95 0.95 1.00 0.98 0.00 0.09 0.09 0.00 0.04 001583 - 0.26 0.05 0.05 0.09 0.12 + 0.74 0.95 0.95 0.91 0.88 0.38 0.09 0.09 0.16 0.21 001728 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 002199 + 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 - 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 002219 A 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.97 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 002258 - 0.02 0.00 0.00 0.08 0.03 + 0.98 1.00 1.00 0.92 0.97 0.04 0.00 0.00 0.15 0.05 002337 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 002790 G 0.31 0.05 0.09 0.10 0.15 T 0.69 0.95 0.91 0.90 0.85 0.43 0.09 0.17 0.19 0.25 002869 + 0.28 0.05 0.11 0.17 0.16 - 0.72 0.95 0.89 0.83 0.84 0.40 0.09 0.20 0.28 0.27 002992 - 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 + 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 003117 - 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 + 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 003479 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 003608 T 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 003694 G 0.66 0.50 0.16 0.42 0.43 A 0.34 0.50 0.84 0.57 0.57 0.45 0.50 0.27 0.49 0.49 004024 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 004064 C 0.02 0.07 0.00 0.07 0.04 G 0.98 0.93 1.00 0.93 0.96 0.04 0.13 0.00 0.13 0.07 004070 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 004089 C 0.60 0.50 0.16 0.43 0.43 T 0.40 0.50 0.84 0.57 0.57 0.48 0.50 0.27 0.49 0.49 004747 T 0.00 0.00 0.09 0.00 0.02 C 1.00 1.00 0.91 1.00 0.98 0.00 0.00 0.17 0.00 0.04 004923 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 004995 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 005343 + 0.46 0.41 0.09 0.30 0.32 - 0.54 0.59 0.91 0.70 0.68 0.50 0.48 0.17 0.42 0.44 005462 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 005526 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 005950 C 0.07 0.00 0.05 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.95 1.00 0.97 0.14 0.00 0.09 0.00 0.06 006209 + 0.24 0.23 0.45 0.30 0.30 - 0.76 0.78 0.55 0.70 0.70 0.37 0.35 0.50 0.42 0.42 006559 T 0.17 0.03 0.00 0.00 0.05 C 0.83 0.97 1.00 1.00 0.95 0.28 0.05 0.00 0.00 0.10 006583 + 0.12 0.00 0.02 0.00 0.04 - 0.88 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.04 0.00 0.07 006804 T 0.17 0.07 0.03 0.09 0.09 A 0.83 0.93 0.97 0.91 0.91 0.28 0.14 0.05 0.16 0.16 007013 A 0.14 0.30 0.45 0.34 0.30 C 0.86 0.70 0.55 0.66 0.70 0.24 0.42 0.49 0.45 0.42 007091 C 0.11 0.00 0.02 0.00 0.04 A 0.89 1.00 0.98 1.00 0.96 0.20 0.00 0.05 0.00 0.08 007293 - 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 + 1.00 1.00 1.00 0.95 0.99 0.00 0.00 0.00 0.09 0.02 007303 G 0.15 0.55 0.19 0.23 0.27 A 0.85 0.45 0.81 0.77 0.73 0.25 0.50 0.31 0.35 0.39 007667 C 0.12 0.09 0.16 0.18 0.14 T 0.88 0.91 0.84 0.82 0.86 0.22 0.16 0.27 0.30 0.24 007814 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 008097 + 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.03 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001583: GA 002199: ACCCCC 002258: GCT 002869: G 002992: CAGA 003117: G 005343: TT 006209: A 006583: T 007293: C 008097: T