Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000173 T 0.12 0.24 0.28 0.11 0.18 A 0.88 0.76 0.72 0.89 0.82 0.20 0.36 0.40 0.19 0.29 000576 G 0.10 0.24 0.28 0.10 0.17 C 0.90 0.76 0.72 0.90 0.83 0.18 0.36 0.40 0.17 0.28 000672 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000986 + 0.00 0.00 0.03 0.04 0.02 - 1.00 1.00 0.97 0.96 0.98 0.00 0.00 0.05 0.08 0.03 001022 C 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 001023 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 001030 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001133 C 0.12 0.25 0.25 0.10 0.17 T 0.88 0.75 0.75 0.90 0.83 0.20 0.38 0.38 0.19 0.29 003126 C 0.00 0.00 0.03 0.05 0.02 G 1.00 1.00 0.97 0.95 0.98 0.00 0.00 0.05 0.09 0.03 003596 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 003846 G 0.16 0.00 0.03 0.00 0.05 C 0.84 1.00 0.97 1.00 0.95 0.27 0.00 0.05 0.00 0.10 003851 G 0.00 0.00 0.12 0.00 0.03 C 1.00 1.00 0.88 1.00 0.97 0.00 0.00 0.22 0.00 0.06 003950 A 0.17 0.00 0.03 0.00 0.05 G 0.83 1.00 0.97 1.00 0.95 0.28 0.00 0.05 0.00 0.10 004115 A 0.00 0.05 0.03 0.00 0.02 G 1.00 0.95 0.97 1.00 0.98 0.00 0.10 0.05 0.00 0.03 004470 G 0.05 0.37 0.19 0.17 0.19 A 0.95 0.63 0.81 0.83 0.81 0.09 0.47 0.30 0.28 0.30 012345 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 012538 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 012814 + 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 012935 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 012973 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 013046 C 0.02 0.00 0.00 0.15 0.04 A 0.98 1.00 1.00 0.85 0.96 0.04 0.00 0.00 0.26 0.08 014924 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 015558 C 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 015577 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 015800 A 0.02 0.35 0.24 0.17 0.19 T 0.98 0.65 0.76 0.83 0.81 0.04 0.45 0.36 0.28 0.30 015881 - 0.02 0.00 0.00 0.02 0.01 + 0.98 1.00 1.00 0.98 0.99 0.04 0.00 0.00 0.04 0.02 024088 G 0.02 0.33 0.24 0.17 0.18 T 0.98 0.67 0.76 0.83 0.82 0.04 0.44 0.36 0.29 0.29 024240 C 0.02 0.00 0.03 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.97 1.00 0.99 0.04 0.00 0.05 0.00 0.02 024250 A 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 024286 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 024392 G 0.04 0.36 0.23 0.17 0.19 C 0.96 0.64 0.78 0.83 0.81 0.07 0.46 0.35 0.29 0.30 024717 G 0.02 0.00 0.02 0.13 0.04 A 0.98 1.00 0.98 0.87 0.96 0.04 0.00 0.04 0.23 0.08 024799 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 024947 C 0.15 0.00 0.02 0.00 0.05 T 0.85 1.00 0.98 1.00 0.95 0.25 0.00 0.04 0.00 0.09 025495 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 025912 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 025975 T 0.28 0.00 0.02 0.00 0.08 G 0.72 1.00 0.98 1.00 0.92 0.41 0.00 0.05 0.00 0.15 026121 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 027514 T 0.35 0.00 0.02 0.00 0.11 C 0.65 1.00 0.98 1.00 0.89 0.45 0.00 0.04 0.00 0.19 027721 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 031846 G 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 031849 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 032314 G 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 A 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.05 0.00 0.02 032533 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 032627 C 0.54 0.00 0.05 0.00 0.16 G 0.46 1.00 0.95 1.00 0.84 0.50 0.00 0.09 0.00 0.28 032825 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 032859 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 032941 A 0.02 0.18 0.14 0.17 0.12 G 0.98 0.82 0.86 0.83 0.88 0.04 0.30 0.24 0.28 0.21 033148 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 033256 - 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 033285 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 033589 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 033743 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 034006 C 0.02 0.18 0.17 0.17 0.13 T 0.98 0.82 0.83 0.83 0.87 0.04 0.30 0.28 0.28 0.22 034713 G 0.02 0.34 0.24 0.17 0.18 A 0.98 0.66 0.76 0.83 0.82 0.04 0.45 0.36 0.28 0.30 035067 A 0.56 0.00 0.05 0.00 0.17 G 0.44 1.00 0.95 1.00 0.83 0.49 0.00 0.10 0.00 0.29 035110 G 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 035519 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 035555 A 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 035685 C 0.12 0.30 0.18 0.11 0.17 T 0.88 0.70 0.82 0.89 0.83 0.20 0.42 0.30 0.19 0.29 042366 A 0.00 0.00 0.03 0.03 0.01 G 1.00 1.00 0.97 0.97 0.99 0.00 0.00 0.06 0.06 0.03 042466 A 0.25 0.56 0.50 0.72 0.47 G 0.75 0.44 0.50 0.28 0.53 0.38 0.49 0.50 0.40 0.50 042546 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 042558 T 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 042832 T 0.24 0.50 0.56 0.77 0.48 A 0.76 0.50 0.44 0.23 0.52 0.36 0.50 0.49 0.35 0.50 043131 A 0.04 0.02 0.00 0.10 0.04 G 0.96 0.98 1.00 0.90 0.96 0.07 0.05 0.00 0.19 0.08 043643 C 0.50 0.31 0.27 0.10 0.30 G 0.50 0.69 0.73 0.90 0.70 0.50 0.43 0.40 0.19 0.42 043914 A 0.04 0.18 0.14 0.17 0.13 G 0.96 0.82 0.86 0.83 0.87 0.07 0.30 0.24 0.28 0.22 044080 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 044171 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 044186 A 0.02 0.17 0.14 0.17 0.12 C 0.98 0.83 0.86 0.83 0.88 0.04 0.28 0.24 0.28 0.21 044257 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 044269 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 044302 - 0.26 0.53 0.57 0.60 0.48 + 0.74 0.47 0.42 0.40 0.52 0.38 0.50 0.49 0.48 0.50 044422 G 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 044574 T 0.02 0.00 0.00 0.02 0.01 C 0.98 1.00 1.00 0.98 0.99 0.04 0.00 0.00 0.04 0.02 044701 A 0.02 0.19 0.14 0.17 0.12 G 0.98 0.81 0.86 0.83 0.88 0.04 0.31 0.24 0.28 0.21 045143 A 0.00 0.06 0.03 0.00 0.02 G 1.00 0.94 0.97 1.00 0.98 0.00 0.11 0.05 0.00 0.04 045438 A 0.02 0.23 0.11 0.17 0.12 G 0.98 0.77 0.89 0.83 0.88 0.04 0.36 0.20 0.28 0.21 052337 G 0.00 0.03 0.03 0.00 0.01 A 1.00 0.97 0.97 1.00 0.99 0.00 0.05 0.06 0.00 0.02 052747 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 052783 - 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 + 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.06 0.00 0.01 053023 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 053514 C 0.02 0.17 0.14 0.17 0.12 T 0.98 0.83 0.86 0.83 0.88 0.04 0.28 0.24 0.28 0.20 053533 G 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 053550 C 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.12 0.00 0.00 0.00 0.04 053576 G 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.97 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 053966 C 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.18 0.00 0.00 0.00 0.06 054143 C 0.02 0.18 0.15 0.15 0.12 G 0.98 0.82 0.85 0.85 0.88 0.04 0.30 0.26 0.26 0.21 054294 A 0.10 0.28 0.21 0.11 0.16 G 0.90 0.72 0.79 0.89 0.84 0.17 0.40 0.33 0.19 0.28 054406 T 0.61 0.03 0.06 0.00 0.21 C 0.39 0.97 0.94 1.00 0.79 0.48 0.05 0.10 0.00 0.33 054569 G 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.95 0.99 0.00 0.00 0.00 0.09 0.03 054840 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 054966 G 0.70 0.30 0.30 0.12 0.37 A 0.30 0.70 0.70 0.88 0.63 0.42 0.42 0.42 0.22 0.47 054998 C 0.02 0.00 0.02 0.15 0.05 G 0.98 1.00 0.98 0.85 0.95 0.04 0.00 0.04 0.25 0.09 055090 T 0.02 0.18 0.14 0.17 0.12 G 0.98 0.82 0.86 0.83 0.88 0.04 0.30 0.24 0.28 0.21 055101 T 0.26 0.52 0.55 0.56 0.46 G 0.74 0.48 0.45 0.44 0.54 0.38 0.50 0.50 0.49 0.50 055408 A 0.02 0.14 0.23 0.16 0.12 T 0.98 0.86 0.77 0.84 0.88 0.05 0.24 0.35 0.27 0.22 055718 A 0.02 0.14 0.00 0.00 0.04 T 0.98 0.86 1.00 1.00 0.96 0.04 0.24 0.00 0.00 0.08 055732 G 0.02 0.18 0.15 0.16 0.12 A 0.98 0.82 0.85 0.84 0.88 0.04 0.30 0.26 0.27 0.22 055882 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 055923 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 056141 C 0.10 0.00 0.05 0.25 0.09 T 0.90 1.00 0.95 0.75 0.91 0.19 0.00 0.09 0.38 0.17 060220 C 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 060316 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 060691 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 060805 G 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 060818 G 0.02 0.14 0.14 0.17 0.11 A 0.98 0.86 0.86 0.83 0.89 0.04 0.24 0.24 0.28 0.20 060903 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 061065 T 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 061246 C 0.26 0.52 0.57 0.54 0.46 G 0.74 0.48 0.42 0.46 0.54 0.38 0.50 0.49 0.50 0.50 061302 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 061353 T 0.04 0.18 0.14 0.17 0.13 C 0.96 0.82 0.86 0.83 0.87 0.07 0.30 0.24 0.28 0.22 061370 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 062445 G 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 062518 C 0.10 0.31 0.17 0.12 0.17 T 0.90 0.69 0.82 0.88 0.83 0.17 0.43 0.29 0.22 0.28 062557 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 062588 C 0.27 0.55 0.53 0.56 0.47 T 0.73 0.45 0.47 0.44 0.53 0.39 0.49 0.50 0.49 0.50 062690 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 062966 G 0.02 0.18 0.14 0.17 0.12 C 0.98 0.82 0.86 0.83 0.88 0.04 0.30 0.24 0.28 0.22 063019 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 063115 A 0.02 0.18 0.14 0.17 0.12 G 0.98 0.82 0.86 0.83 0.88 0.04 0.30 0.24 0.28 0.22 063491 C 0.02 0.19 0.14 0.17 0.12 A 0.98 0.81 0.86 0.83 0.88 0.04 0.31 0.24 0.28 0.22 064003 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 073015 G 0.02 0.18 0.14 0.17 0.12 C 0.98 0.82 0.86 0.83 0.88 0.04 0.30 0.24 0.28 0.21 073037 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 073056 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 073124 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 073249 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 073377 C 0.02 0.14 0.12 0.17 0.11 T 0.98 0.86 0.88 0.83 0.89 0.04 0.24 0.21 0.29 0.20 073648 A 0.35 0.00 0.02 0.00 0.10 G 0.65 1.00 0.98 1.00 0.90 0.45 0.00 0.05 0.00 0.19 073710 T 0.00 0.16 0.09 0.00 0.06 A 1.00 0.84 0.91 1.00 0.94 0.00 0.27 0.17 0.00 0.11 073739 - 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 + 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 074318 C 0.16 0.00 0.02 0.00 0.05 T 0.84 1.00 0.98 1.00 0.95 0.27 0.00 0.04 0.00 0.09 074642 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 074706 C 0.33 0.00 0.02 0.00 0.10 T 0.67 1.00 0.98 1.00 0.90 0.44 0.00 0.04 0.00 0.17 074892 A 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 075562 A 0.02 0.00 0.02 0.15 0.05 G 0.98 1.00 0.98 0.85 0.95 0.04 0.00 0.04 0.26 0.10 076161 G 0.54 0.00 0.05 0.00 0.15 A 0.46 1.00 0.95 1.00 0.85 0.50 0.00 0.09 0.00 0.26 076190 - 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 + 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 076694 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 076896 A 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 076917 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 077111 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 077194 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 077598 A 0.66 0.43 0.38 0.30 0.44 G 0.34 0.57 0.62 0.70 0.56 0.45 0.49 0.47 0.42 0.49 084093 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 084099 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 084895 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 084896 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 085328 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 085707 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 085776 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 086658 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 086899 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 086943 A 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 087017 G 0.00 0.00 0.14 0.00 0.04 A 1.00 1.00 0.86 1.00 0.96 0.00 0.00 0.24 0.00 0.07 087245 G 0.02 0.18 0.11 0.17 0.12 A 0.98 0.82 0.89 0.83 0.88 0.04 0.30 0.20 0.28 0.21 087289 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 087666 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 087694 A 0.72 0.30 0.36 0.26 0.40 G 0.28 0.70 0.64 0.74 0.60 0.40 0.42 0.46 0.39 0.48 087933 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 088021 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 088328 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 088420 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 088889 + 0.27 0.48 0.52 0.63 0.47 - 0.73 0.52 0.48 0.37 0.53 0.39 0.50 0.50 0.47 0.50 089177 G 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 089656 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 089715 A 0.56 0.00 0.05 0.00 0.17 G 0.44 1.00 0.95 1.00 0.83 0.49 0.00 0.10 0.00 0.29 089750 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 089905 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 090546 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 090966 G 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.97 0.99 0.00 0.00 0.00 0.06 0.01 091112 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 093343 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 093558 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 093836 + 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 094466 G 0.56 0.00 0.05 0.00 0.17 C 0.44 1.00 0.95 1.00 0.83 0.49 0.00 0.09 0.00 0.28 094510 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 094855 C 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 094969 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 095010 A 0.02 0.00 0.03 0.17 0.05 G 0.98 1.00 0.97 0.83 0.95 0.04 0.00 0.05 0.28 0.10 104229 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 104256 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 104257 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 104617 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 104621 T 0.00 0.00 0.00 0.07 0.02 C 1.00 1.00 1.00 0.93 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 104939 T 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 105249 A 0.00 0.00 0.00 0.07 0.02 C 1.00 1.00 1.00 0.93 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 105745 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 105752 G 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.97 0.99 0.00 0.00 0.00 0.06 0.01 106013 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 106910 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 107109 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 107802 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 108130 C 0.65 0.28 0.36 0.17 0.39 T 0.35 0.72 0.64 0.82 0.61 0.46 0.40 0.46 0.29 0.48 108168 A 0.04 0.30 0.25 0.15 0.17 G 0.96 0.70 0.75 0.85 0.83 0.07 0.42 0.38 0.26 0.28 108186 - 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 + 1.00 1.00 1.00 0.95 0.99 0.00 0.00 0.00 0.10 0.02 109208 A 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 G 1.00 1.00 1.00 0.92 0.98 0.00 0.00 0.00 0.15 0.04 109714 A 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.06 0.00 0.01 109960 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 109965 G 0.10 0.23 0.38 0.11 0.19 A 0.90 0.77 0.62 0.89 0.81 0.17 0.35 0.47 0.19 0.31 110549 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 110924 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 112297 A 0.02 0.21 0.33 0.00 0.13 G 0.98 0.79 0.67 1.00 0.87 0.04 0.34 0.44 0.00 0.23 112442 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 112689 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.04 112996 A 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.12 0.00 0.00 0.00 0.04 113105 - 0.02 0.18 0.29 0.00 0.11 + 0.98 0.82 0.71 1.00 0.89 0.04 0.30 0.41 0.00 0.19 113365 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 113623 G 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 113681 A 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 113688 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 113700 A 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 113701 C 0.00 0.02 0.03 0.00 0.01 T 1.00 0.98 0.97 1.00 0.99 0.00 0.05 0.05 0.00 0.02 113768 C 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 113992 + 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 - 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 114193 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 114338 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 114402 C 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 T 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 114447 C 0.00 0.00 0.00 0.07 0.02 G 1.00 1.00 1.00 0.93 0.98 0.00 0.00 0.00 0.13 0.03 114547 G 0.00 0.00 0.00 0.07 0.02 C 1.00 1.00 1.00 0.93 0.98 0.00 0.00 0.00 0.14 0.04 114638 + 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 - 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 114834 T 0.17 0.34 0.39 0.50 0.34 C 0.83 0.66 0.61 0.50 0.66 0.28 0.45 0.47 0.50 0.45 114835 C 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 G 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 114942 C 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 118543 C 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 118598 + 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 - 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 118719 T 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 C 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.05 0.00 0.02 118814 - 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 + 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 118837 A 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 118923 G 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 A 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 119078 A 0.02 0.02 0.00 0.00 0.01 G 0.98 0.98 1.00 1.00 0.99 0.04 0.04 0.00 0.00 0.02 119143 A 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 119416 C 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 119613 G 0.00 0.00 0.00 0.07 0.02 A 1.00 1.00 1.00 0.93 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 119673 C 0.00 0.00 0.00 0.07 0.02 T 1.00 1.00 1.00 0.93 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 119681 C 0.09 0.36 0.21 0.24 0.22 T 0.91 0.64 0.79 0.76 0.78 0.17 0.46 0.34 0.36 0.34 119896 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 119901 - 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 + 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 119983 A 0.15 0.23 0.36 0.10 0.20 T 0.85 0.77 0.64 0.90 0.80 0.25 0.35 0.46 0.19 0.32 120361 C 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 A 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 120581 - 0.38 0.02 0.03 0.00 0.12 + 0.62 0.98 0.97 1.00 0.88 0.47 0.04 0.05 0.00 0.21 120623 G 0.48 0.02 0.03 0.00 0.15 A 0.52 0.98 0.97 1.00 0.85 0.50 0.04 0.05 0.00 0.25 120668 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 120705 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 120826 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 120827 G 0.13 0.23 0.36 0.15 0.21 A 0.87 0.77 0.64 0.85 0.79 0.23 0.35 0.46 0.25 0.33 120899 A 0.00 0.00 0.00 0.07 0.02 G 1.00 1.00 1.00 0.93 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 121139 C 0.00 0.00 0.00 0.07 0.02 T 1.00 1.00 1.00 0.93 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 121177 T 0.00 0.00 0.00 0.07 0.02 G 1.00 1.00 1.00 0.93 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 121199 C 0.00 0.00 0.00 0.07 0.02 G 1.00 1.00 1.00 0.93 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 121259 A 0.00 0.00 0.00 0.07 0.02 G 1.00 1.00 1.00 0.93 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 121295 A 0.00 0.00 0.00 0.07 0.02 G 1.00 1.00 1.00 0.93 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 122343 G 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.95 0.99 0.00 0.00 0.00 0.09 0.03 122356 + 0.03 0.05 0.00 0.17 0.07 - 0.97 0.95 1.00 0.83 0.93 0.05 0.10 0.00 0.28 0.13 122394 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.02 122956 A 0.13 0.18 0.30 0.12 0.18 G 0.87 0.82 0.70 0.88 0.82 0.23 0.29 0.42 0.21 0.29 123942 G 0.00 0.00 0.02 0.04 0.02 A 1.00 1.00 0.98 0.96 0.98 0.00 0.00 0.05 0.08 0.03 124019 C 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 124292 + 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 124908 C 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 124983 C 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 T 0.83 1.00 1.00 1.00 0.95 0.28 0.00 0.00 0.00 0.09 125156 A 0.76 0.32 0.30 0.06 0.37 C 0.24 0.68 0.70 0.94 0.63 0.37 0.43 0.42 0.12 0.47 125166 T 0.11 0.32 0.25 0.00 0.16 A 0.89 0.68 0.75 1.00 0.84 0.20 0.43 0.38 0.00 0.27 125190 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 125218 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000986: CAAG 012814: T 015881: aaata 024286: actt 033256: ac 044302: A 052783: aa 053023: t 073739: t 076190: TT 086658: GA 088889: TTGTA 093836: TC 108186: AT 113105: AAAG 113992: A 114638: TCTA 118598: GGTTAGGGATGCTGACCCCCTGT 118814: tatat 119901: attt 120581: G 122356: G 124292: t