Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000372 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000479 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000522 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 000625 A 0.74 0.09 0.14 0.58 0.41 G 0.26 0.91 0.86 0.42 0.59 0.38 0.17 0.24 0.49 0.48 000693 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 000750 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 001002 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001121 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001134 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001385 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 001399 A 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 G 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.04 0.00 0.02 001417 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 001562 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 001756 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 001898 A 0.79 0.10 0.14 0.59 0.42 G 0.21 0.90 0.86 0.41 0.58 0.33 0.17 0.24 0.48 0.49 001997 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 002021 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 002325 C 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 002549 T 0.02 0.07 0.02 0.17 0.07 G 0.98 0.93 0.98 0.83 0.93 0.04 0.14 0.05 0.28 0.14 002572 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 002867 C 0.74 0.10 0.14 0.58 0.42 T 0.26 0.90 0.86 0.42 0.58 0.38 0.18 0.24 0.49 0.49 003047 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 003678 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 004371 G 0.31 0.23 0.14 0.00 0.17 A 0.69 0.77 0.86 1.00 0.83 0.43 0.35 0.24 0.00 0.29 004578 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 004694 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 004741 G 0.15 0.12 0.02 0.00 0.08 T 0.85 0.88 0.98 1.00 0.92 0.26 0.21 0.04 0.00 0.14 004837 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 004863 C 0.17 0.00 0.00 0.13 0.08 A 0.83 1.00 1.00 0.87 0.92 0.29 0.00 0.00 0.23 0.15 004891 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 004900 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 004970 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 005254 G 0.70 0.10 0.12 0.61 0.40 A 0.30 0.90 0.88 0.39 0.60 0.42 0.18 0.21 0.48 0.48 005675 T 0.12 0.00 0.03 0.00 0.04 C 0.88 1.00 0.97 1.00 0.96 0.21 0.00 0.06 0.00 0.08 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001134: ttttct