Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000156 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000396 G 0.11 0.05 0.00 0.00 0.04 A 0.89 0.95 1.00 1.00 0.96 0.20 0.09 0.00 0.00 0.08 001156 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001280 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 001497 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001519 T 0.06 0.00 0.02 0.00 0.02 C 0.94 1.00 0.98 1.00 0.98 0.10 0.00 0.04 0.00 0.04 001659 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001874 G 0.00 0.02 0.03 0.00 0.01 C 1.00 0.98 0.97 1.00 0.99 0.00 0.05 0.05 0.00 0.02 002065 G 0.00 0.00 0.02 0.10 0.03 C 1.00 1.00 0.98 0.90 0.97 0.00 0.00 0.05 0.19 0.07 002155 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 002257 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 002283 G 0.00 0.07 0.02 0.00 0.02 A 1.00 0.93 0.98 1.00 0.98 0.00 0.13 0.04 0.00 0.04 002401 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 002416 C 0.15 0.05 0.00 0.00 0.05 G 0.85 0.95 1.00 1.00 0.95 0.25 0.09 0.00 0.00 0.09 002923 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 002958 T 0.12 0.05 0.00 0.00 0.04 A 0.88 0.95 1.00 1.00 0.96 0.21 0.09 0.00 0.00 0.08 003111 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 003114 A 0.00 0.05 0.02 0.00 0.02 C 1.00 0.95 0.98 1.00 0.98 0.00 0.09 0.04 0.00 0.03 003410 - 0.38 0.48 0.34 0.79 0.50 + 0.62 0.52 0.66 0.21 0.50 0.47 0.50 0.45 0.33 0.50 003847 T 0.25 0.00 0.02 0.00 0.07 C 0.75 1.00 0.98 1.00 0.93 0.38 0.00 0.04 0.00 0.14 004248 A 0.33 0.00 0.02 0.00 0.10 G 0.67 1.00 0.98 1.00 0.90 0.44 0.00 0.04 0.00 0.18 004259 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 004798 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 005006 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 005214 G 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.10 0.00 0.00 0.02 005859 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 005868 - 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 + 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 005947 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 005994 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 006081 T 0.30 0.52 0.64 0.20 0.40 C 0.70 0.48 0.36 0.80 0.60 0.42 0.50 0.46 0.31 0.48 006681 A 0.12 0.05 0.00 0.00 0.04 G 0.88 0.95 1.00 1.00 0.96 0.22 0.09 0.00 0.00 0.09 006820 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 007639 A 0.28 0.52 0.62 0.21 0.40 C 0.72 0.48 0.38 0.79 0.60 0.40 0.50 0.47 0.33 0.48 007682 C 0.12 0.05 0.00 0.00 0.04 T 0.88 0.95 1.00 1.00 0.96 0.20 0.09 0.00 0.00 0.08 008504 + 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 - 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 008512 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 008523 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 010294 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 010409 + 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 - 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 010496 T 0.13 0.05 0.00 0.00 0.05 C 0.87 0.95 1.00 1.00 0.95 0.23 0.09 0.00 0.00 0.09 010767 G 0.32 0.20 0.25 0.73 0.38 A 0.68 0.80 0.75 0.27 0.62 0.44 0.33 0.38 0.40 0.47 010836 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 011887 A 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 012392 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 012599 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 012666 - 0.12 0.05 0.00 0.00 0.04 + 0.88 0.95 1.00 1.00 0.96 0.22 0.09 0.00 0.00 0.09 012672 G 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 013067 C 0.17 0.47 0.68 0.22 0.37 A 0.83 0.53 0.32 0.78 0.63 0.28 0.50 0.43 0.34 0.46 013371 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 013405 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 013665 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 015932 A 0.37 0.45 0.30 0.82 0.48 G 0.63 0.55 0.70 0.18 0.52 0.46 0.50 0.42 0.30 0.50 016012 T 0.16 0.48 0.64 0.22 0.36 C 0.84 0.52 0.36 0.78 0.64 0.27 0.50 0.46 0.34 0.46 016853 A 0.02 0.02 0.07 0.21 0.08 G 0.98 0.98 0.93 0.79 0.92 0.04 0.04 0.13 0.34 0.15 016978 G 0.16 0.05 0.00 0.00 0.05 T 0.84 0.95 1.00 1.00 0.95 0.27 0.09 0.00 0.00 0.10 017143 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 017202 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 017806 G 0.13 0.05 0.00 0.00 0.05 T 0.87 0.95 1.00 1.00 0.95 0.23 0.09 0.00 0.00 0.09 017888 G 0.17 0.48 0.64 0.23 0.37 A 0.83 0.52 0.36 0.77 0.63 0.28 0.50 0.46 0.35 0.46 017972 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 018267 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 018321 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018383 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018786 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 019681 C 0.11 0.03 0.00 0.00 0.04 A 0.89 0.97 1.00 1.00 0.96 0.19 0.05 0.00 0.00 0.07 020297 T 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.95 1.00 1.00 0.99 0.00 0.09 0.00 0.00 0.02 020936 C 0.17 0.48 0.62 0.21 0.36 T 0.83 0.52 0.38 0.79 0.64 0.28 0.50 0.47 0.34 0.46 021249 + 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 - 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.04 021665 G 0.00 0.05 0.07 0.00 0.03 A 1.00 0.95 0.93 1.00 0.97 0.00 0.09 0.14 0.00 0.05 021999 C 0.13 0.05 0.00 0.00 0.05 G 0.87 0.95 1.00 1.00 0.95 0.23 0.09 0.00 0.00 0.09 022002 C 0.28 0.00 0.02 0.00 0.09 T 0.72 1.00 0.98 1.00 0.91 0.40 0.00 0.05 0.00 0.16 022017 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 022350 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 022369 - 0.30 0.00 0.02 0.00 0.09 + 0.70 1.00 0.98 1.00 0.91 0.42 0.00 0.04 0.00 0.17 022373 C 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 T 0.85 1.00 1.00 1.00 0.96 0.26 0.00 0.00 0.00 0.08 022930 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 023309 T 0.17 0.48 0.64 0.20 0.36 C 0.83 0.52 0.36 0.80 0.64 0.28 0.50 0.46 0.31 0.46 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000156: gttt 003410: tct 005868: g 008504: AG 010409: AGAGAGAGGTGAGTTAC 012666: ta 021249: GC 022369: gtttttagatctctaacatgaaa