Site Genotype1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 HD-chi2 XD-chi2 Total-chi2 000135 -- 22 12 20 15 69 +- 5 8 2 9 24 ++ 0 2 0 0 2 0.281 0.153 0.050 1.278 0.003 000291 AA 0 4 1 0 5 AG 9 10 2 10 31 GG 18 8 19 14 59 1.080 0.079 4.455 1.662 0.122 000464 CC 0 0 0 0 0 CG 2 0 0 0 2 GG 25 21 22 24 92 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 000678 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 2 2 TT 27 22 22 22 93 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 000969 CC 25 21 22 24 92 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 001032 GG 26 17 22 24 89 GT 1 5 0 0 6 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.362 0.000 0.000 0.101 001078 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001355 CC 6 13 15 18 52 CG 14 8 6 4 32 GG 7 1 1 2 11 0.040 0.027 0.153 3.840 2.814 001458 -- 27 22 21 24 94 +- 0 0 1 0 1 ++ 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 001684 -- 3 0 0 0 3 +- 15 3 6 4 28 ++ 6 18 16 19 59 1.748 0.124 0.548 0.209 0.021 001750 CC 24 20 22 23 89 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001815 CC 25 19 19 23 86 CT 0 1 3 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.013 0.118 0.000 0.046 002034 CC 24 21 22 22 89 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 002120 AA 4 12 15 18 49 AG 13 8 6 4 31 GG 7 1 1 2 11 0.243 0.053 0.153 3.840 2.780 002136 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 23 21 22 24 90 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 002450 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 23 21 22 23 89 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 002508 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 2 2 GG 24 21 22 22 89 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 002862 AA 5 1 1 2 9 AT 14 8 6 4 32 TT 6 13 15 18 52 0.371 0.027 0.153 3.840 1.446 003006 AA 7 1 1 2 11 AC 14 8 6 4 32 CC 6 13 15 18 52 0.040 0.027 0.153 3.840 2.814 003277 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 25 22 22 23 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 003319 AA 7 0 1 2 10 AC 13 9 6 4 32 CC 5 13 15 18 51 0.055 1.455 0.153 3.840 1.977 003568 -- 5 18 15 18 56 +- 13 3 6 5 27 ++ 6 1 1 1 9 0.174 2.296 0.153 0.644 3.895 003606 AA 0 0 0 0 0 AG 1 5 0 0 6 GG 23 17 22 24 86 0.011 0.362 0.000 0.000 0.105 003711 -- 0 0 0 0 0 +- 0 0 0 2 2 ++ 24 22 22 22 90 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 003721 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 23 22 22 24 91 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 003981 CC 6 12 15 17 50 CT 13 8 6 4 31 TT 6 1 1 2 10 0.040 0.053 0.153 3.584 2.201 004026 CC 24 21 22 23 90 CG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 004114 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 21 22 23 90 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 004343 CC 6 1 1 2 10 CT 14 8 6 4 32 TT 6 12 15 18 51 0.154 0.053 0.153 3.840 1.977 004432 CC 24 22 22 22 90 CT 0 0 0 2 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 004433 AA 0 0 0 0 0 AG 0 2 2 0 4 GG 24 20 20 24 88 0.000 0.050 0.050 0.000 0.045 004583 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 24 22 21 24 91 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 004705 CC 22 22 22 24 90 CG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.045 0.000 0.000 0.000 0.011 004731 CC 24 22 22 23 91 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 005199 CC 20 22 22 24 88 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.112 0.000 0.000 0.000 0.026 005439 -- 18 18 21 20 77 +- 7 0 0 0 7 ++ 0 0 0 0 0 0.663 0.000 0.000 0.000 0.159 005469 CC 0 0 0 0 0 CT 1 5 0 0 6 TT 24 13 21 20 78 0.010 0.468 0.000 0.000 0.115 005546 -- 0 0 0 0 0 +- 3 1 2 2 8 ++ 22 21 20 20 83 0.102 0.012 0.050 0.050 0.192 005587 AA 0 0 0 0 0 AG 1 5 0 0 6 GG 24 17 21 22 84 0.010 0.362 0.000 0.000 0.107 005721 AA 24 14 22 22 82 AG 1 7 0 0 8 GG 0 1 0 0 1 0.010 0.011 0.000 0.000 2.144 005744 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 22 22 22 90 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 005790 CC 20 22 22 22 86 CG 5 0 0 0 5 GG 0 0 0 0 0 0.309 0.000 0.000 0.000 0.073 006254 CC 22 20 22 21 85 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.102 0.000 0.000 0.000 0.026 006361 GG 20 21 22 21 84 GT 5 0 0 0 5 TT 0 0 0 0 0 0.309 0.000 0.000 0.000 0.074 006685 GG 24 15 19 23 81 GT 1 5 0 0 6 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.408 0.000 0.000 0.111 007212 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 24 15 20 16 75 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 007276 AA 0 0 0 0 0 AT 0 0 0 1 1 TT 25 15 20 15 75 0.000 0.000 0.000 0.017 0.003 007389 CC 7 0 1 2 10 CT 13 7 6 3 29 TT 4 8 13 11 36 0.243 1.389 0.078 3.261 1.099 008191 AA 27 18 18 18 81 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.014 0.000 0.000 0.003 008358 CC 27 21 19 23 90 CT 0 1 3 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.118 0.000 0.044 008364 AA 0 0 0 0 0 AG 5 0 0 0 5 GG 22 22 22 23 89 0.281 0.000 0.000 0.000 0.070 008565 CC 27 22 21 23 93 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 008663 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 1 0 1 TT 24 18 17 16 75 0.000 0.000 0.015 0.000 0.003 008682 -- 6 0 0 2 8 +- 14 7 5 3 29 ++ 6 9 11 12 38 0.154 1.254 0.549 3.602 0.472 008880 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 3 3 GG 24 19 22 18 83 0.000 0.000 0.000 0.124 0.027 009429 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 2 2 GG 27 22 22 20 91 0.000 0.000 0.000 0.050 0.011 009499 CC 7 0 1 1 9 CG 15 9 6 5 35 GG 4 13 15 15 47 0.746 1.455 0.153 0.429 0.425 009794 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 22 21 22 22 87 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 009837 CC 0 0 0 0 0 CT 0 3 1 0 4 TT 22 18 21 22 83 0.000 0.124 0.012 0.000 0.048 010023 CC 21 20 22 22 85 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 010071 AA 7 1 1 1 10 AC 12 8 6 5 31 CC 5 13 15 18 51 0.001 0.027 0.153 0.644 2.328 010159 AA 4 13 15 16 48 AG 13 8 6 5 32 GG 6 0 1 1 8 0.445 1.163 0.153 0.499 0.611 010272 -- 14 18 16 17 65 +- 9 3 6 4 22 ++ 0 0 0 0 0 1.361 0.124 0.548 0.233 1.823 010300 CC 4 12 14 15 45 CG 12 9 5 6 32 GG 6 0 1 1 8 0.220 1.562 0.360 0.153 0.429 010362 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 2 2 TT 23 21 21 20 85 0.000 0.000 0.000 0.050 0.012 010363 -- 5 0 1 1 7 +- 14 8 6 5 33 ++ 4 13 15 16 48 1.110 1.163 0.153 0.499 0.156 010546 CC 6 0 1 1 8 CT 13 7 4 5 29 TT 4 12 14 14 44 0.445 0.969 0.825 0.360 0.939 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000135: T 001458: T 001684: GGGGCAAGATCTGATGGTTTTATAAGGGGAAA 003568: c 003711: c 005439: CACCCCTGTCTGCCGTCCCGCCA 005546: t 008682: T 010272: T 010363: T