Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000093 G 0.06 0.00 0.05 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.95 1.00 0.97 0.11 0.00 0.09 0.00 0.05 000187 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000322 T 0.11 0.75 0.36 0.48 0.41 G 0.89 0.25 0.64 0.52 0.59 0.20 0.38 0.46 0.50 0.48 000586 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 000587 T 0.04 0.05 0.02 0.02 0.03 C 0.96 0.95 0.98 0.98 0.97 0.07 0.09 0.04 0.04 0.06 000675 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 000764 + 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 000915 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 000920 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 000993 T 0.04 0.03 0.02 0.02 0.03 G 0.96 0.97 0.98 0.98 0.97 0.08 0.05 0.04 0.04 0.05 001086 G 0.00 0.00 0.09 0.00 0.02 T 1.00 1.00 0.91 1.00 0.98 0.00 0.00 0.17 0.00 0.04 001110 - 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 + 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 001220 T 0.00 0.00 0.05 0.02 0.02 A 1.00 1.00 0.95 0.98 0.98 0.00 0.00 0.09 0.04 0.03 001357 A 0.02 0.00 0.00 0.02 0.01 C 0.98 1.00 1.00 0.98 0.99 0.04 0.00 0.00 0.04 0.02 001580 T 0.07 0.00 0.02 0.00 0.02 C 0.93 1.00 0.98 1.00 0.98 0.13 0.00 0.04 0.00 0.04 001704 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 001789 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 001924 G 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.95 1.00 0.99 0.00 0.00 0.09 0.00 0.02 002139 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 002156 T 0.05 0.00 0.03 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.97 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 0.00 0.03 002175 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 002404 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 002423 - 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 + 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 002652 C 0.06 0.05 0.05 0.02 0.04 G 0.94 0.95 0.95 0.98 0.96 0.12 0.09 0.09 0.04 0.08 002943 T 0.30 0.00 0.02 0.02 0.09 G 0.70 1.00 0.98 0.98 0.91 0.42 0.00 0.05 0.04 0.16 003809 C 0.06 0.00 0.02 0.00 0.02 G 0.94 1.00 0.98 1.00 0.98 0.11 0.00 0.04 0.00 0.04 004324 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 004589 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 004668 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 004706 C 0.00 0.00 0.00 0.15 0.04 T 1.00 1.00 1.00 0.85 0.96 0.00 0.00 0.00 0.25 0.07 005008 A 0.22 0.00 0.11 0.17 0.13 G 0.78 1.00 0.89 0.83 0.87 0.35 0.00 0.20 0.28 0.23 005215 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 005223 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 005230 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 005265 C 0.02 0.39 0.07 0.15 0.15 T 0.98 0.61 0.93 0.85 0.85 0.04 0.47 0.13 0.25 0.25 005460 C 0.04 0.05 0.02 0.02 0.03 A 0.96 0.95 0.98 0.98 0.97 0.07 0.09 0.04 0.04 0.06 005591 A 0.02 0.30 0.25 0.33 0.23 G 0.98 0.70 0.75 0.67 0.77 0.04 0.42 0.38 0.44 0.35 005766 - 0.20 0.00 0.09 0.17 0.12 + 0.80 1.00 0.91 0.83 0.88 0.31 0.00 0.17 0.28 0.20 005850 A 0.06 0.00 0.05 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.95 1.00 0.97 0.11 0.00 0.09 0.00 0.05 005896 A 0.06 0.00 0.07 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.93 1.00 0.97 0.11 0.00 0.13 0.00 0.06 006906 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 006933 T 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 007195 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 007296 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 007309 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 007408 C 0.06 0.00 0.05 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.95 1.00 0.97 0.11 0.00 0.09 0.00 0.05 007414 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 007518 - 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 + 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 007553 G 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.05 0.00 0.02 007556 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000764: TGGGGGG 001110: AAGGCGGGGTAAGGGG 002423: ag 005766: C 007518: ctgt