Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Total-hz 000139 A 0.08 C 0.92 0.14 000240 C 0.11 G 0.89 0.20 000468 T 0.03 C 0.97 0.06 000512 T 0.07 A 0.93 0.14 000543 C 0.07 T 0.93 0.13 000568 T 0.11 C 0.89 0.19 000751 T 0.01 C 0.99 0.01 000820 C 0.33 T 0.67 0.44 001659 T 0.12 C 0.88 0.21 001764 - 0.01 + 0.99 0.01 001831 G 0.01 C 0.99 0.02 001847 A 0.31 G 0.69 0.43 001865 C 0.12 G 0.88 0.21 001878 A 0.01 C 0.99 0.02 002173 A 0.03 C 0.97 0.05 002296 T 0.03 C 0.97 0.06 002305 A 0.09 G 0.91 0.16 002313 A 0.49 G 0.51 0.50 002357 A 0.02 G 0.98 0.04 004094 T 0.02 G 0.98 0.03 004155 A 0.03 T 0.97 0.05 004189 T 0.37 C 0.63 0.46 004191 C 0.12 T 0.88 0.21 004222 T 0.03 G 0.97 0.05 004556 A 0.49 C 0.51 0.50 004577 A 0.01 G 0.99 0.02 004583 C 0.12 T 0.88 0.21 007369 C 0.12 G 0.88 0.21 007404 G 0.01 C 0.99 0.02 007505 T 0.01 C 0.99 0.01 007540 A 0.01 C 0.99 0.01 007742 C 0.03 T 0.97 0.06 008019 T 0.01 C 0.99 0.02 009415 T 0.01 A 0.99 0.01 010048 A 0.01 G 0.99 0.01 010127 T 0.01 C 0.99 0.02 010174 A 0.02 G 0.98 0.04 010236 T 0.01 C 0.99 0.01 010258 T 0.01 C 0.99 0.01 010480 A 0.01 G 0.99 0.01 010641 A 0.02 C 0.98 0.04 010646 T 0.01 C 0.99 0.01 010668 T 0.01 C 0.99 0.01 010801 A 0.01 G 0.99 0.01 010862 T 0.37 A 0.63 0.47 010919 C 0.01 T 0.99 0.01 010974 G 0.01 C 0.99 0.01 011045 G 0.01 A 0.99 0.01 011112 C 0.49 T 0.51 0.50 011419 C 0.01 T 0.99 0.02 011720 A 0.48 C 0.52 0.50 011909 T 0.08 C 0.92 0.15 019728 A 0.05 G 0.95 0.10 020060 C 0.45 T 0.55 0.50 020145 G 0.01 T 0.99 0.01 020214 T 0.01 C 0.99 0.01 020233 + 0.03 - 0.97 0.05 020683 C 0.03 A 0.97 0.06 020853 C 0.01 A 0.99 0.01 022142 C 0.50 G 0.50 0.50 022542 T 0.01 C 0.99 0.02 022756 G 0.01 A 0.99 0.01 022993 G 0.01 T 0.99 0.01 023027 C 0.01 T 0.99 0.01 023989 T 0.02 C 0.98 0.04 024090 A 0.01 C 0.99 0.01 024388 C 0.48 G 0.52 0.50 025700 T 0.01 C 0.99 0.01 025708 A 0.01 T 0.99 0.01 025709 A 0.09 G 0.91 0.16 025783 T 0.01 C 0.99 0.01 025808 T 0.01 A 0.99 0.01 026009 C 0.01 T 0.99 0.01 026175 C 0.03 A 0.97 0.07 026662 A 0.01 G 0.99 0.01 026962 G 0.01 T 0.99 0.02 027061 G 0.08 C 0.92 0.14 027450 A 0.01 C 0.99 0.01 027621 C 0.01 A 0.99 0.02 027683 A 0.01 T 0.99 0.01 027733 T 0.03 C 0.97 0.06 027980 T 0.01 C 0.99 0.01 028326 G 0.01 A 0.99 0.01 028521 T 0.08 G 0.92 0.15 028587 T 0.01 C 0.99 0.01 028748 C 0.09 T 0.91 0.16 028786 A 0.01 G 0.99 0.01 029034 G 0.01 C 0.99 0.01 029100 T 0.01 C 0.99 0.01 029114 T 0.01 C 0.99 0.01 029307 T 0.01 C 0.99 0.01 030266 G 0.04 A 0.96 0.07 030277 A 0.01 G 0.99 0.01 030315 T 0.50 C 0.50 0.50 030317 A 0.01 G 0.99 0.01 031077 G 0.01 C 0.99 0.01 031305 T 0.01 C 0.99 0.01 031510 G 0.01 A 0.99 0.02 031521 C 0.08 G 0.92 0.15 031912 T 0.03 C 0.97 0.06 032006 T 0.08 A 0.92 0.15 032314 A 0.01 G 0.99 0.01 032467 A 0.08 G 0.92 0.15 032767 T 0.01 C 0.99 0.02 032872 T 0.01 C 0.99 0.01 033374 A 0.01 G 0.99 0.02 033475 A 0.01 G 0.99 0.01 033502 T 0.01 C 0.99 0.01 034047 A 0.01 G 0.99 0.01 034109 A 0.08 C 0.92 0.15 034113 G 0.02 A 0.98 0.04 034171 G 0.49 A 0.51 0.50 034388 A 0.01 G 0.99 0.02 034659 T 0.01 C 0.99 0.03 035367 + 0.01 - 0.99 0.01 035861 G 0.48 A 0.52 0.50 036031 - 0.03 + 0.97 0.06 036095 A 0.09 G 0.91 0.16 036187 T 0.35 A 0.65 0.45 036266 G 0.01 A 0.99 0.01 036489 G 0.32 C 0.68 0.44 036570 T 0.01 C 0.99 0.03 036860 T 0.01 C 0.99 0.01 036887 A 0.01 G 0.99 0.01 037092 C 0.01 G 0.99 0.01 037241 T 0.01 G 0.99 0.01 037303 T 0.01 C 0.99 0.01 037702 A 0.01 G 0.99 0.01 Note: Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001764: agtgtt 020233: T 035367: TACC 036031: gccacctcctgct