Site Genotype1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 HD-chi2 XD-chi2 Total-chi2 000064 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 3 1 4 TT 17 19 17 20 73 0.000 0.000 0.131 0.012 0.055 000237 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 26 22 21 23 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 000450 CC 25 19 21 23 88 CT 1 3 0 1 5 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.118 0.000 0.011 0.071 000590 AA 18 14 15 17 64 AG 1 0 0 0 1 GG 1 0 0 0 1 8.183 0.000 0.000 0.000 28.655 000774 AA 0 0 0 0 0 AG 0 2 0 1 3 GG 20 11 15 16 62 0.000 0.090 0.000 0.016 0.036 000785 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 19 14 15 17 65 0.013 0.000 0.000 0.000 0.004 000802 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 2 1 5 GG 17 14 13 16 60 0.059 0.000 0.077 0.016 0.104 000894 AA 9 8 10 21 48 AC 9 10 9 2 30 CC 5 1 1 0 7 0.857 0.903 0.330 0.048 0.545 001020 CC 19 20 21 24 84 CT 6 0 0 0 6 TT 0 0 0 0 0 0.465 0.000 0.000 0.000 0.107 001066 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 24 19 21 24 88 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001530 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 17 18 20 21 76 0.059 0.000 0.000 0.000 0.013 001746 AA 27 21 21 23 92 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 001819 GG 27 21 21 23 92 GT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 001901 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 27 22 20 23 92 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 002022 CC 26 22 20 24 92 CG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 002350 CC 18 17 15 18 68 CT 1 0 0 0 1 TT 1 0 0 0 1 8.183 0.000 0.000 0.000 30.434 002565 CC 24 22 22 23 91 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 002618 CC 0 0 0 0 0 CG 2 0 0 0 2 GG 24 22 22 23 91 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 002797 AA 5 1 1 0 7 AG 10 12 9 3 34 GG 12 8 12 20 52 1.144 1.714 0.182 0.112 0.191 002842 AA 0 0 0 0 0 AG 1 1 1 0 3 GG 26 20 21 22 89 0.010 0.012 0.012 0.000 0.025 003161 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 21 20 24 89 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 003177 CC 25 20 20 24 89 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 003257 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 26 22 20 23 91 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 003287 CC 21 14 12 23 70 CT 4 7 7 1 19 TT 1 1 1 0 3 1.578 0.011 0.000 0.011 1.336 003338 CC 0 0 0 0 0 CT 0 4 0 1 5 TT 26 17 20 23 86 0.000 0.233 0.000 0.011 0.073 003512 AA 25 21 19 20 85 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 003542 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 26 20 19 20 85 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 003550 CC 22 14 15 19 70 CG 2 6 4 0 12 GG 2 1 0 0 3 10.097 0.114 0.263 0.000 5.501 003556 CC 0 0 0 0 0 CT 2 1 0 0 3 TT 24 20 19 19 82 0.042 0.012 0.000 0.000 0.027 003696 AA 0 1 0 0 1 AG 2 5 5 0 12 GG 24 14 12 18 68 0.042 0.360 0.505 0.000 0.309 004036 AA 1 1 1 0 3 AG 5 6 7 1 19 GG 20 15 14 23 72 0.793 0.153 0.011 0.011 1.432 004223 CC 0 0 0 0 0 CT 8 5 2 2 17 TT 17 16 18 22 73 0.907 0.383 0.055 0.045 0.979 004483 CC 22 22 21 24 89 CG 3 0 0 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.102 0.000 0.000 0.000 0.025 004625 CC 5 1 1 0 7 CT 10 12 8 3 33 TT 10 9 12 21 52 0.694 1.455 0.053 0.107 0.299 004751 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 3 1 4 GG 25 22 18 23 88 0.000 0.000 0.124 0.011 0.045 004773 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 0 1 1 TT 24 22 20 23 89 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 004778 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 22 22 20 24 88 0.045 0.000 0.000 0.000 0.011 004788 CC 9 9 12 21 51 CT 10 12 7 3 32 TT 5 1 1 0 7 0.490 1.455 0.000 0.107 0.387 004894 -- 0 0 0 0 0 +- 0 0 1 0 1 ++ 24 22 20 24 90 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 004936 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 0 1 ++ 24 22 21 24 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 005183 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 18 21 24 87 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 005353 CC 20 18 21 24 83 CT 4 0 0 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.198 0.000 0.000 0.000 0.048 005368 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 23 18 21 24 86 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 005401 CC 24 18 21 23 86 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 137659 AA 23 19 20 24 86 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 137753 GG 1 0 0 0 1 GT 2 0 0 0 2 TT 21 19 20 24 84 4.959 0.000 0.000 0.000 20.739 137782 AA 0 0 0 0 0 AC 2 0 0 0 2 CC 22 19 20 24 85 0.045 0.000 0.000 0.000 0.012 138065 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 23 22 20 24 89 0.043 0.000 0.000 0.000 0.011 138180 GG 25 22 19 24 90 GT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.013 0.000 0.003 138190 CC 20 10 10 18 58 CT 5 10 9 6 30 TT 0 2 1 0 3 0.309 0.050 0.330 0.490 0.137 138201 AA 20 10 10 18 58 AG 5 10 9 6 30 GG 0 2 1 0 3 0.309 0.050 0.330 0.490 0.137 138473 AA 25 21 22 24 92 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 138629 GG 0 0 1 0 1 GT 0 0 0 0 0 TT 25 22 21 24 92 0.000 0.000 22.000 0.000 93.000 138668 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 4 5 TT 25 21 22 20 88 0.000 0.012 0.000 0.198 0.071 138683 CC 25 22 21 24 92 CT 0 0 0 0 0 TT 0 0 1 0 1 0.000 0.000 22.000 0.000 93.000 139241 AA 27 22 19 20 88 AT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.013 0.000 0.003 139337 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 20 20 88 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 139338 AA 26 22 20 20 88 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 139352 AA 4 0 0 0 4 AG 11 0 1 0 12 GG 12 22 19 20 73 0.308 0.000 0.013 0.000 9.346 139442 AA 3 11 13 13 40 AG 7 10 7 8 32 GG 17 1 2 3 23 2.283 0.468 0.505 0.897 8.781 139622 GG 21 20 17 23 81 GT 4 2 3 0 9 TT 0 0 0 0 0 0.189 0.050 0.131 0.000 0.249 139702 AA 16 1 2 3 22 AG 6 10 6 8 30 GG 3 11 12 12 38 2.926 0.468 0.800 0.733 8.737 140071 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 1 1 2 CC 26 22 21 21 90 0.000 0.000 0.012 0.012 0.011 140241 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 2 2 TT 27 22 22 22 93 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 140814 AA 26 22 21 23 92 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 141554 AA 18 15 20 21 74 AT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.014 0.000 0.000 0.000 0.003 141682 CC 17 15 20 21 73 CG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.059 0.000 0.000 0.000 0.014 142089 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 25 21 22 24 92 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 142162 AA 17 0 2 2 21 AG 7 10 7 7 31 GG 3 11 13 15 42 2.283 2.051 0.505 0.730 8.789 142294 GG 27 20 22 24 93 GT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 142391 AA 0 0 0 0 0 AG 1 1 4 0 6 GG 26 20 18 22 86 0.010 0.012 0.220 0.000 0.105 142413 CC 1 0 0 0 1 CT 0 0 0 0 0 TT 26 21 22 22 91 27.000 0.000 0.000 0.000 92.000 143140 AA 2 0 1 2 5 AG 2 8 1 7 18 GG 22 13 20 15 70 10.097 1.163 9.075 0.730 5.501 143272 AA 25 19 18 24 86 AC 1 2 4 0 7 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.053 0.220 0.000 0.142 143622 CC 0 0 0 0 0 CG 2 0 0 0 2 GG 24 20 22 24 90 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 143662 AA 26 20 22 23 91 AT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 144281 AA 24 20 22 23 89 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 144306 AA 20 9 12 17 58 AG 4 10 9 6 29 GG 1 2 1 0 4 1.469 0.107 0.182 0.517 0.024 144446 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 24 21 22 23 90 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 144572 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 25 22 22 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 144684 CC 2 0 0 0 2 CT 2 0 0 0 2 TT 22 22 22 23 89 10.097 0.000 0.000 0.000 39.967 144808 CC 9 14 19 15 57 CG 10 8 2 7 27 GG 7 0 1 1 9 1.330 1.086 4.455 0.025 4.043 144838 CC 1 2 1 0 4 CG 4 9 9 6 28 GG 21 11 12 17 61 1.578 0.007 0.182 0.517 0.118 145093 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 145423 GG 25 22 22 23 92 GT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 145486 AA 0 0 0 0 0 AG 4 0 1 0 5 GG 22 22 21 23 88 0.181 0.000 0.012 0.000 0.071 145494 -- 0 0 0 0 0 +- 0 0 0 1 1 ++ 25 22 22 22 91 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 145561 CC 21 22 22 23 88 CT 4 0 0 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.189 0.000 0.000 0.000 0.045 146284 AA 0 5 5 5 15 AG 2 8 10 13 33 GG 25 9 6 3 43 0.040 1.352 0.043 1.307 3.599 146711 AA 12 22 21 21 76 AG 11 0 1 0 12 GG 4 0 0 0 4 0.308 0.000 0.012 0.000 9.827 148296 CC 26 21 22 24 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 148348 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 26 21 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 148359 AA 0 5 6 8 19 AG 2 7 10 12 31 GG 25 9 6 4 44 0.040 1.995 0.182 0.020 7.917 148367 CC 12 21 21 24 78 CT 11 0 1 0 12 TT 4 0 0 0 4 0.308 0.000 0.012 0.000 10.148 148456 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 21 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 148595 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 21 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 149259 GG 24 20 21 21 86 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 149699 CC 23 22 21 24 90 CT 3 0 1 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.097 0.000 0.012 0.000 0.044 149766 CC 20 18 15 24 77 CG 6 4 7 0 17 GG 0 0 0 0 0 0.442 0.220 0.787 0.000 0.929 149776 CC 25 22 22 24 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 150358 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 24 22 22 24 92 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 150391 AA 23 22 21 24 90 AG 2 0 1 0 3 GG 1 0 0 0 1 5.462 0.000 0.012 0.000 13.832 339249 CC 26 22 21 23 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 339301 CC 26 22 21 23 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 339391 CC 27 22 21 22 92 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 339416 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 21 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 339437 CC 0 0 0 1 1 CT 0 5 4 6 15 TT 27 17 17 16 77 0.000 0.362 0.233 0.195 0.078 339620 CC 24 22 22 24 92 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.000 0.000 0.024 339629 CC 0 0 0 0 0 CT 3 0 0 0 3 TT 24 22 22 24 92 0.093 0.000 0.000 0.000 0.024 340581 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 341010 AA 21 13 16 18 68 AG 3 4 2 1 10 GG 2 3 2 0 7 6.624 4.356 7.389 0.014 22.530 341218 -- 0 0 0 0 0 +- 0 0 1 0 1 ++ 27 22 21 24 94 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 341240 AA 0 7 9 1 17 AG 3 3 1 0 7 GG 24 12 11 23 70 0.093 11.166 17.157 24.000 57.432 341387 CC 1 0 0 0 1 CT 0 0 0 0 0 TT 26 22 21 24 93 27.000 0.000 0.000 0.000 94.000 341806 -- 0 0 0 0 0 +- 0 0 0 2 2 ++ 26 21 21 19 87 0.000 0.000 0.000 0.053 0.011 341898 GG 22 22 22 23 89 GT 0 0 0 0 0 TT 1 0 0 0 1 23.000 0.000 0.000 0.000 90.000 341900 CC 23 22 22 23 90 CT 0 0 0 0 0 TT 1 0 0 0 1 24.000 0.000 0.000 0.000 91.000 342096 CC 0 0 0 0 0 CG 6 0 0 0 6 GG 21 22 22 23 88 0.422 0.000 0.000 0.000 0.102 342194 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 342253 AA 24 12 10 23 69 AT 3 9 9 1 22 TT 0 1 3 0 4 0.093 0.182 0.177 0.011 1.585 342436 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 1 1 CC 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 342445 AA 26 22 22 24 94 AG 0 0 0 0 0 GG 1 0 0 0 1 27.000 0.000 0.000 0.000 95.000 342585 AA 0 0 0 1 1 AT 0 5 4 7 16 TT 27 17 18 16 78 0.000 0.362 0.220 0.044 0.031 342603 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 27 22 21 24 94 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 343016 AA 17 7 8 3 35 AG 7 12 10 9 38 GG 3 3 4 12 22 2.283 0.362 0.079 0.389 3.242 343186 -- 7 0 0 2 9 +- 6 7 5 9 27 ++ 12 15 17 13 57 6.250 0.787 0.362 0.061 4.043 343384 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 27 22 21 24 94 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 343451 GG 0 0 0 0 0 GT 0 1 0 0 1 TT 27 21 22 24 94 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 343502 AA 23 21 22 23 89 AC 4 0 0 0 4 CC 0 0 0 0 0 0.173 0.000 0.000 0.000 0.045 343621 AA 1 1 3 0 5 AG 4 8 9 1 22 GG 22 12 10 22 66 1.688 0.053 0.177 0.011 2.676 343739 CC 4 3 4 11 22 CT 9 11 10 9 39 TT 14 7 8 3 32 1.396 0.159 0.079 0.277 2.134 343935 AA 22 14 17 22 75 AG 5 6 4 1 16 GG 0 1 1 0 2 0.281 0.114 1.144 0.011 0.998 344180 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 21 22 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 473404 CC 6 0 0 0 6 CT 12 0 0 0 12 TT 9 22 22 24 77 0.270 0.000 0.000 0.000 17.379 473521 AA 1 0 0 0 1 AG 3 0 0 0 3 GG 23 22 22 24 91 3.099 0.000 0.000 0.000 13.993 473601 AA 8 22 22 24 76 AG 12 0 0 0 12 GG 6 0 0 0 6 0.133 0.000 0.000 0.000 17.125 473907 -- 0 0 0 0 0 +- 3 0 0 0 3 ++ 24 22 22 24 92 0.093 0.000 0.000 0.000 0.024 474022 AA 0 0 0 0 0 AT 0 1 1 0 2 TT 27 21 21 24 93 0.000 0.012 0.012 0.000 0.011 474032 AA 27 21 22 24 94 AT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 474069 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 2 2 GG 27 22 22 22 93 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 474617 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 1 2 ++ 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.011 0.011 474870 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 474965 CC 21 16 13 8 58 CT 4 5 8 14 31 TT 2 1 1 2 6 4.606 0.499 0.027 1.434 0.442 475081 CC 16 8 10 20 54 CG 7 11 10 4 32 GG 3 2 2 0 7 2.068 0.416 0.050 0.198 0.534 475130 AA 1 0 0 0 1 AC 4 3 0 0 7 CC 21 18 22 24 85 1.578 0.124 0.000 0.000 3.103 475264 CC 26 20 21 24 91 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 475409 AA 0 0 0 0 0 AC 0 1 1 1 3 CC 27 21 21 23 92 0.000 0.012 0.012 0.011 0.024 475548 -- 2 3 2 0 7 +- 8 14 10 5 37 ++ 17 5 10 19 51 0.551 1.766 0.050 0.324 0.007 475578 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 475779 CC 17 5 10 18 50 CT 7 14 10 5 36 TT 2 3 2 0 7 0.968 1.766 0.050 0.342 0.022 475860 AA 20 22 22 23 87 AG 6 0 0 0 6 GG 0 0 0 0 0 0.442 0.000 0.000 0.000 0.103 476188 CC 15 15 11 7 48 CT 4 5 7 14 30 TT 0 1 1 2 4 0.263 0.429 0.007 1.775 0.062 476213 AA 1 0 0 0 1 AG 2 0 0 0 2 GG 16 22 19 23 80 3.698 0.000 0.000 0.000 19.738 476523 GG 0 0 0 0 0 GT 7 0 0 0 7 TT 18 22 22 24 86 0.663 0.000 0.000 0.000 0.142 476896 AA 4 0 0 0 4 AG 12 0 0 0 12 GG 8 22 22 24 76 0.020 0.000 0.000 0.000 9.827 487444 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 21 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 487449 CC 27 22 20 24 93 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 487844 AA 15 5 9 19 48 AG 11 14 10 4 39 GG 1 3 2 1 7 0.354 1.766 0.107 1.361 0.058 487862 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 0 1 1 TT 27 22 21 23 93 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 488626 CC 0 0 0 0 0 CT 7 0 0 0 7 TT 20 22 22 24 88 0.599 0.000 0.000 0.000 0.139 488648 CC 1 3 2 1 7 CG 11 14 10 4 39 GG 15 5 10 19 49 0.354 1.766 0.050 1.361 0.040 488660 AA 27 22 22 23 94 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 488747 GG 1 3 2 1 7 GT 11 14 10 4 39 TT 15 5 10 19 49 0.354 1.766 0.050 1.361 0.040 488922 AA 14 7 7 6 34 AG 12 12 9 12 45 GG 1 3 6 6 16 0.667 0.362 0.714 0.000 0.029 488960 AA 1 3 2 1 7 AG 11 14 10 4 39 GG 15 5 10 19 49 0.354 1.766 0.050 1.361 0.040 488996 CC 1 3 2 1 7 CG 11 14 10 4 39 GG 15 5 10 19 49 0.354 1.766 0.050 1.361 0.040 489160 AA 0 0 0 0 0 AG 7 0 0 0 7 GG 20 22 22 24 88 0.599 0.000 0.000 0.000 0.139 489446 -- 1 3 2 0 6 +- 10 13 9 4 36 ++ 16 5 10 19 50 0.138 1.307 0.000 0.209 0.020 489451 AA 19 22 22 23 86 AG 5 0 0 0 5 GG 0 0 0 0 0 0.324 0.000 0.000 0.000 0.073 489579 AA 0 3 2 1 6 AT 11 14 10 4 39 TT 15 5 10 18 48 1.872 1.766 0.050 1.252 0.267 489627 AA 16 5 10 19 50 AT 10 14 10 4 38 TT 0 3 2 0 5 1.474 1.766 0.050 0.209 0.418 489846 AA 25 22 22 24 93 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 489898 CC 25 22 22 23 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 489989 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 2 2 GG 26 22 22 21 91 0.000 0.000 0.000 0.048 0.011 490007 CC 25 22 22 23 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 490057 -- 1 0 0 0 1 +- 3 0 0 0 3 ++ 21 22 22 23 88 2.778 0.000 0.000 0.000 13.512 490162 -- 15 5 10 18 48 +- 8 14 10 4 36 ++ 1 3 2 1 7 0.003 1.766 0.050 1.252 0.005 490846 AA 0 0 0 0 0 AT 0 2 0 0 2 TT 25 18 22 24 89 0.000 0.055 0.000 0.000 0.011 490892 GG 25 18 22 24 89 GT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.014 0.000 0.000 0.003 490894 AA 23 19 22 24 88 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.000 0.000 0.011 490974 GG 24 22 22 24 92 GT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.000 0.000 0.024 491022 CC 15 5 10 19 49 CT 11 14 10 4 39 TT 1 3 2 1 7 0.354 1.766 0.050 1.361 0.040 491037 CC 15 5 10 19 49 CT 11 14 10 4 39 TT 1 3 2 1 7 0.354 1.766 0.050 1.361 0.040 491038 AA 15 5 10 19 49 AC 11 14 10 4 39 CC 1 3 2 1 7 0.354 1.766 0.050 1.361 0.040 491079 CC 27 22 18 15 82 CG 0 0 4 9 13 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.220 1.278 0.512 491130 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 491350 CC 26 21 21 24 92 CT 1 1 1 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.012 0.012 0.000 0.024 491506 AA 23 22 22 24 91 AG 4 0 0 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 491528 AA 15 5 10 19 49 AG 11 14 10 4 39 GG 1 3 2 1 7 0.354 1.766 0.050 1.361 0.040 491687 AA 11 5 10 19 45 AC 14 14 10 4 42 CC 2 3 2 1 8 0.750 1.766 0.050 1.361 0.170 491735 AA 26 22 22 24 94 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 491781 AA 1 3 2 1 7 AG 11 14 10 4 39 GG 15 5 10 19 49 0.354 1.766 0.050 1.361 0.040 491789 AA 0 0 0 0 0 AG 4 0 0 0 4 GG 23 22 22 24 91 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 491795 AA 1 3 2 0 6 AC 10 14 10 4 38 CC 16 5 10 20 51 0.138 1.766 0.050 0.198 0.094 491807 AA 27 22 18 15 82 AC 0 0 4 9 13 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.220 1.278 0.512 491876 AA 16 5 10 20 51 AG 10 14 10 4 38 GG 1 3 2 0 6 0.138 1.766 0.050 0.198 0.094 492078 AA 0 3 6 6 15 AG 6 12 9 12 39 GG 21 7 7 6 41 0.422 0.362 0.714 0.000 1.202 492119 AA 12 15 13 8 48 AC 11 6 7 14 38 CC 4 1 2 2 9 0.308 0.153 0.505 1.434 0.136 492239 CC 15 5 10 19 49 CT 8 13 10 4 35 TT 0 3 2 1 6 1.019 1.307 0.050 1.361 0.006 492372 AA 17 21 22 24 84 AG 4 0 0 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.233 0.000 0.000 0.000 0.048 492476 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 2 3 GG 20 21 22 22 85 0.012 0.000 0.000 0.045 0.026 492888 AA 23 15 12 22 72 AG 1 6 4 0 11 GG 0 0 1 0 1 0.011 0.583 0.617 0.000 0.577 492971 GG 23 21 17 22 83 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 499018 AA 25 22 22 24 93 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 499144 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 499190 CC 0 3 6 5 14 CG 3 12 7 9 31 GG 24 7 9 10 50 0.093 0.362 2.719 1.119 5.378 499313 AA 15 5 10 19 49 AG 11 14 10 4 39 GG 1 3 2 1 7 0.354 1.766 0.050 1.361 0.040 499435 AA 1 3 2 1 7 AG 9 13 10 3 35 GG 17 6 10 20 53 0.020 0.917 0.050 2.617 0.134 499508 AA 14 7 7 6 34 AG 12 12 9 12 45 GG 1 3 6 6 16 0.667 0.362 0.714 0.000 0.029 499527 CC 19 13 15 21 68 CT 7 6 5 2 20 TT 1 3 2 1 7 0.120 2.148 2.001 4.959 7.639 499605 AA 24 22 22 24 92 AC 1 0 0 0 1 CC 1 0 0 0 1 10.859 0.000 0.000 0.000 41.103 499654 AA 0 3 2 1 6 AG 0 0 0 0 0 GG 26 19 20 23 88 0.000 22.000 22.000 24.000 94.000 499669 CC 1 3 2 1 7 CT 1 0 0 0 1 TT 24 19 20 23 86 10.859 22.000 22.000 24.000 80.873 499686 CC 0 0 1 0 1 CG 0 0 0 0 0 GG 26 22 21 24 93 0.000 0.000 22.000 0.000 94.000 500018 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 21 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 500231 -- 10 5 10 19 44 +- 13 14 9 3 39 ++ 3 3 2 1 9 0.159 1.766 0.000 2.457 0.007 500262 AA 26 22 20 23 91 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 500267 AA 25 22 21 23 91 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 500533 AA 17 19 19 23 78 AC 4 0 0 0 4 CC 0 0 0 0 0 0.233 0.000 0.000 0.000 0.051 500628 GG 0 0 0 0 0 GT 0 2 1 0 3 TT 21 17 18 23 79 0.000 0.059 0.014 0.000 0.028 500797 AA 0 0 0 0 0 AG 4 0 0 0 4 GG 22 22 21 24 89 0.181 0.000 0.000 0.000 0.045 500822 CC 14 5 9 19 47 CT 11 14 10 4 39 TT 1 3 2 1 7 0.427 1.766 0.107 1.361 0.079 500829 CC 23 22 21 24 90 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.097 0.000 0.000 0.000 0.025 501031 CC 14 5 9 19 47 CT 11 14 10 4 39 TT 1 3 2 1 7 0.427 1.766 0.107 1.361 0.079 501160 GG 1 3 2 1 7 GT 11 14 10 4 39 TT 15 5 9 19 48 0.354 1.766 0.107 1.361 0.058 501407 GG 9 5 9 19 42 GT 15 12 10 4 41 TT 2 2 2 1 7 1.548 1.659 0.107 1.361 0.486 501475 CC 26 19 21 22 88 CT 1 0 0 2 3 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.045 0.026 501958 CC 12 4 8 18 42 CG 6 12 10 4 32 GG 1 2 2 1 6 0.048 2.205 0.196 1.252 0.001 502191 AA 24 22 22 23 91 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 502241 CC 0 0 0 0 0 CG 4 0 0 0 4 GG 21 22 22 24 89 0.189 0.000 0.000 0.000 0.045 502248 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 25 22 22 23 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 502295 CC 4 3 2 1 10 CG 12 14 9 4 39 GG 9 5 10 19 43 0.000 1.766 0.000 1.361 0.067 502302 AA 19 5 10 20 54 AG 5 14 10 4 33 GG 1 3 2 0 6 0.718 1.766 0.050 0.198 0.099 502344 AA 24 22 21 22 89 AT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 502700 AA 25 22 22 24 93 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 502725 AA 1 3 2 1 7 AC 11 14 10 4 39 CC 15 5 10 19 49 0.354 1.766 0.050 1.361 0.040 502786 AA 25 20 21 23 89 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 502875 AA 24 20 21 23 88 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 502998 AA 19 20 21 23 83 AG 7 0 0 0 7 GG 0 0 0 0 0 0.629 0.000 0.000 0.000 0.147 503073 -- 19 20 21 23 83 +- 7 0 0 0 7 ++ 0 0 0 0 0 0.629 0.000 0.000 0.000 0.147 503276 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 0 1 1 TT 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 503406 AA 24 22 22 24 92 AT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.000 0.000 0.024 503518 GG 0 0 0 0 0 GT 0 3 0 0 3 TT 27 19 22 24 92 0.000 0.118 0.000 0.000 0.024 503607 CC 1 3 2 1 7 CT 11 13 10 4 38 TT 15 5 10 19 49 0.354 1.307 0.050 1.361 0.010 503608 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 27 21 22 23 93 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 503616 AA 0 0 0 0 0 AG 3 0 0 0 3 GG 24 21 22 24 91 0.093 0.000 0.000 0.000 0.025 503626 AA 1 3 2 1 7 AG 11 13 10 4 38 GG 15 5 10 19 49 0.354 1.307 0.050 1.361 0.010 504017 CC 22 8 8 10 48 CT 1 11 8 9 29 TT 0 1 6 5 12 0.011 1.286 1.564 1.119 4.340 504107 AA 3 3 2 1 9 AG 12 13 10 4 39 GG 8 4 10 19 41 0.209 1.839 0.050 1.361 0.004 504419 AA 15 5 10 19 49 AC 9 14 10 4 37 CC 1 3 2 1 7 0.060 1.766 0.050 1.361 0.000 504472 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 25 22 22 23 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 504581 AA 20 22 22 24 88 AT 4 0 0 0 4 TT 1 0 0 0 1 1.469 0.000 0.000 0.000 9.001 504603 AA 21 22 22 24 89 AG 4 0 0 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.189 0.000 0.000 0.000 0.045 504892 AA 14 5 8 18 45 AG 9 14 10 4 37 GG 1 3 2 1 7 0.091 1.766 0.196 1.252 0.025 505072 AA 14 14 19 22 69 AC 5 0 0 0 5 CC 0 0 0 0 0 0.436 0.000 0.000 0.000 0.090 505129 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 19 15 19 22 75 0.053 0.000 0.000 0.000 0.013 505268 AA 16 15 19 22 72 AG 3 0 0 0 3 GG 2 0 0 0 2 4.954 0.000 0.000 0.000 23.379 541845 AA 0 0 0 1 1 AC 0 4 4 10 18 CC 25 18 18 13 74 0.000 0.220 0.220 0.296 0.007 541905 CC 25 18 18 13 74 CT 0 4 4 10 18 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.220 0.220 0.296 0.007 542085 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 0 2 2 TT 27 22 22 22 93 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 542275 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 2 2 GG 27 22 22 22 93 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 542751 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 542868 -- 0 0 0 0 0 +- 2 3 4 0 9 ++ 21 18 18 23 80 0.048 0.124 0.220 0.000 0.252 542910 CC 22 22 22 23 89 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 543001 CC 21 22 22 23 88 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.107 0.000 0.000 0.000 0.026 543226 CC 23 22 20 23 88 CG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 543524 AA 26 22 22 24 94 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 543539 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 543590 CC 24 22 21 19 86 CT 3 0 1 5 9 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.012 0.324 0.235 543782 CC 26 21 22 24 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 543871 CC 23 19 20 24 86 CT 4 0 0 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.173 0.000 0.000 0.000 0.046 549771 CC 22 21 22 24 89 CT 4 0 0 0 4 TT 1 0 0 0 1 1.688 0.000 0.000 0.000 9.113 550142 AA 27 22 21 19 89 AG 0 0 1 5 6 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.324 0.101 550541 CC 17 18 15 11 61 CT 10 4 5 12 31 TT 0 0 2 1 3 1.395 0.220 2.001 1.059 0.155 550603 AA 25 21 22 24 92 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 551034 AA 26 22 21 24 93 AT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 551050 -- 22 12 14 21 69 +- 5 9 7 3 24 ++ 0 1 0 0 1 0.281 0.182 0.840 0.107 0.477 551104 -- 20 22 18 23 83 +- 7 0 1 0 8 ++ 0 0 0 0 0 0.599 0.000 0.014 0.000 0.192 551201 CC 0 0 0 0 0 CT 6 0 0 0 6 TT 21 22 19 23 85 0.422 0.000 0.000 0.000 0.106 551240 -- 27 21 14 16 78 +- 0 1 7 8 16 ++ 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.840 0.960 0.813 551266 AA 0 0 0 0 0 AC 4 0 0 0 4 CC 23 22 22 24 91 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 551294 AA 26 22 22 24 94 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 551395 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 22 21 22 23 88 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 551456 AA 21 21 22 23 87 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.048 0.000 0.000 0.000 0.011 551689 AA 16 8 8 6 38 AT 10 11 8 10 39 TT 1 2 6 8 17 0.138 0.416 1.564 0.621 1.507 551729 AA 22 21 22 24 89 AG 5 0 0 0 5 GG 0 0 0 0 0 0.281 0.000 0.000 0.000 0.070 551931 GG 0 1 0 0 1 GT 3 3 4 0 10 TT 19 17 18 24 78 0.118 2.136 0.220 0.000 1.008 552100 AA 22 22 22 24 90 AT 4 0 0 0 4 TT 1 0 0 0 1 1.688 0.000 0.000 0.000 9.224 552264 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 1 0 2 TT 27 21 21 24 93 0.000 0.012 0.012 0.000 0.011 552384 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 27 22 21 24 94 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 552506 AA 25 22 21 23 91 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 552747 AA 21 22 21 24 88 AT 4 0 0 0 4 TT 1 0 0 0 1 1.578 0.000 0.000 0.000 9.001 552971 AA 27 16 15 12 70 AT 0 4 6 11 21 TT 0 0 1 1 2 0.000 0.247 0.153 0.618 0.081 553249 AA 0 0 0 0 0 AC 4 0 0 0 4 CC 23 22 22 24 91 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 553281 AA 23 22 22 24 91 AG 4 0 0 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 553285 CC 1 1 0 0 2 CT 7 9 7 3 26 TT 19 12 15 21 67 0.120 0.182 0.787 0.107 0.081 553531 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 27 21 22 24 94 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 634645 CC 24 22 21 24 91 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 634727 AA 0 0 0 0 0 AG 0 2 0 0 2 GG 27 20 22 24 93 0.000 0.050 0.000 0.000 0.011 634786 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 25 22 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 634857 AA 24 21 22 24 91 AT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 634999 AA 18 8 10 6 42 AG 7 10 8 12 37 GG 0 3 4 6 13 0.663 0.002 1.010 0.000 1.052 635107 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 24 21 22 24 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 635168 AA 18 8 10 6 42 AC 6 10 8 12 36 CC 0 4 4 6 14 0.490 0.079 1.010 0.000 1.739 635474 CC 27 21 16 13 77 CT 0 1 6 10 17 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.012 0.548 0.296 0.003 635489 CC 0 4 4 6 14 CT 7 10 8 12 37 TT 20 8 10 6 44 0.599 0.079 1.010 0.000 1.725 635518 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 2 2 GG 27 22 22 22 93 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 635526 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 635527 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 635826 CC 27 21 21 23 92 CT 0 1 1 1 3 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.012 0.011 0.024 636031 -- 14 14 16 19 63 +- 8 5 2 5 20 ++ 2 0 0 0 2 0.296 0.436 0.062 0.324 0.075 636082 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 16 14 16 19 65 0.000 0.000 0.016 0.000 0.004 636083 CC 12 4 7 3 26 CT 4 7 6 10 27 TT 0 3 4 6 13 0.327 0.000 1.252 0.120 1.461 636099 AA 0 0 0 0 0 AC 0 2 2 1 5 CC 16 12 15 18 61 0.000 0.083 0.066 0.014 0.102 636233 AA 26 16 19 20 81 AT 0 5 3 3 11 TT 0 1 0 0 1 0.000 0.499 0.118 0.112 0.758 636699 CC 0 0 0 0 0 CT 5 0 0 0 5 TT 21 20 19 20 80 0.294 0.000 0.000 0.000 0.078 636754 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 27 21 22 23 93 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 636831 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 27 21 21 24 93 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 636889 CC 26 21 22 24 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 637045 CC 25 16 19 24 84 CT 2 5 3 0 10 TT 0 1 0 0 1 0.040 0.499 0.118 0.000 1.160 637091 AA 7 1 1 0 9 AG 12 9 11 6 38 GG 8 12 10 18 48 0.326 0.182 0.889 0.490 0.136 637146 AA 0 4 4 6 14 AC 6 10 8 12 36 CC 20 8 10 4 42 0.442 0.079 1.010 0.220 1.739 637208 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 1 3 GG 24 22 22 22 90 0.042 0.000 0.000 0.011 0.025 637369 CC 0 4 4 6 14 CG 6 10 8 12 36 GG 20 8 10 6 44 0.442 0.079 1.010 0.000 2.036 637402 AA 26 21 22 24 93 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 637424 GG 26 22 22 23 93 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 638109 AA 0 3 4 6 13 AG 6 10 7 12 35 GG 21 8 10 6 45 0.422 0.002 1.577 0.000 1.989 638297 AA 0 0 0 0 0 AT 2 0 0 0 2 TT 25 21 22 24 92 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 638497 AA 27 22 21 24 94 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 638773 AA 26 21 21 22 90 AC 0 0 0 2 2 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 639306 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 2 0 2 GG 27 22 20 23 92 0.000 0.000 0.050 0.000 0.011 639332 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 1 0 1 CC 27 22 21 24 94 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 639357 AA 22 22 22 24 90 AG 5 0 0 0 5 GG 0 0 0 0 0 0.281 0.000 0.000 0.000 0.069 639361 -- 26 22 22 23 93 +- 1 0 0 1 2 ++ 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.011 0.011 639490 GG 27 20 19 24 90 GT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.013 0.000 0.003 639633 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 0 1 1 GG 27 20 20 23 90 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 639890 CC 19 8 9 6 42 CT 7 10 8 11 36 TT 0 4 4 6 14 0.629 0.079 0.777 0.043 1.739 639891 AA 0 0 0 0 0 AG 0 2 0 0 2 GG 26 20 21 23 90 0.000 0.050 0.000 0.000 0.011 639907 AA 19 8 9 6 42 AG 7 10 8 11 36 GG 0 4 4 6 14 0.629 0.079 0.777 0.043 1.739 639949 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 25 22 21 23 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 640008 AA 26 22 21 22 91 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 640112 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 640114 AA 20 8 10 6 44 AT 7 10 8 12 37 TT 0 4 4 6 14 0.599 0.079 1.010 0.000 1.725 640266 AA 26 22 21 19 88 AG 0 0 1 5 6 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.324 0.102 640582 -- 0 4 4 6 14 +- 7 10 8 12 37 ++ 20 8 10 6 44 0.599 0.079 1.010 0.000 1.725 640657 AA 0 4 4 6 14 AG 7 10 8 12 37 GG 20 8 10 6 44 0.599 0.079 1.010 0.000 1.725 640945 CC 0 4 4 6 14 CT 7 10 8 12 37 TT 20 8 10 6 44 0.599 0.079 1.010 0.000 1.725 640995 AA 22 22 22 24 90 AT 5 0 0 0 5 TT 0 0 0 0 0 0.281 0.000 0.000 0.000 0.069 641077 AA 20 8 10 6 44 AG 7 10 8 12 37 GG 0 4 4 6 14 0.599 0.079 1.010 0.000 1.725 674682 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 674683 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 674736 CC 1 0 0 0 1 CT 7 0 1 0 8 TT 19 22 21 24 86 0.120 0.000 0.012 0.000 2.299 674768 CC 0 4 4 6 14 CT 7 10 8 12 37 TT 20 8 10 6 44 0.599 0.079 1.010 0.000 1.725 674801 AA 26 22 22 24 94 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 674892 CC 8 12 10 18 48 CT 13 9 11 6 39 TT 6 1 1 0 8 0.027 0.182 0.889 0.490 0.000 674924 CC 27 22 21 24 94 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 675116 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 1 0 1 TT 27 22 21 24 94 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 675629 AA 0 4 4 6 14 AT 7 10 8 12 37 TT 20 8 10 6 44 0.599 0.079 1.010 0.000 1.725 675667 AA 27 22 22 23 94 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 675783 AA 27 21 22 24 94 AT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 675789 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 675798 GG 0 4 4 6 14 GT 7 10 8 12 37 TT 20 8 10 6 44 0.599 0.079 1.010 0.000 1.725 676071 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 676399 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 21 21 24 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 676758 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 23 20 21 23 87 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 676819 CC 14 12 10 6 42 CG 9 7 8 11 35 GG 0 3 4 6 13 1.361 1.223 1.010 0.043 1.571 676828 CC 22 21 22 22 87 CT 1 1 0 1 3 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.012 0.000 0.011 0.026 676969 AA 0 2 1 0 3 AG 9 3 8 6 26 GG 14 17 12 17 60 1.361 5.290 0.053 0.517 0.008 708997 AA 0 0 0 0 0 AT 0 0 0 1 1 TT 27 19 20 19 85 0.000 0.000 0.000 0.013 0.003 709296 CC 26 17 17 19 79 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.015 0.000 0.000 0.003 709685 GG 26 19 20 23 88 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 709840 CC 25 17 21 23 86 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 709874 CC 26 18 20 23 87 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 710072 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 2 2 GG 26 18 21 21 86 0.000 0.000 0.000 0.048 0.012 710216 CC 25 21 21 23 90 CG 1 0 0 0 1 GG 1 0 0 0 1 11.304 0.000 0.000 0.000 40.214 710428 AA 5 1 3 0 9 AT 13 8 9 11 41 TT 9 12 9 12 42 0.006 0.053 0.093 2.272 0.048 710456 CC 4 2 4 6 16 CT 11 13 8 10 42 TT 12 6 10 8 36 0.308 1.702 1.010 0.621 0.385 710482 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 710736 AA 0 1 0 1 2 AG 3 6 7 2 18 GG 22 14 15 19 70 0.102 0.114 0.787 4.455 0.415 710848 * 710941 AA 26 15 16 17 74 AG 1 6 6 7 20 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.583 0.548 0.700 1.332 711012 AA 25 15 16 17 73 AC 2 6 6 7 21 CC 0 0 0 0 0 0.040 0.583 0.548 0.700 1.486 711325 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 711373 CC 20 22 20 22 84 CG 6 0 1 0 7 GG 0 0 0 0 0 0.442 0.000 0.012 0.000 0.146 711861 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 1 0 1 CC 25 22 21 23 91 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 712464 CC 25 21 20 17 83 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.015 0.003 712690 CC 23 20 21 24 88 CT 3 1 0 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.097 0.012 0.000 0.000 0.045 712754 AA 10 7 12 8 37 AG 12 11 5 10 38 GG 4 3 4 6 17 0.016 0.159 4.121 0.621 1.626 712896 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 0 1 ++ 25 21 21 24 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 713845 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 714211 AA 26 22 21 24 93 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 004894: t 004936: g 145494: G 341218: C 341806: AT 343186: t 473907: a 474617: at 475548: aataa 489446: AGAA 490057: aat 490162: GATACA 500231: CAA 503073: AT 542868: gt 551050: T 551104: AGTT 551240: A 636031: T 639361: AT 640582: agcc 712896: c Tri-allelic sites: Site Genotype AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop 710848 AA 0 0 0 0 0 710848 AG 0 0 0 3 3 710848 AT 0 0 0 0 0 710848 GG 15 6 10 6 37 710848 GT 10 12 8 9 39 710848 TT 2 3 4 6 15