************************************************************* **** **** **** Output from PHASE v2.0 **** **** Code by M Stephens, with contributions from N Li **** **** **** ************************************************************* BEGIN COMMAND_LINE /net/nickerson/lims/bin/phase/PHASE2 -d1 gabpa.phase.inp gabpa.phase.out END COMMAND_LINE BEGIN OUTFILE_LIST gabpa.phase.out_freqs : haplotype frequency estimates gabpa.phase.out_pairs : most likely haplotype pairs for each individual gabpa.phase.out_recom : estimates of recombination parameters gabpa.phase.out_monitor : file for monitoring convergence END OUTFILE_LIST BEGIN INPUT_SUMMARY Number of Individuals: 95 Number of Loci: 66 Positions of loci: 534 835 1058 1161 1228 1429 2591 2999 3889 3918 4996 5053 5394 5645 6317 6678 7783 7813 9086 9270 12283 12461 12734 13570 13809 14049 14703 14798 15019 15020 16166 16196 16287 16725 16855 17496 18536 18577 19228 19468 20784 20813 20981 22523 22669 22797 22908 23498 24164 27006 27581 29228 29297 29510 29968 31508 31620 31680 32104 35164 35684 35702 37591 37689 37958 38068 END INPUT_SUMMARY List of haplotypes found in best reconstruction, with counts. (See file gabpa.phase.out_freqs for haplotype population frequency estimates) BEGIN LIST_SUMMARY 1 AAATGGCTAGCGCDTCGAGCATIAGCCTGAAACAGCTCTCCADAATIGICDAAGCAIIGGIGCGAD 1.000000 2 AAATGGCTAGCGCDTCGAGCAADATTTTGAAACAGATCTCGAITATIGDTDATACTDDGGIGTAGI 1.000000 3 AAATGGCTAGCGCDTCGAGCAADATTTTGAAACAGCTCTCGAITATIGDTDATACTDDGGIGTAGI 1.000000 4 AAATGGCTAGCGCDCCGAGCGTDAGCCCGAAGCAGCTCTCGGDTATIGICDAAAAADDAGIGCGAI 1.000000 5 AAATGGCTAGCGCDCCGAGCGTDAGCCCGAAGCAGCTCTCGGDAATIGICDAAAAADDAGIGCGAI 2.000000 6 AAATGGCTAGCGCDCTGAGCGTDAGCCCGAAGCAAAGCCCGGDAATIGICDAAACADDATIGCGAI 1.000000 7 AAATGGCTAGCTCDTTGTGCATDAGCCTGAAACAGAGCCCGADTATIGITDAAACADIGGIACGAI 1.000000 8 AAATGGCTAGTGCDTCGAGCATIAGCCTGAAACAGCTCTCCADAATIGICDAAGCAIIGGIGCGAD 1.000000 9 AAATGGCTAGTGCDTCGAGCAADAGCTTGAAACAGCTCTCGAIAATIGICDAAACAIIGGIACGAI 1.000000 10 AAATGGCTAGTGCDTTGAGTATDAGCCTGAAACAGAGTTTCADAATIGITDGAGCAIIGGIACGAD 1.000000 11 AAATGGCTAGTGCDCTGAGCGTDAGCCCGAAGCAAAGCCCGGDAATIGICDAAACADDATIGCGAI 1.000000 12 AAATGGCTAGTGCDCTGAGTATDAGCCCGAAGCAGAGTTTGGDAATIGICDGAACADDAGIACGAI 1.000000 13 AAATGGCTAGTGCDCTGAGTAADGTTTTGAAATAGAGTTTGAIAATIGICDGTACTDDGGIATAGI 1.000000 14 AAATGGCTAGTTADTTAAGCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADAATIGICIAAGCAIIGTIACGAD 2.000000 15 AAATGGCTAGTTCDTTGAGCATDAGCCTGAAACAAAGCCCGADAATIGICIAAACADIGTIACGAI 1.000000 16 AAATGGCTAGTTCDTTGAGCATIAGCCTCTGACAAAGCCCCADAATIGITDAAACAIDGTDACGAI 1.000000 17 AAATGGCTAGTTCDTTGAGCATIGGCCTCTGACAAAGCCCCADTATIGICIAAACAIIGTIACGAI 1.000000 18 AAATGGCTAGTTCDTTGAGCATIGGCCTCTGACAAAGCCCCADAATIGICIAAACAIIGTIACGAI 4.000000 19 AAATGGTTAGCTCDTTGAGCATIAGCCTGAAACAGAGCCCCADAATIGICDAAACAIIGGIACGAI 1.000000 20 AAATGGTTAGCTCDTTGAGCAADATTTTGAAATAGAGCCCCADTATIGITDAAACADIGTDACGAI 1.000000 21 AAGTGGCTAGCGCITCGAGCATIAGCCTGAAACAGCTCTCCADAGCIGICDGTACADIGGIACGAD 1.000000 22 AAGTGGCTAGCGCICCGAGCGTDAGCCCGAAGCAACTCTCGGDTATIGICDAAAAADDAGIGCGAI 1.000000 23 AAGTGGCTAGCGCDTCGAGCATIAGCCTGAAACAGCTCTCCADAATIGICDAAGAAIIGGIGCGAD 2.000000 24 AAGTGGCTAGCGCDCCGAGCATDAGCCCGAAGCAGCTCTCGGDAATIGICDAAAAADDAGIGCGAI 2.000000 25 AAGTGGCTAGCGCDCCGAGCGTDAGCCCGAAGCAGATCTCCGDAATIGICDAAAAADDAGIGCGAI 1.000000 26 AAGTGGCTAGCGCDCCGAGCGTDAGCCCGAAGCAGATCTCGGDAATIGICDAAAAADDAGIGCGAI 2.000000 27 AAGTGGCTAGCGCDCCGAGCGTDAGCCCGAAGCAGCTCTCGGDAATIGICDAAAAADDAGIGCGAI 20.000000 28 AAGTGGCTAGCGCDCCGAGCGTDAGCCCGAAGCAGCTCTCGGDAATIGITDAAAAADDAGIGCGAI 1.000000 29 AAGTGGCTAGCGCDCCGTGCGTDAGCCCGAAGCAGCTCTCGGDAATIGICDAAAAADDAGIGCGAI 1.000000 30 AAGTGGCTAGCGCDCTGAGCGTDAGCCCGAAACAGATCTCGGDAATIGICDAAAAADDAGIGCGAI 1.000000 31 AAGTGGCTAGTTCDTTGAGCATIGGCCTCTGACAAAGCCCCADAATIGICIAAACAIIGTIACGAI 1.000000 32 ATAGGCCCATCGCITTGAGTAADATTTTGAAACAGCGTTTGAIAGCIGICDGTACTDDGGIATAGI 2.000000 33 ATAGGCTCATCGAITTAAGTATIAGCCTGAAACAGAGTTTCADAATIGICDAAAAADDAGIGCGAI 1.000000 34 ATAGGCTCATCGAITTAAGTATIAGCCTGAAACAGAGTTTCADAGCIGICDGAGCAIIGGIACGAD 1.000000 35 ATAGGCTCATCGAITTAAGTATIAGCCTGAAACAGAGTTTCADAGCIGICDGTGCADIGGIACGAD 1.000000 36 ATAGGCTCATCGAITTAAGTAADATCTTGAAACAGAGTTTGAIAGCIGICIGTACTDDGGIATAGI 1.000000 37 ATAGGCTCATCGAITTAAGTAADATTTTGAAATAGAGTTTGAIAGCIGICDGTACTDDGGIATAGI 4.000000 38 ATAGGCTCATCGCITTGAGTATIAGCCTGAAACAGAGTTTCADAGCIGICDGAGCAIIGGIACGAD 1.000000 39 ATAGGCTCATCGCITTGAGTATIAGCCTGAAACAGAGTTTCADAGCIGICDGTACADIGGIACGAD 1.000000 40 ATAGGCTCATCGCITTGAGTATIAGCCTGAAACAGAGTTTCADAGCIGICDGTGCAIIGGIACGAD 2.000000 41 TAATGGCTAGCGCITTGTCCAADATTTTGAAATAACGCCCGAITATIGDTDATACTDDGTDATAGI 2.000000 42 TAATGGCTAGCGCDTTGACCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGDTDAAGCAIIGTIACGAD 1.000000 43 TAATGGCTAGCGCDTTGACCATIAGCCTGAAACGAAGCCCCADTATIADTDAAGCAIIGTIACGAD 1.000000 44 TAATGGCTAGCGCDTTGACCATIAGCCTGAAACGAAGCCCCADTATDADTDAAGCAIIGTIACGAD 1.000000 45 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATDAGCCTGAAACAGAGCCCGADTATIGITDAAACADIGGIACGAI 1.000000 46 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATDAGCCTGAAACAAAGCCCGADTATIGDTDAAACADIGTIACGAI 1.000000 47 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATDAGCCTGAAACGAAGCCCCADTATDADTDAAGCAIIGTIACGAD 3.000000 48 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATDAGCCTGAAACGAAGCCCCADAATDADTDAAGCAIIGTIACGAD 1.000000 49 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATDAGCCCGAAGCAAAGCCCGGDTATIGDTDAAACADDGTIACGAI 3.000000 50 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATDAGCCCGAAGCAAAGCCCGGDTATIGDTDAAACADDGTIGCGAI 1.000000 51 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATDAGCCCGAAGCAAAGCCCGGDTATDGDTDAAACADDGTIACGAI 1.000000 52 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGITDAAACAIDGTDACGAI 1.000000 53 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGITDAAACAIIGTDACGAI 4.000000 54 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGITDAAGCAIIGTIACGAD 1.000000 55 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGDCDAAGCAIIGTIACGAD 1.000000 56 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGDTDAAACAIIGTIACGAI 1.000000 57 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGDTDAAGCAIIGTIACGAI 2.000000 58 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGDTDAAGCAIIGTIACGAD 15.000000 59 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATDGDTDAAGCAIIGTIACGAD 8.000000 60 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATDADTDAAGCAIIGTIACGAI 2.000000 61 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACGAAGCCCCADTATDAICDAAGCAIIGTIACGAD 1.000000 62 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACGAAGCCCCADTATDAITDAAGCAIIGTIACGAD 1.000000 63 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACGAAGCCCCADTATDADTDAAACADDGTIGCGAI 1.000000 64 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACGAAGCCCCADTATDADTDAAACADIGTIACGAI 1.000000 65 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACGAAGCCCCADTATDADTDAAGCAIIGTIACGAD 25.000000 66 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIGGCCTCTGACAAAGCCCCADAGTIGICDAAACADIGTIACGAI 1.000000 67 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIGGCCTCTGACAAAGCCCGAIAATIGICDGTACTDDGGIATAGI 1.000000 68 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCATIGGCCTCTGACGAAGCCCCADTATDADTDAAACADIGTIACGAI 1.000000 69 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCAADAGCTTGAAACAAAGCCCGAITATIGDTDAAACADDGTIACGAI 2.000000 70 TAATGGCTAGCGCDTTGTCCAADATTTTGAAATGAAGCCCGAITATDADTDATACTDDGTIATAGI 2.000000 71 TAATGGCTAGCGCDCTGTCCGTDAGCCCGAAGCAAAGCCCGGDTATIGDTDAAACADDATIACGAI 1.000000 72 TAATGGCTGGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGITDAAACAIIGTDACGAI 1.000000 73 TAATGGCTGGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGITDAAGCAIIGTDACGAD 2.000000 74 TAATGGTCATCGCITTGAGTATIAGCCTGAAACAGAGTTTCADAGCIGICDGAGCAIIGGIACGAD 1.000000 75 TAATAGCTAGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGITDAAACAIIGTDACGAI 9.000000 76 TAATAGCTAGCGCDTTGTCCATIGGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGITDAAACAIIGTDACGAI 1.000000 77 TAATAGCTGGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGITDAAACAIIGTDACGAI 14.000000 78 TAATAGCTGGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATIGITDAAGCAIIGTDACGAD 1.000000 79 TAATAGCTGGCGCDTTGTCCATIAGCCTGAAACAAAGCCCCADTATDGITDAAACAIIGTDACGAI 1.000000 END LIST_SUMMARY Summary of best reconstruction (numbers refer to the list of haplotypes given above) BEGIN BESTPAIRS_SUMMARY D001: (21,33) D002: (69,70) D003: (9,63) D004: (23,35) D005: (53,64) D006: (32,46) D007: (6,36) D008: (69,75) D009: (41,77) D010: (12,37) D011: (10,73) D012: (49,65) D013: (11,41) D014: (19,38) D015: (23,32) DY01: (13,77) DY02: (15,39) DY03: (40,51) DY04: (50,65) DY05: (49,56) DY06: (58,65) DY07: (68,70) DY08: (49,65) DY09: (34,52) DY10: (20,67) DY11: (3,66) DY12: (2,58) E101: (1,78) E102: (58,58) E103: (14,40) E104: (8,58) E105: (58,73) E106: (22,65) E107: (60,65) E108: (42,77) E109: (65,77) E110: (47,57) E111: (65,77) E112: (47,71) E113: (14,74) E114: (47,77) E115: (58,60) E116: (65,79) E117: (5,65) E118: (58,72) E119: (58,65) E120: (48,58) E121: (54,62) E122: (65,77) H101: (27,58) H102: (59,61) H103: (59,76) H104: (4,17) H105: (27,28) H106: (27,57) H107: (65,75) H108: (5,65) H109: (75,77) H110: (7,55) H111: (18,65) H112: (27,29) H113: (43,44) H114: (31,65) H115: (26,75) H116: (59,65) H117: (18,53) H118: (27,58) H119: (58,65) H120: (18,59) H121: (16,45) H122: (58,65) X101: (26,30) X102: (24,24) X103: (53,58) X104: (65,75) X105: (65,65) X106: (27,65) X107: (27,27) X108: (27,53) X109: (18,77) X110: (27,27) X111: (27,75) X112: (65,65) X113: (27,27) X114: (27,27) X115: (59,75) X116: (27,59) X117: (37,77) X118: (25,77) X119: (27,77) X120: (59,75) X121: (77,77) X122: (37,59) X123: (27,75) X124: (27,37) END BESTPAIRS_SUMMARY Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in []: BEGIN BESTPAIRS1 0 D001 A A G T G G C T A G C G C I T C G A G C A T I A G C C T G A A A C A G C T C T C C A D A G C I G I C D G T A C A D I G G I A C G A D A T A G G C T C A T C G A I T T A A G T A T I A G C C T G A A A C A G A G T T T C A D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I 0 D002 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A A D A G C T T G A A A C A A A G C C C G A I T A T I G D T D A A A C A D D G T I A C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A A D A T T T T G A A A T G A A G C C C G A I T A T D A D T D A T A C T D D G T I A T A G I 0 D003 (A) A A T G G C T A G (T) G C D T (C) G [A] (G) C A A D A G C T T G A A A C A G C T C T C G A I [A] A T I G I C D A A A C A I I G G I A C G A I (T) A A T G G C T A G (C) G C D T (T) G [T] (C) C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A A C A D D G T I G C G A I 0 D004 A A G T G G C T A G C G C D T C G A G C A T I A G C C T G A A A C A G C T C T C C A D A A T I G I C D A A G A A (I) I G G I G C G A D A T A G G C T C A T C G A I T T A A G T A T I A G C C T G A A A C A G A G T T T C A D A G C I G I C D G T G C A (D) I G G I A C G A D 0 D005 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A A C A D I G T I A C G A I 0 D006 A T A G G C C C A T C G C I T T G A G T A A D A T T T T G A A A C A G [C] G T T T G A I A G C I G I C D G T A C T D D G G I A T A G I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T D A G C C T G A A A C A A A G C C C G A D T A T I G D T D A A A C A D I G T I A C G A I 0 D007 A A A T G G C T A G C G C D C T G A G C G T D A G C C C G A A G C A A A G C C C G G D A A T I G I C D A A A C A D D A T I G C G A I A T A G G C T C A T C G A I T T A A G T A A D A T C T T G A A A C A G A G T T T G A I A G C I G I C I G T A C T D D G G I A T A G I 0 D008 [T] A A T G G C T A G C G C D T [T] G [T] [C] C A A D A G C T T G A A A C A [A] [A] [G] C [C] C G A I [T] A T I G [D] [T] D A A A C A [D] [D] G [T] I A C G A I T A A T [A] G C T [A] G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 D009 T A A T G G C T A G C G C I T T G T C C A A D A T T T T G A A A T A A C G C C C G A I T A T I G D T D A T A C T D D G T D A T A G I T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 D010 A A A T G G C T A G T G C D C T G A G T A T D A G C C C G A A G C A G A G T T T G G D A A T I G I C D G A A C A D D A G I A C G A I A T A G G C T C A T C G A I T T A A G T A A D A T T T T G A A A T A G A G T T T G A I A G C I G I C D G T A C T D D G G I A T A G I 0 D011 A A A T G G C T A G T G C D T T G A G T A T (D) A G C C T G A A A C A G A G T T T C A D A A T I G [I] T D G A G C A I I G G I A C G A D T A A T G G C T G G C G C D T T G T C C A T (I) A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A G C A I I G T D A C G A D 0 D012 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T D A G C C C G A A G C A A A G C C C G G D T A T I G D T D A A A C A D D G T I A C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 D013 A A A T G G C T A G T G C D C T G A G C G T D A G C C C G A A G C A A A G C C C G G D A A T I G I C D A A A C A D D A T I G C G A I T A A T G G C T A G C G C I T T G T C C A A D A T T T T G A A A T A A C G C C C G A I T A T I G D T D A T A C T D D G T D A T A G I 0 D014 A A A T G G T T A G C T C D T T G A G C A T I A G C C T G A A A C A G A G C C C C A D A A T I G I C D A A A C A I I G G I A C G A I A T A G G C [T] C A T C G C I T T G A G T A T I A G C C T G A A A C A G A G T T T C A D A G C I G I C D G A G C A I I G G I A C G A D 0 D015 A A G T G G C T A G C G C D T C G A G C A T I A G C C T G A A A C A G C T C T C C A D A A T I G I C D A A G A A I I G G I G C G A D A T A G G C C C A T C G C I T T G A G T A A D A T T T T G A A A C A G [C] G T T T G A I A G C I G I C D G T A C T D D G G I A T A G I 0 DY01 A A A T G G C T A G T G C D C T [G] A G T A A D (G) T T T T G A A A T A G A G T T T G A I A A T I G I C D [G] T A C T D D G G I A T A G I T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I (A) G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 DY02 A A A T G G C T A G T T C D T T G A G C A T D A G C C T G A A A C A A A G C C C G A D A (A) (T) I G I C (I) (A) (A) A C A D I G (T) I A C G A (I) A T A G G C T C A T C G C I T T G A G T A T I A G C C T G A A A C A G A G T T T C A D A (G) (C) I G I C (D) (G) (T) A C A D I G (G) I A C G A (D) 0 DY03 A T A G G C T C A T C G C I T T G A G T A T I A G C C T G A A A C A G A G T T T C A D A G C I G I C D G T G C A I I G G I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T D A G C C C G A A G C A A A G C C C G G D T A T D G D T D A A A C A D D G T I A C G A I 0 DY04 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T D A G C C C G A A G C A A A G C C C G G D T A T I G D T D A A (A) C A (D) (D) G T I (G) C G A (I) T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A (G) C A (I) (I) G T I (A) C G A (D) 0 DY05 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T D A G C C C G A A G C A A A G C C C G G D T A T [I] G D T D A A A C A D D G T I A C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T [I] G D T D A A A C A I I G T I A C G A [I] 0 DY06 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 DY07 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I G G C C T C T G A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A A C A D I G T I A C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A A D A T T T T G A A A T G A A G C C C G A I T A T D A D T D A T A C T D D G T I A T A G I 0 DY08 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T D A G C C C G A A G C A A A G C C C G G D T A T I G D T D A A A C A D D G T I A C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 DY09 A T A G G C T C A T C G A I T T A A G T A T I A G C C T G A A A C A G A G T T T C A D A G C I G I C D G A G C A I (I) G G I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D [T] A T I G I T D A A A C A I (D) G T D A C G A I 0 DY10 (A) A A T G G (T) T A G C (T) C D T T G (A) (G) C A A D A T T T T G A A A T A G A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A D I G T D A C G A I (T) A A T G G (C) T A G C (G) C D T T G (T) (C) C A T I G G C C T C T G A C A A A G C C C G A I A A T I G I C D [G] T A C T D D G G I A T A G I 0 DY11 A A A T G G C T A G C G C D T C G A G C A A D A T T T T G A A A C A G (C) T C T C G A I T (A) T I G D T D A T A C T D D G G I G T A G I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I G G C C T C T G A C A A (A) G C C C C A D A (G) T I G I C D A A A C A D I G T I A C G A I 0 DY12 A A A T G G C T A G C G C D T C G A G C A A D A T T T T G A A A C A G A T C T C G A I T A T I G D T D A T A C T D D G G I G T A G I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 E101 A A A T (G) G C T A G C G C D T C G A G C A T I A G C C T G A A A C A G C T C T C C A D A A T I G I C D A A G C A I I G G I G C G A D T A A T (A) G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A G C A I I G T D A C G A D 0 E102 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 E103 A A A T G G C T A G T T A D T T A A G C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D A A T I G I C I A A G C A I I G T I A C G A D A T A G G C T C A T C G C I T T G A G T A T I A G C C T G A A A C A G A G T T T C A D A G C I G I C D G T G C A I I G G I A C G A D 0 E104 A A A T G G C T A G (T) G C D T C G A G C A T I A G C C T G A A A C A G C T C T C C A D A A T I G I C D A A G C A I I G G I G C G A D T A A T G G C T A G (C) G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A [D] 0 E105 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A G C A I I G T D A C G A D 0 E106 A A G T G G C T A G C G C (I) C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A A C T C T C G G D T A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T G G C T A G C G C (D) T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 E107 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C (A) A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C (G) A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 E108 T A A T G G C T A G C G C D T T G (A) C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T A G C T G G C G C D T T G (T) C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 E109 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 E110 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T D A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A (D) T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A (I) 0 E111 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 E112 T A A T G G C T A G C G C D (T) T G T C C (A) T D A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A [D] T A A T G G C T A G C G C D (C) T G T C C (G) T D A G C C C G A A G C A A A G C C C G G D T A T I G D T D A A A C A D D A T I A C G A I 0 E113 A A A T G G C T A G T T A D T T A A G C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D A A T I G I C I A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G T C A T C G C I T T G A G T A T I A G C C T G A A A C A G A G T T T C A D A G C I G I C D G A G C A I I G G I A C G A D 0 E114 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T D A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 E115 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A [I] 0 E116 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T D G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 E117 A A A T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 E118 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A (G) C A I I G T I A C G A (D) T A A T G G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A (A) C A I I G T D A C G A (I) 0 E119 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 E120 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T D A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D (A) A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D (T) A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A [D] 0 E121 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A I T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 E122 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 H101 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 H102 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C (A) A A G C C C C A D T A T D (G) D (T) D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C (G) A A G C C C C A D T A T D (A) I (C) D A A G C A I I G T I A C G A D 0 H103 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I (A) G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T D G D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T A G C T A G C G C D T T G T C C A T I (G) G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 H104 A A A T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D T A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I A A A T G G C T A G T T C D T T G A G C A T I G G C C T C T G A C A A A G C C C C A D T A T I G I C I A A A C A I I G T I A C G A I 0 H105 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I T D A A A A A D D A G I G C G A I 0 H106 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A I 0 H107 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T A G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 H108 A A A T G G C T A G C G C D C C G A G C [G] T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 H109 T A A T A G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 H110 (A) A A T G G C T A G C (T) C D T T G T (G) C A T D A G C C T G A A A C A G A G C C C G A D T A T I G I (T) D A A A C A D I G G I A C G A I (T) A A T G G C T A G C (G) C D T T G T (C) C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G [D] (C) D A A G C A I I G T I A C G A D 0 H111 A A A T G G C T A G T T C D T T G A G C A T I G G C C T C T G A C A A A G C C C C A D A A T I G I C I A A A C A I I G T I A C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 H112 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I A A G T G G C T A G C G C D C C G T G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I 0 H113 T A A T G G C T A G C G C D T T G A C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T I A D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G A C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 H114 A A (G) T G G C T A G T T C D T T G A G C A T I G G C C T C T G A C A A A G C C C C A D A A T I G I C I A A A C A I I G T I A C G A I T A (A) T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 H115 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G A T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T A G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 H116 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T D G D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 H117 A A A T G G C T A G T T C D T T G A G C A T I G G C C T C T G A C A A A G C C C C A D A A T I G I C I A A A C A I I G T I A C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 H118 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 H119 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 H120 A A A T G G C T A G T T C D T T G A G C A T I G G C C T C T G A C A A A G C C C C A D [A] A T I G I C I A A A C A I I G T I A C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T D G D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 H121 (A) A A T G G C T A G (T) (T) C D T T G (A) (G) C A T I A G C C T C T G A C A A A G C C C C A D A A T I G I T D A A A C A I (D) G T D A C G A I (T) A A T G G C T A G (C) (G) C D T T G (T) (C) C A T D A G C C T G A A A C A G A G C C C G A D T A T I G I T D A A A C A D (I) G G I A C G A I 0 H122 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 X101 A A G T G G C T A G C G C D C (C) G A G C G T D A G C C C G A A G C A G A T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I A A G T G G C T A G C G C D C (T) G A G C G T D A G C C C G A A A C A G A T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I 0 X102 A A [G] T G G C T A G C G C D C C G A G C A T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I A A [G] T G G C T A G C G C D C C G A G C A T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I 0 X103 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 X104 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T A G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 X105 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 X106 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 X107 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I 0 X108 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 X109 A A A T G G C T A G T T C D T T G A G C A T I G G C C T C T G A C A A A G C C C C A D A A T I G I C I A A A C A I I G T I A C G A I T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 X110 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I A A [G] T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I 0 X111 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T A G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 X112 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C G A A G C C C C A D T A T D A [D] T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 X113 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I 0 X114 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I 0 X115 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T D G D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T A G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 X116 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T D G D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 X117 A T A G G C T C A T C G A I T T A A G T A A D A T T T T G A A A T A G A G T T T G A I A G C I G I C D G T A C T D D G G I A T A G I T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 X118 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G A T C T C C G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 X119 A A [G] T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 X120 T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T D G D T D A A G C A I I G T I A C G A D T A A T A G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 X121 T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I T A A T A G C T G G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 X122 A T A G G C T C A T C G A I T T A A G T A A D A T T T T G A A A T A G A G T T T G A I A G C I G I C D G T A C T D D G G I A T A G I T A A T G G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T D G D T D A A G C A I I G T I A C G A D 0 X123 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I T A A T A G C T A G C G C D T T G T C C A T I A G C C T G A A A C A A A G C C C C A D T A T I G I T D A A A C A I I G T D A C G A I 0 X124 A A G T G G C T A G C G C D C C G A G C G T D A G C C C G A A G C A G C T C T C G G D A A T I G I C D A A A A A D D A G I G C G A I A T A G G C T C A T C G A I T T A A G T A A D A T T T T G A A A T A G A G T T T G A I A G C I G I C D G T A C T D D G G I A T A G I END BESTPAIRS1 Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in [] with phase known positions indicated by = BEGIN BESTPAIRS2 0 D001 = A G T = G ? T = G = = C = = C G = = C = = ? ? ? ? = = = = = = = = = C T C = C = = = ? ? C = = = = = G T = C = ? ? ? = = A ? ? ? ? = T A G = C ? C = T = = A = = T A = = T = = ? ? ? ? = = = = = = = = = A G T = T = = = ? ? T = = = = = A A = A = ? ? ? = = G ? ? ? ? 0 D002 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G C = = = = = = C A = = = = = = = = = = = = I G ? = ? ? ? = ? A = = = = = = C G A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T T = = = = = = T G = = = = = = = = = = = = D A ? = ? ? ? = ? T = = = = = = T A G = 0 D003 (A) = = = = = = = = = (T) = = = = (C) ? ? (G) = = A D = = = T = = = = = = A G C T = T ? G = I ? ? = I G I C = = = = = = I I = G = A = = = = (T) = = = = = = = = = (C) = = = = (T) ? ? (C) = = T I = = = C = = = = = = G A A G = C ? C = D ? ? = D A D T = = = = = = D D = T = G = = = = 0 D004 = A G T = G C T = G = = C D = C G = = C = = = = = = = = = = = = = = = C T C = C = = = = A T = = = = = A A = A = (I) = = = = G = = = = = T A G = C T C = T = = A I = T A = = T = = = = = = = = = = = = = = = A G T = T = = = = G C = = = = = G T = C = (D) = = = = A = = = = 0 D005 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = I G I = = = = = = = I = = = D = ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = D A D = = = = = = = D = = = I = ? = = ? 0 D006 A T = G = C ? C = T = = = I = = = A G T = A = = T T T = = = = = = = G ? = T T T = = I A G C = = I C = G T = = T = D = G = = T A G = T A = T = G ? T = G = = = D = = = T C C = T = = G C C = = = = = = = A ? = C C C = = D T A T = = D T = A A = = A = I = T = = C G A = 0 D007 = A = T = G ? T = G = = C D C = G = = C G T = = G = C C = = = G = = A ? = C C C = G D ? ? T = = = = D A A = = A = = A T = G C G A ? = T = G = C ? C = T = = A I T = A = = T A A = = T = T T = = = A = = G ? = T T T = A I ? ? C = = = = I G T = = T = = G G = A T A G ? 0 D008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? = A D = = = T = = = = = = ? ? ? ? ? ? ? G = I ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = ? = ? ? = ? ? ? = = = = ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? = T I = = = C = = = = = = ? ? ? ? ? ? ? C = D ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = ? = ? ? = ? ? ? = = = = 0 D009 ? ? = = ? = ? = A = = = = I = = ? ? = = = A D = T T T = = = = = T = = ? = = = = G = I ? ? = = = ? ? = = T = ? T D D = = ? ? T A G = ? ? = = ? = ? = G = = = = D = = ? ? = = = T I = G C C = = = = = C = = ? = = = = C = D ? ? = = = ? ? = = A = ? A I I = = ? ? C G A = 0 D010 = A = T = G ? T = G T = C D C = G = = = = T = = G C C C = = = G C = = = = = = = = G D = A T = = ? ? = = A = = A = = A = = = C G A = = T = G = C ? C = T C = A I T = A = = = = A = = T T T T = = = A T = = = = = = = = A I = G C = = ? ? = = T = = T = = G = = = T A G = 0 D011 A = ? = = = ? = A = T = = = = = = A G T = = (D) = = = = = = = = = = = G = = T T T = = = A = = = = ? = = G = = = = = = = G I ? = = = = T = ? = = = ? = G = C = = = = = = T C C = = (I) = = = = = = = = = = = A = = C C C = = = T = = = = ? = = A = = = = = = = T D ? = = = = 0 D012 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = C = = = G = A = ? = = = = G G = ? ? = I G ? = = = = A = = D D = = = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = I = = = = T = = = A = G = ? = = = = C A = ? ? = D A ? = = = = G = = I I = = = = = = = D 0 D013 A = = = = = ? = = = T = = ? C = ? ? G = G T = = G C ? ? = = = G C = = ? = = = = = G D A = = = = ? C = = A = = A = = A = I G C G A = T = = = = = ? = = = C = = ? T = ? ? C = A A = = T T ? ? = = = A T = = ? = = = = = A I T = = = = ? T = = T = = T = = G = D A T A G = 0 D014 = A = T = G ? T = G = T = ? = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = ? = C C C = = = = A T = = ? = = A = A = = = = = = = = = = = I = T = G = C ? C = T = G = ? = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = ? = T T T = = = = G C = = ? = = G = G = = = = = = = = = = = D 0 D015 = A G T = G = T = G = = = ? = C ? = = C = T I = G C C = = = = = = = = ? T C = C C = D = A T = = ? ? = A A G A A I I = = = G C G A D = T A G = C = C = T = = = ? = T ? = = T = A D = T T T = = = = = = = = ? G T = T G = I = G C = = ? ? = G T A C T D D = = = A T A G I 0 DY01 A = = ? G = ? = A = T = = ? C = ? ? G T = A D (G) T T ? ? = = = = T = G ? = T T T G = I A = = ? = ? C ? ? T = = T ? ? = G ? = T A G = T = = ? A = ? = G = C = = ? T = ? ? C C = T I (A) G C ? ? = = = = C = A ? = C C C C = D T = = ? = ? T ? ? A = = A ? ? = T ? = C G A = 0 DY02 = A ? ? = G C T = G T T = D = = = = = C = = D = = = = = = = = = = = A = = C C C G = = = (A) (T) = = ? = (I) (A) (A) = = = = = = (T) = = = = = (I) = T ? ? = C T C = T C G = I = = = = = T = = I = = = = = = = = = = = G = = T T T C = = = (G) (C) = = ? = (D) (G) (T) = = = = = = (G) = = = = = (D) 0 DY03 A T ? ? = C T C = T = = = I = = = A G T = = I = = = = T = = = A = = G = = T T T C A = A G C I = ? C = G T G = = I I = G = = = = = D T A ? ? = G C T = G = = = D = = = T C C = = D = = = = C = = = G = = A = = C C C G G = T A T D = ? T = A A A = = D D = T = = = = = I 0 DY04 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = = ? = C = = = G = A = = ? ? = = G G = = = = I G = = = = = (A) = = (D) (D) = = = (G) = = = (I) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = I = = ? = T = = = A = G = = ? ? = = C A = = = = D A = = = = = (G) = = (I) (I) = = = (A) = = = (D) 0 DY05 = = = = = = = = ? ? = = ? = = ? = = = = = = D = = = = C = = ? ? ? = = = = = = = G G = = = = ? = = = = = = = = = D D = = = = = = ? ? = = = = = = = = ? ? = = ? = = ? = = = = = = I = = = = T = = ? ? ? = = = = = = = C A = = = = ? = = = = = = = = = I I = = = = = = ? ? 0 DY06 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = I G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = D A = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 DY07 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T I G G C C = C T G = C = = = = = = = C = D = = = = = = = = = A = = A = I = = = = C G A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A D A T T T = G A A = T = = = = = = = G = I = = = = = = = = = T = = T = D = = = = T A G = 0 DY08 = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = C = = ? ? ? A = = = = = = G G = = = = I G ? ? = = = A = = D D = = = = = = = I = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = I = = = = T = = ? ? ? G = = = = = = C A = = = = D A ? ? = = = G = = I I = = = = = = = D 0 DY09 A T = G = C ? C = T = = A I = = A A G T = = = = = = = = = = = = = = G = = T T T = = = ? ? C = = = C = G = G = = = (I) = G I = = = = D T A = T = G ? T = G = = C D = = G T C C = = = = = = = = = = = = = = A = = C C C = = = ? ? T = = = T = A = A = = = (D) = T D = = = = I 0 DY10 (A) = = = = = (T) = = = = (T) = = = = = (A) (G) = = A D A T T T = G A A = T = G = = = = = C = D T = = = = = T = ? A = = A = I = T D = C G A ? (T) = = = = = (C) = = = = (G) = = = = = (T) (C) = = T I G G C C = C T G = C = A = = = = = G = I A = = = = = C = ? T = = T = D = G I = T A G ? 0 DY11 A = = = = = = = = = = = = = = C = A G = = A D A T T T = G A A = = = G (C) T = T = G = I T (A) = = = ? T = = T = = T = D = G = G T A G = T = = = = = = = = = = = = = = T = T C = = T I G G C C = C T G = = = A (A) G = C = C = D A (G) = = = ? C = = A = = A = I = T = A C G A = 0 DY12 A = = = = = = = = = = = = = = C = A G = = A D = T T T = = = = = = = G = T = T = G = I = = = = = = = = = T A = T D D = G = G T A G I T = = = = = = = = = = = = = = T = T C = = T I = G C C = = = = = = = A = G = C = C = D = = = = = = = = = A G = A I I = T = A C G A D 0 E101 A = = = (G) = = = A = = = = = = C = A G = = = = = = = = = = = = = = = G C T = T = = = = A = = = = = C = = = = = = = = = G I G = = = = T = = = (A) = = = G = = = = = = T = T C = = = = = = = = = = = = = = = A A G = C = = = = T = = = = = T = = = = = = = = = T D A = = = = 0 E102 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E103 = A = T = G C T = G T T A D = = A = = C = = = = = = = = = = = = = = A = = C C C = = = = A T = = = = I A A = = = = = = T ? = = ? ? ? = T = G = C T C = T C G C I = = G = = T = = = = = = = = = = = = = = G = = T T T = = = = G C = = = = D G T = = = = = = G ? = = ? ? ? 0 E104 A = = = = = = = = = (T) = = = = C = A G = = = = = = = = = = = = = = = G ? T = T = = = = A = = = = I C = = = = = = = = = G = G ? ? ? ? T = = = = = = = = = (C) = = = = T = T C = = = = = = = = = = = = = = = A ? G = C = = = = T = = = = D T = = = = = = = = = T = A ? ? ? ? 0 E105 = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = ? = = = = = = = = D = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = ? = = = = = = = = I = = = = = = = = = = = D = = = = = 0 E106 A = G = = = = = = = = = = (I) C C = A ? ? G = D = = = = C = = = G = ? = C ? ? T = G G = = = = I G I C = = = A A = D D A G ? G = = = I T = A = = = = = = = = = = (D) T T = T ? ? A = I = = = = T = = = A = ? = A ? ? C = C A = = = = D A D T = = = G C = I I G T ? A = = = D 0 E107 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? (A) = = = = = = = = = = = = ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? (G) = = = = = = = = = = = = ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? D 0 E108 = = = = G = = = A = = = = = = = = (A) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = G = = = = = = I = = = = D = = = = A = = = G = = = = = = = = (T) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = I = = = = A = = = = = = D = = = = I 0 E109 = = = = G = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = D A ? = = = = G = = = = = = I = = = = D = = = = A = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = I G ? = = = = A = = = = = = D = = = = I 0 E110 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = ? ? ? G = = = = = = = = = = = = D A = = = = = = = = = = = = = = = = = (D) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = ? ? ? A = = = = = = = = = = = = I G = = = = = = = = = = = = = = = = = (I) 0 E111 = = = = G ? = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = D A D = = = = G = = = = = = I = ? ? ? ? = = = = A ? = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = I G I = = = = A = = = = = = D = ? ? ? ? 0 E112 = = = = = = = = = = = = = = (T) = = = = = (A) = = = = = = T = = ? ? ? G = = = = = = C A = = = = D A = = = = = G = = I I G = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = (C) = = = = = (G) = = = = = = C = = ? ? ? A = = = = = = G G = = = = I G = = = = = A = = D D A = = = = = = ? 0 E113 A = = = = = C T = G T T A D = = A = = C = = = = = = ? ? = = = = = = A = = C C C = = = ? ? T = = = = I A = = = = = = = T = = = = = = T = = = = = T C = T C G C I = = G = = T = = = = = = ? ? = = = = = = G = = T T T = = = ? ? C = = = = D G = = = = = = = G = = = = = = 0 E114 = = = = G = = = A = = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = ? ? = D A D = = = = G = = = = = = ? ? = = = D = = = = A = = = G = = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = ? ? = I G I = = = = A = = = = = = ? ? = = = I 0 E115 = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? G ? = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? A ? = = = = = = = = = = = = = = = ? ? 0 E116 = = = = G = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = A ? = = = = G = = = = = = I = = = = D = = = = A = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = G ? = = = = A = = = = = = D = = = = I 0 E117 A = = = ? = = = = = = = = = C C = A G = G = D = = = = C = = = G = A G C T = T = G G = A = = ? G ? C = = = A A = D D A G = G = = = I T = = = ? = = = = = = = = = T T = T C = A = I = = = = T = = = A = G A A G = C = C A = T = = ? A ? T = = = G C = I I G T = A = = = D 0 E118 = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = (G) = = = = = = I = = = = (D) = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = I = = = = (A) = = = = = = D = = = = (I) 0 E119 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = I G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = D A = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E120 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = (A) = = D A = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = (T) = = I G = = = = = = = = = = = = = = = = = ? 0 E121 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = ? G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = ? A = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E122 = = = = G = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = D A D = = = = G = = = = = = I = = = ? D = = = = A = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = I G I = = = = A = = = = = = D = = = ? I 0 H101 A = G = = = = = = = = = = = C ? = A G = G = D = = = = C = = = G = = G C T = T = G G = A = = = = ? C = = = A A = D D A G = G = = = I T = A = = = = = = = = = = = T ? = T C = A = I = = = = T = = = A = = A A G = C = C A = T = = = = ? T = = = G C = I I G T = A = = = D 0 H102 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = (A) = = = = = = = = = = = = = (G) D (T) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = (G) = = = = = = = = = = = = = (A) I (C) = = = = = = = = = = = = = = = = 0 H103 = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = (A) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = D = = = = G = = = = = = I ? = = = ? = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = (G) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = I = I = = = = A = = = = = = D ? = = = ? 0 H104 = = = = = = = = = = C G = ? C C = = = = G = D A = = = C G A A G = = G C T = T = G G = = = = = = = = D = = = A = D D A G = G = = = ? = = = = = = = = = = T T = ? T T = = = = A = I G = = = T C T G A = = A A G = C = C A = = = = = = = = I = = = C = I I G T = A = = = ? 0 H105 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = 0 H106 A = G = = = = = = = = = = ? ? C = A G = G = D = = = = C = = = G = = G C T = T = G G = ? ? = = = I C = = = A A = D D A G = G = = = = T = A = = = = = = = = = = ? ? T = T C = A = I = = = = T = = = A = = A A G = C = C A = ? ? = = = D T = = = G C = I I G T = A = = = = 0 H107 = = = = G = = = = = ? ? = = = ? = = ? ? = = = = = = = = = = = = = G = ? = = = = = = = = = = D A D = = = = G = = = = = = I ? = = = D = = = = A = = = = = ? ? = = = ? = = ? ? = = = = = = = = = = = = = A = ? = = = = = = = = = = I G I = = = = A = = = = = = D ? = = = I 0 H108 A = = = = = = = = = = = = = C C ? ? G = ? ? D = = = = C = = ? ? ? ? ? C T = T = G G = A = = I G I C = = = A A = D D A G = G = = = I T = = = = = = = = = = = = = T T ? ? C = ? ? I = = = = T = = ? ? ? ? ? A G = C = C A = T = = D A D T = = = G C = I I G T = A = = = D 0 H109 = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 H110 (A) = = = = = = = = = = (T) = = = = = = (G) = = = D = = = = = = = = = = = G = = = = = G = = = = = = = ? (T) = = = A = = D = = G = = = = = I (T) = = = = = = = = = = (G) = = = = = = (C) = = = I = = = = = = = = = = = A = = = = = C = = = = = = = ? (C) = = = G = = I = = T = = = = = D 0 H111 A = = = = = = = = = T T = = = = = A G = = = = G = = = = C T G = = A = = = = = = = = = A = = I G I C I = = A = = = = = = = = = = = I T = = = = = = = = = C G = = = = = T C = = = = A = = = = G A A = = G = = = = = = = = = T = = D A D T D = = G = = = = = = = = = = = D 0 H112 = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 H113 = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 H114 A = (G) = = = = = = = T T = = = = = A G = = = = G = = = = C T G = = A = = = = = = = = = A = = I G I C I = = A = = = = = = = = = = = I T = (A) = = = = = = = C G = = = = = T C = = = = A = = = = G A A = = G = = = = = = = = = T = = D A D T D = = G = = = = = = = = = = = D 0 H115 A = G = G = = = = = = = = = C C = A G = G = D = = = = C = = = G = = G = T = T = G G = ? ? = = = = C = = = = A = D D A G I ? = = = = T = A = A = = = = = = = = = T T = T C = A = I = = = = T = = = A = = A = G = C = C A = ? ? = = = = T = = = = C = I I G T D ? = = = = 0 H116 = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? A = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? G = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = ? = = = = = = = = = = = 0 H117 A = = = = = = = = = T T = = = = = A G = = ? = G = = = = C T G = = = = = = = = = = = = A = = = = = C I = = = = = = = = = I = = = = = T = = = = = = = = = C G = = = = = T C = = ? = A = = = = G A A = = = = = = = = = = = = T = = = = = T D = = = = = = = = = D = = = = = 0 H118 A = G = = = = = = = = = = = C C ? ? G = G = D = = = = C = = = G = = G C T = T = G G = A = = = = ? C = = = A A = D D A G = G = = = I T = A = = = = = = = = = = = T T ? ? C = A = I = = = = T = = = A = = A A G = C = C A = T = = = = ? T = = = G C = I I G T = A = = = D 0 H119 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = I G ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = D A ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 H120 A = = = = = = = = = T T = = = = = A G = = = = G = = = = C T G = = = = = = = = = = = = ? ? = I = I C I = = A = = = = = = = = = = = I T = = = = = = = = = C G = = = = = T C = = = = A = = = = G A A = = = = = = = = = = = = ? ? = D = D T D = = G = = = = = = = = = = = D 0 H121 (A) = = = = = = = = = (T) (T) = = = = = (A) (G) = = = I = = = = = C T G = = = A = = = = = C = = A = = = = = = = = = = = = I (D) = T D = = = = = (T) = = = = = = = = = (C) (G) = = = = = (T) (C) = = = D = = = = = G A A = = = G = = = = = G = = T = = = = = = = = = = = = D (I) = G I = = = = = 0 H122 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = I G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = D A = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 X101 = = = = = = = = = = = = = = = (C) = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = (T) = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 X102 = = ? ? = = ? = = = = = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = ? = = = = = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = 0 X103 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = I = = = = A = = = = = = D = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = G = = = = = = I = = = = D 0 X104 = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = D A ? = ? ? = G = = = = = = I = = = = D = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = I G ? = ? ? = A = = = = = = D = = = = I 0 X105 = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 X106 A = G = = = = = = = = = = = C C = A G = G = D = = = = C = = = G = A G C T = T = G G = A = = I G I C = = = A A = D D A G ? G = = = I T = A = = = = = = = = = = = T T = T C = A = I = = = = T = = = A = G A A G = C = C A = T = = D A D T = = = G C = I I G T ? A = = = D 0 X107 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 X108 A = G = = = = = = = = = = = C C = A ? = G = D = = = = C = = = G = = G C T = T = G G = A = = = = = C = = = = A = D D A G I ? = = = = T = A = = = = = = = = = = = T T = T ? = A = I = = = = T = = = A = = A A G = C = C A = T = = = = = T = = = = C = I I G T D ? = = = = 0 X109 A = = = G ? = = A = T T = = = = = A G = = = = G = = = = C T G = = = = ? = = = = = = = A = = = = = C I = = = = = = = = = I = = = = = T = = = A ? = = G = C G = = = = = T C = = = = A = = = = G A A = = = = ? = = = = = = = T = = = = = T D = = = = = = = = = D = = = = = 0 X110 = = ? ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 X111 A = G = G = = = = = = = = = C C = A G = G = D = = = = C = = = G = = G C T = T = G G = A = = = = = C = = = = A = D D A G I G = = = = T = A = A = = = = = = = = = T T = T C = A = I = = = = T = = = A = = A A G = C = C A = T = = = = = T = = = = C = I I G T D A = = = = 0 X112 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 X113 = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 X114 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 X115 = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = D = = = = G = = = = = = I = = = = D = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = I = I = = = = A = = = = = = D = = = = I 0 X116 A = G = = = = = = = = = = = C C = A G = G = D = = = = C = = = G = = G ? T = T = G G = A = = I = I C = = = A A = D D A G = G = = = I T = A = = = = = = = = = = = T T = T C = A = I = = = = T = = = A = = A ? G = C = C A = T = = D = D T = = = G C = I I G T = A = = = D 0 X117 A T = G G C T C A T = = A I = = A A G T = A D = T T T = = = = = T = G ? = T T T G = I A G C = = = C ? G T = = T D D = G I = T A G = T A = T A G C T G G = = C D = = G T C C = T I = G C C = = = = = C = A ? = C C C C = D T A T = = = T ? A A = = A I I = T D = C G A = 0 X118 A = ? ? G = = = A = = = = ? C C = A G = G = D = = = = C = = = G = = G = T = T = = G = A = = = = = C = = = = A = D D ? G I G = = = = T = ? ? A = = = G = = = = ? T T = T C = A = I = = = = T = = = A = = A = G = C = = A = T = = = = = T = = = = C = I I ? T D A = = = = 0 X119 A = ? ? G = ? = A = = = = = C C = A ? = G = D = = = = C = = = G = = G C T = T = G ? ? A = = = = ? C = = = = A = D D A G I G = = = = T = ? ? A = ? = G = = = = = T T = T ? = A = I = = = = T = = = A = = A A G = C = C ? ? T = = = = ? T = = = = C = I I G T D A = = = = 0 X120 = = ? ? G = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = D = ? = = = = G = = = = = = I = = = = D = = ? ? A = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = I = ? = = = = A = = = = = = D = = = = I 0 X121 = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 X122 A T = G = C T C = T = = A I = = A A G T = A D = T T T = = = = = T = G = = T T T G = I A G C I = I C = G T A = T D D = G ? ? T A G I T A = T = G C T = G = = C D = = G T C C = T I = G C C = = = = = C = A = = C C C C = D T A T D = D T = A A G = A I I = T ? ? C G A D 0 X123 A = G = G = ? = = = = = = = C C = A G = G = D = = = = C = = = G = = G ? T = T = G G = A = = = = = C ? = = = A = D D A G I G = = = = T = A = A = ? = = = = = = = T T = T C = A = I = = = = T = = = A = = A ? G = C = C A = T = = = = = T ? = = = C = I I G T D A = = = = 0 X124 = A G T = G ? ? = G = = C D C C G = = C ? ? = = G C C C ? ? ? ? ? = = ? T C = C = ? ? = A T = ? = = ? A A = A A = = A = ? ? C G A = = T A G = C ? ? = T = = A I T T A = = T ? ? = = T T T T ? ? ? ? ? = = ? G T = T = ? ? = G C = ? = = ? G T = C T = = G = ? ? T A G = END BESTPAIRS2 Phase probabilities at each site with phase known positions indicated by = and missing data positions indicated by ? BEGIN PHASEPROBS = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = ? ? ? ? = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = ? ? 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = ? ? ? = = 1.00 ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 ? = ? ? ? = ? 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = 0.60 = = = = = = = = = 0.60 = = = = 0.60 ? ? 0.60 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? 1.00 = 1.00 ? ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 0.62 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = 0.99 = = = 0.99 = ? = = ? 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 ? 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = 0.91 ? = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 ? 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 ? ? 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = ? ? ? ? ? ? ? 1.00 = 1.00 ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = ? = ? ? = ? ? ? = = = = ? ? = = ? = ? = 1.00 = = = = 1.00 = = ? ? = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = ? = = = = 1.00 = 1.00 ? ? = = = ? ? = = 1.00 = ? 1.00 1.00 1.00 = = ? ? 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 ? 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = ? ? = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = ? = = = ? = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 0.60 = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = ? = = 0.96 = = = = = = = 0.96 0.96 ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = ? = = = = 1.00 1.00 = ? ? = 1.00 1.00 ? = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = ? = = = 1.00 = = ? 1.00 = ? ? 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 ? ? = = = 1.00 1.00 = = ? = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = ? 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 ? 1.00 = 1.00 = 1.00 = ? = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = ? = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = ? = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = ? = 1.00 ? = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = ? 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = ? ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = ? 1.00 = ? = 1.00 = 1.00 = = ? 1.00 = ? ? 1.00 1.00 = 1.00 1.00 0.75 1.00 1.00 ? ? = = = = 1.00 = 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = ? = ? 1.00 ? ? 1.00 = = 1.00 ? ? = 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 ? ? = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = 0.99 = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 0.99 = = = 0.77 0.77 = = ? = 0.77 0.77 0.77 = = = = = = 0.77 = = = = = 0.77 1.00 1.00 ? ? = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = ? = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = ? ? = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = = = 0.85 = = 0.85 0.85 = = = 0.58 = = = 0.85 = = = = = = = = ? ? = = ? = = ? = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = ? ? ? = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = ? = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = ? ? ? 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 ? ? = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = 1.00 0.97 0.97 = 0.97 = 0.97 ? 0.97 = 0.97 = = 0.97 0.97 = = 0.97 0.97 0.97 0.97 = = = = = = = = = = = = = = 0.98 = = 0.98 0.98 0.98 = = = ? ? 0.98 = = = 0.98 = 0.98 = 0.98 = = = 0.79 = 0.98 0.98 = = = = 0.98 0.58 = = = = = 0.60 = = = = 0.58 = = = = = 0.58 0.58 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 0.96 = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = ? 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 0.57 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 0.63 = = = ? 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 0.94 = = = 0.89 = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 ? = = ? ? ? 0.99 = = = = = = = = = 0.72 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 ? 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 ? ? ? ? = = = = = = = = 0.97 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = ? = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = 0.99 = 0.93 = = = = = = = = = = 0.61 1.00 1.00 = 1.00 ? ? 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = ? = 1.00 ? ? 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? 0.80 = = = = = = = = = = = = ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? 1.00 = = = = 0.98 = = = 0.97 = = = = = = = = 0.67 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = 0.99 = = = 0.99 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 ? = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.94 = = = = = = = ? ? ? 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.66 = = = = 0.99 ? = = 0.99 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = 0.68 = = = = = 0.65 = = = = = = 1.00 = = ? ? ? 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = ? 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = ? ? = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = ? ? 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 0.99 = = = 0.99 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = ? ? = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = ? ? = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? 0.99 ? = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = 0.97 = = = 0.97 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.93 = = = = = = = = = = = = = 0.93 ? = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 0.99 = = = ? = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = ? 1.00 ? 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = 0.90 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 0.89 = = = = = = 1.00 = = = = 0.89 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 0.52 = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = ? 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.99 = = = 0.99 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = ? 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 ? = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = ? 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.76 = = = = = = = = = = = = = 0.76 1.00 0.66 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.98 = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.52 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 ? = = = ? = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = ? 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 0.98 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = ? ? 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = ? ? = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = 0.99 = = = = = ? ? = = = ? = = ? ? = = = = = = = = = = = = = 1.00 = ? = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 ? = = = 1.00 0.99 = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 ? ? 1.00 = ? ? 1.00 = = = = 1.00 = = ? ? ? ? ? 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.69 = = = = = = = = = = 0.50 = = = = = = 0.69 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = ? 0.58 = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.98 = 0.80 = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = ? ? = = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = ? = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = ? = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 ? ? 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = ? 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = ? ? = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 0.88 = = = = = = = = = 0.88 0.88 = = = = = 0.88 0.88 = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 0.93 0.87 = 0.96 0.93 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.66 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = ? = = = = = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = 0.99 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 ? = ? ? = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 ? = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? = = = = 1.00 = = = 1.00 ? = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = ? = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = ? ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.99 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.99 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 ? 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 ? 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = ? ? 1.00 = = = 1.00 = = = = ? 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = ? ? 1.00 = ? = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 ? = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 ? ? 1.00 = = = = ? 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = ? ? 0.98 = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = 0.99 = ? = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? ? 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = ? = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 ? 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 ? = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? ? = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 ? ? = = 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? ? ? ? = = ? 1.00 1.00 = 1.00 = ? ? = 1.00 1.00 = ? = = ? 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = ? ? 1.00 1.00 1.00 = END PHASEPROBS