Site Genotype1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 HD-chi2 XD-chi2 Total-chi2 000288 CC 20 18 21 24 83 CT 1 1 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.012 0.014 0.000 0.000 0.012 000307 -- 15 17 19 24 75 +- 5 2 1 0 8 ++ 0 0 0 0 0 0.408 0.059 0.013 0.000 0.213 000534 AA 7 1 3 7 18 AT 10 5 11 10 36 TT 8 16 8 7 39 0.987 0.499 0.065 0.667 3.156 000728 CC 24 22 22 24 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 000814 AA 25 22 22 23 92 AT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 000835 AA 15 21 22 21 79 AT 10 1 0 3 14 TT 0 0 0 0 0 1.562 0.012 0.000 0.107 0.616 000918 CC 23 21 22 21 87 CT 2 1 0 3 6 TT 0 0 0 0 0 0.043 0.012 0.000 0.107 0.103 000955 AA 25 22 21 24 92 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 001058 AA 19 21 14 8 62 AG 3 1 5 6 15 GG 0 0 2 4 6 0.118 0.012 1.802 1.606 9.400 001161 GG 0 0 0 0 0 GT 8 1 0 3 12 TT 14 21 21 15 71 1.086 0.012 0.000 0.149 0.504 001228 AA 0 0 1 1 2 AG 1 7 3 9 20 GG 24 14 18 14 70 0.010 0.840 2.296 0.091 0.160 001429 CC 0 0 0 0 0 CG 10 1 0 3 14 GG 16 20 22 20 78 1.474 0.012 0.000 0.112 0.624 001436 CC 26 21 22 22 91 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 001458 CC 0 0 0 0 0 CG 0 1 0 0 1 GG 26 20 22 23 91 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 001604 AA 24 21 22 24 91 AG 2 1 0 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.042 0.012 0.000 0.000 0.025 001653 CC 23 21 22 24 90 CG 3 1 0 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.097 0.012 0.000 0.000 0.044 001913 CC 24 21 21 24 90 CG 1 1 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.012 0.000 0.000 0.011 001915 AA 24 22 21 24 91 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001919 CC 24 22 21 24 91 CG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001951 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 20 22 21 24 87 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 002182 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 15 21 22 14 72 0.066 0.000 0.000 0.000 0.014 002198 AA 17 21 22 13 73 AC 0 0 0 1 1 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.019 0.003 002530 GG 14 22 22 15 73 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.018 0.000 0.000 0.000 0.003 002591 CC 12 20 22 15 69 CT 4 2 0 2 8 TT 0 0 0 0 0 0.327 0.050 0.000 0.066 0.231 002780 AA 16 19 21 16 72 AG 0 1 1 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.013 0.012 0.000 0.014 002796 -- 16 18 20 14 68 +- 0 1 1 0 2 ++ 0 0 0 0 0 0.000 0.014 0.012 0.000 0.015 002878 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 0 1 1 GG 26 22 22 22 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 002999 CC 0 0 0 0 0 CT 10 2 0 2 14 TT 16 20 22 21 79 1.474 0.050 0.000 0.048 0.616 003147 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 26 22 21 23 92 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 003151 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 26 22 22 22 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 003311 -- 0 0 0 0 0 +- 1 1 0 0 2 ++ 24 20 22 23 89 0.010 0.012 0.000 0.000 0.011 003363 AA 24 21 22 24 91 AG 2 1 0 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.042 0.012 0.000 0.000 0.025 003507 AA 25 22 22 24 93 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 003544 AA 0 0 0 0 0 AC 0 1 1 0 2 CC 26 21 21 24 92 0.000 0.012 0.012 0.000 0.011 003602 CC 25 22 22 24 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 003835 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 24 22 22 24 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 003889 AA 22 13 20 19 74 AG 3 9 1 4 17 GG 0 0 0 1 1 0.102 1.455 0.012 1.361 0.000 003918 GG 15 20 21 21 77 GT 10 2 0 3 15 TT 0 0 0 0 0 1.562 0.050 0.000 0.107 0.725 004516 -- 0 0 0 0 0 +- 2 1 0 2 5 ++ 23 21 21 21 86 0.043 0.012 0.000 0.048 0.073 004517 AA 0 0 0 0 0 AT 1 1 0 0 2 TT 25 21 22 23 91 0.010 0.012 0.000 0.000 0.011 004828 CC 26 22 19 24 91 CG 0 0 3 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.118 0.000 0.025 004996 CC 20 19 15 23 77 CT 6 3 6 1 16 TT 0 0 0 0 0 0.442 0.118 0.583 0.011 0.824 005014 GG 0 0 0 0 0 GT 0 1 0 0 1 TT 26 21 21 24 92 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 005053 GG 23 20 14 23 80 GT 3 2 7 1 13 TT 0 0 0 0 0 0.097 0.050 0.840 0.011 0.525 005394 AA 0 0 0 0 0 AC 5 2 0 3 10 CC 20 20 22 21 83 0.309 0.050 0.000 0.107 0.300 005645 -- 13 19 20 20 72 +- 8 3 0 3 14 ++ 1 0 0 0 1 0.027 0.118 0.000 0.112 0.115 006180 CC 26 22 22 23 93 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 006317 CC 0 0 2 6 8 CT 4 3 5 8 20 TT 22 19 14 10 65 0.181 0.118 1.802 2.371 9.001 006671 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 25 22 22 23 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 006678 CC 0 0 2 5 7 CT 6 4 5 9 24 TT 19 18 13 10 60 0.465 0.220 1.604 1.119 3.704 007150 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 23 21 19 23 86 0.043 0.000 0.000 0.000 0.012 007239 AA 24 21 19 23 87 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 007316 AA 23 21 19 23 86 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 007502 AA 20 18 18 21 77 AG 2 1 0 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.050 0.014 0.000 0.000 0.029 007557 AA 20 20 19 21 80 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.050 0.000 0.000 0.000 0.012 007657 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 20 21 20 23 84 0.050 0.000 0.000 0.000 0.012 007783 AA 0 0 0 0 0 AG 5 2 0 3 10 GG 16 19 20 20 75 0.383 0.053 0.000 0.112 0.332 007795 GG 0 0 0 0 0 GT 2 0 0 0 2 TT 20 21 20 23 84 0.050 0.000 0.000 0.000 0.012 007813 AA 7 2 3 6 18 AT 7 5 9 10 31 TT 8 14 8 7 37 2.888 1.802 0.032 0.381 5.040 009025 AA 24 22 20 21 87 AG 2 0 1 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.012 0.000 0.026 009086 CC 9 16 7 7 39 CG 10 3 11 8 32 GG 7 2 3 6 18 1.330 4.954 0.159 1.173 5.063 009102 AA 26 21 21 21 89 AC 0 1 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 009270 CC 14 19 21 21 75 CT 11 2 0 3 16 TT 1 0 0 0 1 0.427 0.053 0.000 0.107 0.020 011506 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 1 0 2 TT 27 21 20 24 92 0.000 0.012 0.012 0.000 0.011 011583 * 011787 -- 0 0 0 0 0 +- 0 2 0 0 2 ++ 22 20 21 24 87 0.000 0.050 0.000 0.000 0.011 011946 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 25 22 22 24 93 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 012173 GG 27 21 22 24 94 GT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 012283 AA 25 19 14 11 69 AG 2 3 5 7 17 GG 0 0 2 5 7 0.040 0.118 1.802 2.767 10.874 012461 AA 1 0 0 0 1 AT 13 0 0 2 15 TT 13 22 20 20 75 1.080 0.000 0.000 0.050 0.065 012544 AA 27 22 21 22 92 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 012633 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 0 2 2 TT 26 22 22 22 92 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 012734 -- 5 1 2 7 15 +- 16 5 8 9 38 ++ 4 16 11 8 39 1.989 0.499 0.093 1.484 1.187 012796 GG 23 22 21 24 90 GT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.000 0.000 0.011 013250 AA 25 22 22 24 93 AC 2 0 0 0 2 CC 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 013570 AA 22 21 16 23 82 AG 4 0 6 1 11 GG 0 0 0 0 0 0.181 0.000 0.548 0.011 0.367 013809 GG 14 22 22 21 79 GT 12 0 0 3 15 TT 0 0 0 0 0 2.340 0.000 0.000 0.107 0.707 014049 CC 14 22 22 21 79 CT 11 0 0 3 14 TT 0 0 0 0 0 1.989 0.000 0.000 0.107 0.616 014165 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 014351 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 1 0 2 GG 25 21 21 24 91 0.010 0.000 0.012 0.000 0.011 014393 AA 23 21 22 24 90 AG 3 0 0 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.097 0.000 0.000 0.000 0.025 014454 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 25 21 22 24 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 014525 AA 23 21 22 24 90 AT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.097 0.000 0.000 0.000 0.025 014622 -- 0 0 0 0 0 +- 6 0 0 0 6 ++ 19 21 22 24 86 0.465 0.000 0.000 0.000 0.105 014703 CC 13 21 22 21 77 CT 11 0 0 3 14 TT 1 0 0 0 1 0.514 0.000 0.000 0.107 0.160 014783 AA 23 21 21 24 89 AG 2 0 1 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.012 0.000 0.025 014798 CC 0 0 2 6 8 CT 7 3 6 8 24 TT 18 18 14 10 60 0.663 0.124 1.099 2.371 5.009 014990 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 015018 CC 25 22 22 23 92 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 015019 CC 0 0 0 0 0 CG 3 0 6 1 10 GG 24 22 16 22 84 0.093 0.000 0.548 0.011 0.297 015020 AA 24 22 16 22 84 AT 3 0 6 1 10 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.548 0.011 0.297 015093 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 015792 AA 23 19 22 24 88 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.013 0.000 0.000 0.003 015864 AA 22 20 22 24 88 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 015891 AA 23 19 22 24 88 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.013 0.000 0.000 0.003 016166 AA 22 19 14 20 75 AG 3 0 6 1 10 GG 0 0 0 0 0 0.102 0.000 0.623 0.012 0.332 016196 AA 19 17 13 9 58 AG 6 2 5 8 21 GG 0 0 2 4 6 0.465 0.059 1.604 0.777 3.761 016287 CC 18 19 20 19 76 CT 7 0 0 2 9 TT 0 0 0 0 0 0.663 0.000 0.000 0.053 0.266 016725 AA 18 9 13 20 60 AG 7 11 7 2 27 GG 1 0 1 2 4 0.092 2.878 0.002 9.197 0.183 016855 AA 10 16 12 8 46 AG 11 5 7 9 32 GG 5 0 2 7 14 0.383 0.383 0.399 1.484 4.003 016990 AA 22 19 21 24 86 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.045 0.000 0.000 0.000 0.012 017209 AA 23 19 21 24 87 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.013 0.000 0.000 0.003 017496 AA 14 16 14 10 54 AC 4 3 5 4 16 CC 0 0 2 5 7 0.281 0.140 1.802 5.698 8.778 017633 AA 23 22 22 24 91 AG 3 0 0 0 3 GG 1 0 0 0 1 3.099 0.000 0.000 0.000 13.993 017740 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 017753 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 018048 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 22 22 23 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 018356 CC 24 22 22 24 92 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 018466 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 1 0 2 GG 26 22 21 24 93 0.010 0.000 0.012 0.000 0.011 018536 GG 19 18 14 10 61 GT 6 3 6 8 23 TT 0 0 2 6 8 0.465 0.124 1.099 2.371 5.825 018577 CC 13 19 22 21 75 CT 11 2 0 3 16 TT 1 0 0 0 1 0.514 0.053 0.000 0.107 0.020 018632 -- 0 0 0 0 0 +- 1 2 4 1 8 ++ 24 19 18 23 84 0.010 0.053 0.220 0.011 0.190 019222 AA 25 22 22 24 93 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 019228 CC 11 16 14 8 49 CT 11 6 6 9 32 TT 4 0 2 7 13 0.200 0.548 1.099 1.484 3.840 019394 AA 25 21 21 24 91 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 019451 AA 0 0 0 0 0 AT 5 0 0 0 5 TT 20 21 22 24 87 0.309 0.000 0.000 0.000 0.072 019468 CC 13 19 22 21 75 CT 11 2 0 3 16 TT 1 0 0 0 1 0.514 0.053 0.000 0.107 0.020 019653 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 26 21 20 20 87 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 019664 GG 23 21 20 21 85 GT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.097 0.000 0.000 0.000 0.026 019818 CC 24 21 19 21 85 CT 2 0 1 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.013 0.000 0.026 020029 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 26 21 22 24 93 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 020315 -- 0 0 0 0 0 +- 2 0 1 0 3 ++ 24 21 21 24 90 0.042 0.000 0.012 0.000 0.025 020337 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 1 0 1 TT 27 22 21 24 94 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 020391 CC 27 22 21 23 93 CT 0 0 1 1 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.011 0.011 020784 CC 7 19 12 9 47 CG 15 3 8 8 34 GG 5 0 2 7 14 0.371 0.118 0.153 2.593 3.286 020813 AA 19 19 14 10 62 AG 8 3 6 6 23 GG 0 0 2 6 8 0.817 0.118 1.099 4.180 5.990 020981 -- 13 22 22 20 77 +- 13 0 0 2 15 ++ 1 0 0 0 1 1.080 0.000 0.000 0.050 0.078 021023 CC 27 22 22 20 91 CG 0 0 0 2 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.050 0.011 021085 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 2 2 CC 27 22 22 20 91 0.000 0.000 0.000 0.050 0.011 021143 AA 0 0 0 0 0 AT 2 0 5 1 8 TT 21 22 17 19 79 0.048 0.000 0.362 0.013 0.202 022437 CC 18 20 19 24 81 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.014 0.000 0.000 0.000 0.003 022523 AA 5 1 2 7 15 AT 7 4 7 10 28 TT 8 15 10 7 40 1.612 0.930 0.207 0.667 5.524 022669 AA 12 19 19 21 71 AG 8 1 0 3 12 GG 0 0 0 0 0 1.250 0.013 0.000 0.107 0.504 022751 CC 0 0 0 0 0 CT 2 1 0 0 3 TT 20 20 20 24 84 0.050 0.012 0.000 0.000 0.027 022797 CC 0 0 0 0 0 CT 10 2 0 3 15 TT 16 20 22 21 79 1.474 0.050 0.000 0.107 0.707 022908 -- 1 1 2 2 6 +- 8 9 9 6 32 ++ 15 8 10 16 49 0.003 0.571 0.000 1.407 0.061 023236 CC 25 22 21 22 90 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 023498 AA 1 1 1 2 5 AG 7 13 8 2 30 GG 18 8 13 19 58 0.092 2.182 0.027 8.746 0.184 023978 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 21 22 24 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 024148 AA 13 19 19 18 69 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.019 0.000 0.000 0.000 0.004 024164 -- 5 5 3 1 14 +- 3 8 8 5 24 ++ 5 4 7 12 28 3.769 0.052 0.076 0.231 3.753 024347 AA 23 21 21 21 86 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 024405 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 22 22 22 23 89 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 025418 AA 27 22 22 23 94 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 025535 AA 24 22 21 24 91 AG 2 0 1 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.012 0.000 0.025 025745 CC 24 22 19 24 89 CT 0 0 3 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.118 0.000 0.025 026058 AA 26 22 21 24 93 AG 1 0 1 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.012 0.000 0.011 026171 CC 26 22 21 24 93 CG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 026291 AA 23 21 21 24 89 AG 1 0 1 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.012 0.000 0.011 026332 AA 23 22 21 24 90 AG 1 0 1 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.012 0.000 0.011 026443 -- 0 0 0 0 0 +- 0 1 0 0 1 ++ 24 19 22 24 89 0.000 0.013 0.000 0.000 0.003 026658 CC 24 22 21 24 91 CG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 026930 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 24 22 21 24 91 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 027006 CC 5 2 2 7 16 CT 8 4 12 10 34 TT 9 16 8 7 40 1.352 3.327 0.702 0.667 3.134 027099 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 15 19 21 20 75 0.017 0.000 0.000 0.000 0.003 027397 AA 20 22 22 23 87 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.050 0.000 0.000 0.000 0.011 027581 -- 22 20 17 18 77 +- 2 2 5 1 10 ++ 0 0 0 0 0 0.045 0.050 0.362 0.014 0.323 027936 CC 23 22 22 19 86 CG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 028264 AA 23 22 22 19 86 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 028371 AA 0 0 0 0 0 AT 2 0 0 0 2 TT 20 22 22 17 81 0.050 0.000 0.000 0.000 0.012 028462 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 0 1 1 TT 22 22 22 16 82 0.000 0.000 0.000 0.016 0.003 028632 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 0 1 1 GG 25 22 22 23 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 028742 AA 23 22 19 21 85 AG 0 0 3 2 5 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.118 0.048 0.073 029228 AA 12 20 22 20 74 AG 10 2 0 3 15 GG 1 0 0 0 1 0.374 0.050 0.000 0.112 0.059 029297 AA 11 21 22 21 75 AT 15 1 0 3 19 TT 0 0 0 0 0 4.273 0.012 0.000 0.107 1.188 029510 AA 16 0 7 15 38 AG 8 10 10 7 35 GG 3 12 5 2 22 1.411 1.903 0.153 0.730 5.547 029968 AA 0 0 2 6 8 AC 3 2 6 8 19 CC 21 20 13 10 64 0.107 0.050 0.948 2.371 9.784 029994 CC 0 0 0 0 0 CT 3 1 0 0 4 TT 22 21 22 24 89 0.102 0.012 0.000 0.000 0.045 030286 AA 27 22 22 23 94 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 030697 GG 18 20 21 23 82 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.014 0.000 0.000 0.000 0.003 030834 AA 0 0 0 0 0 AG 1 1 2 0 4 GG 19 19 19 23 80 0.013 0.013 0.053 0.000 0.050 031137 CC 0 0 0 0 0 CG 3 0 0 0 3 GG 23 22 22 24 91 0.097 0.000 0.000 0.000 0.025 031508 AA 15 22 22 21 80 AT 12 0 0 3 15 TT 0 0 0 0 0 2.204 0.000 0.000 0.107 0.698 031620 -- 9 0 2 7 18 +- 11 3 8 9 31 ++ 4 19 12 8 43 0.042 0.118 0.153 1.484 6.824 031680 -- 4 0 2 7 13 +- 14 3 7 9 33 ++ 6 19 13 8 46 0.734 0.118 0.505 1.484 2.872 031808 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 031980 AA 22 22 21 23 88 AG 4 0 1 0 5 GG 0 0 0 0 0 0.181 0.000 0.012 0.000 0.071 032047 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 26 22 22 22 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 032104 AA 0 0 2 6 8 AG 3 3 6 7 19 GG 23 19 14 10 66 0.097 0.118 1.099 3.188 10.209 032153 CC 24 22 21 23 90 CT 2 0 1 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.012 0.000 0.025 032262 CC 27 22 22 21 92 CT 0 0 0 2 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.048 0.011 032682 CC 27 22 22 23 94 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 032739 AA 27 22 22 22 93 AG 0 0 0 2 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 032812 GG 27 22 22 23 94 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 033115 GG 26 21 22 24 93 GT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 033474 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 0 1 1 GG 25 22 22 23 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 033553 CC 25 21 22 24 92 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 034086 AA 24 22 22 24 92 AT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 034181 AA 24 22 22 22 90 AC 0 0 0 2 2 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 034258 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 23 22 22 24 91 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 034445 AA 23 22 21 24 90 AG 2 0 1 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.012 0.000 0.025 034682 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 1 0 1 TT 27 22 21 24 94 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 034778 AA 25 22 22 24 93 AC 2 0 0 0 2 CC 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 034832 AA 25 22 22 24 93 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 034870 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 034880 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 3 3 TT 27 22 22 21 92 0.000 0.000 0.000 0.107 0.024 034920 CC 25 22 22 24 93 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 034942 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 035027 AA 0 0 0 0 0 AC 3 0 0 0 3 CC 22 22 22 24 90 0.102 0.000 0.000 0.000 0.025 035067 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 25 21 22 24 92 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 035164 GG 5 0 2 7 14 GT 11 6 8 9 34 TT 10 16 12 8 46 0.383 0.548 0.153 1.484 3.106 035271 AA 23 22 22 24 91 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.000 0.000 0.011 035281 AA 25 22 22 23 92 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 035287 AA 25 22 22 23 92 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 035503 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 25 21 22 21 89 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 035609 AA 21 21 22 21 85 AG 3 0 0 0 3 GG 0 0 0 0 0 0.107 0.000 0.000 0.000 0.026 035684 -- 0 0 1 1 2 +- 5 8 5 11 29 ++ 19 11 16 9 55 0.324 1.351 0.499 1.068 0.657 035702 AA 15 17 12 9 53 AG 9 4 5 6 24 GG 0 0 2 6 8 1.278 0.233 1.406 3.646 3.943 036029 AA 26 22 21 24 93 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 036219 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 1 0 2 GG 19 21 21 24 85 0.013 0.000 0.012 0.000 0.012 037092 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 1 0 1 TT 25 20 20 24 89 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 037591 CC 13 20 22 21 76 CT 12 0 0 3 15 TT 0 0 0 0 0 2.493 0.000 0.000 0.107 0.734 037689 AA 0 0 0 0 0 AG 12 0 0 3 15 GG 14 19 22 21 76 2.340 0.000 0.000 0.107 0.734 037692 CC 26 19 21 24 90 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 037859 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 1 0 1 GG 25 16 21 24 86 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 037958 AA 13 16 22 21 72 AG 12 0 0 3 15 GG 0 0 0 0 0 2.493 0.000 0.000 0.107 0.774 038068 -- 3 6 5 2 16 +- 9 10 8 7 34 ++ 10 0 7 15 32 0.177 3.306 0.737 0.730 1.560 038245 CC 23 18 22 24 87 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.097 0.000 0.000 0.000 0.026 038350 AA 22 20 22 24 88 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 038359 AA 23 20 22 21 86 AG 3 0 0 3 6 GG 0 0 0 0 0 0.097 0.000 0.000 0.107 0.105 038725 AA 24 19 21 24 88 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 039118 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 039360 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 25 22 22 24 93 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 039584 AA 25 20 17 23 85 AG 1 2 5 1 9 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.050 0.362 0.011 0.238 039784 CC 18 22 21 22 83 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.014 0.000 0.000 0.000 0.003 039864 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 1 0 3 TT 17 22 20 22 81 0.059 0.000 0.012 0.000 0.028 039877 CC 20 22 20 23 85 CT 2 0 1 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.050 0.000 0.012 0.000 0.026 039927 AA 0 0 0 0 0 AG 2 1 0 0 3 GG 21 20 22 23 86 0.048 0.012 0.000 0.000 0.026 040198 CC 22 22 21 23 88 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 040285 CC 23 22 21 23 89 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000307: a 002796: T 003311: GTAA 004516: t 005645: a 011787: TGCC 012734: t 014622: ttttt 018632: taa 020315: TG 020981: a 022908: tttt 024164: TCTT 026443: C 027581: t 031620: t 031680: t 035684: attt 038068: t Tri-allelic sites: Site Genotype AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop 011583 CC 0 0 0 0 0 011583 CG 0 0 0 0 0 011583 CT 1 0 0 0 1 011583 GG 0 0 0 0 0 011583 GT 0 0 0 1 1 011583 TT 26 22 21 23 92