Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000163 A 0.13 0.03 0.03 0.09 0.07 C 0.87 0.97 0.97 0.91 0.93 0.23 0.05 0.05 0.16 0.13 000195 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000533 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000542 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 000598 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000950 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001011 T 0.30 0.41 0.39 0.66 0.42 G 0.70 0.59 0.61 0.34 0.58 0.42 0.48 0.47 0.45 0.49 001105 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 001570 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 001941 + 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 - 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 001951 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 002408 T 0.07 0.00 0.00 0.02 0.03 C 0.93 1.00 1.00 0.98 0.97 0.14 0.00 0.00 0.04 0.05 002892 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.03 003145 + 0.06 0.27 0.50 0.60 0.31 - 0.94 0.73 0.50 0.40 0.69 0.11 0.40 0.50 0.48 0.42 003339 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 003462 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 003572 G 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 003723 A 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 004218 A 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 004247 C 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 004331 - 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 + 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 004858 A 0.02 0.36 0.27 0.19 0.20 T 0.98 0.64 0.73 0.81 0.80 0.04 0.46 0.40 0.30 0.32 004899 A 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 004922 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 005015 A 0.24 0.50 0.32 0.19 0.31 G 0.76 0.50 0.68 0.81 0.69 0.37 0.50 0.43 0.30 0.42 005697 T 0.54 0.45 0.38 0.29 0.42 G 0.46 0.55 0.62 0.71 0.58 0.50 0.50 0.47 0.41 0.49 005857 T 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 005929 G 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 006007 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 006117 A 0.00 0.10 0.12 0.00 0.05 G 1.00 0.90 0.88 1.00 0.95 0.00 0.18 0.21 0.00 0.10 006180 + 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 - 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.13 0.00 0.00 0.00 0.04 006795 C 0.28 0.14 0.05 0.23 0.18 T 0.72 0.86 0.95 0.77 0.82 0.40 0.24 0.09 0.35 0.30 006835 T 0.43 0.21 0.27 0.00 0.23 C 0.57 0.79 0.73 1.00 0.77 0.49 0.34 0.40 0.00 0.36 006852 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 006990 - 0.21 0.52 0.36 0.20 0.32 + 0.79 0.48 0.64 0.80 0.68 0.33 0.50 0.46 0.31 0.43 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001941: GCGGC 003145: GCG 004331: CTTT 004922: aa 006180: C 006990: CTGGGGGGACCTGGGCGAG