Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000105 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 000163 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 000283 G 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 000463 + 0.66 0.21 0.20 0.35 0.36 - 0.34 0.79 0.80 0.65 0.64 0.45 0.34 0.33 0.46 0.46 000493 G 0.00 0.00 0.00 0.21 0.06 A 1.00 1.00 1.00 0.79 0.94 0.00 0.00 0.00 0.33 0.10 000925 C 0.26 0.10 0.09 0.08 0.13 G 0.74 0.90 0.91 0.92 0.87 0.39 0.17 0.17 0.15 0.22 001311 A 0.02 0.02 0.00 0.00 0.01 G 0.98 0.98 1.00 1.00 0.99 0.04 0.04 0.00 0.00 0.02 001524 T 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 001547 A 0.15 0.16 0.45 0.38 0.28 G 0.85 0.84 0.55 0.62 0.72 0.25 0.27 0.50 0.47 0.41 001637 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 001675 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 001819 - 0.19 0.68 0.34 0.27 0.36 + 0.81 0.32 0.66 0.73 0.64 0.31 0.43 0.45 0.39 0.46 002098 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 002394 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 002414 G 0.67 0.16 0.20 0.35 0.36 C 0.33 0.84 0.80 0.65 0.64 0.44 0.27 0.33 0.46 0.46 003314 A 0.11 0.62 0.33 0.27 0.31 G 0.89 0.38 0.68 0.73 0.69 0.20 0.47 0.44 0.39 0.43 003334 A 0.20 0.64 0.33 0.27 0.35 C 0.80 0.36 0.68 0.73 0.65 0.33 0.46 0.44 0.39 0.45 003401 A 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 003451 T 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 003509 C 0.07 0.14 0.45 0.38 0.26 T 0.93 0.86 0.55 0.62 0.74 0.13 0.24 0.49 0.47 0.38 003619 C 0.16 0.16 0.47 0.38 0.30 G 0.84 0.84 0.53 0.62 0.70 0.27 0.27 0.50 0.47 0.42 004201 C 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.07 0.00 0.04 0.00 0.03 004885 T 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 005046 T 0.17 0.67 0.32 0.27 0.34 C 0.83 0.33 0.68 0.73 0.66 0.29 0.44 0.43 0.39 0.45 005103 - 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 + 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 005121 C 0.20 0.67 0.32 0.27 0.36 T 0.80 0.33 0.68 0.73 0.64 0.33 0.44 0.43 0.39 0.46 005151 C 0.06 0.05 0.16 0.10 0.09 G 0.94 0.95 0.84 0.90 0.91 0.12 0.09 0.27 0.19 0.17 005215 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 005263 A 0.17 0.67 0.32 0.27 0.34 G 0.83 0.33 0.68 0.73 0.66 0.29 0.44 0.43 0.39 0.45 005386 T 0.02 0.07 0.02 0.00 0.03 C 0.98 0.93 0.98 1.00 0.97 0.04 0.13 0.04 0.00 0.05 005486 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 005617 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 005736 A 0.06 0.07 0.16 0.10 0.10 G 0.94 0.93 0.84 0.90 0.90 0.10 0.13 0.27 0.19 0.17 006885 C 0.09 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.91 1.00 1.00 1.00 0.97 0.16 0.00 0.00 0.00 0.05 006958 C 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.95 0.99 0.00 0.00 0.00 0.09 0.02 006975 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 007081 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 007090 T 0.20 0.57 0.34 0.50 0.39 G 0.80 0.43 0.66 0.50 0.61 0.32 0.49 0.45 0.50 0.48 007172 C 0.06 0.26 0.48 0.38 0.28 T 0.94 0.74 0.52 0.62 0.72 0.10 0.39 0.50 0.47 0.40 007212 C 0.30 0.10 0.09 0.08 0.15 T 0.70 0.90 0.91 0.92 0.85 0.42 0.17 0.17 0.15 0.25 007213 T 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 007308 + 0.09 0.55 0.32 0.29 0.30 - 0.91 0.45 0.68 0.71 0.70 0.17 0.50 0.43 0.41 0.42 007384 G 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.07 0.00 0.04 0.00 0.03 007618 G 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.07 0.00 0.04 0.00 0.03 007888 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 007926 C 0.30 0.09 0.09 0.08 0.15 G 0.70 0.91 0.91 0.92 0.85 0.42 0.17 0.17 0.15 0.25 008829 G 0.80 0.36 0.41 0.23 0.46 A 0.20 0.64 0.59 0.77 0.54 0.32 0.46 0.48 0.35 0.50 009491 G 0.10 0.55 0.30 0.29 0.30 C 0.90 0.45 0.70 0.71 0.70 0.17 0.50 0.42 0.41 0.42 010343 C 0.11 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.89 1.00 1.00 1.00 0.98 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 010398 A 0.44 0.11 0.10 0.08 0.19 T 0.56 0.89 0.90 0.92 0.81 0.49 0.20 0.17 0.15 0.30 010410 C 0.08 0.02 0.00 0.00 0.03 T 0.92 0.98 1.00 1.00 0.97 0.15 0.04 0.00 0.00 0.05 010438 A 0.04 0.18 0.19 0.10 0.13 G 0.96 0.82 0.81 0.90 0.87 0.08 0.30 0.31 0.19 0.22 010572 A 0.48 0.27 0.29 0.19 0.31 T 0.52 0.73 0.71 0.81 0.69 0.50 0.40 0.41 0.30 0.43 010586 - 0.75 0.25 0.55 0.40 0.49 + 0.25 0.75 0.45 0.60 0.51 0.38 0.38 0.50 0.48 0.50 010756 G 0.00 0.11 0.30 0.28 0.18 A 1.00 0.89 0.70 0.72 0.82 0.00 0.19 0.42 0.41 0.29 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000463: a 001819: T 005103: g 007308: c 010586: ta