FOS Color FASTA
The longest form of insertion/deletion sites is shown in the FASTA sequence and contain a '-' as the alternate allele in the variation tag.
*Display courtesy of GeneSNPs

CTTGTCATCC CGAACTGACC ACCCTGCCCA CATAACCACA CCTCGCACTC 50
CCTACCCCTG GGGCCCAGCT CAGAACCGGG CAGACACCCC CTTCAAATGT 100 | var(87):[A:0.01]
CTTCGCACGT AGGTTTTGCA CAGTGTTTAT CTGCTGGTGT CTCAGGGATT 150 | var(120):[C:0.01]
TGACAGTTTC CTTAATATTC CCACACATGG CCGAGAAAAA TAAATAAATA 200
AATGCGCTGT CTTCTTTAAA AAAATAAATA AATAAAGTAC CCAGTATCGT 250
AAAGTAGGTT ATCGTATTCT CTTATTTTGG ATCCTCCACT TTCTGCTTCC 300
AAACGCAGGA ACAGTGCTAG TATTGCTCGA GCCCGAGGGC TGGAGGTTAG 350
GGGATGAAGG TCTGCTTCCA CGCTTTGCAC TGAATTAGGG CTAGAATTGG 400
GGATGGGGGT AGGGGCGCAT TCCTTCGGGA GCCGAGGCTT AAGTCCTCGG 450
GGTCCTGTAC TCGATGCCGT TTCTCCTATC TCTGAGCCTC AGAACTGTCT 500
TCAGTTTCCG TACAAGGGTA AAAAGGCGCT CTCTGCCCCA TCCCCCCCGA 550 | var(543):[G:0.02] | var(546):[A:0.04]
CCTCGGGAAC AAGGGTCCGC ATTGAACCAG GTGCGAATGT TCTCTCTCAT 600
TCTGCGCCGT TCCCGCCTCC CCTCCCCCAG CCGCGGCCCC CGCCTCCCCC 650
CGCACTGCAC CCTCGGTGTT GGCTGCAGCC CGCGAGCAGT TCCCGTCAAT 700
CCCTCCCCCC TTACACAGGA TGTCCATATT AGGACATCTG CGTCAGCAGG 750
TTTCCACGGC CTTTCCCTGT AGCCCTGGGG GGAGCCATCC CCGAAACCCC 800
TCATCTTGGG GGGCCCACGA GACCTCTGAG ACAGGAACTG CGAAATGCTC 850 | var(801):[G:0.07] | var(838):[A:0.01]
ACGAGATTAG GACACGCGCC AAGGCGGGGG CAGGGAGCTG CGAGCGCTGG 900
GGACGCAGCC GGGCGGCCGC AGAAGCGCCC AGGCCCGCGC GCCACCCCTC 950
TGGCGCCACC GTGGTTGAGC CCGTGACGTT TACACTCATT CATAAAACGC 1000 | var(954):[A:0.01]
TTGTTATAAA AGCAGTGGCT GCGGCGCCTC GTACTCCAAC CGCATCTGCA 1050 | Exon 1 | UTR
GCGAGCAACT GAGAAGCCAA GACTGAGCCG GCGGCCGCGG CGCAGCGAAC 1100 | var(1058):[T:0.26]
GAGCAGTGAC CGTGCTCCTA CCCAGCTCTG CTTCACAGCG CCCACCTGTC 1150 | var(1133):[C:0.25]
TCCGCCCCTC GGCCCCTCGC CCGGCTTTGC CTAACCGCCA CGA
TGATGTT 1200
                                               M  M  F 3
CTCGGGCTTC AACGCAGACT ACGAGGCGTC ATCCTCCCGC TGCAGCAGCG 1250
  S  G  F   N  A  D   Y  E  A  S   S  S  R   C  S  S   19
CGTCCCCGGC CGGGGATAGC CTCTCTTACT ACCACTCACC CGCAGACTCC 1300
A  S  P  A   G  D  S   L  S  Y   Y  H  S  P   A  D  S  36
TTCTCCAGCA TGGGCTCGCC TGTCAACGCG CAGGTAAGGC TGGCTTCCCG 1350
 F  S  S   M  G  S  P   V  N  A   Q                    47
TCGCCGCGGG GCCGGGGGCT TGGGGTCGCG GAGGAGGAGA CACCGGGCGG 1400
GACGCTCCAG TAGATGAGTA GGGGGCTCCC TTGTGCCTGG AGGGAGGCTG 1450 | var(1401):[A:0.06]
CCGTGGCCGG AGCGGTGCCG GCTCGGGGGC TCGGGACTTG CTCTGAGCGC 1500
ACGCACGCTT GCCATAGTAA GAATTGGTTC CCCCTTCGGG AGGCAGGTTC 1550
GTTCTGAGCA ACCTCTGGTC TGCACTCCAG GACGGATCTC TGACATTAGC 1600
TGGAGCAGAC GTGTCCCAAG CACAAACTCG CTAACTAGAG CCTGGCTTCT 1650
CCGGGGAGGT GGCAGAAAGC GGCAATCCCC CCTCCCCCGG CAGCCTGGAG 1700 | var(1651):[T:0.07]
CACGGAGGAG GGATGAGGGA GGAGGGTGCA GCGGGCGGGT GTGTAAGGCA 1750
GTTTCATTGA TAAAAAGCGA GTTCATTCTG GAGACTCCGG AGCGGCGCCT 1800
GCGTCAGCGC AGACGTCAGG GATATTTATA ACAAACCCCC TTTCAAGCAA 1850
GTGATGCTGA AGGGATAACG GGAACGCAGC GGCAGGATGG AAGAGACAGG 1900
CACTGCGCTG CGGAATGCCT GGGAGGAAAA GGGGGAGACC TTTCATCCAG 1950
GATGAGGGAC ATTTAAGATG AAATGTCCGT GGCAGGATCG TTTCTCTTCA 2000
CTGCTGCATG CGGCACTGGG AACTCGCCCC ACCTGTGTCC GGAACCTGCT 2050
CGCTCACGTC GGCTTTCCCC TTCTGTTTTG TTCTAGGACT TCTGCACGGA 2100 | Exon 2
                                        D   F  C  T  D 52
CCTGGCCGTC TCCAGTGCCA ACTTCATTCC CACGGTCACT GCCATCTCGA 2150
  L  A  V   S  S  A   N  F  I  P   T  V  T   A  I  S   68
CCAGTCCGGA CCTGCAGTGG CTGGTGCAGC CCGCCCTCGT CTCCTCTGTG 2200 | var(2197):[C:0.23]
T  S  P  D   L  Q  W   L  V  Q   P  A  L  V   S  S  V  85
GCCCCATCGC AGACCAGAGC CCCTCACCCT TTCGGAGTCC CCGCCCCCTC 2250
 A  P  S   Q  T  R  A   P  H  P   F  G  V   P  A  P  S 102
CGCTGGGGCT TACTCCAGGG CTGGCGTTGT GAAGACCATG ACAGGAGGCC 2300
  A  G  A   Y  S  R   A  G  V  V   K  T  M   T  G  G   118
GAGCGCAGAG CATTGGCAGG AGGGGCAAGG TGGAACAGGT GAGGAACTCT 2350
R  A  Q  S   I  G  R   R  G  K   V  E  Q               131
AGCGTACTCT TCCTGGGAAT GTGGGGGCTG GGTGGGAAGC AGCCCCGGAG 2400 | var(2376):[A:0.05]
ATGCAGGAGC CCAGTACAGA GGATGAAGCC ACTGATGGGG CTGGCTGCAC 2450
ATCCGTAACT GGGAGCCCTG GCTCCAAGCC CATTCCATCC CAACTCAGAC 2500
TCTGAGTCTC ACCCTAAGAA GTACTCTCAT AGTTTCTTCC CTAAGTTTCT 2550
TACCGCATGC TTTCAGACTG GGCTCTTCTT TGTTCTCTTG CTGAGGATCT 2600
TATTTTAAAT GCAAGTCACA CCTAGTCTGC AACTGCAGGT CAGAAATGGT 2650 | var(2625):[T:0.10]
TTCACAGTGG GGTGCCAGGA AGCAGGGAAG CTGCAGGAGC CAGTTCTACT 2700
GGGGTGGGTG AATGGAGGTG ATGGCAGACA CTTTTACTGA ATGTCGGTCT 2750
TTTTTTGTGA TTATTCTAGT TATCTCCAGA AGAAGAAGAG AAAAGGAGAA 2800 | var(2765):[C:0.14] | Exon 3
                      L  S  P  E   E  E  E   K  R  R   141
TCCGAAGGGA AAGGAATAAG ATGGCTGCAG CCAAATGCCG CAACCGGAGG 2850
I  R  R  E   R  N  K   M  A  A   A  K  C  R   N  R  R  158
AGGGAGCTGA CTGATACACT CCAAGCGGTA GGTACTCTGT GGGTTGCTCC 2900
 R  E  L   T  D  T  L   Q  A                           167
TTTTTAAAAC TTAAGGGGAA AGTTGGAGAT TGAGCATAAG GGCCCTTGAG 2950 | var(2918):[-:0.78]
TAAGACTGTG TCTTATGCTT TCCTTTATCC CTCTGTATAC AGGAGACAGA 3000 | Exon 4
                                               E  T  D 170
CCAACTAGAA GATGAGAAGT CTGCTTTGCA GACCGAGATT GCCAACCTGC 3050
  Q  L  E   D  E  K   S  A  L  Q   T  E  I   A  N  L   186
TGAAGGAGAA GGAAAAACTA GAGTTCATCC TGGCAGCTCA CCGACCTGCC 3100
L  K  E  K   E  K  L   E  F  I   L  A  A  H   R  P  A  203
TGCAAGATCC CTGATGACCT GGGCTTCCCA GAAGAGATGT CTGTGGCTTC 3150
 C  K  I   P  D  D  L   G  F  P   E  E  M   S  V  A  S 220
CCTTGATCTG ACTGGGGGCC TGCCAGAGGT TGCCACCCCG GAGTCTGAGG 3200
  L  D  L   T  G  G   L  P  E  V   A  T  P   E  S  E   236
AGGCCTTCAC CCTGCCTCTC CTCAATGACC CTGAGCCCAA GCCCTCAGTG 3250
E  A  F  T   L  P  L   L  N  D   P  E  P  K   P  S  V  253
GAACCTGTCA AGAGCATCAG CAGCATGGAG CTGAAGACCG AGCCCTTTGA 3300
 E  P  V   K  S  I  S   S  M  E   L  K  T   E  P  F  D 270
TGACTTCCTG TTCCCAGCAT CATCCAGGCC CAGTGGCTCT GAGACAGCCC 3350 | var(3337):[G:0.02]
  D  F  L   F  P  A   S  S  R  P   S  G  S   E  T  A   286
GCTCCGTGCC AGACATGGAC CTATCTGGGT CCTTCTATGC AGCAGACTGG 3400
R  S  V  P   D  M  D   L  S  G   S  F  Y  A   A  D  W  303
GAGCCTCTGC ACAGTGGCTC CCTGGGGATG GGGCCCATGG CCACAGAGCT 3450
 E  P  L   H  S  G  S   L  G  M   G  P  M   A  T  E  L 320
GGAGCCCCTG TGCACTCCGG TGGTCACCTG TACTCCCAGC TGCACTGCTT 3500 | var(3472):[A:0.02]
  E  P  L   C  T  P   V  V  T  C   T  P  S   C  T  A   336
ACACGTCTTC CTTCGTCTTC ACCTACCCCG AGGCTGACTC CTTCCCCAGC 3550
Y  T  S  S   F  V  F   T  Y  P   E  A  D  S   F  P  S  353
TGTGCAGCTG CCCACCGCAA GGGCAGCAGC AGCAATGAGC CTTCCTCTGA 3600
 C  A  A   A  H  R  K   G  S  S   S  N  E   P  S  S  D 370
CTCGCTCAGC TCACCCACGC TGCTGGCCCT GTGAGGGGGC AGGGAAGGGG 3650 | UTR
  S  L  S   S  P  T   L  L  A  L                       380
AGGCAGCCGG CACCCACAAG TGCCACTGCC CGAGCTGGTG CATTACAGAG 3700
AGGAGAAACA CATCTTCCCT AGAGGGTTCC TGTAGACCTA GGGAGGACCT 3750
TATCTGTGCG TGAAACACAC CAGGCTGTGG GCCTCAAGGA CTTGAAAGCA 3800
TCCATGTGTG GACTCAAGTC CTTACCTCTT CCGGAGATGT AGCAAAACGC 3850
ATGGAGTGTG TATTGTTCCC AGTGACACTT CAGAGAGCTG GTAGTTAGTA 3900
GCATGTTGAG CCAGGCCTGG GTCTGTGTCT CTTTTCTCTT TCTCCTTAGT 3950
CTTCTCATAG CATTAACTAA TCTATTGGGT TCATTATTGG AATTAACCTG 4000
GTGCTGGATA TTTTCAAATT GTATCTAGTG CAGCTGATTT TAACAATAAC 4050
TACTGTGTTC CTGGCAATAG TGTGTTCTGA TTAGAAATGA CCAATATTAT 4100
ACTAAGAAAA GATACGACTT TATTTTCTGG TAGATAGAAA TAAATAGCTA 4150 | var(4115):[T:0.01]
TATCCATGTA CTGTAGTTTT TCTTCAACAT CAATGTTCAT TGTAATGTTA 4200
CTGATCATGC ATTGTTGAGG TGGTCTGAAT GTTCTGACAT TAACAGTTTT 4250
CCATGAAAAC GTTTTATTGT GTTTTTAATT TATTTATTAA GATGGATTCT 4300
CAGATATTTA TATTTTTATT TTATTTTTTT CTACCTTGAG GTCTTTTGAC 4350
ATGTGGAAAG TGAATTTGAA TGAAAAATTT AAGCATTGTT TGCTTATTGT 4400
TCCAAGACAT TGTCAATAAA
AGCATTTAAG TTGAATGCGA CCAACCTTGT 4450
GCTCTTTTCA TTCTGGAAGT CTTGTAAGTT TCTGAAAGGT ATTATTGGAG 4500
ACCAGTTTGT CAAGAAGGGT AGCTGCTGGA GGGGGACACA CCCTCTGTCT 4550
GATCCCTTAT CAAAGAGGAC AAGGAAACTA TAGAGCTGAT TTTAGAATAT 4600 | var(4551):[T:0.01] | var(4583):[C:0.01]
TTTACAAATA CATGCCTTCC ATTGGAATGC TAAGATTTTC TACTGCTTCT 4650
GGGGACGGGA AACCGCTGTG TAACAGCTTT TGTGGGAATA CATTTTTTCT 4700
GTTTCAGTAC TCGCAGGGGG AAATATTTAA ATTTTGTTGT GCTAATATTA 4750 | var(4709):[G:0.01]
AATTCAGATG TTTTGATCTT AAAGGAACCC TTTAAGCAAA CAGAACCTAG 4800
CTTTGTACAG ACTATTTTAA CTTTTTATTC TCACAAAATC ACGTGGAGGG 4850
TTATTCTACT TCAAAGATGA GCAAATTGAA GAATGGTTAG AATAAACAAC 4900
TTTCTTGATA TTCCGTTATC GGCATTAGAA TCTTCCTGCT CGTTATCGTA 4950
TCCAGCAGGC TGAACTGCCT CTTGATACTT GGTTAAAAAA AATTTTCAGG 5000 | var(4991):[T:0.01] | REPEAT
CCGGGCGCGG TGGCCCATGC CTGTAATCCT AGCACTTTGG GAGGCCGAGG 5050
CAGGCGGATC ACCTGAGGTC