Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000142 A 0.00 0.07 0.17 0.21 0.11 G 1.00 0.93 0.83 0.79 0.89 0.00 0.13 0.28 0.33 0.20 000184 C 0.00 0.11 0.05 0.00 0.04 T 1.00 0.89 0.95 1.00 0.96 0.00 0.20 0.09 0.00 0.07 000199 T 0.04 0.14 0.10 0.21 0.12 C 0.96 0.86 0.90 0.79 0.88 0.08 0.24 0.17 0.33 0.21 000200 G 0.19 0.25 0.57 0.62 0.41 A 0.81 0.75 0.43 0.38 0.59 0.30 0.38 0.49 0.47 0.48 000204 T 0.02 0.02 0.31 0.21 0.14 C 0.98 0.98 0.69 0.79 0.86 0.04 0.04 0.43 0.33 0.24 000509 G 0.00 0.07 0.00 0.00 0.02 C 1.00 0.93 1.00 1.00 0.98 0.00 0.13 0.00 0.00 0.03 000549 T 0.04 0.02 0.00 0.00 0.02 A 0.96 0.98 1.00 1.00 0.98 0.08 0.04 0.00 0.00 0.03 000556 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 000664 T 0.09 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.91 1.00 1.00 1.00 0.98 0.16 0.00 0.00 0.00 0.04 000786 C 0.15 0.05 0.31 0.21 0.18 T 0.85 0.95 0.69 0.79 0.82 0.25 0.09 0.43 0.33 0.29 001098 G 0.14 0.19 0.53 0.62 0.39 C 0.86 0.81 0.47 0.38 0.61 0.24 0.31 0.50 0.47 0.47 001104 A 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 001205 A 0.09 0.00 0.31 0.21 0.16 T 0.91 1.00 0.69 0.79 0.84 0.17 0.00 0.43 0.33 0.26 001228 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001277 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 001571 C 0.16 0.05 0.30 0.21 0.18 G 0.84 0.95 0.70 0.79 0.82 0.27 0.09 0.42 0.33 0.29 001642 A 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 001652 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 001787 C 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 001919 C 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 002052 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 002102 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 002156 G 0.26 0.53 0.20 0.38 0.33 A 0.74 0.47 0.80 0.62 0.67 0.38 0.50 0.33 0.47 0.44 002244 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 002308 A 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 002981 T 0.07 0.18 0.13 0.21 0.15 C 0.93 0.82 0.87 0.79 0.85 0.13 0.30 0.23 0.34 0.25 002982 A 0.10 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.90 1.00 1.00 1.00 0.98 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 003016 - 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 003106 T 0.02 0.03 0.00 0.00 0.01 C 0.98 0.97 1.00 1.00 0.99 0.04 0.05 0.00 0.00 0.02 003937 T 0.05 0.05 0.33 0.15 0.14 C 0.95 0.95 0.67 0.85 0.86 0.10 0.10 0.44 0.25 0.24 003938 G 0.56 0.37 0.61 0.38 0.47 A 0.44 0.63 0.39 0.62 0.53 0.49 0.47 0.48 0.47 0.50 003953 T 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.06 0.00 0.00 0.00 0.01 004054 C 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 004141 C 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 004142 G 0.00 0.08 0.15 0.27 0.13 A 1.00 0.92 0.85 0.73 0.87 0.00 0.15 0.26 0.39 0.22 004196 C 0.26 0.20 0.16 0.00 0.15 A 0.74 0.80 0.84 1.00 0.85 0.39 0.32 0.27 0.00 0.26 004375 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 004446 A 0.53 0.41 0.64 0.38 0.48 G 0.47 0.59 0.36 0.62 0.52 0.50 0.48 0.46 0.47 0.50 004570 - 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 + 0.83 1.00 1.00 1.00 0.95 0.29 0.00 0.00 0.00 0.09 004599 T 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 C 0.83 1.00 1.00 1.00 0.95 0.29 0.00 0.00 0.00 0.09 004615 T 0.05 0.05 0.23 0.12 0.10 C 0.95 0.95 0.77 0.88 0.90 0.09 0.10 0.36 0.22 0.19 005471 C 0.04 0.02 0.00 0.00 0.02 T 0.96 0.98 1.00 1.00 0.98 0.07 0.04 0.00 0.00 0.03 005486 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 005499 T 0.13 0.07 0.34 0.14 0.17 A 0.87 0.93 0.66 0.86 0.83 0.23 0.13 0.45 0.24 0.28 005538 T 0.06 0.16 0.14 0.23 0.14 C 0.94 0.84 0.86 0.77 0.86 0.10 0.27 0.24 0.35 0.24 005634 G 0.00 0.16 0.11 0.23 0.12 A 1.00 0.84 0.89 0.77 0.88 0.00 0.27 0.20 0.35 0.21 005645 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 005741 A 0.06 0.14 0.14 0.20 0.13 G 0.94 0.86 0.86 0.80 0.87 0.11 0.24 0.24 0.33 0.23 005750 C 0.10 0.02 0.00 0.00 0.03 T 0.90 0.98 1.00 1.00 0.97 0.17 0.04 0.00 0.00 0.06 005799 C 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.05 005859 A 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 005954 - 0.06 0.16 0.14 0.22 0.14 + 0.94 0.84 0.86 0.78 0.86 0.10 0.27 0.24 0.34 0.24 006173 C 0.06 0.00 0.02 0.00 0.02 T 0.94 1.00 0.98 1.00 0.98 0.10 0.00 0.04 0.00 0.04 006652 G 0.35 0.18 0.14 0.00 0.17 A 0.65 0.82 0.86 1.00 0.83 0.46 0.30 0.24 0.00 0.29 010977 A 0.08 0.05 0.35 0.16 0.16 G 0.92 0.95 0.65 0.84 0.84 0.15 0.10 0.45 0.27 0.26 011030 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 011036 A 0.06 0.17 0.14 0.24 0.15 G 0.94 0.82 0.86 0.76 0.85 0.11 0.29 0.24 0.36 0.26 011105 C 0.48 0.40 0.64 0.39 0.48 A 0.52 0.60 0.36 0.61 0.52 0.50 0.48 0.46 0.48 0.50 011253 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 013750 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 013796 C 0.04 0.05 0.33 0.15 0.13 G 0.96 0.95 0.67 0.85 0.87 0.07 0.09 0.44 0.25 0.23 013831 A 0.30 0.60 0.39 0.62 0.47 C 0.70 0.40 0.61 0.38 0.53 0.42 0.48 0.47 0.47 0.50 013922 C 0.46 0.24 0.48 0.15 0.34 T 0.54 0.76 0.52 0.85 0.66 0.50 0.36 0.50 0.25 0.45 014184 A 0.04 0.17 0.14 0.24 0.14 G 0.96 0.83 0.86 0.76 0.86 0.08 0.28 0.24 0.36 0.24 014266 A 0.04 0.05 0.33 0.15 0.14 G 0.96 0.95 0.67 0.85 0.86 0.08 0.10 0.44 0.25 0.24 014533 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 014556 T 0.22 0.15 0.10 0.00 0.12 A 0.78 0.85 0.90 1.00 0.88 0.35 0.26 0.17 0.00 0.21 014746 A 0.04 0.05 0.32 0.15 0.13 G 0.96 0.95 0.68 0.85 0.87 0.07 0.10 0.43 0.25 0.23 014810 T 0.06 0.12 0.03 0.23 0.12 G 0.94 0.88 0.97 0.77 0.88 0.11 0.20 0.06 0.35 0.21 015093 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 015200 A 0.06 0.11 0.04 0.23 0.12 G 0.94 0.89 0.96 0.77 0.88 0.11 0.19 0.07 0.35 0.21 016932 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 017092 - 0.07 0.09 0.33 0.15 0.15 + 0.93 0.91 0.67 0.85 0.85 0.14 0.17 0.44 0.25 0.26 017147 - 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.07 0.00 0.05 0.00 0.03 017242 A 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 017299 A 0.35 0.18 0.14 0.00 0.17 G 0.65 0.82 0.86 1.00 0.83 0.46 0.30 0.24 0.00 0.29 017355 T 0.04 0.02 0.00 0.00 0.02 A 0.96 0.98 1.00 1.00 0.98 0.07 0.04 0.00 0.00 0.03 017412 G 0.06 0.15 0.12 0.23 0.14 A 0.94 0.85 0.88 0.77 0.86 0.11 0.26 0.21 0.35 0.24 017504 T 0.61 0.39 0.62 0.38 0.50 C 0.39 0.61 0.38 0.62 0.50 0.48 0.48 0.47 0.47 0.50 017508 T 0.02 0.03 0.02 0.00 0.02 C 0.98 0.97 0.98 1.00 0.98 0.04 0.05 0.05 0.00 0.03 017524 C 0.35 0.24 0.50 0.15 0.30 T 0.65 0.76 0.50 0.85 0.70 0.45 0.36 0.50 0.25 0.42 017761 - 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 + 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 017945 C 0.06 0.16 0.14 0.23 0.15 T 0.94 0.84 0.86 0.77 0.85 0.12 0.27 0.24 0.35 0.25 018271 C 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.05 0.00 0.02 018286 T 0.13 0.00 0.00 0.00 0.04 C 0.87 1.00 1.00 1.00 0.96 0.23 0.00 0.00 0.00 0.07 018688 C 0.09 0.07 0.35 0.15 0.16 T 0.91 0.93 0.65 0.85 0.84 0.17 0.14 0.45 0.25 0.27 018835 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 018836 C 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.06 018883 T 0.09 0.07 0.33 0.15 0.15 C 0.91 0.93 0.67 0.85 0.85 0.17 0.13 0.44 0.25 0.26 018914 A 0.41 0.34 0.26 0.23 0.31 G 0.59 0.66 0.74 0.77 0.69 0.48 0.45 0.39 0.35 0.43 018984 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018991 - 0.10 0.07 0.35 0.15 0.16 + 0.90 0.93 0.65 0.85 0.84 0.17 0.13 0.45 0.25 0.27 019113 A 0.06 0.15 0.12 0.23 0.14 G 0.94 0.85 0.88 0.77 0.86 0.10 0.26 0.22 0.35 0.24 019146 G 0.30 0.57 0.34 0.62 0.46 A 0.70 0.42 0.66 0.38 0.54 0.42 0.49 0.45 0.47 0.50 019296 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 019320 G 0.20 0.19 0.12 0.00 0.13 C 0.80 0.81 0.88 1.00 0.87 0.32 0.31 0.21 0.00 0.22 019454 - 0.06 0.16 0.14 0.22 0.14 + 0.94 0.84 0.86 0.78 0.86 0.10 0.27 0.24 0.34 0.24 019554 T 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.05 0.00 0.02 019623 A 0.04 0.02 0.00 0.00 0.02 G 0.96 0.98 1.00 1.00 0.98 0.07 0.04 0.00 0.00 0.03 019712 G 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.07 0.00 0.04 0.00 0.03 019730 C 0.22 0.18 0.11 0.00 0.13 A 0.78 0.82 0.89 1.00 0.87 0.35 0.30 0.20 0.00 0.23 019848 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 020517 C 0.22 0.50 0.20 0.35 0.32 G 0.78 0.50 0.80 0.65 0.68 0.34 0.50 0.32 0.46 0.43 020592 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 020705 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 020782 T 0.06 0.05 0.35 0.15 0.14 C 0.94 0.95 0.65 0.85 0.86 0.11 0.09 0.45 0.25 0.24 020926 T 0.04 0.02 0.00 0.00 0.02 C 0.96 0.98 1.00 1.00 0.98 0.07 0.05 0.00 0.00 0.03 020953 T 0.41 0.31 0.29 0.23 0.31 G 0.59 0.69 0.71 0.77 0.69 0.48 0.43 0.41 0.35 0.43 020990 C 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 021177 T 0.04 0.06 0.34 0.15 0.14 C 0.96 0.94 0.66 0.85 0.86 0.07 0.10 0.45 0.25 0.24 021227 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 021407 T 0.06 0.03 0.00 0.00 0.02 C 0.94 0.97 1.00 1.00 0.98 0.10 0.05 0.00 0.00 0.04 021497 A 0.40 0.14 0.50 0.15 0.29 C 0.60 0.86 0.50 0.85 0.71 0.48 0.24 0.50 0.25 0.42 021499 G 0.00 0.00 0.07 0.04 0.03 A 1.00 1.00 0.93 0.96 0.97 0.00 0.00 0.14 0.08 0.06 021535 G 0.02 0.00 0.03 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.97 1.00 0.99 0.04 0.00 0.05 0.00 0.02 021648 T 0.16 0.00 0.00 0.00 0.05 C 0.84 1.00 1.00 1.00 0.95 0.27 0.00 0.00 0.00 0.09 022028 A 0.00 0.07 0.08 0.27 0.10 G 1.00 0.93 0.92 0.73 0.90 0.00 0.14 0.15 0.40 0.19 022105 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 022187 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 022433 C 0.25 0.44 0.19 0.39 0.31 T 0.75 0.56 0.81 0.61 0.69 0.38 0.49 0.31 0.47 0.43 022552 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 022563 C 0.42 0.19 0.16 0.23 0.26 G 0.58 0.81 0.84 0.77 0.74 0.49 0.31 0.27 0.35 0.38 022577 A 0.06 0.05 0.34 0.15 0.15 C 0.94 0.95 0.66 0.85 0.85 0.11 0.09 0.45 0.25 0.25 022610 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 022649 T 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.97 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 022681 T 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.95 1.00 1.00 1.00 0.99 0.09 0.00 0.00 0.00 0.02 022905 A 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.95 1.00 1.00 1.00 0.99 0.10 0.00 0.00 0.00 0.02 023091 A 0.07 0.16 0.13 0.24 0.15 G 0.93 0.84 0.87 0.76 0.85 0.13 0.27 0.23 0.36 0.25 023094 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 023457 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 023464 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 023786 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 023897 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 024199 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 024598 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 024609 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 024686 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 024708 T 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.20 0.00 0.00 0.00 0.07 024845 T 0.07 0.03 0.33 0.14 0.14 C 0.93 0.97 0.68 0.86 0.86 0.14 0.05 0.44 0.24 0.24 024903 A 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.06 025098 C 0.09 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.91 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 025123 T 0.46 0.20 0.50 0.35 0.38 C 0.54 0.80 0.50 0.65 0.62 0.50 0.33 0.50 0.46 0.47 025191 G 0.04 0.16 0.11 0.23 0.13 A 0.96 0.84 0.89 0.77 0.87 0.07 0.27 0.20 0.35 0.23 025347 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 025352 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 025479 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 025486 C 0.37 0.16 0.16 0.23 0.24 T 0.63 0.84 0.84 0.77 0.76 0.47 0.27 0.27 0.35 0.36 025663 T 0.07 0.05 0.34 0.12 0.14 C 0.93 0.95 0.66 0.88 0.86 0.14 0.09 0.45 0.22 0.24 025796 G 0.06 0.00 0.02 0.00 0.02 A 0.94 1.00 0.98 1.00 0.98 0.11 0.00 0.05 0.00 0.04 025837 T 0.13 0.00 0.02 0.00 0.04 C 0.87 1.00 0.98 1.00 0.96 0.23 0.00 0.05 0.00 0.08 026006 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 026007 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 026098 T 0.06 0.17 0.14 0.24 0.15 G 0.94 0.83 0.86 0.76 0.85 0.11 0.28 0.24 0.36 0.25 026110 A 0.44 0.21 0.52 0.36 0.39 G 0.56 0.79 0.48 0.64 0.61 0.49 0.34 0.50 0.46 0.47 026191 A 0.35 0.17 0.15 0.23 0.23 C 0.65 0.83 0.85 0.77 0.77 0.46 0.28 0.26 0.35 0.35 026372 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 026484 - 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 026521 A 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 026661 T 0.43 0.18 0.45 0.36 0.36 A 0.57 0.82 0.55 0.64 0.64 0.49 0.30 0.49 0.46 0.46 026662 A 0.27 0.18 0.13 0.00 0.15 C 0.73 0.82 0.87 1.00 0.85 0.40 0.30 0.23 0.00 0.25 027266 + 0.46 0.20 0.50 0.35 0.38 - 0.54 0.80 0.50 0.65 0.62 0.50 0.33 0.50 0.46 0.47 027532 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 027596 T 0.00 0.07 0.17 0.27 0.12 G 1.00 0.93 0.83 0.73 0.88 0.00 0.13 0.28 0.39 0.21 027627 T 0.06 0.14 0.14 0.23 0.14 C 0.94 0.86 0.86 0.77 0.86 0.10 0.24 0.24 0.35 0.24 027794 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 027864 C 0.16 0.00 0.02 0.00 0.04 T 0.84 1.00 0.98 1.00 0.96 0.27 0.00 0.04 0.00 0.08 028030 T 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.14 0.00 0.00 0.00 0.04 028134 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 028463 T 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 029233 G 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.07 0.00 0.04 0.00 0.03 029236 G 0.11 0.05 0.34 0.13 0.15 A 0.89 0.95 0.66 0.87 0.85 0.20 0.09 0.45 0.23 0.26 029440 T 0.00 0.03 0.03 0.00 0.01 C 1.00 0.97 0.97 1.00 0.99 0.00 0.05 0.06 0.00 0.02 029454 C 0.00 0.03 0.03 0.00 0.01 T 1.00 0.97 0.97 1.00 0.99 0.00 0.05 0.06 0.00 0.02 029522 G 0.00 0.00 0.06 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.94 1.00 0.99 0.00 0.00 0.12 0.00 0.02 029610 G 0.27 0.06 0.27 0.13 0.19 A 0.73 0.94 0.73 0.87 0.81 0.39 0.12 0.39 0.23 0.30 029665 A 0.38 0.06 0.29 0.13 0.23 G 0.62 0.94 0.71 0.87 0.77 0.47 0.11 0.42 0.23 0.35 029684 G 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.06 0.00 0.01 029760 T 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 030363 G 0.28 0.24 0.06 0.00 0.15 A 0.72 0.76 0.94 1.00 0.85 0.40 0.36 0.10 0.00 0.25 030378 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 030510 C 0.28 0.07 0.26 0.13 0.20 T 0.72 0.93 0.74 0.87 0.80 0.40 0.12 0.39 0.23 0.31 030562 G 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 030573 T 0.25 0.06 0.25 0.13 0.18 C 0.75 0.94 0.75 0.87 0.82 0.38 0.12 0.38 0.23 0.30 030591 G 0.27 0.07 0.25 0.13 0.19 A 0.73 0.93 0.75 0.87 0.81 0.39 0.12 0.38 0.23 0.30 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 003016: gt 004570: GTATTCCATGGTGTGTGCATATATACATA 005954: gt 014533: CA 017092: aa 017147: t 017761: ca 018991: ctt 019454: c 026484: T 027266: T