Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000388 A 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.06 000843 G 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 000850 C 0.16 0.05 0.00 0.10 0.08 T 0.84 0.95 1.00 0.90 0.92 0.27 0.10 0.00 0.17 0.15 000955 C 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.17 0.00 0.00 0.00 0.06 001110 C 0.20 0.18 0.11 0.00 0.12 G 0.80 0.82 0.89 1.00 0.88 0.32 0.30 0.19 0.00 0.22 001135 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 002318 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 002458 T 0.17 0.24 0.10 0.00 0.13 C 0.83 0.76 0.90 1.00 0.87 0.28 0.36 0.18 0.00 0.22 002648 - 0.10 0.00 0.03 0.00 0.04 + 0.90 1.00 0.97 1.00 0.96 0.19 0.00 0.05 0.00 0.07 003457 - 0.17 0.25 0.07 0.00 0.13 + 0.83 0.75 0.93 1.00 0.87 0.29 0.38 0.12 0.00 0.23 003637 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 003680 - 0.19 0.20 0.12 0.00 0.13 + 0.81 0.80 0.88 1.00 0.87 0.30 0.32 0.22 0.00 0.23 003738 + 0.18 0.17 0.07 0.00 0.10 - 0.82 0.83 0.93 1.00 0.90 0.29 0.28 0.13 0.00 0.18 004099 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 004502 A 0.08 0.24 0.26 0.43 0.23 G 0.92 0.76 0.74 0.57 0.77 0.15 0.36 0.39 0.49 0.35 004699 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 005332 T 0.35 0.26 0.11 0.05 0.20 G 0.65 0.74 0.89 0.95 0.80 0.45 0.39 0.20 0.09 0.32 005668 C 0.27 0.21 0.10 0.00 0.15 T 0.73 0.79 0.90 1.00 0.85 0.40 0.33 0.18 0.00 0.26 005756 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 005764 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 005862 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.02 006186 A 0.28 0.24 0.08 0.00 0.15 C 0.72 0.76 0.92 1.00 0.85 0.41 0.36 0.15 0.00 0.26 006219 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 006297 T 0.18 0.23 0.10 0.00 0.13 C 0.82 0.77 0.90 1.00 0.87 0.30 0.35 0.17 0.00 0.22 006337 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 006536 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 006637 T 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 006655 C 0.28 0.23 0.11 0.00 0.16 T 0.72 0.77 0.89 1.00 0.84 0.40 0.35 0.20 0.00 0.27 006815 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 007158 G 0.06 0.23 0.09 0.00 0.09 A 0.94 0.77 0.91 1.00 0.91 0.10 0.35 0.17 0.00 0.16 007248 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 007387 G 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 A 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 007403 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 007443 - 0.09 0.00 0.02 0.00 0.03 + 0.91 1.00 0.98 1.00 0.97 0.17 0.00 0.04 0.00 0.06 007846 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 008114 A 0.12 0.30 0.58 0.43 0.34 G 0.88 0.70 0.42 0.57 0.66 0.21 0.42 0.49 0.49 0.45 008454 A 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.97 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 008479 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 008493 A 0.02 0.00 0.00 0.03 0.01 G 0.98 1.00 1.00 0.97 0.99 0.04 0.00 0.00 0.05 0.02 008814 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 009011 - 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 009036 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 009185 - 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 + 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 009276 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 009282 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 009328 T 0.08 0.25 0.30 0.48 0.27 C 0.92 0.75 0.70 0.52 0.73 0.14 0.38 0.42 0.50 0.40 009445 T 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 009587 - 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 + 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 009723 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 009908 T 0.18 0.30 0.55 0.43 0.36 C 0.82 0.70 0.45 0.57 0.64 0.30 0.42 0.50 0.49 0.46 009934 A 0.18 0.05 0.00 0.09 0.08 G 0.82 0.95 1.00 0.91 0.92 0.30 0.09 0.00 0.16 0.15 010007 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 010434 T 0.10 0.00 0.03 0.00 0.04 C 0.90 1.00 0.97 1.00 0.96 0.19 0.00 0.06 0.00 0.07 010600 C 0.57 0.30 0.14 0.05 0.28 T 0.43 0.70 0.86 0.95 0.72 0.49 0.42 0.24 0.09 0.40 011058 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 011316 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 012575 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 012578 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 012943 A 0.16 0.03 0.00 0.06 0.06 G 0.84 0.97 1.00 0.94 0.94 0.27 0.05 0.00 0.10 0.12 013094 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 013164 A 0.21 0.05 0.00 0.02 0.08 G 0.79 0.95 1.00 0.98 0.92 0.33 0.09 0.00 0.05 0.14 013567 + 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 - 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 013802 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002648: CAG 003457: C 003680: TGTGCCCA 003738: G 007443: g 009011: G 009185: C 009587: ct 013567: g