Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Total-hz 000163 T 0.01 C 0.99 0.02 001321 C 0.01 G 0.99 0.01 001937 G 0.01 A 0.99 0.01 002001 A 0.01 G 0.99 0.01 002002 A 0.01 C 0.99 0.01 002019 A 0.01 C 0.99 0.01 002071 T 0.35 G 0.65 0.45 002296 C 0.01 A 0.99 0.01 002323 A 0.01 T 0.99 0.01 002324 C 0.01 G 0.99 0.01 002528 G 0.01 A 0.99 0.01 002717 + 0.01 - 0.99 0.02 006070 G 0.01 C 0.99 0.02 006669 C 0.34 A 0.66 0.45 007961 A 0.01 C 0.99 0.02 008271 C 0.02 A 0.98 0.04 008416 G 0.04 C 0.96 0.08 008441 T 0.02 G 0.98 0.04 008477 G 0.01 A 0.99 0.01 008703 T 0.01 C 0.99 0.01 009104 T 0.01 C 0.99 0.01 009146 T 0.04 G 0.96 0.08 009167 C 0.34 T 0.66 0.45 010191 G 0.35 A 0.65 0.46 010439 C 0.05 T 0.95 0.09 010453 T 0.34 C 0.66 0.45 010469 G 0.01 A 0.99 0.01 010498 T 0.01 C 0.99 0.01 010587 T 0.35 C 0.65 0.46 010686 C 0.05 T 0.95 0.09 010709 A 0.01 G 0.99 0.01 011000 C 0.01 A 0.99 0.01 013080 G 0.41 A 0.59 0.48 013343 T 0.01 G 0.99 0.01 014061 A 0.39 G 0.61 0.47 014653 T 0.05 C 0.95 0.10 014658 T 0.05 C 0.95 0.09 014696 T 0.40 C 0.60 0.48 014697 A 0.40 G 0.60 0.48 014927 G 0.39 A 0.61 0.48 015049 G 0.01 A 0.99 0.01 015287 T 0.01 C 0.99 0.01 015485 C 0.01 T 0.99 0.01 015918 C 0.01 T 0.99 0.01 016045 A 0.35 T 0.65 0.45 016046 A 0.34 C 0.66 0.45 016121 G 0.35 A 0.65 0.45 016187 A 0.01 G 0.99 0.01 016953 G 0.01 A 0.99 0.01 017290 A 0.02 G 0.98 0.03 017413 T 0.01 C 0.99 0.02 017517 T 0.34 C 0.66 0.45 018485 A 0.03 G 0.97 0.05 018508 A 0.01 G 0.99 0.01 018771 G 0.33 C 0.67 0.44 019159 A 0.01 C 0.99 0.01 019161 C 0.34 T 0.66 0.45 019236 C 0.34 T 0.66 0.45 019470 T 0.01 C 0.99 0.01 019506 C 0.01 G 0.99 0.01 019648 T 0.35 C 0.65 0.46 020056 C 0.01 T 0.99 0.01 020133 C 0.01 T 0.99 0.01 020139 T 0.04 C 0.96 0.08 020295 A 0.01 G 0.99 0.01 020364 T 0.01 C 0.99 0.01 020389 G 0.01 T 0.99 0.01 020404 G 0.01 A 0.99 0.01 020807 T 0.32 A 0.68 0.44 021019 T 0.04 A 0.96 0.08 021128 A 0.01 G 0.99 0.01 021520 G 0.01 A 0.99 0.02 022002 G 0.03 A 0.97 0.07 022003 T 0.01 C 0.99 0.01 022104 T 0.33 C 0.67 0.44 022175 T 0.01 C 0.99 0.02 022423 C 0.17 A 0.83 0.29 022692 T 0.14 C 0.86 0.24 022697 A 0.01 G 0.99 0.01 022944 G 0.01 C 0.99 0.02 023049 C 0.01 T 0.99 0.02 023912 A 0.06 C 0.94 0.11 023932 T 0.30 C 0.70 0.42 024177 C 0.01 G 0.99 0.01 024484 C 0.01 A 0.99 0.01 024741 T 0.19 C 0.81 0.31 024915 T 0.08 G 0.92 0.15 024953 C 0.01 G 0.99 0.03 025239 T 0.01 C 0.99 0.02 025275 A 0.01 G 0.99 0.02 025425 T 0.01 C 0.99 0.02 025700 T 0.01 C 0.99 0.01 025754 C 0.27 T 0.73 0.39 025758 A 0.18 G 0.82 0.29 025867 G 0.01 A 0.99 0.01 025973 - 0.07 + 0.93 0.14 025981 G 0.12 A 0.88 0.21 026076 G 0.39 A 0.61 0.47 026612 C 0.01 T 0.99 0.01 026677 A 0.01 G 0.99 0.01 026707 T 0.01 C 0.99 0.01 026853 C 0.18 A 0.82 0.30 026944 G 0.09 A 0.91 0.16 027157 T 0.01 C 0.99 0.01 027193 T 0.01 G 0.99 0.01 027296 C 0.11 T 0.89 0.19 027360 T 0.01 G 0.99 0.01 027366 A 0.01 C 0.99 0.01 027834 C 0.01 G 0.99 0.01 027849 G 0.01 T 0.99 0.01 027859 C 0.01 G 0.99 0.01 028021 G 0.01 C 0.99 0.02 028056 C 0.01 T 0.99 0.01 028370 A 0.02 G 0.98 0.03 028429 A 0.01 G 0.99 0.01 028453 G 0.01 A 0.99 0.02 028578 C 0.27 T 0.73 0.39 028632 G 0.01 A 0.99 0.01 029192 T 0.02 C 0.98 0.04 029360 A 0.01 T 0.99 0.01 029420 T 0.01 C 0.99 0.02 029604 G 0.11 C 0.89 0.20 029703 - 0.01 + 0.99 0.01 029730 C 0.35 T 0.65 0.45 030373 A 0.02 G 0.98 0.04 030415 A 0.12 T 0.88 0.21 030481 T 0.12 C 0.88 0.21 030489 T 0.01 G 0.99 0.01 030498 T 0.12 C 0.88 0.21 030682 A 0.17 G 0.83 0.28 030871 G 0.02 A 0.98 0.04 030921 A 0.01 G 0.99 0.01 031180 A 0.01 G 0.99 0.01 031234 T 0.15 A 0.85 0.26 031358 T 0.03 C 0.97 0.07 031403 A 0.01 C 0.99 0.01 031858 G 0.01 A 0.99 0.01 031956 T 0.16 C 0.84 0.28 032380 G 0.01 A 0.99 0.01 032739 A 0.01 G 0.99 0.01 032952 C 0.01 T 0.99 0.01 Note: Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002717: TGCc 025973: AT 029703: g