Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000671 C 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.88 1.00 1.00 1.00 0.97 0.22 0.00 0.00 0.00 0.06 000691 G 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.88 1.00 1.00 1.00 0.97 0.22 0.00 0.00 0.00 0.06 000884 A 0.67 0.62 0.36 0.03 0.44 C 0.33 0.38 0.64 0.97 0.56 0.44 0.47 0.46 0.05 0.49 000900 - 0.65 0.70 0.36 0.07 0.44 + 0.35 0.30 0.64 0.93 0.56 0.45 0.42 0.46 0.13 0.49 001051 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 001213 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 001590 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001812 G 0.00 0.15 0.00 0.00 0.03 C 1.00 0.85 1.00 1.00 0.97 0.00 0.26 0.00 0.00 0.06 001855 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001863 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 001866 T 0.06 0.03 0.00 0.00 0.02 C 0.94 0.97 1.00 1.00 0.98 0.10 0.05 0.00 0.00 0.04 001996 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 002020 A 0.19 0.62 0.23 0.00 0.25 G 0.81 0.38 0.77 1.00 0.75 0.31 0.47 0.35 0.00 0.38 002887 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 003016 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 003119 A 0.06 0.11 0.07 0.00 0.06 G 0.94 0.89 0.93 1.00 0.94 0.11 0.20 0.13 0.00 0.11 003124 A 0.23 0.00 0.02 0.00 0.07 G 0.77 1.00 0.98 1.00 0.93 0.35 0.00 0.04 0.00 0.12 003530 G 0.28 0.20 0.36 0.30 0.29 A 0.72 0.80 0.64 0.70 0.71 0.40 0.33 0.46 0.42 0.41 003610 A 0.00 0.00 0.09 0.00 0.02 G 1.00 1.00 0.91 1.00 0.98 0.00 0.00 0.17 0.00 0.04 003759 T 0.02 0.11 0.11 0.00 0.06 C 0.98 0.89 0.89 1.00 0.94 0.04 0.20 0.20 0.00 0.11 003760 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 003855 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 003860 T 0.06 0.59 0.11 0.00 0.18 C 0.94 0.41 0.89 1.00 0.82 0.10 0.48 0.20 0.00 0.29 003960 T 0.19 0.00 0.02 0.00 0.06 C 0.81 1.00 0.98 1.00 0.94 0.30 0.00 0.04 0.00 0.11 004105 A 0.02 0.09 0.11 0.00 0.05 G 0.98 0.91 0.89 1.00 0.95 0.04 0.17 0.20 0.00 0.10 004130 T 0.17 0.23 0.36 0.35 0.27 C 0.83 0.77 0.64 0.65 0.73 0.28 0.35 0.46 0.46 0.40 004146 C 0.46 0.23 0.41 0.35 0.37 T 0.54 0.77 0.59 0.65 0.63 0.50 0.35 0.48 0.46 0.47 004175 T 0.22 0.02 0.14 0.48 0.22 G 0.78 0.98 0.86 0.52 0.78 0.35 0.04 0.24 0.50 0.34 004193 T 0.06 0.02 0.11 0.48 0.17 C 0.94 0.98 0.89 0.52 0.83 0.10 0.04 0.20 0.50 0.28 004194 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 004207 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 004254 G 0.17 0.23 0.36 0.38 0.28 C 0.83 0.77 0.64 0.62 0.72 0.28 0.35 0.46 0.47 0.40 004273 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 004992 G 0.28 0.66 0.34 0.17 0.35 A 0.72 0.34 0.66 0.83 0.65 0.40 0.45 0.45 0.28 0.46 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000900: CCCCTCCTCCCTCAGATCCAGGAGTACAGGCCCAGACCCTCCTCCCTCAGA