FEN1 Color FASTA
The longest form of insertion/deletion sites is shown in the FASTA sequence and contain a '-' as the alternate allele in the variation tag.
*Display courtesy of GeneSNPs

TGAGCTATGG TCAAGACATT CAAGTTCTGG TTCTGAGTAA TCTGAGTCTG 50
AGTAAAGCGA CTGTAATATC TATTTCACAG AACTGAAAAA TAAGAAAGAT 100
GATGAATCAA AGCATCTAGT GCCTAGCAGG GAGTATTTTG CTCAACAGGT 150 | var(103):[C:0.01]
ATTTGCTTCC TTCCTAAGGC TGTAGGGAAG ATGATGAGAT AATGTCTTTT 200
ATGAAAGAGG GCTGTAAACG TAAAGATCTG TACAAATGTT AACTTCATTG 250
TCACCGGTCA GCCAATGCTT CTAAAATCCA GAACATAACA ACTCTAGAGA 300
AGTAAACTGC CCCCATTGTT CTGAGACACT GGAATTCAAT TCAGTAAACA 350
ATCACGGCCC CCTTCCCCCA AAATGATAAA GACAATCACT GCCATTTATT 400 | var(360):[T:0.01] | REPEAT
GAGCTTCCAA TTACGGGCCC TCTGTTTGGC ACTGAGAATA CAAAGATGAA 450
TAGACATCAT CCCAGAGCTA GATGCGCGTC AGACGGTGGT CACTAGGAGG 500
CGTGGCCGAA AACAAAGAAG TCCATGGAAC GTGGCCAGAG ATCTGTACAG 550 | var(504):[T:0.01]
AGGCTGTGGG CGCTCCTAGG AAAGTCTGGC CAAGTGCCTG AGAGTTGGAA 600
GTGCTTCACC AATAAACATT TGCCCAGGGC ATTGTAGGAT GGGCACGGGT 650
TCGGCAGAAG AACTTTCCAA ATAAAGATAA CACACCACCG ATAACAGAGA 700
TATACAAACT GGAAGGTATT CAAAATTCGC CCCACGCCTC TCGCCCTTAG 750
AAATCGCGAG CTGAGAAACC TAAGGAGTTC ATGGCAAGGG GCTTCCCCCT 800
TCCCCACCCT TCAGCCCAAG CCGGAGGTTC CAGGAGCGTC TAGCCCTCTG 850
GATCTCCGGC GTCTGAGGAG ATAAGCGCGG TGTGGGTCAG ACCCCGAGGG 900
GTCCTCGCAT CTCCGTCTGG AACTCCCCTC AACGCTCTCA CCATTTTGCC 950
CCGCGAAGGC TAATCCGCCG CTCCGCCACC GGAAGAACAC GTCGGCAGGA 1000 | var(974):[T:0.01] | var(982):[C:0.01] | var(995):[A:0.39]
GCAGGCGCCT AGCACAACCG GAAAAGGAAG TGCCTCCGGC GCAAGTGGCA 1050
TTGAGGGACT TGTAGTCCTG CGATTTCGGG TGTAGAGGGA GCAGGGGCCT 1100 | Exon 1 | UTR
GCGGGGACCT GGTGTGGGTG GAGTGGGGAC AAGCGGTGGA GAAGGGTACG 1150
CCAGGGTCGC TGAGAGACTC TGTTCTCCCT GGAGGGACTG GTTGCCATGA 1200 | var(1175):[T:0.07]
GAGCAGCCGT CTGAGGGGAC GCAGCCTGCA CTACGCGCCC CAAGAGGCTG 1250
TGCGTGGCGA GCAGGTCACG TGACGGGAGC GCGGGCTTTG GAAGGCGGCT 1300
GAACGTCAGG CCACCCGCCG CTAAGCTGAG AAGGGAGAGC GAGCTTAGGA 1350
CCGCCTGCCC GGGGCAACCC CGAACCAAGC TTTAGCCGCC GAGGCCGCGT 1400
GTCCCAAAGG CCAG
GTGAGA CCCCATGGGA AGCGCCTCCG GGAGCGACGG 1450
GGTCCGCTTG GCGCTGGGGG CCGTGGGGAG CCGGGGTCTG GAGTGCGCGG 1500 | REPEAT
GATTCGCAGT CAAGAGGTCC CGCCACTTTT CCCCCTGTGA GCCTTGGGCC 1550
AGTCGCGTAA GCTCCGAGCC TCTCTTTCCT CCATTGTAGA AAAGCGGTAA 1600
TAAGTTCCAC CTTATGGGGT CGTGTTGTAT TTTTCCTAAG ACCTTGGACG 1650
AGAAACATTT CTGACACTTG AGTTGTTTAG GCCCCTTTCC TGCCTACCTG 1700
TCTGTGGGAC GCCGTGAGGG GATCAAGGGC TACATGGTCT GGTCCTCAGT 1750
CCACACTCCA GCAGCGCGGC CGGCTTGAGG CAAGAGCCGA AGGGTTGAAC 1800
AGGCCTGGAG AGGGGACATT AGAGGTTTCT GTCTGTTGTC TCAGTTAACC 1850 | REPEAT
CTGGCAGCAG CCCTGAGAGA CAGGCATGGT AATCGTTCTT CTTCTGTAGA 1900
CGAGAAAATA AACCTCAGTG GCTTGGTAAT GTCACACGGA TGGTAAATGC 1950
CGCGCCTAGA TTCAAGGCCA GAGCTTTTGC CGCTGCAGTT CACAGGGGAA 2000
TTATTCATAT TAATCAAATG AATAATTCAT TGTCAATTAA TTATTAATTG 2050
ATTAATAATC CAGGGATGGA CCTGGAAGGA CGCGTGAGAG GATGGCGAGA 2100
GGAGGGCACA GCTAAGGAAA AGTGGGAAAA GGCGGGCCTT ATTCCAGCTT 2150
TCTGTTGAGA TCCCAGAATG TAGGGTTAGG TTGGGAACCA GAACATGAAA 2200
GATCGTGATG CCATGCTGAA GTGTTTGGAC TGAATTAGAA GGAAGAATTG 2250 | var(2202):[G:0.02]
AACAGTCATT GATGCTCTAG AAAGAACCCT GTGAAGAAAG AGTGGGAACA 2300
ATGAAAAGGC CTGATGGAGT CTTTCGTTTC TTCTTTCTCT TTTCTTTTGT 2350 | REPEAT
CTTCTTTTCT TTTCTTGACA GGGTCTTGCT CTGTTGCCCA GGCTGGAGTG 2400
TGGTGGCACA ATCATAGCTC ACTGTAGCCT GGAACTCCTG GGCTCATGTG 2450
ATCCTCCCAC CACGGCCTCC CAAAGTGCTG GGATTACTGC CCAGAGCCTC 2500
TGTGCCTGGC CCCAGTAGAA TATTTCTTGG AGTATTGGAC ACATACCAAC 2550
AGTGGGCACA AGATGAGTTT TTTATTTTTT TGAGACGGAG TCTCACTCTC 2600 | REPEAT
TTGCTAGGCT GGAGTGCAGC GGCACAATCT CGGCTCACTG CATTCTCTGC 2650 | var(2632):[A:0.01]
CTCCTGGGTT CAAGCGATTC TCCTGCCTCA GCCTCCCGAG TAGCTGGGAT 2700
TACAGGTGCA CACCACCACA CCCAGCTAAT TTTTTTTTTT TTTGTATTTT 2750
TAGTAGAGAC AGGGTTTCAC CGTGTTGGCC AGGATGGCAA GATGATTTTA 2800
AATTGCACCC CCTAAAAATC CTTTTTAATA GTTATACATT TAATACATAT 2850
TAAAATATAA CTAATAGAAC ACAAATATTA TTGCTTATGA GTTTTCCAGT 2900
TTAGTTTTTT AAAAAAAATT CTAAGTGAAT GAAAGTACGG GTTTTAGTTG 2950 | REPEAT
GAAGTAGCAA AAATCGTGAG GGTGATTTGG GAAACACTGC TATCTGGGAA 3000
ACACTGAACT CTGAAGTGCA ATACTCTTTT GAGCCCAGTG ACTACAGCAT 3050
GCCAGACCCC TAAATCAGGA CCTGGGGAGG AGCCATGGAG TTAACATTTC 3100
AGACTGAGTG GTGGCGAGAA AACGCAAAGG GAAAGACTTG AAACTCTAGC 3150 | var(3138):[G:0.01]
AACATTATAA TAAAAGTAGA AACTCTTATG TGCTGAGGCG ATGATGAAGA 3200
GAGTTTAGAG AAGCTTGTGA GAAAGCCACA TCACCTCCAT TCAGATATGT 3250
TTGCAATCCT TTTTCAAGGC TGCCTTATTA GTCAGGGTTC TCCAGAGACT 3300 | REPEAT
CAAAACAAAT CAGATCTGTT TGTTTAGCTG GTGTATTTGC CTGTCTTTCA 3350
GGTCTGCCAT TATGGTCCCT GGACTCCTCA AGCCAGGCCA AGCATCCTGG 3400
CCTTCTGTGG TCCTTGATGG AGACCTATGT TGCAGGTTTT TTTTGTGTAA 3450
TAAATAATGC TGCTACCTTA GAATATCAAC AGTATCTTAT TTCTCTAAGC 3500
ACGTGGTTCA ATTTCTGGTA CTCGTTGAGC CTTACTATTG AGTAAATTCT 3550
CCTGCTAGAC TGAGTTTTTT GAGAATGGGG ACCTTGTTCA TCTTTTTATC 3600
TTTAGCAGTG CTGACATGGT GTCCTTTTTG TTGTGTGGAA TTTAGTTGAA 3650
GGCATGAAGT TGGTGAGATA ACACCAGTTA TAACCTTTCT CCTTTCCTCC 3700 | var(3690):[G:0.01]
GTCTCTGACT TGCCTTTCTT TTTTAGTCAT CCCTCCTCTG TGTTGCCATG 3750 | Exon 2 | UTR
                                                    M  1
GGAATTCAAG GCCTGGCCAA ACTAATTGCT GATGTGGCCC CCAGTGCCAT 3800
 G  I  Q   G  L  A  K   L  I  A   D  V  A   P  S  A  I 18
CCGGGAGAAT GACATCAAGA GCTACTTTGG CCGTAAGGTG GCCATTGATG 3850
  R  E  N   D  I  K   S  Y  F  G   R  K  V   A  I  D   34
CCTCTATGAG CATTTATCAG TTCCTGATTG CTGTTCGCCA GGGTGGGGAT 3900
A  S  M  S   I  Y  Q   F  L  I   A  V  R  Q   G  G  D  51
GTGCTGCAGA ATGAGGAGGG TGAGACCACC AGCCACCTGA TGGGCATGTT 3950
 V  L  Q   N  E  E  G   E  T  T   S  H  L   M  G  M  F 68
CTACCGCACC ATTCGCATGA TGGAGAACGG CATCAAGCCC GTGTATGTCT 4000
  Y  R  T   I  R  M   M  E  N  G   I  K  P   V  Y  V   84
TTGATGGCAA GCCGCCACAG CTCAAGTCAG GCGAGCTGGC CAAACGCAGT 4050
F  D  G  K   P  P  Q   L  K  S   G  E  L  A   K  R  S  101
GAGCGGCGGG CTGAGGCAGA GAAGCAGCTG CAGCAGGCTC AGGCTGCTGG 4100
 E  R  R   A  E  A  E   K  Q  L   Q  Q  A   Q  A  A  G 118
GGCCGAGCAG GAGGTGGAAA AATTCACTAA GCGGCTGGTG AAGGTCACTA 4150
  A  E  Q   E  V  E   K  F  T  K   R  L  V   K  V  T   134
AGCAGCACAA TGATGAGTGC AAACATCTGC TGAGCCTCAT GGGCATCCCT 4200
K  Q  H  N   D  E  C   K  H  L   L  S  L  M   G  I  P  151
TATCTTGATG CACCCAGTGA GGCAGAGGCC AGCTGTGCTG CCCTGGTGAA 4250 | NOT SCANNED
 Y  L  D   A  P  S  E   A  E  A   S  C  A   A  L  V  K 168
GGCTGGCAAA GTCTATGCTG CGGCTACCGA GGACATGGAC TGCCTCACCT 4300
  A  G  K   V  Y  A   A  A  T  E   D  M  D   C  L  T   184
TCGGCAGCCC TGTGCTAATG CGACACCTGA CTGCCAGTGA AGCCAAAAAG 4350
F  G  S  P   V  L  M   R  H  L   T  A  S  E   A  K  K  201
CTGCCAATCC AGGAATTCCA CCTGAGCCGG ATTCTGCAGG AGCTGGGCCT 4400
 L  P  I   Q  E  F  H   L  S  R   I  L  Q   E  L  G  L 218
GAACCA
GGAA CAGTTTGTGG ATCTGTGCAT CCTGCTAGGC AGTGACTACT 4450
  N  Q  E   Q  F  V   D  L  C  I   L  L  G   S  D  Y   234
GTGAGAGTAT CCGGGGTATT GGGCCCAAGC GGGCTGTGGA CCTCATCCAG 4500
C  E  S  I   R  G  I   G  P  K   R  A  V  D   L  I  Q  251
AAGCACAAGA GCATCGAGGA GATCGTGCGG CGACTTGACC CCAACAAGTA 4550
 K  H  K   S  I  E  E   I  V  R   R  L  D   P  N  K  Y 268
CCCTGTGCCA GAAAATTGGC TCCACAAGGA GGCTCACCAG CTCTTCTTGG 4600
  P  V  P   E  N  W   L  H  K  E   A  H  Q   L  F  L   284
AACCTGAGGT GCTGGACCCA GAGTCTGTGG AGCTGAAGTG GAGCGAGCCA 4650
E  P  E  V   L  D  P   E  S  V   E  L  K  W   S  E  P  301
AATGAAGAAG AGCTGATCAA GTTCATGTGT GGTGAAAAGC AGTTCTCTGA 4700
 N  E  E   E  L  I  K   F  M  C   G  E  K   Q  F  S  E 318
GGAGCGAATC CGCAGTGGGG TCAAGAGGCT GAGTAAGAGC CGCCAAGGCA 4750
  E  R  I   R  S  G   V  K  R  L   S  K  S   R  Q  G   334
GCACCCAGGG CCGCCTGGAT GATTTCTTCA AGGTGACCGG CTCACTCTCT 4800
S  T  Q  G   R  L  D   D  F  F   K  V  T  G   S  L  S  351
TCAGCTAAGC GCAAGGAGCC AGAACCCAAG GGATCCACTA AGAAGAAGGC 4850
 S  A  K   R  K  E  P   E  P  K   G  S  T   K  K  K  A 368
AAAGACTGGG GCAGCAGGGA AGTTTAAAAG GGGAAAATAA ATGTGTTTCC 4900 | UTR
  K  T  G   A  A  G   K  F  K  R   G  K                380
CCATTATACC TCCTTCACCC CAGAATATTT GCCGTCTTGT ACCCTTAAGA 4950 | var(4920):[G:0.01]
GCTACAGCTA GAGAAACCTT CACGGGGTGG AGAGAGGATT CTAAGGCTTT 5000 | var(4973):[T:0.01]
TCTAGCGTGA CCCTTTTCAG TAGTGCTAGT CCCTTTTTTA CTTGATCTTA 5050
ATGGCAAGAA GGCCACAGAG GTACTTTTCC TTTTTTAGCT CAGGAAAATA 5100
TGTCAGGCTC AAACCACTTC TCAGGCAGTT TAATGGACAC TAAGTCCATT 5150
GTTACATGAA AGTGATAGAT AGCAACAAGT TTTGGAGAAG AGAGAGGGAG 5200
ATAAAAGGGG GAGACAAAAG ATGTACAGAA ATGATTTCCT GGCTGGCCAA 5250 | var(5213):[T:0.41]
CTGGTGGCCA GTGGGAGGTG ATGGTGGACC TAGACTGTGC TTTTCTGTCT 5300
TGTTCAGCCT TGACCCACCT TGAGAGAGAG CCACCAGGAA GGCGCATCTT 5350
AGCAGATGGG AGGAACTGCT GAGAGAAGAT GGGCAGAAAG CTGGAGCCCC 5400
TGGAGTTGGC TGTGTCTGTG TTTGTGACTG ATTACTGGCT GTGTCTTGGG 5450
TGGGCAGAAA CTCGAACTTG CTATGTAATT TGTGTCTAGT TATTCAGAGG 5500
AGTAAGATGG TGATGTTCAC CTGGCAATCA GCTGAGTTGA GACTTTGGAA 5550
TAAGACACTG GTTTTCATGC GCTGTTTTTG TTTTAAAGTT ATGAAGAAAA 5600
AAGTCAATAA AATTCTAAAA GTAA
CCAAAA TGTCATGTTC TTTGAGAACA 5650
TTTGAAAATA TCCCAAGTGA CCATGGCTCC AAATAGCTTT CCTTTTCACT 5700
CTTAACATGC TGTAATTGCA CTTGATTAAC AATGGGTGGT TTGAGAGTGG 5750
CCACAAGATG GCACCATGCT CCATAAAATG GCCATAGCAG CTAGATGGAA 5800
CTTCAGCCAT TAGGAGGAGG ATGTTTTGTT TATTTTATTT TGCTGGGAGA 5850
GGAGTTTTAA TACGTTGAAT AGATTTCTAG TCTCTCACTC CATGAGATCA 5900
AAGGAGTGCC TTTAAGAAAG CCTCACAATT TAGATCAACT ACCTCATAAC 5950
ATCCAAGCAT TTACTTTGCC ACTACTTGTA AACTGAAAGC TGCCATTCAG 6000
AAACCATTTT CTTGTTCCTT TTGTAACATC AAATCCAAGA TACTGTTTCC 6050
CATAGAGATG GCATGTTTTT GAGCTTTGAA AGTTTTATAA TCCTGATAAA 6100
GCTTGGCCCA TTTGAATGTC TGACGTTTTA GCATTCCTGT CAGGGCCATT 6150 | var(6108):[T:0.03]
TGAAGTTAAC AGGGACACTT ATGTAACTGT CCGAAATTTA AGCTGGCAAT 6200
GTCTTGACAG ATTAAACAGG TAGGGAGCCT GAAGACCAGT AGTTTTCAAG 6250
TCTTTTAATG GAGAAACCTA TTCTTCAAGT GTAATCTTAT GTGAAACTTT 6300
AGGATGTACA GGTTCCTCTG GTTGAAGCTG GAATGGGATA AAGTTTACCC 6350 | var(6346):[C:0.01]
AGCAACGGCC TCATAACTAG GGTACTTTTT GAAAACTGGT GTTGACAAAA 6400
AGTTCTATCC CAAGGGCAGG TAACTTTTGA AACTGATTTT CCCAGATTAT 6450
ACCAAGCCAC ACAACTTATT TGAGCTCTAT TTTCTGATTC AGGTAGATTG 6500
CTTCTAAATC TGCAGTAATG GTGATAGGAA CTAAAG