Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop hz 000263 G 0.05 A 0.95 0.10 000361 C 0.31 T 0.69 0.43 000495 G 0.01 C 0.99 0.01 001079 C 0.01 G 0.99 0.01 001204 A 0.06 T 0.94 0.11 001390 T 0.01 C 0.99 0.01 001436 T 0.06 G 0.94 0.11 001454 C 0.20 T 0.80 0.32 001749 A 0.02 C 0.98 0.05 001906 C 0.01 T 0.99 0.02 001928 T 0.01 C 0.99 0.02 002137 T 0.01 G 0.99 0.01 002148 T 0.20 G 0.80 0.32 002289 G 0.03 A 0.97 0.06 002354 + 0.04 - 0.96 0.07 002646 A 0.01 G 0.99 0.01 002698 G 0.01 C 0.99 0.01 002794 T 0.02 C 0.98 0.04 002942 A 0.01 G 0.99 0.03 003157 A 0.01 C 0.99 0.01 003243 T 0.01 C 0.99 0.02 003923 - 0.01 + 0.99 0.01 004016 T 0.01 C 0.99 0.01 004020 A 0.01 G 0.99 0.01 004028 T 0.01 C 0.99 0.01 004533 A 0.03 G 0.97 0.05 004703 C 0.38 G 0.62 0.47 004743 - 0.03 + 0.97 0.06 004979 G 0.35 C 0.65 0.46 005027 T 0.06 C 0.94 0.11 005051 T 0.01 C 0.99 0.01 005106 T 0.04 G 0.96 0.07 005412 T 0.36 C 0.64 0.46 005518 C 0.01 G 0.99 0.02 005569 G 0.29 A 0.71 0.41 005728 T 0.01 C 0.99 0.01 006201 G 0.01 A 0.99 0.01 006227 T 0.03 C 0.97 0.06 006288 - 0.01 + 0.99 0.02 006293 A 0.01 G 0.99 0.01 006742 A 0.26 C 0.74 0.38 007262 A 0.02 G 0.98 0.04 007268 C 0.03 A 0.97 0.06 008269 A 0.26 G 0.74 0.38 008485 T 0.13 C 0.87 0.23 008672 C 0.01 T 0.99 0.01 008801 T 0.33 C 0.67 0.44 009262 G 0.01 C 0.99 0.01 009775 T 0.31 C 0.69 0.43 009863 T 0.01 C 0.99 0.01 010304 T 0.27 C 0.73 0.40 010310 T 0.01 C 0.99 0.01 010405 A 0.38 G 0.62 0.47 011476 T 0.01 C 0.99 0.01 011939 A 0.01 C 0.99 0.02 012079 T 0.01 C 0.99 0.01 012083 A 0.01 G 0.99 0.01 012478 G 0.28 A 0.72 0.41 012488 A 0.01 G 0.99 0.02 012624 C 0.29 A 0.71 0.41 014027 G 0.29 A 0.71 0.42 014340 + 0.38 - 0.62 0.47 015078 G 0.28 A 0.72 0.40 015133 - 0.15 + 0.85 0.26 015972 A 0.42 G 0.58 0.49 015979 C 0.15 G 0.85 0.25 016329 T 0.27 G 0.73 0.40 016556 - 0.12 + 0.88 0.21 016659 T 0.32 C 0.68 0.44 016722 C 0.33 T 0.67 0.44 016921 C 0.01 T 0.99 0.01 016995 C 0.02 T 0.98 0.04 017063 G 0.30 T 0.70 0.42 Note: pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002354: G 003923: G 004743: ATTC 006288: A 014340: acaggcaataacaaatggtgg 015133: a 016556: ttc