*************************************************************
****                                                     ****
****            Output from PHASE v2.0                   ****
****  Code by M Stephens, with contributions from N Li   ****
****                                                     ****
*************************************************************

BEGIN COMMAND_LINE 
/net/nickerson/lims/bin/phase/PHASE2 -d1 ephx2.phase.inp ephx2.phase.out 
END COMMAND_LINE 

BEGIN OUTFILE_LIST
ephx2.phase.out_freqs : haplotype frequency estimates
ephx2.phase.out_pairs : most likely haplotype pairs for each individual
ephx2.phase.out_recom : estimates of recombination parameters
ephx2.phase.out_monitor : file for monitoring convergence
END OUTFILE_LIST

BEGIN INPUT_SUMMARY
Number of Individuals: 95
Number of Loci: 71
Positions of loci: 550 727 744 1551 1743 3144 3194 3470 6177 6246 11643 11861 12851 14321 14667 15119 15499 16045 16493 17799 18144 18314 18321 22125 22691 23678 24903 24934 24965 24969 25546 26837 27222 27280 27793 31990 32274 33017 37262 47727 47748 47900 48085 48318 48610 49472 49569 49884 49908 50448 50518 50730 51793 51981 52879 53065 53405 54503 55325 55435 55493 55855 55892 56025 56138 56591 57091 57138 57486 57498 57715 
END INPUT_SUMMARY

List of haplotypes found in best reconstruction, with counts.
(See file ephx2.phase.out_freqs for haplotype population frequency estimates)

BEGIN LIST_SUMMARY
         1 TCCGGATGAACAAACDTGGACAAGGCCAAGACGCTCGITCTGCACTACTCCGCCGG 3 GCGCTGAGCGAAAT    1.000000
         2 TCCGGATGAACAAACDTGAACAAGGCCAAGACGCTCGITCTGCACTACTCCCCTGG 3 GCGCTGAGCGAAAT    1.000000
         3 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGGCTGGAGCGTACGIGCTGCACTGCTCCCCCGG 3 GCGCTGAGCGGGAC    4.000000
         4 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGGCTGGAGCGTACGIGCTGCACTGCTCCCCCGG 3 ACGCCGGACGAGGC    1.000000
         5 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGGCTGGAGCGTACGIGTTACCCGGCTCCCCCGG 3 GCGCTGAGCGGGAC    1.000000
         6 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGGCTGGAGCGTATGIGCTGGCTGGTTCTCTCGA 2 GAATCGGGCGAGGC    3.000000
         7 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGGCTGGAGCGTATGIGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC   30.000000
         8 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGGCTGGAGCGTATGIGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCAAGGC    5.000000
         9 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGGCTGGAGCATACGITCTGCACTACTCCCCCGG 3 GCGCTGAGCGAAAT    2.000000
        10 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGGCTGGAGCATATGIGCTGGCTGGTTCTCTCGG 3 GCGCCGGACGAGGC    1.000000
        11 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGGCTGGAGCATATGIGCTGGCTGGTTTTCCTCG 1 ACGCCGGGCGAGGT    2.000000
        12 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGGCTGGAGCATATGIGCTGGCTGGTTTTCCTCG 1 ACGCCGGACGAGGC   20.000000
        13 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGGCCAAGACGCACGIGCCGCCTGGCCCCCCCGG 3 GCGCTAGGCGAGAC    3.000000
        14 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGGCCAAGACGCACGIGCCGCCTGGCCCCCCCGG 3 GCATCGGGCAAGGC    1.000000
        15 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGGCCAAGACGCACGIGCCGCCTGGCCCCCCCGG 3 GAATCGGGCAAGGC    1.000000
        16 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGACTGGAACGTATGDGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    1.000000
        17 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGACTGGAGCGTATGIGCTGGCTGGTTCTCCCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    2.000000
        18 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGACTGGAGCGTATGIGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    2.000000
        19 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGACTGGAGCGTATGDGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GCGCTGAGCGAAAT    1.000000
        20 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGACTGGAGCGTATGDGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC   24.000000
        21 TCCGGATGAACAAACDTGAACGAGACTGGAGTGTATGDGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    3.000000
        22 TCCGGATGAACAAACDTGAATGAGACTGGAGCGTATGIGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    1.000000
        23 TCCGGATGAACAAACDTGAATGAGACTGGAGCGTATGDGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    2.000000
        24 TCCGGATGAACAAACDTGAATGAGACTGGAGCGTATGDGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGT    9.000000
        25 TCCGGATGAACAAACDTGAATGAGACTGGAGCGTATGDGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCAAGGC    1.000000
        26 TCCGGATGAACAAACDTGAATGAGACTGGAGTGTATGIGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    3.000000
        27 TCCGGATGAACGCATICGAACGAGACTGGAGCGTATGDGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    1.000000
        28 TCCGGATGAATAAACDTGAACGAGACTGGAGCGTATGDGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    9.000000
        29 TCCGGGCGAACGAACICGGACGGAGCCGGAACGCTCGIGCCGCCTGGCCCCCCCGG 3 GCGCCGGATGAGAC    1.000000
        30 TCCAGATGAACAAACDTGAACGAGGCTGGAGCGTATGIGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    2.000000
        31 TCCAGATGAACAAACDTGAACGAGACTGGAGCGTATGIGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    2.000000
        32 TCCAGATGAACAAACDTGAATGAGACTGGAGCGTATGIGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    1.000000
        33 TCCAGATGAATAAACDTGAACGAGACTGGAGCGTATGDGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    1.000000
        34 TCCAAGCATGCGAACICGGACGGAGCCGGAACGCACGIGCCGCCTGGCCCCGCCGG 3 GCGCTAGGCGAAAC    1.000000
        35 TCGGGATGAACAAACDTGGACAAGGCCAAGACGCACGITCTGCACTACTCCGCCGG 3 GCGCTGAGCGAAAT    1.000000
        36 TCGGGATGAACAAACDTGGACAAGGCCAAGACGCACGITCTGGACTACTCTGCCGG 3 GCGCTGAGCGAAAT    1.000000
        37 TCGGGATGAACAAACDTGGACAAGGCCAAGACGCACGITCTGGACTACTCTGCCGG 3 GCGCTGAACGAAAT    1.000000
        38 TCGGGATGAACAAACDTGGACAAGGCCAAGACGCTCGITCTGCACTACTCCCCCGG 3 GCGCTGAGCGAAAT   11.000000
        39 TCGGGATGAACAAACDTGGACAAGGCCAAGACGCTCGITCTGCACTACTCCGCCGG 3 GCGCTGAGCGAAAT    4.000000
        40 TCGGGATGAACAAACDTGGACAAGGCCAAGATGCTCGITCTGCACTACTCCCCCGG 3 GCGCTGAGCGAAAT    1.000000
        41 TTCGGATGAACAACCDTCGCCGAGGCCGGAACGCTCAIGCCGCCTGGCCCCCCCGG 3 GCGCTAGGCGAGAC    2.000000
        42 TTCGGATGAACAACCDTCGCCGAGGCCGGAACGCTCAIGCTGCACTGCTCCCCTGG 1 ACGCCGGATGAGGC    1.000000
        43 TTCGGATGAACAACCDTCGCCGAGGCCGGAACGCTCAIGCTGCACTGCTCCCCTGG 1 ACGCCGGATAAGGC    6.000000
        44 TTCGGATGAACAACCDTCGCCGAGGCCGGAACGCTCAIGCTGCACTGCTCCCCTGG 3 GCGCTAGGCGAGAC    1.000000
        45 TTCGGATGAACAACCDTCGCCGAGGCCGGAATGCACGIGCCGCCTGGCCCCCCCGG 3 GCGCCGGATGAGAC    1.000000
        46 TTCGGATGAACAACCDTCGCCGAGGCCGGAATGCACGIGCCGCCTGGCCCCGCCGG 3 GCGCCGGATGAGAC    1.000000
        47 CCCAAGCATGCGCACDTGAACGAGGCTGGAGCGTACGIGCTGGACTGCTCCGCCGG 1 GAATCGGGCGAGGC    1.000000
        48 CCCAAGCATGCGCATICGGACGGAGCCGGAACGCACGIGCTGCACTGCTCCCCCGG 3 GCGCTAGGCGAGAC    3.000000
        49 CCCAAGCATGCGCATICGGACGGAGCCGGAACGCACGIGCTGCACTGCTCCCCTGG 1 ACGTCGGATGAGGC    1.000000
        50 CCCAAGCATGCGCATICGGACGGAGCCGGAGTGCACGIGCCGCCTGGCCCCCCCGG 3 GAATCGGGCAAGGC    1.000000
        51 CCCAAGCATGCGCATICGGACGGAGTCGGAACGCTCAIGTTACACTGCTCCCCCGG 3 GCGCTGAGCGGGAC    1.000000
        52 CCCAAGCATGCGCATICGGACGGAGTCGGAACGCTCGIGTTACACTGCTCCCCCGG 3 GCGCTGAGCGGGAC    7.000000
        53 CCCAAGCATGCGCATICGGACGGAGTCGGAACGCTCGIGTTAGACTGCTCCCCCGG 3 GCGCTAGGCGAGAC    1.000000
        54 CCCAAGCATGCGCATICGGACGGAGTCGGAACGTATGIGCTGGCTGGTTCTCTCGA 3 GAATCGGGCGAGGC    1.000000
END LIST_SUMMARY


Summary of best reconstruction
(numbers refer to the list of haplotypes given above)

BEGIN BESTPAIRS_SUMMARY
D001: (36,41)
D002: (3,13)
D003: (1,7)
D004: (34,49)
D005: (3,43)
D006: (20,43)
D007: (3,7)
D008: (47,48)
D009: (30,51)
D010: (48,54)
D011: (13,39)
D012: (39,39)
D013: (12,43)
D014: (14,20)
D015: (35,46)
DY01: (37,43)
DY02: (7,39)
DY03: (4,42)
DY04: (3,45)
DY05: (38,43)
DY06: (2,44)
DY07: (11,29)
DY08: (12,43)
DY09: (12,48)
DY10: (15,41)
DY11: (7,12)
DY12: (13,50)
E101: (7,20)
E102: (31,52)
E103: (7,17)
E104: (20,38)
E105: (7,12)
E106: (7,38)
E107: (7,7)
E108: (6,38)
E109: (7,52)
E110: (7,20)
E111: (7,12)
E112: (7,24)
E113: (52,53)
E114: (7,12)
E115: (18,38)
E116: (12,20)
E117: (31,52)
E118: (7,23)
E119: (7,7)
E120: (7,17)
E121: (16,52)
E122: (21,38)
H101: (8,24)
H102: (7,40)
H103: (32,52)
H104: (30,52)
H105: (7,20)
H106: (28,28)
H107: (12,12)
H108: (10,20)
H109: (20,26)
H110: (20,38)
H111: (20,21)
H112: (8,21)
H113: (20,26)
H114: (12,24)
H115: (5,27)
H116: (20,26)
H117: (12,20)
H118: (7,24)
H119: (20,24)
H120: (20,22)
H121: (12,18)
H122: (7,20)
X101: (12,19)
X102: (24,25)
X103: (7,28)
X104: (12,24)
X105: (7,8)
X106: (7,9)
X107: (12,28)
X108: (6,7)
X109: (7,28)
X110: (20,20)
X111: (6,12)
X112: (24,28)
X113: (8,9)
X114: (8,12)
X115: (23,38)
X116: (7,12)
X117: (20,24)
X118: (20,38)
X119: (12,28)
X120: (20,38)
X121: (20,20)
X122: (33,38)
X123: (28,28)
X124: (7,11)
END BESTPAIRS_SUMMARY


Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in ()
and uncertain genotypes enclosed in []:

BEGIN BESTPAIRS1
0 D001
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A [C] G C A C G I T C T G G A C T A C T C T G C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
T T C G G A T G A A C A A C C D T C G C C G A G G C C G G A A  C  G C T C A I G C C G C C T G G C C C C C C C G G 3 G C G C T A G G C G A G A C 
0 D002
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A C G I G C T G C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G G G A C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C C A A G A C G C A C G I G C C G C C T G G C C C C C C C G G 3 G C G C T A G G C G A G A C 
0 D003
T C C G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C G C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 D004
(T) C C A A G C A T G C G A A C I C G G A C G G A G C C [G] [G] [A] A C G C A C G I G C C G C C T G G C C C C G C  C  G G 3 G C G C T A [G] G C G A A A C 
(C) C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G C C  G   G   A  A C G C A C G I G C T G C A C T G C T C C C C [T] G G 1 A C G T C G  G  A T G A G G C 
0 D005
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A C G I G C T G C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G G G A C 
T T C G G A T G A A C A A C C D T C G C C G A G G C C G G A A C G C T C A I G C T G C A C T G C T C C C C T G G 1 A C G C C G G A T A A G G C 
0 D006
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T T C G G A T G A A C A A C C D T C G C C G A G G C C G G A A C G C T C A I G C T G C A C T G C T C C C C T G G 1 A C G C C G G A T A A G G C 
0 D007
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A C G I G C T G C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G G G A C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 D008
C C C A A G C A T G C G C A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A C G I G C T G G A C T G C T C C (G) C C G G (1) G (A) (A) (T) (C) (G) G G C G A G (G) C 
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G C C G G A A C G C A C G I G C T G C A C T G C T C C (C) C C G G (3) G (C) (G) (C) (T) (A) G G C G A G (A) C 
0 D009
T C C A G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G T C G G A A C G C T C A I G T T A C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G G G A C 
0 D010
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G C C G G A A C G C A C G I G C T G C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T A G G C G A G A C 
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G T C G G A A C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 D011
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C C A A G A C G C A C G I G C C G C C T G G C C C C C C C G G 3 G C G C T A G G C G A G A C 
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C G C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 D012
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C G C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C G C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 D013
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
T T C G G A T G A A C A A C C D T C G C C G A G G C C G G A A C G C T C A I G C T G C A C T G C T C C C C T G G 1 A C G C C G G A T A A G G C 
0 D014
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C C A A G A C G C A C G I G C C G C C T G G C C C C C C C G G 3 G C A T C G G G C A A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 D015
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C A C G I T C T G C A C T A C T C C G C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
T T C G G A T G A A C A A C C D T C G C C G A G G C C G G A A T G C A C G I G C C G C C T G G C C C C G C C G G 3 G C G C C G G A T G A G A C 
0 DY01
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A [C] G C A C G I T C T G G A C T A C T C T G C C G G 3 G C G C T G A A C G A A A T 
T T C G G A T G A A C A A C C D T C G C C G A G G C C G G A A  C  G C T C A I G C T G C A C T G C T C C C C T G G 1 A C G C C G G A T A A G G C 
0 DY02
T C  C  G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C [G] G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C G C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 DY03
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A C G I G C T G C A C T G C T C C C C C G G 3 A C G C C G G A C G A G G C 
T T C G G A T G A A C A A C C D T C G C C G A G G C C G G A A C G C T C A I G C T G C A C T G C T C C C C T G G 1 A C G C C G G A T G A G G C 
0 DY04
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A C G I G C T G C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G G G A C 
T T C G G A T G A A C A A C C D T C G C C G A G G C C G G A A T G C A C G I G C C G C C T G G C C C C C C C G G 3 G C G C C G G A T G A G A C 
0 DY05
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
T T C G G A T G A A C A A C C D T C G C C G A G G C C G G A A C G C T C A I G C T G C A C T G C T C C C C T G G 1 A C G C C G G A T A A G G C 
0 DY06
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C C C T G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
T T C G G A T G A A C A A C C D T C G C C G A G G C C G G A A C G C T C A I G C T G C A C T G C T C C C C T G G 3 G C G C T A G G C G A G A C 
0 DY07
T C C G G (A) (T) G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G G C G A G G T 
T C C G G (G) (C) G A A C G A A C I C G G A C G G A G C C G G A A C G C T C G I G C C G C C T G G C C C C C C C G G 3 G C G C C G G A T G A G A C 
0 DY08
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
T T C G G A T G A A C A A C C D T C G C C G A G G C C G G A A C G C T C A I G C T G C A C T G C T C C C C T G G 1 A C G C C G G A T A A G G C 
0 DY09
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G C C G G A A C G C A C G I G C T G C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T A G G C G A G A C 
0 DY10
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C C A A G A C G C A C G I G C C G C C T G G C C C C C C C G G 3 G (A) (A) (T) [C] (G) G G C (A) A G (G) C 
T T C G G A T G A A C A A C C D T C G C C G A G G C C G G A A C G C T C A I G C C G C C T G G C C C C C C C G G 3 G (C) (G) (C) [T] (A) G G C (G) A G (A) C 
0 DY11
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
0 DY12
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C C A A G A C G C A C G I G C C G C C T G G C C C C C C C G G 3 G C G C T A G G C G A G A C 
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G C C G G A G T G C A C G I G C C G C C T G G C C C C C C C G G 3 G A A T C G G G C A A G G C 
0 E101
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 E102
T C C A G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G T C G G A A C G C T C G I G T T A C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G G G A C 
0 E103
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G (G) C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G (A) C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C C C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 E104
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 E105
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
0 E106
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 E107
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 E108
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 2 G A A T C G G G C G A G G C 
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 E109
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G T C G G A A C G C T C G I G T T A C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G G G A C 
0 E110
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 E111
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
0 E112
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G T 
0 E113
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G T C G G A A C G C T C G I G T T A C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G G G A C 
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G T C G G A A C G C T C G I G T T A G A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T A G G C G A G A C 
0 E114
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
0 E115
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 E116
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 E117
T C C A G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G T C G G A A C G C T C G I G T T A C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G G G A C 
0 E118
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 E119
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 E120
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G (G) C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G (A) C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C C C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 E121
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G [A] C T G G A A C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A  G  T C G G A A C G C T C G I G T T A C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G G G A C 
0 E122
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G (T) G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A (C) G C T C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 H101
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C A A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G T 
0 H102
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G (C) G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A (T) G C T C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 H103
T C C A G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G T C G G A A C G C T C G I G T T A C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G G G A C 
0 H104
T C C A G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
C C C A A G C A T G C G C A T I C G G A C G G A G T C G G A A C G C T C G I G T T A C A C T G C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G G G A C 
0 H105
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 H106
T C C G G A T G A A T A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A T A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 H107
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
0 H108
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G (G) C T G G A G C (A) T A T G (I) G C T G G C T G G T T C T C T C G (G) 3 G C G C C G G A C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G (A) C T G G A G C (G) T A T G (D) G C T G G C T G G T T C T C T C G (A) 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 H109
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G (C) G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G (T) G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 H110
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 H111
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G T G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 H112
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C A A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G T G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 H113
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G (C) G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G (T) G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 H114
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G T 
0 H115
T C C G G A T G A A C (A) (A) A (C) (D) (T) G A A C G A G G C T G G A G C G T A C G I G T T A C C C G G C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G G G A C 
T C C G G A T G A A C (G) (C) A (T) (I) (C) G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 H116
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G (C) G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G (T) G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 H117
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 H118
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G T 
0 H119
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G T 
0 H120
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A (C) G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A (T) G A G A C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 H121
T C C  G  G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
T C C [G] G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 H122
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 X101
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 X102
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C (G) A G G T 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C (A) A G G C 
0 X103
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A T A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 X104
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G T 
0 X105
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C A A G G C 
0 X106
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 X107
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
T C C G G A T G A A T A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 X108
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 2 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 X109
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A T A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 X110
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 X111
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 2 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
0 X112
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G T 
T C C G G A T G A A T A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 X113
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C A A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 X114
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C A A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
0 X115
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 X116
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
0 X117
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A T G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G T 
0 X118
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 X119
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G A C G A G G C 
T C C G G A T G A A T A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 X120
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C G G G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 X121
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 X122
T C C (A) G A T G A A T A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C G (G) G A T G A A C A A A C D T G G A C A A G G C C A A G A C G C T C G I T C T G C A C T A C T C C C C C G G 3 G C G C T G A G C G A A A T 
0 X123
T C C G G A T G A A T A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
T C C G G A T G A A T A A A C D T G A A C G A G A C T G G A G C G T A T G D G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G C 
0 X124
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C G T A T G I G C T G G C T G G T T C T C T C G A 3 G A A T C G G G C G A G G  C  
T C C G G A T G A A C A A A C D T G A A C G A G G C T G G A G C A T A T G I G C T G G C T G G T T T T C C T C G 1 A C G C C G G G C G A G G [T] 
END BESTPAIRS1


Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in ()
and uncertain genotypes enclosed in []
with phase known positions indicated by =

BEGIN BESTPAIRS2
0 D001
= C G = = = = = ? ? = = = ? = = = G = A = A = = = = ? ? ? ? = ? ? ? ? = G = T = T = G A C T A = T = T G ? ? = ? = = = = = = G A = = = = A = T 
= T C = = = = = ? ? = = = ? = = = C = C = G = = = = ? ? ? ? = ? ? ? ? = A = G = C = C C T G G = C = C C ? ? = ? = = = = = = A G = = = = G = C 
0 D002
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? G ? = T = = = = = = T = = A C T = = T = = = = = = = = = = = = = G A = = = G = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? A ? = C = = = = = = C = = C T G = = C = = = = = = = = = = = = = A G = = = A = = = 
0 D003
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = G = = A = = ? = ? ? ? ? A = = C T C = = T = = = C A C T A C = = C G C = = G = = C G C T = A = = = = A A T 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = A = = G = = ? = ? ? ? ? G = = T A T = = G = = = G C T G G T = = T C T = = A = = A A T C = G = = = = G G C 
0 D004
(T) = = = ? = = ? = = = = A = C = = = = = = = = = ? = ? ? ? ? = = = = = = = = = = C = = C T G = = C = = G = ? = = 3 G = = C ? ? ? G C = = A A = 
(C) = = = ? = = ? = = = = C = T = = = = = = = = = ? = ? ? ? ? = = = = = = = = = = T = = A C T = = T = = C = ? = = 1 A = = T ? ? ? A T = = G G = 
0 D005
= C = = = = = = ? = = = = A = = = G A A = = = = = = ? ? ? ? G = = T A = G = = = = = = = = = = = = = = = = C = = 3 G = = = T = A ? C G G = A = 
= T = = = = = = ? = = = = C = = = C G C = = = = = = ? ? ? ? A = = C T = A = = = = = = = = = = = = = = = = T = = 1 A = = = C = G ? T A A = G = 
0 D006
? C = ? = = = = ? = = = = A = = = G A A = = = = ? = ? ? ? ? G = = T A T G D = = = = G C T G = T = = T = T C = A 3 G A A T = = = ? C G = = = = 
? T = ? = = = = ? = = = = C = = = C G C = = = = ? = ? ? ? ? A = = C T C A I = = = = C A C T = C = = C = C T = G 1 A C G C = = = ? T A = = = = 
0 D007
? = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = C = = = ? ? = C A C T = C = = C = ? ? = G ? = C G C T = A = = = G = A = 
? = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = T = = = ? ? = G C T G = T = = T = ? ? = A ? = A A T C = G = = = A = G = 
0 D008
= = = = = = = = ? = = = = = C D T = A = = = A G = = T = = = G ? = T = = = = = = = = G = = = = = = = = (G) = = = = (1) = (A) (A) (T) (C) (G) = ? = = = = (G) = 
= = = = = = = = ? = = = = = T I C = G = = = G A = = C = = = A ? = C = = = = = = = = C = = = = = = = = (C) = = = = (3) = (C) (G) (C) (T) (A) = ? = = = = (A) = 
0 D009
T = = = G A T G ? A = A ? = C D T = A = = = A G = C T = = = G ? = T A T G = = C = G G C T G = T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = A = G = 
C = = = A G C A ? G = G ? = T I C = G = = = G A = T C = = = A ? = C T C A = = T = A C A C T = C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = G = A = 
0 D010
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = ? = C = C = = = = = = C A C T = C = = C = C ? = G = = C G C T A = = = = = = A = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = ? = T = T = = = = = = G C T G = T = = T = T ? = A = = A A T C G = = = = = = G = 
0 D011
= = C = = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = = = = = = = = ? = = A = = = G = C = = C T G G = C = = C = = = = = = = = = = A G = = = = G = C 
= = G = = = = = = = = = = = = = = = G = = A = = = = = = = = = ? = = T = = = T = T = = A C T A = T = = G = = = = = = = = = = G A = = = = A = T 
0 D012
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
0 D013
= C = = = = = = = = = = = A = = = G A A = = = = = = T = = = G = A T A T G = = = = = G C T G = T = T T = = = C = = = = = = = = = = C G = = = = 
= T = = = = = = = = = = = C = = = C G C = = = = = = C = = = A = G C T C A = = = = = C A C T = C = C C = = = G = = = = = = = = = = T A = = = = 
0 D014
= = = ? = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = G = C A A G A ? = C = C = I = = C = C = = = = C C = C = C = = G = = C = = = = = = = A = = = = 
= = = ? = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = A = T G G A G ? = T = T = D = = T = G = = = = T T = T = T = = A = = A = = = = = = = G = = = = 
0 D015
= C G = = = = = ? = = = = A = = ? G = A = A = = = = = A A G = ? = = = = = = T = T = = A C T A = T = = = = = = = = = = = = T = A G C = = A = T 
= T C = = = = = ? = = = = C = = ? C = C = G = = = = = G G A = ? = = = = = = G = C = = C T G G = C = = = = = = = = = = = = C = G A T = = G = C 
0 DY01
= C G = = = = = = = = ? = A = = = G = A = A = = = = = A A G = ? = = A = G = ? = = = ? = = = A = = = T G = C = = 3 G = = = ? ? A = C G = A A T 
= T C = = = = = = = = ? = C = = = C = C = G = = = = = G G A = ? = = T = A = ? = = = ? = = = G = = = C C = T = = 1 A = = = ? ? G = T A = G G C 
0 DY02
= ? ? = = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = = = T G G A G = = T A ? ? ? G = = = G C T G G T = = ? C T = = A = = A A T C = G = = = = G G C 
= ? ? = = = = = = = = = = = = = = = G = = A = = = = C A A G A = = C T ? ? ? T = = = C A C T A C = = ? G C = = G = = C G C T = A = = = = A A T 
0 DY03
= C = = = = = = = = = = = A = = = G A A = = = = = = T = = = G ? = T A = G = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = 3 = = = = = = = = C = = = = = 
= T = = = = = = = = = = = C = = = C G C = = = = = = C = = = A ? = C T = A = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = 1 = = = = = = = = T = = = = = 
0 DY04
= C = = = = = = ? = = = = A = = = G A A = = = = ? = T = = = G C = T = = = = = = T = = A C T = = T = = = = ? = = = = = = = T = A G C = G = = = 
= T = = = = = = ? = = = = C = = = C G C = = = = ? = C = = = A T = C = = = = = = C = = C T G = = C = = = = ? = = = = = = = C = G A T = A = = = 
0 DY05
= C G = = ? ? ? = = = = = A = = = G = A = A = = = = = A A G = = = = = = G = T = = = = = = = A = = = = = = C = = ? G = = = T = A G C G = A A T 
= T C = = ? ? ? = = = = = C = = = C = C = G = = = = = G G A = = = = = = A = G = = = = = = = G = = = = = = T = = ? A = = = C = G A T A = G G C 
0 DY06
= C = = = = = = = = = = = A = = = G A A = A = = = = = A A G = = = = = = G = T = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = G A = = = = A = T 
= T = = = = = = = = = = = C = = = C G C = G = = = = = G G A = = = = = = A = G = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = A G = = = = G = C 
0 DY07
= = = = = (A) (T) = = = = A = = = D T = A = = = A G = = T = = = G ? A T A T = ? = = T = G = = = = T T ? ? = = T C = 1 A = = = = = = G C = = = G T 
= = = = = (G) (C) = = = = G = = = I C = G = = = G A = = C = = = A ? G C T C = ? = = C = C = = = = C C ? ? = = C G = 3 G = = = = = = A T = = = A C 
0 DY08
? C = = = = = = ? = = = = A = = = G A A = = = = = = T = = = G = A T A T G = = = = = G C T G = T = T T = = = C = = = = = = = = = ? C G = = = = 
? T = = = = = = ? = = = = C = = = C G C = = = = = = C = = = A = G C T C A = = = = = C A C T = C = C C = = = G = = = = = = = = = ? T A = = = = 
0 DY09
? = = G G A T G A A = A A = C D T = A = = = A G = = ? ? ? ? G = A T = T = = = = = = G C T G = T = T T = = T C = 1 A = = = C G = A = = = = G = 
? = = A A G C A T G = G C = T I C = G = = = G A = = ? ? ? ? A = G C = C = = = = = = C A C T = C = C C = = C G = 3 G = = = T A = G = = = = A = 
0 DY10
= C = = = = = = = = = = = A = = = G A A = = = = = = = A A G = = = = A = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = (A) (A) (T) ? (G) = = = (A) = = (G) = 
= T = = = = = = = = = = = C = = = C G C = = = = = = = G G A = = = = T = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = (C) (G) (C) ? (A) = = = (G) = = (A) = 
0 DY11
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? G = = = = = = = = = = = = = = = = C = = T C G A 3 G A A T = = = G = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? A = = = = = = = = = = = = = = = = T = = C T C G 1 A C G C = = = A = = = = = = 
0 DY12
T = = G G A T G A A = A A = C D T = A = = = A ? ? = = A A G A C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C G C T A = = = G = = A = 
C = = A A G C A T G = G C = T I C = G = = = G ? ? = = G G A G T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A A T C G = = = A = = G = 
0 E101
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
0 E102
? = = = G A T G A A = ? ? = C D T = A = = = A G A C ? ? ? ? G ? = T A T = = = C = G G C T G = T = = T = ? ? = A = = A A T C = G = = = A ? ? ? 
? = = = A G C A T G = ? ? = T I C = G = = = G A G T ? ? ? ? A ? = C T C = = = T = A C A C T = C = = C = ? ? = G = = C G C T = A = = = G ? ? ? 
0 E103
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = (G) = = = = = = = = = ? = = = ? = = = ? ? = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = (A) = = = = = = = = = ? = = = ? = = = ? ? = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
0 E104
? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = A ? = G = = A = T G G A G = = T A T = D G = = = G C T G G T = ? ? = T = = A = = A A T C = G ? = = = G G C 
? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = G ? = A = = G = C A A G A = = C T C = I T = = = C A C T A C = ? ? = C = = G = = C G C T = A ? = = = A A T 
0 E105
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = G = = = = = = = = = ? ? = = = = = C = = T C G A 3 G A A T = = = ? = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = A = = = = = = = = = ? ? = = = = = T = = C T C G 1 A C G C = = = ? = = = = = = 
0 E106
= = C = = = = = ? = = = = = = = = = A = = G = = = = T G G A G = = T A T = = G = = = G C T G G T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = = G G C 
= = G = = = = = ? = = = = = = = = = G = = A = = = = C A A G A = = C T C = = T = = = C A C T A C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = = A A T 
0 E107
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
0 E108
= = C = = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = ? = T G G A G = = T A T = = G = = = G C T G G T = ? ? = T = = A 2 = A A T C = G = = = = G G C 
= = G = = = = = = = = = = = = = = = G = = A = = ? = C A A G A = = C T C = = T = = = C A C T A C = ? ? = C = = G 3 = C G C T = A = = = = A A T 
0 E109
? = = G G A T G A A = A A = C D T = A = = = A G = C ? ? ? ? G = = T A T = = ? C = G G C T G = T = = T = T ? = A = = A A T ? ? G = = = A = G = 
? = = A A G C A T G = G C = T I C = G = = = G A = T ? ? ? ? A = = C T C = = ? T = A C A C T = C = = C = C ? = G = = C G C ? ? A = = = G = A = 
0 E110
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
0 E111
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = ? ? = = = = = C = = T C G A 3 G A A T = = = ? = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = ? ? = = = = = T = = C T C G 1 A C G C = = = ? = = = = = = 
0 E112
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = C = = = G = = = = = = = = = = = = I ? = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = C 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = D ? = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = T 
0 E113
= = = = = ? ? ? = = = = ? = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = ? = = = = = = = ? ? A = = = G = = = 
= = = = = ? ? ? = = = = ? = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = ? = = = = = = = ? ? G = = = A = = = 
0 E114
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = ? ? = = = = = C = = T C G A 3 G A A T = = = G = ? ? = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = ? ? = = = = = T = = C T C G 1 A C G C = = = A = ? ? = = = 
0 E115
= = C = = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = A = T G G A G = = T A T = = G = = = G C T G G T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = = G G C 
= = G = = = = = = = = = = = = = = = G = = A = = G = C A A G A = = C T C = = T = = = C A C T A C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = = A A T 
0 E116
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = ? A = = = = I = = = = ? ? = = = = = T = = C T C G 1 A C G C = = = A = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = ? G = = = = D = = = = ? ? = = = = = C = = T C G A 3 G A A T = = = G = = = = = = 
0 E117
? = = = G A T G A A = A A = C D T = A = = = A G A C T = = = G = = T A T = = = C = G G C T G = T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = A = G = 
? = = = A G C A T G = G C = T I C = G = = = G A G T C = = = A = = C T C = = = T = A C A C T = C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = G = A = 
0 E118
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = C = = = G = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
0 E119
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
0 E120
= = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = (G) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = (A) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
0 E121
? = = G G A T G ? A = A A = C D T = A = = = A G ? C ? ? ? ? = = = T A T = D = C = G G C T G = T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = A = G = 
? = = A A G C A ? G = G C = T I C = G = = = G A ? T ? ? ? ? = = = C T C = I = T = A C A C T = C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = G = A = 
0 E122
= = C = = = = = ? = = = = = = = = = A = = G = = A = T G G A G (T) = T A T = D G = = = G C T G G T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = = G G C 
= = G = = = = = ? = = = = = = = = = G = = A = = G = C A A G A (C) = C T C = I T = = = C A C T A C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = = A A T 
0 H101
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = C = = = G = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = C 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = T 
0 H102
= = C = = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = = = T G G A G (C) = T A T = = G = = = G C T G G T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = = G G C 
= = G = = = = = = = = = = = = = = = G = = A = = = = C A A G A (T) = C T C = = T = = = C A C T A C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = = A A T 
0 H103
? = = = G A T G A A = A A = C D T = A = T = A G A C T = = = G = = T A T = = = C = G G C T G = T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = A = G = 
? = = = A G C A T G = G C = T I C = G = C = G A G T C = = = A = = C T C = = = T = A C A C T = C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = G = A = 
0 H104
? = = = G ? ? ? A A = A A = C D T = A = = = A G = C T = = = G = = T A T = = = C = G G C T G = T = = T = T = = A ? = A A T C = G ? ? ? ? = G = 
? = = = A ? ? ? T G = G C = T I C = G = = = G A = T C = = = A = = C T C = = = T = A C A C T = C = = C = C = = G ? = C G C T = A ? ? ? ? = A = 
0 H105
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
0 H106
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 
0 H107
= = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
= = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
0 H108
= = = ? = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = (G) = = = = = = = (A) = = = = (I) = = = = = = = = = = = = = = = = = (G) = = C G C = = = A = = = = = = 
= = = ? = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = (A) = = = = = = = (G) = = = = (D) = = = = = = = = = = = = = = = = = (A) = = A A T = = = G = = = = = = 
0 H109
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = (C) = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = (T) = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
0 H110
= = C = = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = A = T G G A G ? = T A T = D G = = = G C T G G T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = = G G C 
= = G = = = = = = = = = = = = = = = G = = A = = G = C A A G A ? = C T C = I T = = = C A C T A C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = = A A T 
0 H111
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = 
0 H112
= = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = C = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = 
= = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = T = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = 
0 H113
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = (C) = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = (T) = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
0 H114
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = C = = = G = = = = = = = A = = = = I = = = = = = = = = = = T = = C T C G 1 A C G C = = = A = = = = = C 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = T = = = A = = = = = = = G = = = = D = = = = = = = = = = = C = = T C G A 3 G A A T = = = G = = = = = T 
0 H115
= = = = = = = = = = = (A) (A) = (C) (D) (T) = = = = = = = G = = = = = = = = = = C = I = T = A C = C = = C = = C = C = = G = = ? G C T = A = = = G = A = 
= = = = = = = = = = = (G) (C) = (T) (I) (C) = = = = = = = A = = = = = = = = = = T = D = C = G G = T = = T = = T = T = = A = = ? A T C = G = = = A = G = 
0 H116
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = (C) = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = (T) = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
0 H117
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = A = = = = I = = = = = = = = = = = T = = C T C G 1 A C G C = = = A = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = G = = = = D = = = = = = = = = = = C = = T C G A 3 G A A T = = = G = = = = = = 
0 H118
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = G = = = = = = ? = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = A = = = = = = ? = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T 
0 H119
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T 
0 H120
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = (C) = = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = (T) = = = = = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = 
0 H121
= = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = T = = C T C G 1 A C ? ? = = = A = = = = = = 
= = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = C = = T C G A 3 G A ? ? = = = G = = = = = = 
0 H122
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
0 X101
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = G = ? ? ? ? = = A = = = = I = = = = = = = = = = = T = = C T C G 1 A = = = C = G A = = = G G C 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = A = ? ? ? ? = = G = = = = D = = = = = = = = = = = C = = T C G A 3 G = = = T = A G = = = A A T 
0 X102
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = (G) = = = T 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = (A) = = = C 
0 X103
= = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
0 X104
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = C = = = G = = = = = = ? A = = = = I = = = = = = = = = = = T = = C T C G 1 A C G C = = = A = = = = = C 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = T = = = A = = = = = = ? G = = = = D = = = = = = = = = = = C = = T C G A 3 G A A T = = = G = = = = = T 
0 X105
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = 
0 X106
= = = = = = = = = = = = = ? = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = G = = T = = G = = = G C T G G T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = = G G C 
= = = = = = = = = = = = = ? = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = A = = C = = T = = = C A C T A C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = = A A T 
0 X107
= = = ? = = = = ? = C = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = A = = = = I = = = = = = = = = = = T = = C T C G 1 A C G C = = = A = = = = = = 
= = = ? = = = = ? = T = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = G = = = = D = = = = = = = = = = = C = = T C G A 3 G A A T = = = G = = = = = = 
0 X108
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = 2 = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = 3 = = = = = = = = = = = = = = 
0 X109
= = = = = = = = ? = C = = = = = = = = = = = = = G = ? ? ? ? = = = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
= = = = = = = = ? = T = = = = = = = = = = = = = A = ? ? ? ? = = = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
0 X110
= = = = = = = = ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
0 X111
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = ? = = ? = = = = = = = C = = T C G A 2 G A A T = = = G = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = ? = = ? = = = = = = = T = = C T C G 1 A C G C = = = A = = = = = = 
0 X112
= = = = = = = = = = C = = = = = ? = = = T = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T 
= = = = = = = = = = T = = = = = ? = = = C = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C 
0 X113
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = T = = G = = = G C T G G T = = T = T = = A = = A A T C = G ? = A = G G C 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = C = = T = = = C A C T A C = = C = C = = G = = C G C T = A ? = G = A A T 
0 X114
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = C = = T C G A 3 G A A T = = = G = A = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = T = = C T C G 1 A C G C = = = A = G = = = = 
0 X115
? = C = = = = = ? = = = = = = = = = A = T G = = A = T G G A G = = T A T = D G = = = G C T G G T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = = G G C 
? = G = = = = = ? = = = = = = = = = G = C A = = G = C A A G A = = C T C = I T = = = C A C T A C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = = A A T 
0 X116
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = C = = T C G A 3 G A A T = = = G = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = T = = C T C G 1 A C G C = = = A = = = = = = 
0 X117
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T 
0 X118
= = C ? = ? ? ? ? = = = = = = = = = A = = G = = A = T G G A G = = T ? T = D G = = = G C T G G T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = = G G C 
= = G ? = ? ? ? ? = = = = = = = = = G = = A = = G = C A A G A = = C ? C = I T = = = C A C T A C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = = A A T 
0 X119
= = = = = = = = ? = C = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = A = = = = I = = = = ? ? = = = = = T = = C T C G 1 A C G C = = = A = = = = = = 
= = = = = = = = ? = T = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = G = = = = D = = = = ? ? = = = = = C = = T C G A 3 G A A T = = = G = = = = = = 
0 X120
? = C = = ? ? ? ? = = = = = = = = = A = = G = = A = T G G A G ? = T A T = D G = = = G C T G G T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = = G G C 
? = G = = ? ? ? ? = = = = = = = = = G = = A = = G = C A A G A ? = C T C = I T = = = C A C T A C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = = A A T 
0 X121
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
0 X122
? = C (A) = ? ? ? ? = T = = = = = = = A = = G = = A = ? ? ? A G = = T A T = D G = = = G C T G G T = = T = T = = A = = A A T C = G = = = = G G C 
? = G (G) = ? ? ? ? = C = = = = = = = G = = A = = G = ? ? ? G A = = C T C = I T = = = C A C T A C = = C = C = = G = = C G C T = A = = = = A A T 
0 X123
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = ? = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = ? = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = 
0 X124
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = G = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = ? ? = T C G A ? G A A T = = = = = = = ? ? ? 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = A = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = ? ? = C T C G ? A C G C = = = = = = = ? ? ? 
END BESTPAIRS2


Phase probabilities at each site
with phase known positions indicated by =
and missing data positions indicated by ?

BEGIN PHASEPROBS
= 1.00 1.00 = = = = = ? ? = = = ? = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = ? ? ? ? = ? ? ? ? = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 ? ? = ? = = = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? 1.00 ? = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = ? = ? ? ? ? 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 
0.52 = = = ? = = ? = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = ? = ? ? ? ? = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = ? = = 1.00 1.00 = = 1.00 ? ? ? 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 
= 1.00 = = = = = = ? = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = ? ? ? ? 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 
? 1.00 = ? = = = = ? = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = ? = ? ? ? ? 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = ? 1.00 1.00 = = = = 
? = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = 1.00 = = = ? ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = ? ? = 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 
= = = = = = = = ? = = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 ? = 1.00 = = = = = = = = 0.94 = = = = = = = = 0.89 = = = = 0.82 = 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 = ? = = = = 0.82 = 
1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 = 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = ? = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 ? = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = 
= = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = ? = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = 
= = = ? = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = 
= 1.00 1.00 = = = = = ? = = = = 1.00 = = ? 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = ? = = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 
= 1.00 1.00 = = = = = = = = ? = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = ? = = 1.00 = 1.00 = ? = = = ? = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = ? ? 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 
= ? ? = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 ? ? ? 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = ? 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 
= 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 ? = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = 
= 1.00 = = = = = = ? = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = ? = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = ? = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 
= 1.00 1.00 = = ? ? ? = = = = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = ? 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 
= 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 0.99 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 
= = = = = 0.60 0.55 = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 ? ? = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 
? 1.00 = = = = = = ? = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = ? 1.00 1.00 = = = = 
? = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = ? ? ? ? 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = 
= 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.53 0.53 0.53 ? 0.53 = = = 0.53 = = 0.53 = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 
1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 ? ? = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
? = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? ? = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? ? ? 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = ? ? = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 ? ? ? 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = 0.85 = = = = = = = = = ? = = = ? = = = ? ? = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = 1.00 ? = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? ? = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? = = = 1.00 1.00 1.00 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = 1.00 = = = = = = = = = ? ? = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = ? = = = = = = 
= = 1.00 = = = = = ? = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? ? = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 
? = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 ? ? ? ? 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = ? 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 ? = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 ? ? 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = ? ? = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = ? = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 ? = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 
= = = = = ? ? ? = = = = ? = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = ? = = = = = = = ? ? 1.00 = = = 1.00 = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = ? ? = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = ? ? = = = 
= = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 0.98 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = ? 1.00 = = = = 1.00 = = = = ? ? = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 
? = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = 0.98 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 0.99 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = 0.87 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
? = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 ? 1.00 ? ? ? ? = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 
= = 1.00 = = = = = ? = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 0.73 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.92 = = = 1.00 
= = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 0.59 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 
? = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 
? = = = 1.00 ? ? ? 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? ? ? ? = 1.00 = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
= = = ? = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = 0.53 = = = = = = = 0.54 = = = = 0.51 = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.76 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.96 = = = = = = = = = = 0.70 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
= = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = 
= = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.98 = = = = 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = 0.96 = = = = = = = = = = 0.70 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = 1.00 
= = = = = = = = = = = 0.57 0.57 = 0.57 0.57 0.57 = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = 0.96 = = = = = = = = = = 0.70 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = ? = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.55 = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = 
= = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.97 = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? ? = = = 1.00 = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = ? ? ? ? = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = 0.86 = = = 1.00 
= = = = = = = = = = 0.99 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = ? 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = 1.00 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 
= = = = = = = = = = = = = ? = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 
= = = ? = = = = ? = 0.99 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = ? = 0.99 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = ? ? ? ? = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = ? = = ? = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 
= = = = = = = = = = 0.99 = = = = = ? = = = 1.00 = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = = = 
? = 1.00 = = = = = ? = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 
= = 1.00 ? = ? ? ? ? = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 ? 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 
= = = = = = = = ? = 0.99 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = ? ? = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 
? = 1.00 = = ? ? ? ? = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 
= = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = 
? = 1.00 0.56 = ? ? ? ? = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = ? ? ? 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = ? = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = 
= = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = ? ? = 1.00 1.00 1.00 1.00 ? 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = ? ? ? 
END PHASEPROBS