Site Genotype1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 HD-chi2 XD-chi2 Total-chi2 000133 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 1 0 1 TT 24 21 20 24 89 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 000550 CC 2 1 0 0 3 CT 3 0 0 0 3 TT 18 16 20 21 75 5.624 17.000 0.000 0.000 33.913 000574 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 22 16 19 20 77 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 000592 AA 25 21 22 24 92 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 000727 CC 14 21 22 24 81 CT 12 0 0 0 12 TT 0 0 0 0 0 2.340 0.000 0.000 0.000 0.442 000744 CC 20 17 20 20 77 CG 5 4 2 4 15 GG 1 0 0 0 1 0.793 0.233 0.050 0.198 0.078 000917 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 000968 CC 27 22 22 22 93 CG 0 0 0 2 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.045 0.011 000979 GG 26 21 22 24 93 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001090 AA 0 0 0 0 0 AC 0 1 0 0 1 CC 27 20 22 24 93 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 001113 AA 26 21 22 24 93 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001199 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 21 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001234 AA 25 21 22 24 92 AC 2 0 0 0 2 CC 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 001551 AA 4 3 2 0 9 AG 2 2 0 1 5 GG 19 16 17 21 73 14.062 10.032 19.000 0.012 48.872 001570 CC 22 20 18 22 82 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.102 0.000 0.000 0.000 0.027 001703 CC 25 22 22 24 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001743 AA 2 1 0 0 3 AG 3 4 2 0 9 GG 21 17 20 24 82 6.624 1.144 0.050 0.000 11.382 001763 AA 25 22 22 24 93 AT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001923 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 25 22 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001971 AA 25 22 22 24 93 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 001982 GG 21 22 22 24 89 GT 5 0 0 0 5 TT 0 0 0 0 0 0.294 0.000 0.000 0.000 0.070 002143 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 1 0 1 GG 26 22 21 24 93 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 002250 AA 25 22 22 24 93 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 002320 CC 25 17 20 24 86 CG 2 3 2 0 7 GG 0 1 0 0 1 0.040 2.136 0.050 0.000 3.152 003144 AA 19 14 14 20 67 AG 4 4 1 0 9 GG 3 0 0 0 3 6.624 0.281 0.018 0.000 8.975 003194 CC 3 0 0 0 3 CT 4 4 1 0 9 TT 19 14 14 20 67 6.624 0.281 0.018 0.000 8.975 003460 CC 23 18 15 20 76 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 003470 AA 2 0 0 0 2 AG 3 4 1 0 8 GG 19 14 14 20 67 5.958 0.281 0.018 0.000 5.908 006177 AA 10 10 20 9 49 AT 2 3 2 0 7 TT 2 1 0 0 3 4.641 1.017 0.050 0.000 9.200 006199 AA 20 22 22 24 88 AT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 006246 AA 19 17 20 24 80 AG 3 4 2 0 9 GG 3 1 0 0 4 8.806 1.144 0.050 0.000 16.198 006248 AA 25 22 22 24 93 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 006429 GG 25 22 22 23 92 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 006583 AA 22 22 22 24 90 AG 4 0 0 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.181 0.000 0.000 0.000 0.044 006675 AA 25 22 21 23 91 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 006737 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 25 22 21 23 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 006871 CC 25 22 21 23 91 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 011275 AA 27 21 22 23 93 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 011406 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 011535 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 27 21 21 24 93 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 011633 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 27 22 21 23 93 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 011643 CC 27 22 20 17 86 CT 0 0 0 6 6 TT 0 0 1 1 2 0.000 0.000 21.000 0.240 12.612 011852 AA 0 0 0 0 0 AG 1 1 2 0 4 GG 25 20 19 24 88 0.010 0.012 0.053 0.000 0.045 011861 AA 19 17 18 24 78 AG 4 3 3 0 10 GG 3 1 0 0 4 6.624 2.136 0.124 0.000 13.580 012150 CC 26 22 22 23 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 012486 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 24 22 22 24 92 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 012698 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 27 21 21 23 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 012851 AA 21 17 18 24 80 AC 3 3 3 0 9 CC 2 0 0 0 2 6.624 0.131 0.124 0.000 5.891 014277 GG 26 22 21 22 91 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 014321 AA 15 22 21 23 81 AC 11 0 0 0 11 CC 0 0 0 0 0 1.872 0.000 0.000 0.000 0.372 014403 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 2 0 2 GG 26 22 19 23 90 0.000 0.000 0.053 0.000 0.011 014597 CC 23 22 22 24 91 CT 4 0 0 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 014667 CC 21 17 19 23 80 CT 5 4 3 0 12 TT 1 1 0 0 2 0.868 1.144 0.118 0.000 3.053 014685 CC 22 22 22 23 89 CT 5 0 0 0 5 TT 0 0 0 0 0 0.281 0.000 0.000 0.000 0.070 014772 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 014775 AA 26 22 22 23 93 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 015079 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 015119 -- 20 17 19 23 79 +- 5 4 3 0 12 ++ 2 1 0 0 3 3.000 1.144 0.118 0.000 6.489 015499 CC 2 1 0 0 3 CT 5 4 3 0 12 TT 19 17 19 22 77 2.800 1.144 0.118 0.000 6.269 015944 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 3 3 GG 27 22 22 21 92 0.000 0.000 0.000 0.107 0.024 016045 CC 0 0 0 0 0 CG 12 0 0 0 12 GG 15 22 22 24 83 2.204 0.000 0.000 0.000 0.432 016143 CC 27 22 22 23 94 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 016242 AA 25 22 22 22 91 AC 2 0 0 0 2 CC 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 016493 AA 4 12 18 18 52 AG 16 9 4 4 33 GG 7 1 0 0 8 1.080 0.182 0.220 0.220 0.682 017355 -- 0 0 0 0 0 +- 1 0 0 0 1 ++ 23 20 22 23 88 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 017669 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 21 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 017799 AA 15 21 22 24 82 AC 12 0 0 0 12 CC 0 0 0 0 0 2.204 0.000 0.000 0.000 0.437 018144 CC 27 20 13 19 79 CT 0 2 9 4 15 TT 0 0 0 1 1 0.000 0.050 1.455 1.361 0.091 018314 AA 1 0 0 0 1 AG 8 5 2 4 19 GG 18 17 20 20 75 0.009 0.362 0.050 0.198 0.028 018321 AA 20 17 20 24 81 AG 5 4 2 0 11 GG 2 1 0 0 3 3.000 1.144 0.050 0.000 7.954 018323 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 1 1 CC 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 018406 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 021965 CC 25 22 22 24 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 022125 AA 2 1 0 0 3 AG 4 4 2 0 10 GG 20 17 20 24 81 4.351 1.144 0.050 0.000 9.438 022193 CC 26 22 21 24 93 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 022490 AA 19 19 20 23 81 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 022548 CC 0 0 0 0 0 CT 3 0 0 0 3 TT 16 19 20 24 79 0.140 0.000 0.000 0.000 0.028 022691 AA 0 0 7 6 13 AG 1 12 12 10 35 GG 20 8 3 8 39 0.012 3.673 0.362 0.621 1.181 022723 CC 20 20 20 24 84 CT 0 0 2 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.050 0.000 0.012 022736 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 20 20 22 23 85 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 023090 GG 23 17 21 18 79 GT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.000 0.000 0.013 023393 AA 18 20 20 22 80 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.014 0.000 0.000 0.000 0.003 023446 CC 18 20 20 21 79 CG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.014 0.000 0.000 0.000 0.003 023678 CC 25 17 20 24 86 CT 2 4 2 0 8 TT 0 1 0 0 1 0.040 1.144 0.050 0.000 2.299 023703 CC 25 22 22 24 93 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 023832 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 024095 GG 0 0 0 0 0 GT 4 0 0 0 4 TT 23 22 22 24 91 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 024129 CC 24 18 21 22 85 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 024197 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 2 2 TT 27 19 21 21 88 0.000 0.000 0.000 0.048 0.011 024271 * 024280 GG 25 20 21 23 89 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 024558 AA 27 21 22 22 92 AT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 024703 CC 0 0 0 0 0 CG 4 0 0 0 4 GG 21 18 21 22 82 0.189 0.000 0.000 0.000 0.049 024797 AA 21 19 20 18 78 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.048 0.000 0.000 0.000 0.013 024903 CC 9 0 0 0 9 CT 9 6 4 3 22 TT 2 11 17 17 47 0.013 0.781 0.233 0.131 5.287 024934 AA 2 0 0 0 2 AG 8 5 2 3 18 GG 10 12 19 17 58 0.045 0.505 0.053 0.131 0.176 024965 AA 2 0 0 0 2 AG 8 5 2 3 18 GG 10 13 19 17 59 0.045 0.468 0.053 0.131 0.193 024969 AA 10 13 19 17 59 AG 8 5 2 4 19 GG 2 0 0 0 2 0.045 0.468 0.053 0.233 0.099 025041 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 20 19 21 20 80 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 025368 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 26 21 20 22 89 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 025503 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 25 22 20 22 89 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 025546 AA 10 2 0 0 12 AG 15 8 4 4 31 GG 2 12 18 20 52 1.284 0.153 0.220 0.198 4.060 025612 CC 27 21 22 24 94 CG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 025678 CC 24 21 22 23 90 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 025712 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 24 21 22 23 90 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 026017 AA 0 0 0 0 0 AG 3 3 0 0 6 GG 14 16 22 23 75 0.159 0.140 0.000 0.000 0.120 026075 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 16 19 19 19 73 0.016 0.000 0.000 0.000 0.003 026085 CC 17 18 19 19 73 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.014 0.000 0.000 0.003 026124 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 17 18 19 19 73 0.000 0.014 0.000 0.000 0.003 026203 CC 18 18 19 19 74 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.014 0.000 0.000 0.003 026290 AA 18 18 19 19 74 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.014 0.000 0.000 0.003 026563 AA 0 0 0 0 0 AC 0 1 0 0 1 CC 13 18 18 20 69 0.000 0.014 0.000 0.000 0.004 026837 CC 12 18 12 20 62 CT 2 1 6 0 9 TT 0 0 0 0 0 0.083 0.014 0.720 0.000 0.325 027044 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 25 22 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 027211 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 26 21 22 24 93 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 027222 AA 0 0 1 0 1 AG 5 4 4 10 23 GG 21 18 17 14 70 0.294 0.220 1.144 1.662 0.351 027280 CC 9 1 0 0 10 CT 15 9 4 4 32 TT 2 12 18 20 52 1.548 0.182 0.220 0.198 2.096 027336 CC 19 22 22 24 87 CT 7 0 0 0 7 TT 0 0 0 0 0 0.629 0.000 0.000 0.000 0.141 027337 GG 25 22 22 24 93 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 027758 CC 22 21 22 24 89 CT 4 0 0 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.181 0.000 0.000 0.000 0.045 027766 GG 0 0 0 0 0 GT 4 0 0 0 4 TT 22 21 22 23 88 0.181 0.000 0.000 0.000 0.045 027793 AA 11 11 18 20 60 AT 12 9 4 3 28 TT 3 1 0 0 4 0.010 0.247 0.220 0.112 0.100 028067 AA 21 15 17 16 69 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.012 0.000 0.000 0.000 0.004 028670 -- 0 0 0 0 0 +- 4 0 0 0 4 ++ 22 22 22 23 89 0.181 0.000 0.000 0.000 0.045 028820 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 028983 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 029063 AA 25 22 22 24 93 AT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 029109 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 029205 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 029210 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 029217 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 029256 CC 25 22 22 24 93 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 029336 CC 0 0 0 0 0 CT 4 0 0 0 4 TT 23 22 22 24 91 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 029360 AA 26 22 22 24 94 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 029661 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 26 21 22 23 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 030172 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 27 21 22 24 94 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 030212 CC 25 22 22 24 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 030323 AA 25 22 22 24 93 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 030354 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 25 22 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 030426 AA 25 22 22 24 93 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 031596 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 24 22 22 23 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 031752 CC 23 22 22 23 90 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.043 0.000 0.000 0.000 0.011 031860 CC 24 22 22 23 91 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 031906 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 25 22 22 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 031961 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 25 22 22 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 031964 CC 26 22 21 23 92 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 031990 CC 15 1 0 0 16 CT 10 9 5 6 30 TT 1 12 17 17 47 0.181 0.182 0.362 0.517 6.992 032133 CC 26 21 22 23 92 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 032205 AA 0 0 0 0 0 AC 0 1 0 0 1 CC 26 21 22 23 92 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 032274 AA 0 0 0 0 0 AG 11 0 0 0 11 GG 15 22 22 23 82 1.872 0.000 0.000 0.000 0.367 032387 CC 24 21 22 23 90 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 032480 AA 0 0 1 0 1 AC 0 0 1 0 1 CC 25 21 20 23 89 0.000 0.000 9.075 0.000 39.769 032544 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 25 22 21 23 91 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 032671 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 25 22 21 23 91 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 032686 CC 19 22 22 23 86 CT 6 0 0 0 6 TT 0 0 0 0 0 0.465 0.000 0.000 0.000 0.105 032687 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 5 0 5 GG 25 22 17 23 87 0.000 0.000 0.362 0.000 0.072 032823 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 22 22 23 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 032956 GG 25 22 22 23 92 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 032972 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 25 22 22 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 033017 -- 0 0 3 5 8 +- 2 8 14 10 34 ++ 23 14 5 8 50 0.043 1.086 1.766 0.306 0.404 033051 AA 25 22 22 23 92 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 033111 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 22 22 23 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 033138 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 23 21 22 23 89 0.043 0.000 0.000 0.000 0.011 033205 AA 24 21 22 23 90 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 033225 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 21 22 23 90 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 033230 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 24 21 22 23 90 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 033264 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 24 21 22 23 90 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 033399 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 27 22 21 23 93 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 033627 AA 27 17 19 23 86 AG 0 4 2 0 6 GG 0 1 0 0 1 0.000 1.144 0.053 0.000 4.351 033711 AA 26 22 21 23 92 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 033753 AA 0 0 0 0 0 AG 1 1 1 0 3 GG 26 21 20 23 90 0.010 0.012 0.012 0.000 0.025 033763 AA 26 22 21 23 92 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 033819 CC 20 22 21 23 86 CT 6 0 0 0 6 TT 1 0 0 0 1 0.386 0.000 0.000 0.000 4.351 033913 GG 27 22 22 22 93 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 034047 CC 26 22 22 23 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 034123 AA 0 0 0 0 0 AG 0 2 0 2 4 GG 25 15 18 18 76 0.000 0.066 0.000 0.055 0.053 036285 AA 26 21 22 21 90 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 036535 CC 26 22 22 22 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 036583 AA 0 0 0 0 0 AT 5 0 0 0 5 TT 22 21 21 23 87 0.281 0.000 0.000 0.000 0.072 036591 -- 22 20 22 21 85 +- 5 0 0 0 5 ++ 0 0 0 0 0 0.281 0.000 0.000 0.000 0.073 036877 CC 25 21 22 23 91 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 036956 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 037065 CC 24 19 22 22 87 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 037088 CC 25 19 22 22 88 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 037128 CC 24 19 22 22 87 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.042 0.000 0.000 0.000 0.011 037262 GG 18 14 20 16 68 GT 7 5 2 6 20 TT 1 0 0 0 1 0.092 0.436 0.050 0.548 0.124 037273 AA 25 19 22 22 88 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 047314 CC 23 22 22 24 91 CT 4 0 0 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 047379 AA 23 22 22 24 91 AG 4 0 0 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 047425 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 047432 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 047460 AA 23 22 22 24 91 AG 4 0 0 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 047618 CC 25 19 19 23 86 CT 1 3 3 0 7 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.118 0.118 0.000 0.142 047727 CC 25 17 19 23 84 CT 1 4 3 0 8 TT 0 1 0 0 1 0.010 1.144 0.118 0.000 2.221 047748 CC 2 0 0 0 2 CT 8 0 0 0 8 TT 16 22 22 23 83 0.462 0.000 0.000 0.000 7.679 047795 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 25 22 22 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 047900 AA 0 1 0 0 1 AG 1 4 3 0 8 GG 26 17 19 21 83 0.010 1.144 0.118 0.000 2.183 048085 CC 12 0 0 0 12 CG 13 10 5 6 34 GG 1 7 17 17 42 1.236 2.951 0.362 0.517 1.390 048088 AA 0 0 0 0 0 AG 4 0 0 0 4 GG 22 17 22 23 84 0.181 0.000 0.000 0.000 0.048 048313 AA 26 17 22 23 88 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 048318 AA 7 1 0 0 8 AC 15 9 4 6 34 CC 5 7 18 17 47 0.371 0.746 0.220 0.517 0.263 048343 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 27 16 22 23 88 0.000 0.016 0.000 0.000 0.003 048459 AA 27 18 22 24 91 AG 0 4 0 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.220 0.000 0.000 0.044 048507 AA 27 22 22 23 94 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 048610 CC 7 1 0 0 8 CT 15 9 5 6 35 TT 5 12 17 18 52 0.371 0.182 0.362 0.490 0.364 048718 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 048783 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 048821 CC 24 22 22 24 92 CT 3 0 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.093 0.000 0.000 0.000 0.024 048877 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 23 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 049025 GG 19 22 22 23 86 GT 8 0 0 0 8 TT 0 0 0 0 0 0.817 0.000 0.000 0.000 0.186 049272 CC 25 22 22 24 93 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 049472 GG 5 12 18 18 53 GT 15 9 4 6 34 TT 7 1 0 0 8 0.371 0.182 0.220 0.490 0.565 049477 AA 0 0 0 0 0 AG 4 0 0 0 4 GG 23 22 22 24 91 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 049569 AA 1 0 0 0 1 AG 8 5 2 6 21 GG 18 17 20 18 73 0.009 0.362 0.050 0.490 0.143 049646 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 1 0 1 TT 27 22 21 23 93 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 049705 CC 25 22 22 23 92 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 049730 CC 25 22 22 23 92 CG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 049813 CC 0 0 0 0 0 CG 2 0 0 0 2 GG 25 22 22 24 93 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 049884 CC 15 1 0 0 16 CT 11 9 5 6 31 TT 1 12 17 18 48 0.354 0.182 0.362 0.490 6.613 049908 CC 2 0 0 0 2 CT 8 0 0 0 8 TT 17 22 22 24 85 0.551 0.000 0.000 0.000 7.901 049974 CC 23 22 22 24 91 CT 4 0 0 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 050195 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 050209 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 25 22 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 050228 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 050448 CC 22 15 17 14 68 CT 4 4 3 7 18 TT 0 0 1 0 1 0.181 0.263 2.136 0.840 0.025 050518 CC 13 1 0 0 14 CT 11 7 5 6 29 TT 1 11 16 15 43 0.514 0.007 0.383 0.583 4.915 050530 CC 25 22 22 23 92 CG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 050698 AA 26 22 22 24 94 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 050724 CC 26 21 22 24 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 1 0 0 1 0.010 22.000 0.000 0.000 41.548 050730 CC 18 22 22 24 86 CG 7 0 0 0 7 GG 2 0 0 0 2 1.089 0.000 0.000 0.000 10.005 050759 GG 27 22 22 23 94 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 050780 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 050854 GG 26 22 22 24 94 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 050860 AA 27 22 22 23 94 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 050947 GG 26 22 22 24 94 GT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 051031 CC 25 22 22 24 93 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 051044 CC 27 17 19 24 87 CT 0 4 3 0 7 TT 0 1 0 0 1 0.000 1.144 0.118 0.000 3.201 051091 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 051158 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 21 22 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 051195 CC 22 21 22 24 89 CT 5 0 0 0 5 TT 0 0 0 0 0 0.281 0.000 0.000 0.000 0.070 051247 AA 0 0 0 0 0 AG 4 0 0 0 4 GG 23 21 22 24 90 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 051251 AA 23 21 22 24 90 AT 4 0 0 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 051332 CC 25 22 22 24 93 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 051793 CC 18 1 1 0 20 CT 7 14 8 14 43 TT 0 6 13 10 29 0.663 3.590 0.027 4.069 0.290 051981 CC 11 13 16 16 56 CT 7 4 3 8 22 TT 3 0 1 0 4 1.018 0.302 1.976 0.960 0.861 052174 AA 1 0 0 0 1 AG 5 0 0 0 5 GG 17 21 22 23 83 0.571 0.000 0.000 0.000 5.854 052380 AA 25 22 22 23 92 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 052465 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 052472 AA 0 0 0 0 0 AG 3 0 0 0 3 GG 23 21 22 24 90 0.097 0.000 0.000 0.000 0.025 052534 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 25 21 22 22 90 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 052713 GG 27 22 22 23 94 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 052787 AA 26 21 22 24 93 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 052835 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 25 22 22 23 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 052879 CC 0 0 1 0 1 CG 5 4 3 8 20 GG 22 18 18 16 74 0.281 0.220 2.296 0.960 0.075 053065 AA 0 8 12 10 30 AG 8 13 9 14 44 GG 18 1 1 0 20 0.860 2.182 0.182 4.069 0.265 053405 * 053429 AA 0 0 0 0 0 AG 3 0 2 3 8 GG 22 21 19 20 82 0.102 0.000 0.053 0.112 0.195 053452 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 24 21 20 23 88 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 054264 GG 0 1 0 0 1 GT 0 4 3 0 7 TT 27 17 19 23 86 0.000 1.144 0.118 0.000 3.152 054352 CC 27 21 22 24 94 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 054494 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 25 22 22 24 93 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 054503 AA 3 0 1 0 4 AG 8 4 3 8 23 GG 16 18 18 16 68 1.411 0.220 2.296 0.960 1.222 054742 CC 27 22 21 23 93 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 054965 AA 0 0 0 0 0 AC 4 0 0 0 4 CC 23 22 22 24 91 0.173 0.000 0.000 0.000 0.044 054983 CC 25 22 22 24 93 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 055072 CC 26 22 22 24 94 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 055325 AA 0 8 12 10 30 AC 11 13 8 13 45 CC 16 1 1 1 19 1.767 2.182 0.053 1.630 0.080 055435 AA 1 8 11 10 30 AG 10 13 8 13 44 GG 16 1 1 1 19 0.138 2.182 0.089 1.630 0.151 055493 CC 15 1 1 1 18 CT 11 13 8 13 45 TT 1 8 11 10 30 0.354 2.182 0.089 1.630 0.023 055614 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 22 24 94 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 055628 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 0 1 1 GG 27 22 22 23 94 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 055855 CC 7 12 16 16 51 CT 12 8 5 7 32 TT 5 0 0 0 5 0.001 1.250 0.383 0.741 0.000 055892 AA 0 0 0 0 0 AG 9 0 0 0 9 GG 16 20 21 23 80 1.205 0.000 0.000 0.000 0.252 056025 AA 1 0 0 0 1 AG 13 10 5 7 35 GG 12 12 17 16 57 1.236 1.903 0.362 0.741 3.042 056138 AA 3 0 0 0 3 AG 7 2 4 7 20 GG 13 15 15 13 56 1.431 0.066 0.263 0.900 0.496 056375 GG 19 20 22 23 84 GT 8 0 0 0 8 TT 0 0 0 0 0 0.817 0.000 0.000 0.000 0.190 056464 AA 0 0 0 0 0 AG 6 0 0 0 6 GG 21 22 22 24 89 0.422 0.000 0.000 0.000 0.101 056591 CC 16 22 21 24 83 CT 11 0 0 0 11 TT 0 0 0 0 0 1.767 0.000 0.000 0.000 0.363 056592 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 22 21 24 93 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 056894 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 21 21 24 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 056959 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 25 21 21 24 91 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 057001 CC 25 21 21 24 91 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 057091 AA 0 0 0 0 0 AG 9 0 2 4 15 GG 18 21 19 20 78 1.080 0.000 0.053 0.198 0.716 057138 AA 22 16 19 24 81 AG 5 5 2 0 12 GG 0 0 0 0 0 0.281 0.383 0.053 0.000 0.442 057152 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 26 21 21 24 92 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 057155 AA 27 21 21 23 92 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 057286 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 25 22 22 24 93 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 057383 CC 0 0 0 0 0 CG 0 1 0 0 1 GG 27 20 22 23 92 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 057486 AA 1 0 0 0 1 AG 9 5 2 7 23 GG 17 16 20 16 69 0.020 0.383 0.050 0.741 0.367 057487 CC 25 21 22 23 91 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.040 0.000 0.000 0.000 0.011 057498 AA 7 1 0 0 8 AG 14 8 5 7 34 GG 6 12 17 16 51 0.040 0.053 0.362 0.741 0.456 057607 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 1 1 CC 27 21 22 22 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 057645 AA 26 21 22 23 92 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.010 0.000 0.000 0.000 0.003 057715 CC 17 15 16 12 60 CT 9 6 6 11 32 TT 1 0 0 0 1 0.020 0.583 0.548 2.272 2.140 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 015119: c 017355: c 028670: a 033017: GAG 036591: A Tri-allelic sites: Site Genotype AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop 024271 AA 0 0 0 0 0 024271 AG 0 0 0 1 1 024271 AT 0 0 0 0 0 024271 GG 25 19 21 22 87 024271 GT 1 0 0 0 1 024271 TT 0 0 0 0 0 053405 AA 2 0 1 0 3 053405 AC 0 0 0 1 1 053405 AG 9 4 3 6 22 053405 CC 0 0 0 0 0 053405 CG 0 1 0 1 2 053405 GG 14 17 17 15 63