Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Total-hz 000464 A 0.06 G 0.94 0.11 000548 * 000758 T 0.02 A 0.98 0.05 000794 C 0.14 G 0.86 0.24 001132 - 0.01 + 0.99 0.01 001147 G 0.01 A 0.99 0.01 001149 G 0.01 A 0.99 0.01 001173 T 0.47 C 0.53 0.50 001363 A 0.02 T 0.98 0.04 001545 G 0.12 C 0.88 0.21 001553 G 0.08 A 0.92 0.15 001742 T 0.01 A 0.99 0.02 001959 - 0.43 + 0.57 0.49 001987 + 0.43 - 0.57 0.49 001999 G 0.02 T 0.98 0.04 002037 A 0.01 G 0.99 0.02 002107 G 0.01 C 0.99 0.02 002218 T 0.15 G 0.85 0.25 002269 T 0.03 C 0.97 0.05 002400 C 0.01 G 0.99 0.01 002739 C 0.09 G 0.91 0.16 002916 G 0.21 A 0.79 0.33 002946 C 0.02 T 0.98 0.03 003034 A 0.01 C 0.99 0.01 003510 C 0.01 G 0.99 0.02 003565 A 0.19 G 0.81 0.30 003681 G 0.03 A 0.97 0.07 003750 A 0.01 C 0.99 0.02 004043 G 0.11 T 0.89 0.20 004139 T 0.09 C 0.91 0.16 004279 C 0.03 G 0.97 0.07 004346 A 0.03 G 0.97 0.07 004780 T 0.24 C 0.76 0.36 004825 G 0.12 A 0.88 0.22 004867 A 0.12 C 0.88 0.21 004948 T 0.08 C 0.92 0.15 005162 A 0.01 G 0.99 0.01 005345 T 0.01 C 0.99 0.02 005474 G 0.42 T 0.58 0.49 005811 T 0.02 A 0.98 0.04 006175 A 0.01 G 0.99 0.01 006715 T 0.01 C 0.99 0.01 006830 C 0.02 G 0.98 0.03 007018 G 0.01 A 0.99 0.02 007068 T 0.01 C 0.99 0.02 007233 A 0.01 G 0.99 0.01 007243 A 0.01 G 0.99 0.01 007365 T 0.45 A 0.55 0.50 008436 G 0.39 T 0.61 0.48 008510 A 0.01 G 0.99 0.02 008653 T 0.24 C 0.76 0.37 008725 + 0.01 - 0.99 0.01 008877 C 0.01 G 0.99 0.02 008954 T 0.02 C 0.98 0.03 009033 A 0.02 G 0.98 0.03 009098 T 0.16 C 0.84 0.27 009121 T 0.04 C 0.96 0.08 009366 T 0.01 C 0.99 0.02 009888 T 0.40 C 0.60 0.48 011461 C 0.41 G 0.59 0.48 011659 - 0.01 + 0.99 0.02 011681 - 0.02 + 0.98 0.03 012087 C 0.24 G 0.76 0.37 012092 T 0.01 C 0.99 0.01 012187 G 0.01 C 0.99 0.01 013061 A 0.15 G 0.85 0.25 013099 G 0.40 A 0.60 0.48 013284 G 0.01 C 0.99 0.02 013490 G 0.01 A 0.99 0.01 013556 G 0.01 C 0.99 0.01 013924 G 0.08 A 0.92 0.15 013969 A 0.02 G 0.98 0.04 014177 T 0.01 G 0.99 0.01 014190 G 0.01 A 0.99 0.02 014220 A 0.01 G 0.99 0.01 014301 G 0.04 A 0.96 0.09 015010 G 0.14 A 0.86 0.25 015103 A 0.17 G 0.83 0.29 015554 A 0.01 G 0.99 0.01 015564 A 0.09 G 0.91 0.16 016199 + 0.45 - 0.55 0.50 016210 A 0.01 G 0.99 0.01 016213 A 0.03 G 0.97 0.07 016335 C 0.02 T 0.98 0.04 016470 T 0.01 C 0.99 0.01 016754 C 0.13 T 0.87 0.23 016759 C 0.01 T 0.99 0.01 016855 C 0.20 T 0.80 0.32 017743 A 0.01 C 0.99 0.03 018083 C 0.01 T 0.99 0.01 018104 G 0.13 A 0.87 0.23 018286 C 0.01 G 0.99 0.01 018652 A 0.02 G 0.98 0.03 018663 C 0.10 T 0.90 0.18 018709 C 0.01 G 0.99 0.01 018716 T 0.01 G 0.99 0.02 018792 + 0.14 - 0.86 0.24 018892 G 0.09 A 0.91 0.16 019061 A 0.09 C 0.91 0.16 019252 T 0.01 C 0.99 0.01 019263 G 0.47 A 0.53 0.50 019595 - 0.02 + 0.98 0.04 019661 G 0.01 C 0.99 0.01 019758 T 0.14 C 0.86 0.24 019912 G 0.10 A 0.90 0.19 019934 T 0.01 C 0.99 0.01 019982 + 0.09 - 0.91 0.16 020081 G 0.37 A 0.63 0.46 020260 A 0.01 G 0.99 0.01 020390 C 0.01 A 0.99 0.01 020416 C 0.02 T 0.98 0.03 020487 G 0.09 A 0.91 0.16 020778 T 0.01 G 0.99 0.03 021000 T 0.09 G 0.91 0.17 021052 A 0.06 G 0.94 0.11 021117 A 0.09 G 0.91 0.16 021187 T 0.01 G 0.99 0.02 021369 C 0.21 T 0.79 0.33 021454 G 0.05 A 0.95 0.09 021469 C 0.01 A 0.99 0.01 021477 A 0.08 G 0.92 0.15 Note: Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001132: T 001959: GTCCTTTATGGTAAGTGGATATGGTCCA 001987: CGCTTCCTGGTG 008725: G 011659: t 011681: aa 016199: CA 018792: C 019595: A 019982: A Tri-allelic sites: Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop Allele3 Total-pop 000548 T 0.15 C 0.20 A 0.65