Site Allele1 Total-pop Allele2 Total-pop hz 000371 - 0.01 + 0.99 0.01 079045 - 0.01 + 0.99 0.02 079257 G 0.01 A 0.99 0.02 079714 C 0.12 G 0.88 0.21 079861 T 0.26 C 0.74 0.39 080229 A 0.01 G 0.99 0.01 080371 G 0.32 A 0.68 0.43 080887 G 0.22 A 0.78 0.35 081266 G 0.02 A 0.98 0.03 081339 T 0.09 C 0.91 0.16 081443 T 0.15 C 0.85 0.26 081606 T 0.01 C 0.99 0.01 081639 T 0.06 C 0.94 0.11 081750 G 0.01 A 0.99 0.01 081806 G 0.08 A 0.92 0.15 082240 T 0.01 C 0.99 0.01 082291 G 0.03 T 0.97 0.06 082346 G 0.01 T 0.99 0.01 082765 T 0.02 C 0.98 0.04 083113 C 0.20 G 0.80 0.32 083413 T 0.01 C 0.99 0.01 083502 C 0.02 T 0.98 0.04 083667 A 0.31 G 0.69 0.43 083708 A 0.01 G 0.99 0.01 083801 C 0.01 G 0.99 0.02 083900 C 0.25 T 0.75 0.37 084542 A 0.43 G 0.57 0.49 084601 A 0.32 G 0.68 0.44 084610 G 0.26 T 0.74 0.38 084650 T 0.03 C 0.97 0.07 084790 T 0.34 C 0.66 0.45 084830 T 0.05 C 0.95 0.09 084834 T 0.14 C 0.86 0.24 084856 G 0.01 A 0.99 0.01 085286 T 0.42 G 0.58 0.49 085610 G 0.01 T 0.99 0.02 085613 A 0.44 C 0.56 0.49 085633 A 0.05 G 0.95 0.10 085643 T 0.01 C 0.99 0.01 085677 A 0.01 G 0.99 0.01 086038 T 0.01 C 0.99 0.01 086189 G 0.05 A 0.95 0.10 086270 A 0.31 G 0.69 0.43 086276 A 0.01 G 0.99 0.02 086410 A 0.01 G 0.99 0.01 086923 C 0.12 T 0.88 0.21 086930 G 0.13 C 0.87 0.22 086933 A 0.42 G 0.58 0.49 086945 A 0.01 G 0.99 0.01 087223 T 0.01 G 0.99 0.02 087285 + 0.02 - 0.98 0.04 087414 C 0.01 A 0.99 0.01 087416 A 0.01 G 0.99 0.01 088431 G 0.05 T 0.95 0.09 088469 A 0.01 G 0.99 0.02 088870 C 0.01 T 0.99 0.01 089434 T 0.01 C 0.99 0.02 089951 G 0.01 A 0.99 0.01 090448 G 0.01 C 0.99 0.02 090614 G 0.01 A 0.99 0.01 091036 T 0.26 C 0.74 0.38 091276 A 0.01 G 0.99 0.01 091502 C 0.06 T 0.94 0.10 092028 G 0.15 C 0.85 0.25 092042 C 0.03 T 0.97 0.06 092050 A 0.29 T 0.71 0.41 Note: pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000371: AG 079045: GTTT 087285: AGAAA